EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000020275 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4782 bases
Position: chr7:25053311-25058092
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000029927	RVT_1	PF00078.27	7.4e-32	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000030633	-	4782	-	ENSACLP00000029927	1593 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000020275	-	81	42.311	ENSACLG00000015880	-	95	42.311
ENSACLG00000020275	-	50	32.008	ENSACLG00000002180	-	52	32.008
ENSACLG00000020275	-	77	36.887	ENSACLG00000002182	-	90	37.086
ENSACLG00000020275	-	53	34.783	ENSACLG00000025719	-	55	34.783
ENSACLG00000020275	-	78	35.970	ENSACLG00000001555	-	84	35.970
ENSACLG00000020275	-	55	61.943	ENSACLG00000000373	-	77	61.943
ENSACLG00000020275	-	90	50.068	ENSACLG00000003361	-	97	50.068
ENSACLG00000020275	-	81	39.150	ENSACLG00000003799	-	89	39.150
ENSACLG00000020275	-	80	35.125	ENSACLG00000013669	-	86	35.125
ENSACLG00000020275	-	75	34.496	ENSACLG00000013718	-	70	34.496
ENSACLG00000020275	-	77	36.963	ENSACLG00000019658	-	90	37.163
ENSACLG00000020275	-	85	54.124	ENSACLG00000010542	-	99	54.124
ENSACLG00000020275	-	90	50.137	ENSACLG00000013455	-	97	50.137
ENSACLG00000020275	-	86	35.908	ENSACLG00000021770	-	95	35.878
ENSACLG00000020275	-	52	35.398	ENSACLG00000014619	-	55	35.398
ENSACLG00000020275	-	92	50.834	ENSACLG00000001282	-	99	51.034
ENSACLG00000020275	-	55	61.943	ENSACLG00000012657	-	77	61.943
ENSACLG00000020275	-	59	40.224	ENSACLG00000008010	-	84	40.224
ENSACLG00000020275	-	52	32.802	ENSACLG00000026192	-	62	32.802
ENSACLG00000020275	-	92	50.475	ENSACLG00000025904	-	96	50.611
ENSACLG00000020275	-	75	53.135	ENSACLG00000018344	-	97	53.135
ENSACLG00000020275	-	79	36.258	ENSACLG00000004344	-	81	36.258
ENSACLG00000020275	-	52	32.965	ENSACLG00000027730	-	71	32.965
ENSACLG00000020275	-	51	31.478	ENSACLG00000016676	-	56	31.478
ENSACLG00000020275	-	53	34.576	ENSACLG00000024091	-	55	34.576
ENSACLG00000020275	-	86	34.110	ENSACLG00000000384	-	88	34.110
ENSACLG00000020275	-	89	36.519	ENSACLG00000027747	-	94	36.519
ENSACLG00000020275	-	55	34.244	ENSACLG00000017161	-	57	34.244
ENSACLG00000020275	-	97	50.415	ENSACLG00000012963	-	98	50.415
ENSACLG00000020275	-	57	50.205	ENSACLG00000014688	-	76	50.205
ENSACLG00000020275	-	92	49.764	ENSACLG00000009118	-	99	49.764
ENSACLG00000020275	-	82	37.378	ENSACLG00000003852	-	91	37.378
ENSACLG00000020275	-	52	35.398	ENSACLG00000019876	-	55	35.398
ENSACLG00000020275	-	51	31.277	ENSACLG00000008642	-	69	31.277
ENSACLG00000020275	-	85	54.367	ENSACLG00000005531	-	99	54.367
ENSACLG00000020275	-	63	42.885	ENSACLG00000013947	-	91	42.885
ENSACLG00000020275	-	81	34.753	ENSACLG00000027618	-	83	34.753
ENSACLG00000020275	-	73	35.887	ENSACLG00000024387	-	95	35.887
ENSACLG00000020275	-	53	32.489	ENSACLG00000027291	-	51	33.333
ENSACLG00000020275	-	97	33.210	ENSACLG00000002176	-	72	33.231
ENSACLG00000020275	-	62	39.212	ENSACLG00000018454	-	99	35.811
ENSACLG00000020275	-	52	31.933	ENSACLG00000013572	-	50	32.143
ENSACLG00000020275	-	81	38.995	ENSACLG00000006945	-	89	38.995
ENSACLG00000020275	-	50	35.699	ENSACLG00000008738	-	70	35.699
ENSACLG00000020275	-	50	36.600	ENSACLG00000012278	-	97	36.600
ENSACLG00000020275	-	75	35.308	ENSACLG00000003748	-	66	35.308
ENSACLG00000020275	-	80	36.105	ENSACLG00000020048	-	89	36.180
ENSACLG00000020275	-	91	49.966	ENSACLG00000016624	-	99	50.102
ENSACLG00000020275	-	54	39.047	ENSACLG00000017258	-	84	39.047
ENSACLG00000020275	-	56	40.220	ENSACLG00000001267	-	77	40.220
ENSACLG00000020275	-	78	36.046	ENSACLG00000013171	-	85	36.046
ENSACLG00000020275	-	50	40.456	ENSACLG00000027627	-	66	40.456
