EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000021022 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3385 bases
Position: chr8:3213966-3217350
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000031030	zf-C2H2	PF00096.26	6.7e-16	1	3
ENSACLP00000031030	zf-C2H2	PF00096.26	6.7e-16	2	3
ENSACLP00000031030	zf-C2H2	PF00096.26	6.7e-16	3	3
ENSACLP00000031030	zf-met	PF12874.7	1.2e-05	1	2
ENSACLP00000031030	zf-met	PF12874.7	1.2e-05	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000031756	-	438	-	ENSACLP00000031030	145 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000021022	-	95	45.545	ENSACLG00000017939	-	93	50.000
ENSACLG00000021022	-	76	45.161	ENSACLG00000014365	-	90	45.361
ENSACLG00000021022	-	87	48.810	ENSACLG00000017849	-	61	48.810
ENSACLG00000021022	-	92	38.272	ENSACLG00000003679	-	92	38.272
ENSACLG00000021022	-	84	47.253	ENSACLG00000019318	-	95	49.451
ENSACLG00000021022	-	66	44.444	ENSACLG00000027053	gfi1b	51	44.444
ENSACLG00000021022	-	79	42.697	ENSACLG00000022497	-	90	42.697
ENSACLG00000021022	-	77	53.774	ENSACLG00000017487	-	62	53.774
ENSACLG00000021022	-	76	43.956	ENSACLG00000017996	prdm5	68	43.956
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ENSACLG00000021022	-	66	50.549	ENSACLG00000006718	-	53	50.549
ENSACLG00000021022	-	70	47.917	ENSACLG00000026538	-	80	47.917
ENSACLG00000021022	-	72	42.697	ENSACLG00000017329	-	81	42.697
ENSACLG00000021022	-	68	47.126	ENSACLG00000014176	-	86	47.126
ENSACLG00000021022	-	67	49.451	ENSACLG00000005795	-	59	49.451
ENSACLG00000021022	-	77	45.000	ENSACLG00000019349	-	71	45.000
ENSACLG00000021022	-	81	51.064	ENSACLG00000024308	-	97	54.945
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ENSACLG00000021022	-	72	48.958	ENSACLG00000023979	-	90	48.958
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ENSACLG00000021022	-	65	51.724	ENSACLG00000018707	-	93	51.724
ENSACLG00000021022	-	75	45.556	ENSACLG00000020579	znf319b	85	44.554
ENSACLG00000021022	-	72	43.243	ENSACLG00000014600	-	87	43.243
ENSACLG00000021022	-	66	42.697	ENSACLG00000001045	-	97	42.697
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ENSACLG00000021022	-	83	43.820	ENSACLG00000017336	-	92	43.820
ENSACLG00000021022	-	72	51.648	ENSACLG00000024957	-	90	51.648
ENSACLG00000021022	-	70	52.632	ENSACLG00000007888	-	75	46.154
ENSACLG00000021022	-	79	47.253	ENSACLG00000024459	-	82	47.959
ENSACLG00000021022	-	72	47.917	ENSACLG00000024294	-	77	47.917
ENSACLG00000021022	-	63	45.000	ENSACLG00000000521	-	70	45.000
ENSACLG00000021022	-	65	47.191	ENSACLG00000021846	-	86	47.191
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ENSACLG00000021022	-	65	50.588	ENSACLG00000003229	-	79	50.000
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ENSACLG00000021022	-	65	46.739	ENSACLG00000015816	-	92	46.739
ENSACLG00000021022	-	66	50.000	ENSACLG00000019094	-	75	50.000
ENSACLG00000021022	-	68	43.820	ENSACLG00000000537	-	97	42.697
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ENSACLG00000021022	-	70	44.565	ENSACLG00000019499	-	89	44.565
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ENSACLG00000021022	-	74	42.697	ENSACLG00000001003	-	81	42.697
ENSACLG00000021022	-	79	49.505	ENSACLG00000025251	-	94	50.000
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ENSACLG00000021022	-	88	42.391	ENSACLG00000013604	znf710b	50	42.391
ENSACLG00000021022	-	66	44.444	ENSACLG00000019291	-	82	44.444
ENSACLG00000021022	-	68	44.828	ENSACLG00000020474	-	83	44.828
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ENSACLG00000021022	-	87	43.011	ENSACLG00000006702	-	72	43.956
ENSACLG00000021022	-	70	52.222	ENSACLG00000021045	-	74	52.222
