EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000020541 (Gene tree)
Gene ID: 113032963
Gene Symbol: polr1a
Alias: fa26a03|sb:cb935|wu:fa26a03
Full Name: RNA polymerase I subunit A
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 28940 bases
Position: chr2:19118690-19147629
Accession: ZDB-GENE-030131-5286
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000030438	RNA_pol_Rpb1_5	PF04998.17	6.8e-100	1	1
ENSACLP00000030438	RNA_pol_Rpb1_4	PF05000.17	1.1e-20	1	1
ENSACLP00000030438	RNA_pol_Rpb1_2	PF00623.20	1.6e-67	1	1
ENSACLP00000030438	RNA_pol_Rpb1_3	PF04983.18	5.4e-37	1	1
ENSACLP00000030438	RNA_pol_Rpb1_1	PF04997.12	4.4e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000031150	-	4764	-	ENSACLP00000030438	1587 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACLG00000020541's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACLG00000020541's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000020541	polr1a	75	35.238	ENSACLG00000006735	polr2a	61	35.238
ENSACLG00000020541	polr1a	81	30.719	ENSACLG00000005914	polr3a	87	31.655

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.760	ENSG00000068654	POLR1A	100	62.154	Homo_sapiens
ENSACLG00000020541	polr1a	68	78.541	ENSAPOG00000017945	polr1a	99	78.965	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	62.442	ENSAMEG00000005807	POLR1A	100	64.694	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000020541	polr1a	100	82.427	ENSACIG00000022147	polr1a	100	83.153	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000020541	polr1a	99	86.842	ENSAOCG00000017336	polr1a	98	86.842	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000020541	polr1a	100	79.388	ENSAPEG00000016105	polr1a	97	86.842	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020541	polr1a	100	80.924	ENSATEG00000016773	polr1a	100	80.924	Anabas_testudineus
ENSACLG00000020541	polr1a	86	65.155	ENSAPLG00000013871	POLR1A	98	65.406	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000020541	polr1a	99	61.561	ENSACAG00000012141	POLR1A	99	61.435	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.445	ENSANAG00000033927	POLR1A	100	62.189	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000020541	polr1a	100	62.667	ENSBTAG00000006481	POLR1A	100	62.783	Bos_taurus
ENSACLG00000020541	polr1a	93	41.940	WBGene00012999	rpoa-1	77	59.783	Caenorhabditis_elegans
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.770	ENSCJAG00000019547	POLR1A	100	62.283	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	62.703	ENSCAFG00000007613	POLR1A	100	62.935	Canis_familiaris
ENSACLG00000020541	polr1a	100	63.919	ENSCAFG00020014752	POLR1A	93	72.222	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000020541	polr1a	100	62.653	ENSCHIG00000018204	POLR1A	100	62.354	Capra_hircus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.761	ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	62.021	Carlito_syrichta
ENSACLG00000020541	polr1a	97	59.568	ENSCAPG00000010132	POLR1A	100	60.192	Cavia_aperea
ENSACLG00000020541	polr1a	100	62.181	ENSCPOG00000012350	POLR1A	100	62.849	Cavia_porcellus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.726	ENSCCAG00000019839	POLR1A	100	62.362	Cebus_capucinus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.946	ENSCATG00000029786	POLR1A	100	62.327	Cercocebus_atys
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.415	ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	62.341	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.600	ENSCSAG00000016251	POLR1A	100	61.662	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000020541	polr1a	99	63.026	ENSCPBG00000001115	POLR1A	99	63.201	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000020541	polr1a	99	46.208	ENSCSAVG00000007184	-	99	46.054	Ciona_savignyi
