EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000020849 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2187 bases
Position: chr19:9640289-9642475
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000030782	RVT_1	PF00078.27	6.9e-45	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000031498	-	2187	-	ENSACLP00000030782	657 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000020849	-	69	33.117	ENSACLG00000006688	-	98	33.117
ENSACLG00000020849	-	99	58.652	ENSACLG00000017200	-	63	58.652
ENSACLG00000020849	-	98	50.774	ENSACLG00000002312	-	64	50.774
ENSACLG00000020849	-	91	55.017	ENSACLG00000018778	-	59	55.017
ENSACLG00000020849	-	70	30.342	ENSACLG00000019420	-	93	30.769
ENSACLG00000020849	-	58	31.552	ENSACLG00000005746	-	88	31.552
ENSACLG00000020849	-	71	30.508	ENSACLG00000005158	-	52	30.508
ENSACLG00000020849	-	57	31.316	ENSACLG00000021354	-	100	31.316
ENSACLG00000020849	-	62	50.617	ENSACLG00000001102	-	53	50.617
ENSACLG00000020849	-	98	50.464	ENSACLG00000013374	-	75	50.464
ENSACLG00000020849	-	64	30.556	ENSACLG00000020601	-	98	31.019
ENSACLG00000020849	-	59	57.403	ENSACLG00000010907	-	98	57.403
ENSACLG00000020849	-	87	98.074	ENSACLG00000027127	-	77	98.074
ENSACLG00000020849	-	97	54.531	ENSACLG00000018002	-	75	54.531
ENSACLG00000020849	-	64	30.093	ENSACLG00000026769	-	98	30.556
ENSACLG00000020849	-	64	30.093	ENSACLG00000025562	-	98	30.556
ENSACLG00000020849	-	69	53.863	ENSACLG00000020009	-	77	53.863
ENSACLG00000020849	-	54	30.028	ENSACLG00000008024	-	97	30.028
ENSACLG00000020849	-	58	30.982	ENSACLG00000011058	-	80	30.982
ENSACLG00000020849	-	64	30.093	ENSACLG00000008572	-	98	30.556
ENSACLG00000020849	-	80	59.623	ENSACLG00000001773	-	70	59.623
ENSACLG00000020849	-	60	33.333	ENSACLG00000004613	-	95	33.333
ENSACLG00000020849	-	85	54.480	ENSACLG00000016956	-	99	54.480
ENSACLG00000020849	-	51	32.565	ENSACLG00000021583	-	83	32.565
ENSACLG00000020849	-	65	30.664	ENSACLG00000012094	-	88	30.664
ENSACLG00000020849	-	85	30.366	ENSACLG00000016231	-	97	30.366
ENSACLG00000020849	-	98	50.464	ENSACLG00000005489	-	96	50.464
ENSACLG00000020849	-	59	31.486	ENSACLG00000005642	-	66	31.486
ENSACLG00000020849	-	54	31.081	ENSACLG00000026286	-	97	31.081
ENSACLG00000020849	-	91	57.286	ENSACLG00000017241	-	99	57.286
ENSACLG00000020849	-	99	52.914	ENSACLG00000000579	-	99	52.914
ENSACLG00000020849	-	59	30.198	ENSACLG00000022277	-	97	30.198
ENSACLG00000020849	-	98	59.877	ENSACLG00000004427	-	80	59.877
ENSACLG00000020849	-	51	31.609	ENSACLG00000012279	-	53	31.609
ENSACLG00000020849	-	99	53.988	ENSACLG00000019498	-	92	53.988
ENSACLG00000020849	-	58	33.159	ENSACLG00000021422	-	96	33.159
ENSACLG00000020849	-	77	51.677	ENSACLG00000008551	-	92	51.677
ENSACLG00000020849	-	71	61.834	ENSACLG00000008558	-	99	61.834
ENSACLG00000020849	-	100	99.543	ENSACLG00000008988	-	71	99.543
ENSACLG00000020849	-	99	98.933	ENSACLG00000003707	-	79	98.933
ENSACLG00000020849	-	51	31.471	ENSACLG00000002725	-	92	31.471
ENSACLG00000020849	-	59	30.730	ENSACLG00000001035	-	96	30.730
ENSACLG00000020849	-	98	50.929	ENSACLG00000001858	-	90	50.929
ENSACLG00000020849	-	55	31.383	ENSACLG00000025851	-	94	31.383
ENSACLG00000020849	-	61	52.228	ENSACLG00000005509	-	89	52.228
ENSACLG00000020849	-	69	50.331	ENSACLG00000019219	-	100	50.331
ENSACLG00000020849	-	66	57.176	ENSACLG00000026433	-	97	57.176
ENSACLG00000020849	-	68	30.263	ENSACLG00000006327	-	91	30.252
ENSACLG00000020849	-	64	30.324	ENSACLG00000027855	-	98	30.787
ENSACLG00000020849	-	64	30.000	ENSACLG00000016639	-	94	30.465