ENSACLG00000020275	-	50	39.130	ENSACLG00000021355	-	100	39.130
ENSACLG00000020275	-	53	34.576	ENSACLG00000009628	-	55	34.576
ENSACLG00000020275	-	80	35.450	ENSACLG00000021546	-	86	35.450

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000020275	-	81	35.809	ENSAPOG00000000887	-	87	36.003	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000020275	-	94	51.248	ENSAPOG00000022647	-	99	51.248	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000020275	-	84	56.227	ENSAPOG00000005387	-	85	56.227	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000020275	-	81	55.225	ENSAPOG00000011081	-	84	55.225	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000020275	-	65	32.734	ENSAPOG00000015320	-	95	32.734	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000020275	-	87	51.915	ENSAPEG00000002424	-	97	52.125	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020275	-	84	55.695	ENSAPEG00000024442	-	99	50.247	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020275	-	81	35.115	ENSAPEG00000015779	-	96	33.631	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020275	-	71	36.784	ENSAPEG00000015494	-	97	34.845	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020275	-	61	36.932	ENSAPEG00000002572	-	96	36.932	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020275	-	56	40.854	ENSATEG00000016298	-	85	39.937	Anabas_testudineus
ENSACLG00000020275	-	53	39.977	ENSATEG00000006997	-	91	39.977	Anabas_testudineus
ENSACLG00000020275	-	62	34.406	ENSATEG00000018698	-	83	34.026	Anabas_testudineus
ENSACLG00000020275	-	83	55.979	ENSAMXG00000032330	-	92	55.335	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	97	50.284	ENSAMXG00000043312	-	98	50.284	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	79	37.481	ENSAMXG00000038338	-	89	37.481	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	83	51.909	ENSAMXG00000032783	-	98	51.909	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	74	41.237	ENSAMXG00000038531	-	88	41.237	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	71	55.712	ENSAMXG00000039473	-	99	55.712	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	58	32.573	ENSAMXG00000037247	-	60	32.573	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	77	38.191	ENSAMXG00000033912	-	96	38.266	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	97	50.347	ENSAMXG00000038997	-	98	50.347	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	82	36.459	ENSAMXG00000033629	-	73	36.459	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	72	60.027	ENSAMXG00000036113	-	98	60.027	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	82	37.781	ENSAMXG00000043385	-	95	37.781	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	73	36.401	ENSAMXG00000036680	-	78	36.401	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	81	35.962	ENSAMXG00000035138	-	88	35.845	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	52	41.516	ENSAMXG00000035923	-	100	41.516	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	80	38.799	ENSAMXG00000035335	-	89	38.799	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	61	35.288	ENSAMXG00000032559	-	84	35.288	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	96	50.318	ENSAMXG00000044052	-	98	50.318	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	81	46.897	ENSAMXG00000030747	-	63	46.897	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	80	37.405	ENSAMXG00000039912	-	89	36.470	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	82	37.509	ENSAMXG00000030479	-	93	37.509	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	72	57.589	ENSAMXG00000039110	-	97	51.246	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	