ENSACLG00000020541	polr1a	100	59.172	ENSCANG00000031785	POLR1A	100	59.096	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000020541	polr1a	96	62.233	ENSCGRG00001006651	Polr1a	100	57.825	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000020541	polr1a	62	62.293	ENSCGRG00000010834	Polr1a	100	61.923	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000020541	polr1a	100	72.186	ENSCSEG00000020190	polr1a	97	77.106	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000020541	polr1a	100	77.585	ENSCVAG00000020941	polr1a	100	78.149	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	68.692	ENSDARG00000098375	polr1a	100	68.651	Danio_rerio
ENSACLG00000020541	polr1a	100	59.536	ENSDNOG00000010829	POLR1A	100	59.594	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.908	ENSDORG00000008298	Polr1a	100	61.734	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000020541	polr1a	90	49.524	FBgn0019938	RpI1	99	42.806	Drosophila_melanogaster
ENSACLG00000020541	polr1a	72	87.500	ENSETEG00000000412	-	72	87.500	Echinops_telfairi
ENSACLG00000020541	polr1a	90	46.747	ENSEBUG00000005667	-	99	46.765	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.866	ENSEASG00005001625	POLR1A	100	62.942	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.982	ENSECAG00000030510	-	99	65.596	Equus_caballus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.982	ENSECAG00000010092	POLR1A	99	65.596	Equus_caballus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.982	ENSECAG00000036306	-	99	65.596	Equus_caballus
ENSACLG00000020541	polr1a	83	76.364	ENSEEUG00000000676	POLR1A	78	76.364	Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	69.778	ENSELUG00000012769	polr1a	99	70.070	Esox_lucius
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.828	ENSFCAG00000008966	POLR1A	100	62.703	Felis_catus
ENSACLG00000020541	polr1a	99	61.304	ENSFALG00000010082	POLR1A	99	61.854	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.645	ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	62.225	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000020541	polr1a	100	74.955	ENSFHEG00000005996	polr1a	100	74.582	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	68.570	ENSGMOG00000002230	polr1a	100	68.704	Gadus_morhua
ENSACLG00000020541	polr1a	89	59.573	ENSGALG00000038160	-	99	59.715	Gallus_gallus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	78.300	ENSGAFG00000015266	polr1a	100	78.792	Gambusia_affinis
ENSACLG00000020541	polr1a	100	74.870	ENSGACG00000018791	polr1a	100	74.928	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000020541	polr1a	91	64.032	ENSGAGG00000004984	-	99	64.136	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.817	ENSGGOG00000001788	POLR1A	100	62.212	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000020541	polr1a	89	98.936	ENSHBUG00000020021	polr1a	99	99.267	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000020541	polr1a	100	62.944	ENSHGLG00000006334	POLR1A	100	63.045	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000020541	polr1a	100	62.761	ENSHGLG00100006614	POLR1A	100	62.862	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000020541	polr1a	100	76.705	ENSHCOG00000003345	polr1a	100	76.386	Hippocampus_comes
ENSACLG00000020541	polr1a	100	67.213	ENSIPUG00000013174	polr1a	100	67.075	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.852	ENSSTOG00000012580	POLR1A	100	61.623	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	62.681	ENSJJAG00000013113	Polr1a	100	62.399	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	79.022	ENSKMAG00000007399	polr1a	100	79.022	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	78.140	ENSLBEG00000015401	polr1a	99	83.250	Labrus_bergylta
ENSACLG00000020541	polr1a	52	65.652	ENSLACG00000003218	polr1a	100	65.652	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000020541	polr1a	100	67.365	ENSLOCG00000010881	polr1a	100	67.093	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	62.413	ENSLAFG00000014948	POLR1A	100	62.811	Loxodonta_africana