ENSACLG00000020849	-	60	30.467	ENSACLG00000025525	-	99	30.467
ENSACLG00000020849	-	68	60.000	ENSACLG00000010366	-	99	60.000
ENSACLG00000020849	-	64	30.556	ENSACLG00000017363	-	98	30.556
ENSACLG00000020849	-	66	62.156	ENSACLG00000009848	-	99	62.156
ENSACLG00000020849	-	75	60.649	ENSACLG00000023590	-	99	60.649
ENSACLG00000020849	-	60	31.017	ENSACLG00000001556	-	85	31.017
ENSACLG00000020849	-	56	58.696	ENSACLG00000026307	-	100	58.696
ENSACLG00000020849	-	98	50.000	ENSACLG00000007954	-	96	50.000
ENSACLG00000020849	-	56	50.820	ENSACLG00000027508	-	80	50.820
ENSACLG00000020849	-	100	99.696	ENSACLG00000016551	-	65	99.696
ENSACLG00000020849	-	56	31.316	ENSACLG00000021775	-	96	31.316
ENSACLG00000020849	-	64	30.324	ENSACLG00000017093	-	98	30.787
ENSACLG00000020849	-	50	34.226	ENSACLG00000015324	-	86	34.226
ENSACLG00000020849	-	99	53.988	ENSACLG00000007650	-	63	53.988
ENSACLG00000020849	-	53	60.969	ENSACLG00000000505	-	99	60.969
ENSACLG00000020849	-	94	99.028	ENSACLG00000027577	-	100	99.028
ENSACLG00000020849	-	64	30.093	ENSACLG00000010080	-	98	30.556
ENSACLG00000020849	-	80	61.027	ENSACLG00000021942	-	77	61.027
ENSACLG00000020849	-	78	56.360	ENSACLG00000023788	-	99	56.360

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000020849	-	68	53.452	ENSAPEG00000014494	-	99	53.452	Amphiprion_percula
ENSACLG00000020849	-	77	36.452	ENSAMXG00000035582	-	99	36.452	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000020849	-	52	31.503	ENSCPBG00000006651	-	90	31.503	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000020849	-	66	31.066	ENSCPBG00000024353	-	84	31.066	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000020849	-	50	30.606	ENSCPBG00000002205	-	90	30.606	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000020849	-	58	30.729	ENSCPBG00000001408	-	87	30.729	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000020849	-	51	31.940	ENSCPBG00000001455	-	90	31.940	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000020849	-	54	30.978	ENSCPBG00000005177	-	92	30.978	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000020849	-	56	32.345	ENSCPBG00000004252	-	89	32.345	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000020849	-	66	30.090	ENSCPBG00000022715	-	94	30.090	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000020849	-	50	31.611	ENSGAGG00000000719	-	92	31.611	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000020849	-	54	33.240	ENSGAGG00000021454	-	83	33.240	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000020849	-	60	30.025	ENSGAGG00000022076	-	99	30.025	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000020849	-	66	30.485	ENSGAGG00000017706	-	90	30.485	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000020849	-	50	31.611	ENSGAGG00000015930	-	94	31.611	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000020849	-	60	31.218	ENSGAGG00000002004	-	85	31.218	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000020849	-	66	30.394	ENSGAGG00000017850	-	98	30.394	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000020849	-	50	30.395	ENSGAGG00000025522	-	94	30.395	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000020849	-	54	31.742	ENSGAGG00000006922	-	99	31.742	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000020849	-	60	31.218	ENSGAGG00000006259	-	83	31.218	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000020849	-	60	31.061	ENSGAGG00000010190	-	91	31.061	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000020849	-	50	31.307	ENSGAGG00000003617	-	93	31.307	