EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000020388 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1536 bases
Position: chr7:9217743-9219278
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000030085	RVT_1	PF00078.27	1.3e-45	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000030794	-	1536	-	ENSACLP00000030085	363 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000020388	-	94	47.368	ENSACLG00000022277	-	81	48.182
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ENSACLG00000020388	-	67	52.263	ENSACLG00000001035	-	62	52.263
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ENSACLG00000020388	-	94	48.105	ENSACLG00000005017	-	50	48.214
ENSACLG00000020388	-	87	52.038	ENSACLG00000003644	-	98	52.038
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