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.600	ENSMFAG00000046097	POLR1A	100	62.212	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.600	ENSMMUG00000015815	POLR1A	100	62.212	Macaca_mulatta
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.600	ENSMNEG00000043313	POLR1A	100	62.212	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.335	ENSMLEG00000042428	POLR1A	100	61.924	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	80.036	ENSMAMG00000016565	polr1a	100	80.036	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	89.775	ENSMZEG00005004915	polr1a	100	89.775	Maylandia_zebra
ENSACLG00000020541	polr1a	99	59.536	ENSMGAG00000013111	POLR1A	99	59.467	Meleagris_gallopavo
ENSACLG00000020541	polr1a	91	62.564	ENSMAUG00000008497	Polr1a	98	62.308	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.987	ENSMICG00000000757	POLR1A	100	62.167	Microcebus_murinus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	62.145	ENSMOCG00000000122	Polr1a	100	61.930	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000020541	polr1a	100	78.125	ENSMMOG00000010216	polr1a	100	78.191	Mola_mola
ENSACLG00000020541	polr1a	100	58.324	ENSMODG00000009335	POLR1A	100	58.381	Monodelphis_domestica
ENSACLG00000020541	polr1a	100	79.794	ENSMALG00000013363	polr1a	100	80.473	Monopterus_albus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.775	MGP_CAROLIEiJ_G0028494	Polr1a	100	61.574	Mus_caroli
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.659	ENSMUSG00000049553	Polr1a	100	61.387	Mus_musculus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.525	MGP_PahariEiJ_G0022230	Polr1a	100	62.045	Mus_pahari
ENSACLG00000020541	polr1a	100	60.272	MGP_SPRETEiJ_G0029499	Polr1a	100	60.694	Mus_spretus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	62.059	ENSMPUG00000009135	POLR1A	100	62.587	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000020541	polr1a	100	62.190	ENSMLUG00000015723	POLR1A	100	62.651	Myotis_lucifugus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	62.572	ENSNGAG00000017907	Polr1a	100	62.486	Nannospalax_galili
ENSACLG00000020541	polr1a	100	89.561	ENSNBRG00000000519	polr1a	100	89.561	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000020541	polr1a	100	60.103	ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	60.436	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000020541	polr1a	76	81.102	ENSMEUG00000011665	-	75	81.102	Notamacropus_eugenii
ENSACLG00000020541	polr1a	99	57.295	ENSOPRG00000008269	POLR1A	95	72.340	Ochotona_princeps
ENSACLG00000020541	polr1a	100	62.536	ENSODEG00000003542	POLR1A	100	62.950	Octodon_degus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	87.222	ENSONIG00000015895	polr1a	100	87.691	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.866	ENSOCUG00000010138	POLR1A	100	62.965	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	76.523	ENSORLG00000008753	polr1a	99	76.937	Oryzias_latipes
ENSACLG00000020541	polr1a	100	74.867	ENSORLG00020020726	polr1a	99	75.044	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000020541	polr1a	100	75.699	ENSORLG00015016071	polr1a	99	75.638	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.783	ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	62.073	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.891	ENSOARG00000020601	POLR1A	100	63.179	Ovis_aries
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.609	ENSPPAG00000042450	POLR1A	100	61.982	Pan_paniscus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	62.001	ENSPPRG00000006702	POLR1A	100	62.819	Panthera_pardus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.556	ENSPTIG00000018783	POLR1A	100	62.370	Panthera_tigris_altaica
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.694	ENSPTRG00000012147	POLR1A	100	61.982	Pan_troglodytes
ENSACLG00000020541	polr1a	100	62.131	ENSPANG00000025908	POLR1A	100	62.154	Papio_anubis