56	33.482	ENSAMXG00000039114	-	81	33.482	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	61	50.560	ENSAMXG00000041369	-	82	50.560	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	67	38.369	ENSAMXG00000037864	-	94	38.369	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	51	39.387	ENSAMXG00000029230	-	54	39.207	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	76	54.693	ENSAMXG00000030022	-	99	54.494	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	50	37.263	ENSAMXG00000032571	-	57	37.263	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	51	34.491	ENSAMXG00000038033	-	84	34.491	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	73	34.988	ENSAMXG00000030908	-	100	34.944	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	64	42.802	ENSAMXG00000034382	-	86	42.802	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	72	44.539	ENSAMXG00000040885	-	87	44.249	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020275	-	71	38.276	ENSCVAG00000019395	-	87	37.365	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000020275	-	83	45.233	ENSCVAG00000005047	-	80	44.017	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000020275	-	50	34.071	ENSDARG00000114395	CU929458.1	55	34.071	Danio_rerio
ENSACLG00000020275	-	50	34.071	ENSDARG00000115891	CR533578.1	55	34.071	Danio_rerio
ENSACLG00000020275	-	50	33.850	ENSDARG00000111789	BX571665.1	55	33.850	Danio_rerio
ENSACLG00000020275	-	52	40.408	ENSGAFG00000014674	-	87	37.909	Gambusia_affinis
ENSACLG00000020275	-	91	33.445	ENSGAFG00000017103	-	93	33.445	Gambusia_affinis
ENSACLG00000020275	-	80	56.434	ENSGAFG00000016352	-	99	56.667	Gambusia_affinis
ENSACLG00000020275	-	83	44.856	ENSGAFG00000013212	-	66	44.856	Gambusia_affinis
ENSACLG00000020275	-	81	38.537	ENSGAFG00000016760	-	85	38.537	Gambusia_affinis
ENSACLG00000020275	-	97	51.158	ENSHBUG00000021107	-	98	51.443	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000020275	-	75	53.865	ENSHCOG00000012267	-	99	53.865	Hippocampus_comes
ENSACLG00000020275	-	80	30.858	ENSKMAG00000003018	-	92	30.858	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020275	-	97	51.233	ENSKMAG00000012706	-	98	51.233	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020275	-	80	30.858	ENSKMAG00000010491	-	92	30.858	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020275	-	80	30.858	ENSKMAG00000022204	-	92	30.858	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020275	-	53	40.175	ENSLACG00000009524	-	94	40.611	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000020275	-	64	38.021	ENSLACG00000005710	-	81	38.021	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000020275	-	50	50.739	ENSLACG00000010043	-	94	50.739	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000020275	-	69	36.883	ENSMZEG00005025542	-	86	36.883	Maylandia_zebra
ENSACLG00000020275	-	72	37.638	ENSMZEG00005012274	-	80	37.725	Maylandia_zebra
ENSACLG00000020275	-	66	54.811	ENSMZEG00005023862	-	96	54.811	Maylandia_zebra
ENSACLG00000020275	-	83	50.510	ENSMALG00000020759	-	99	50.583	Monopterus_albus
ENSACLG00000020275	-	76	40.404	ENSORLG00000027277	-	89	40.404	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020275	-	51	32.329	ENSORLG00000028879	-	82	32.329	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020275	-	59	36.590	ENSORLG00000028409	-	50	36.590	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020275	-	84	54.052	ENSORLG00000029329	-	99	48.550	Oryzias_latipes
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ENSACLG00000020275	-	98	50.440	ENSXMAG00000029008	-	99	50.598	Xiphophorus_maculatus
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