EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000020610 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2789 bases
Position: chr8:3063982-3066770
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000030426	zf-C2H2	PF00096.26	4e-66	1	11
ENSACLP00000030426	zf-C2H2	PF00096.26	4e-66	2	11
ENSACLP00000030426	zf-C2H2	PF00096.26	4e-66	3	11
ENSACLP00000030426	zf-C2H2	PF00096.26	4e-66	4	11
ENSACLP00000030426	zf-C2H2	PF00096.26	4e-66	5	11
ENSACLP00000030426	zf-C2H2	PF00096.26	4e-66	6	11
ENSACLP00000030426	zf-C2H2	PF00096.26	4e-66	7	11
ENSACLP00000030426	zf-C2H2	PF00096.26	4e-66	8	11
ENSACLP00000030426	zf-C2H2	PF00096.26	4e-66	9	11
ENSACLP00000030426	zf-C2H2	PF00096.26	4e-66	10	11
ENSACLP00000030426	zf-C2H2	PF00096.26	4e-66	11	11
ENSACLP00000030426	zf-met	PF12874.7	1.3e-32	1	5
ENSACLP00000030426	zf-met	PF12874.7	1.3e-32	2	5
ENSACLP00000030426	zf-met	PF12874.7	1.3e-32	3	5
ENSACLP00000030426	zf-met	PF12874.7	1.3e-32	4	5
ENSACLP00000030426	zf-met	PF12874.7	1.3e-32	5	5

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000031136	-	1647	-	ENSACLP00000030426	548 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000020610	-	66	44.957	ENSACLG00000019499	-	91	44.957
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ENSACLG00000020610	-	74	48.466	ENSACLG00000005708	-	73	48.466
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ENSACLG00000020610	-	65	48.857	ENSACLG00000000411	-	90	48.857
ENSACLG00000020610	-	75	50.154	ENSACLG00000015843	-	96	50.154
ENSACLG00000020610	-	65	55.422	ENSACLG00000019424	-	96	46.084
ENSACLG00000020610	-	70	49.020	ENSACLG00000014349	znf341	52	49.020
ENSACLG00000020610	-	66	44.079	ENSACLG00000000102	-	58	44.079
ENSACLG00000020610	-	66	50.000	ENSACLG00000003229	-	92	50.000
ENSACLG00000020610	-	88	47.706	ENSACLG00000006465	bcl6b	58	47.706
ENSACLG00000020610	-	66	41.558	ENSACLG00000015816	-	92	43.617
ENSACLG00000020610	-	61	50.000	ENSACLG00000011710	-	59	45.614
ENSACLG00000020610	-	97	50.794	ENSACLG00000011237	-	99	52.239
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ENSACLG00000020610	-	77	34.967	ENSACLG00000006697	-	79	36.774
ENSACLG00000020610	-	65	50.000	ENSACLG00000017849	-	75	50.000
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ENSACLG00000020610	-	72	58.730	ENSACLG00000021045	-	89	58.730
ENSACLG00000020610	-	66	40.659	ENSACLG00000022360	-	96	40.659
ENSACLG00000020610	-	88	50.909	ENSACLG00000005795	-	85	50.909
ENSACLG00000020610	-	74	45.062	ENSACLG00000019094	-	99	45.062
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ENSACLG00000020610	-	71	48.315	ENSACLG00000023941	-	88	48.315
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ENSACLG00000020610	-	94	49.558	ENSACLG00000017939	-	96	50.877
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ENSACLG00000020610	-	65	41.810	ENSACLG00000013454	-	64	41.810
ENSACLG00000020610	-	65	37.389	ENSACLG00000020579	znf319b	93	35.294
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ENSACLG00000020610	-	98	50.281	ENSACLG00000021343	-	99	50.281
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ENSACLG00000020610	-	74	45.192	ENSACLG00000017576	-	95	44.628
ENSACLG00000020610	-	73	53.571	ENSACLG00000024294	-	89	53.571
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