EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000020682 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2797 bases
Position: chr7:44159958-44162754
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000030528	RVT_1	PF00078.27	4.2e-38	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000031241	-	2797	-	ENSACLP00000030528	708 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000020682	-	56	53.250	ENSACLG00000005668	-	99	53.250
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ENSACLG00000020682	-	87	46.179	ENSACLG00000022810	-	87	45.691
ENSACLG00000020682	-	59	98.337	ENSACLG00000002804	-	99	98.337
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