EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000020302 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1146 bases
Position: chr18:16553502-16554647
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000029962	RVT_1	PF00078.27	4.6e-29	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000030667	-	1146	-	ENSACLP00000029962	381 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000020302	-	60	49.782	ENSACLG00000025525	-	56	49.782
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ENSACLG00000020302	-	73	74.368	ENSSMAG00000016680	-	59	74.368	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000020302	-	100	74.740	ENSSMAG00000020841	-	92	74.740	Scophthalmus_maximus
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ENSACLG00000020302	-	100	51.562	ENSSDUG00000012909	-	62	51.562	Seriola_dumerili
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ENSACLG00000020302	-	78	47.667	ENSSPAG00000005749	-	99	47.249	Stegastes_partitus
ENSACLG00000020302	-	70	71.910	ENSTRUG00000024564	-	60	71.910	Takifugu_rubripes
ENSACLG00000020302	-	58	66.816	ENSTRUG00000020404	-	88	66.816	Takifugu_rubripes
ENSACLG00000020302	-	86	49.697	ENSXMAG00000021176	-	99	49.697	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000020302	-	100	50.781	ENSXMAG00000028039	-	55	50.781	Xiphophorus_maculatus