ENSACLG00000020541	polr1a	100	68.209	ENSPKIG00000005468	polr1a	100	68.209	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000020541	polr1a	65	63.293	ENSPSIG00000009321	-	99	63.788	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000020541	polr1a	54	79.395	ENSPMGG00000009718	polr1a	95	79.399	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.973	ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	61.888	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000020541	polr1a	95	60.597	ENSPCIG00000004222	POLR1A	99	60.242	Phascolarctos_cinereus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	76.106	ENSPFOG00000005025	polr1a	100	76.824	Poecilia_formosa
ENSACLG00000020541	polr1a	100	76.578	ENSPLAG00000021389	polr1a	100	76.841	Poecilia_latipinna
ENSACLG00000020541	polr1a	100	74.617	ENSPMEG00000006463	polr1a	100	75.147	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000020541	polr1a	100	76.820	ENSPREG00000002389	polr1a	100	77.245	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.908	ENSPPYG00000012217	POLR1A	100	62.189	Pongo_abelii
ENSACLG00000020541	polr1a	94	52.448	ENSPCAG00000011582	POLR1A	95	53.042	Procavia_capensis
ENSACLG00000020541	polr1a	100	62.009	ENSPCOG00000026987	POLR1A	100	62.167	Propithecus_coquereli
ENSACLG00000020541	polr1a	93	63.596	ENSPVAG00000012674	POLR1A	95	63.932	Pteropus_vampyrus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	89.657	ENSPNYG00000000026	polr1a	100	89.657	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000020541	polr1a	100	68.682	ENSPNAG00000019223	polr1a	100	69.124	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000020541	polr1a	100	62.065	ENSRNOG00000009545	Polr1a	100	62.623	Rattus_norvegicus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.313	ENSRBIG00000028335	POLR1A	100	61.296	Rhinopithecus_bieti
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.313	ENSRROG00000031473	POLR1A	100	61.296	Rhinopithecus_roxellana
ENSACLG00000020541	polr1a	93	46.763	YOR341W	RPA190	87	46.763	Saccharomyces_cerevisiae
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.668	ENSSBOG00000030262	POLR1A	100	62.536	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACLG00000020541	polr1a	100	56.627	ENSSHAG00000014739	POLR1A	100	57.258	Sarcophilus_harrisii
ENSACLG00000020541	polr1a	100	67.340	ENSSFOG00015019716	polr1a	100	67.596	Scleropages_formosus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	80.630	ENSSMAG00000014342	polr1a	100	81.481	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	81.357	ENSSDUG00000014631	polr1a	100	81.593	Seriola_dumerili
ENSACLG00000020541	polr1a	100	79.537	ENSSLDG00000024095	polr1a	100	79.775	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000020541	polr1a	70	95.122	ENSSARG00000003136	-	71	95.122	Sorex_araneus
ENSACLG00000020541	polr1a	95	72.500	ENSSPUG00000004215	POLR1A	98	72.500	Sphenodon_punctatus
ENSACLG00000020541	polr1a	68	78.392	ENSSPAG00000016341	polr1a	99	78.392	Stegastes_partitus
ENSACLG00000020541	polr1a	82	63.015	ENSSSCG00000008226	POLR1A	99	62.911	Sus_scrofa
ENSACLG00000020541	polr1a	98	60.893	ENSTGUG00000010704	POLR1A	100	61.167	Taeniopygia_guttata
ENSACLG00000020541	polr1a	100	74.159	ENSTRUG00000002210	polr1a	99	74.159	Takifugu_rubripes
ENSACLG00000020541	polr1a	100	68.084	ENSTNIG00000010116	polr1a	100	68.026	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000020541	polr1a	70	82.743	ENSTBEG00000008646	POLR1A	70	82.743	Tupaia_belangeri
ENSACLG00000020541	polr1a	100	60.221	ENSTTRG00000008597	POLR1A	100	60.395	Tursiops_truncatus
ENSACLG00000020541	polr1a	71	64.671	ENSUAMG00000012158	-	94	65.821	Ursus_americanus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.902	ENSUMAG00000006700	POLR1A	100	62.181	Ursus_maritimus
ENSACLG00000020541	polr1a	100	62.529	ENSVVUG00000001245	POLR1A	100	62.703	Vulpes_vulpes
ENSACLG00000020541	polr1a	100	60.313	ENSXETG00000001952	polr1a	100	60.475	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000020541	polr1a	100	77.302	ENSXMAG00000004032	polr1a	100	77.685	Xiphophorus_maculatus