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000020849	-	62	30.562	ENSGAGG00000022089	-	97	30.562	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000020849	-	58	55.381	ENSHBUG00000000067	-	99	55.381	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000020849	-	98	47.604	ENSKMAG00000004644	-	96	47.604	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020849	-	74	47.727	ENSKMAG00000011565	-	99	47.727	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020849	-	62	30.048	ENSKMAG00000020993	-	99	30.048	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020849	-	53	30.508	ENSKMAG00000018693	-	95	30.508	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000020849	-	84	61.691	ENSLBEG00000008627	-	99	61.691	Labrus_bergylta
ENSACLG00000020849	-	58	63.708	ENSLBEG00000007558	-	99	63.708	Labrus_bergylta
ENSACLG00000020849	-	77	61.782	ENSLBEG00000015802	-	70	61.782	Labrus_bergylta
ENSACLG00000020849	-	63	62.169	ENSLBEG00000009271	-	81	62.169	Labrus_bergylta
ENSACLG00000020849	-	60	31.343	ENSLBEG00000007826	-	99	31.343	Labrus_bergylta
ENSACLG00000020849	-	74	62.319	ENSLBEG00000003172	-	99	62.319	Labrus_bergylta
ENSACLG00000020849	-	99	60.863	ENSLBEG00000018374	-	98	60.863	Labrus_bergylta
ENSACLG00000020849	-	69	30.258	ENSLACG00000022410	-	89	30.258	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000020849	-	54	32.584	ENSLACG00000015198	-	61	32.584	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000020849	-	71	30.042	ENSLACG00000017681	-	87	30.042	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000020849	-	57	51.613	ENSMZEG00005027307	-	99	51.613	Maylandia_zebra
ENSACLG00000020849	-	70	99.565	ENSMZEG00005019302	-	100	99.565	Maylandia_zebra
ENSACLG00000020849	-	56	57.377	ENSMZEG00005018243	-	100	57.377	Maylandia_zebra
ENSACLG00000020849	-	64	99.523	ENSMZEG00005006492	-	100	99.523	Maylandia_zebra
ENSACLG00000020849	-	51	98.820	ENSMZEG00005022588	-	100	98.820	Maylandia_zebra
ENSACLG00000020849	-	100	99.543	ENSMZEG00005026189	-	100	99.543	Maylandia_zebra
ENSACLG00000020849	-	52	58.358	ENSMALG00000000456	-	92	58.358	Monopterus_albus
ENSACLG00000020849	-	99	56.154	ENSMALG00000020948	-	91	56.154	Monopterus_albus
ENSACLG00000020849	-	76	56.400	ENSMALG00000018635	-	100	56.800	Monopterus_albus
ENSACLG00000020849	-	58	56.053	ENSMALG00000014933	-	100	56.053	Monopterus_albus
ENSACLG00000020849	-	85	55.456	ENSMALG00000008286	-	99	55.456	Monopterus_albus
ENSACLG00000020849	-	54	54.342	ENSMALG00000006226	-	93	54.342	Monopterus_albus
ENSACLG00000020849	-	58	55.381	ENSMALG00000000369	-	99	55.381	Monopterus_albus
ENSACLG00000020849	-	85	56.172	ENSMALG00000007425	-	99	56.172	Monopterus_albus
ENSACLG00000020849	-	58	57.895	ENSMALG00000009771	-	99	57.895	Monopterus_albus
ENSACLG00000020849	-	85	55.993	ENSMALG00000018226	-	99	55.993	Monopterus_albus
ENSACLG00000020849	-	85	55.993	ENSMALG00000021030	-	99	55.993	Monopterus_albus
ENSACLG00000020849	-	56	32.609	ENSMALG00000009397	-	93	32.609	Monopterus_albus
ENSACLG00000020849	-	51	56.509	ENSMALG00000012850	-	99	56.509	Monopterus_albus
ENSACLG00000020849	-	78	56.699	ENSMALG00000003303	-	99	56.699	Monopterus_albus
ENSACLG00000020849	-	63	56.595	ENSMALG00000009608	-	93	56.595	Monopterus_albus
ENSACLG00000020849	-	84	55.957	ENSMALG00000007417	-	72	55.957	Monopterus_albus
ENSACLG00000020849	-	94	52.110	ENSONIG00000021263	-	81	52.110	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000020849	-	61	93.970	ENSONIG00000020746	-	72	93.970	Oreochromis_niloticus
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