EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000020864 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2403 bases
Position: chr3:40415644-40418046
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000030796	RVT_1	PF00078.27	9.1e-46	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000031513	-	2403	-	ENSACLP00000030796	800 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000020864	-	60	97.065	ENSACLG00000012219	-	100	97.065
ENSACLG00000020864	-	57	48.673	ENSACLG00000001556	-	95	48.673
ENSACLG00000020864	-	59	53.053	ENSACLG00000014537	-	99	53.053
ENSACLG00000020864	-	89	95.938	ENSACLG00000002614	-	100	95.938
ENSACLG00000020864	-	55	54.628	ENSACLG00000027855	-	99	54.628
ENSACLG00000020864	-	66	49.618	ENSACLG00000006327	-	100	49.618
ENSACLG00000020864	-	99	43.233	ENSACLG00000017412	-	83	43.233
ENSACLG00000020864	-	51	53.902	ENSACLG00000002680	-	99	53.902
ENSACLG00000020864	-	60	53.782	ENSACLG00000019420	-	94	53.895
ENSACLG00000020864	-	80	48.983	ENSACLG00000022841	-	81	48.983
ENSACLG00000020864	-	73	47.811	ENSACLG00000022169	-	97	47.811
ENSACLG00000020864	-	98	42.405	ENSACLG00000027511	-	67	42.532
ENSACLG00000020864	-	55	54.628	ENSACLG00000008572	-	99	54.628
ENSACLG00000020864	-	84	48.286	ENSACLG00000008571	-	99	48.286
ENSACLG00000020864	-	55	54.402	ENSACLG00000013944	-	99	54.402
ENSACLG00000020864	-	60	55.975	ENSACLG00000000230	-	100	55.975
ENSACLG00000020864	-	62	40.882	ENSACLG00000012279	-	78	40.882
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ENSACLG00000020864	-	84	48.584	ENSACLG00000020183	-	99	48.584
ENSACLG00000020864	-	52	96.643	ENSACLG00000021583	-	100	96.643
ENSACLG00000020864	-	99	45.466	ENSACLG00000012014	-	85	45.466
ENSACLG00000020864	-	95	44.094	ENSACLG00000020248	-	99	44.094
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ENSACLG00000020864	-	99	45.088	ENSACLG00000017448	-	93	45.088
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ENSACLG00000020864	-	84	48.137	ENSACLG00000001758	-	99	48.137
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ENSACLG00000020864	-	59	94.351	ENSACLG00000011058	-	100	94.351
ENSACLG00000020864	-	79	40.562	ENSACLG00000015331	-	78	40.562
ENSACLG00000020864	-	65	49.520	ENSACLG00000025957	-	97	49.520
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ENSACLG00000020864	-	67	46.828	ENSACLG00000015507	-	98	46.828
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ENSACLG00000020864	-	55	54.402	ENSACLG00000017093	-	99	54.402
ENSACLG00000020864	-	89	42.535	ENSACLG00000009807	-	97	42.997
ENSACLG00000020864	-	55	54.853	ENSACLG00000017363	-	99	54.853
ENSACLG00000020864	-	83	96.988	ENSACLG00000008859	-	98	96.988
ENSACLG00000020864	-	57	32.251	ENSACLG00000008558	-	95	32.251
ENSACLG00000020864	-	58	93.521	ENSACLG00000006014	-	100	93.521
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ENSACLG00000020864	-	99	42.040	ENSACLG00000003857	-	69	42.040
ENSACLG00000020864	-	82	42.944	ENSACLG00000018252	-	81	42.944
ENSACLG00000020864	-	81	48.615	ENSACLG00000014911	-	99	48.615
ENSACLG00000020864	-	81	48.690	ENSACLG00000014915	-	98	48.690
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ENSACLG00000020864	-	99	45.088	ENSACLG00000000393	-	85	45.088
ENSACLG00000020864	-	55	52.144	ENSACLG00000017402	-	94	52.144
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ENSACLG00000020864	-	53	50.000	ENSACLG00000004579	-	100	50.000
ENSACLG00000020864	-	68	47.059	ENSACLG00000009903	-	95	47.059
ENSACLG00000020864	-	85	45.324	ENSACLG00000014413	-	99	45.324
ENSACLG00000020864	-	55	54.402	ENSACLG00000004232	-	99	54.402
ENSACLG00000020864	-	55	51.467	ENSACLG00000018346	-	98	51.467

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000020864	-	99	47.945	ENSAOCG00000011105	-	98	48.010	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000020864	-	63	52.381	ENSAPEG00000014087	-	99	52.381	Amphiprion_percula
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