EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000020393 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 191363 bases
Position: chr8:2863938-3055300
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSACLP00000030103	zf-C2H2	PF00096.26	2.2e-48	1	10
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ENSACLP00000030118	zf-met	PF12874.7	2e-33	1	6
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ENSACLP00000030103	zf-met	PF12874.7	3e-20	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000030812	-	1686	-	ENSACLP00000030103	561 (aa)	-	-
ENSACLT00000030827	-	1338	-	ENSACLP00000030118	445 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000020393	-	91	39.541	ENSACLG00000001003	-	88	41.333
ENSACLG00000020393	-	94	57.292	ENSACLG00000021022	-	79	57.292
ENSACLG00000020393	-	93	50.709	ENSACLG00000021343	-	97	48.529
ENSACLG00000020393	-	98	50.000	ENSACLG00000016405	zbtb17	56	50.000
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ENSACLG00000020393	-	93	47.546	ENSACLG00000011642	-	83	47.546
ENSACLG00000020393	-	89	48.000	ENSACLG00000000102	-	56	48.000
ENSACLG00000020393	-	87	43.713	ENSACLG00000017329	-	99	36.087
ENSACLG00000020393	-	92	47.451	ENSACLG00000017321	-	80	50.575
ENSACLG00000020393	-	96	49.296	ENSACLG00000006718	-	96	49.296
ENSACLG00000020393	-	89	47.748	ENSACLG00000020474	-	86	47.748
ENSACLG00000020393	-	88	46.334	ENSACLG00000000487	-	87	46.334
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ENSACLG00000020393	-	93	57.563	ENSACLG00000020339	-	86	46.457
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ENSACLG00000020393	-	99	42.236	ENSACLG00000005694	-	73	41.615
ENSACLG00000020393	-	95	48.634	ENSACLG00000011237	-	99	46.667
ENSACLG00000020393	-	87	40.155	ENSACLG00000019499	-	88	41.692
ENSACLG00000020393	-	87	46.154	ENSACLG00000014365	-	99	40.000
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