ENSACLG00000021022	-	72	48.315	ENSACLG00000015843	-	86	48.315
ENSACLG00000021022	-	87	45.833	ENSACLG00000020975	-	87	45.833
ENSACLG00000021022	-	70	44.681	ENSACLG00000027692	-	76	44.681
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ENSACLG00000021022	-	66	48.315	ENSACLG00000022439	-	66	48.315
ENSACLG00000021022	-	81	43.820	ENSACLG00000022383	-	95	42.391
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ENSACLG00000021022	-	65	44.706	ENSACLG00000022482	-	79	44.706
ENSACLG00000021022	-	71	43.820	ENSACLG00000006528	-	91	43.820
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ENSACLG00000021022	-	81	41.333	ENSACLG00000022287	-	66	41.333
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ENSACLG00000021022	-	66	47.917	ENSACLG00000023305	-	73	47.917
ENSACLG00000021022	-	69	49.315	ENSACLG00000018746	-	91	46.154
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ENSACLG00000021022	-	78	44.444	ENSACLG00000022305	-	88	44.444
ENSACLG00000021022	-	79	57.292	ENSACLG00000020393	-	94	57.292
ENSACLG00000021022	-	68	49.351	ENSACLG00000018700	-	96	49.351
ENSACLG00000021022	-	63	46.067	ENSACLG00000000411	-	89	46.067
ENSACLG00000021022	-	71	43.519	ENSACLG00000011710	-	62	43.519
ENSACLG00000021022	-	69	50.575	ENSACLG00000019424	-	82	50.575
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ENSACLG00000021022	-	93	46.429	ENSACLG00000021343	-	99	47.059
ENSACLG00000021022	-	63	46.835	ENSACLG00000019674	-	88	46.835
ENSACLG00000021022	-	68	45.833	ENSACLG00000006697	-	55	45.833
ENSACLG00000021022	-	86	41.758	ENSACLG00000019482	-	88	41.758
ENSACLG00000021022	-	66	42.697	ENSACLG00000003546	-	56	42.697
ENSACLG00000021022	-	84	44.944	ENSACLG00000000487	-	86	44.944
ENSACLG00000021022	-	68	42.222	ENSACLG00000001368	-	87	42.222
ENSACLG00000021022	-	68	40.426	ENSACLG00000021184	-	50	40.426
ENSACLG00000021022	-	77	47.126	ENSACLG00000019270	-	75	47.126
ENSACLG00000021022	-	71	36.264	ENSACLG00000001258	-	88	36.264
ENSACLG00000021022	-	81	51.765	ENSACLG00000011237	-	99	51.765
ENSACLG00000021022	-	72	42.222	ENSACLG00000008606	-	86	42.222
ENSACLG00000021022	-	65	48.315	ENSACLG00000023941	-	84	48.315

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000021022	-	69	48.913	ENSAPOG00000011470	-	63	48.913	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000021022	-	98	58.511	ENSAPOG00000005259	-	79	58.511	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000021022	-	75	51.136	ENSAPOG00000022174	-	95	51.136	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000021022	-	71	56.522	ENSAPOG00000021980	-	96	56.522	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000021022	-	82	56.250	ENSACIG00000023212	-	75	56.250	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000021022	-	80	55.208	ENSACIG00000009717	-	88	55.208	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000021022	-	68	51.111	ENSACIG00000001860	-	54	46.512	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000021022	-	86	58.586	ENSAOCG00000013978	-	88	58.511	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000021022	-	75	47.059	ENSAOCG00000007388	-	59	47.059	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000021022	-	69	48.684	ENSAPEG00000013048	-	56	47.368	Amphiprion_percula
ENSACLG00000021022	-	99	58.586	ENSAPEG00000012217	-	65	58.586	Amphiprion_percula
ENSACLG00000021022	-	90	49.451	ENSAPEG00000013550	-	99	49.451	Amphiprion_percula
ENSACLG00000021022	-	73	47.253	ENSACAG00000015141	-	87	47.253	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000021022	-	72	41.975	ENSAMXG00000029059	-	65	42.857	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000021022	-	72	44.792	ENSCSAVG00000006650	-	99	41.860	Ciona_savignyi
ENSACLG00000021022	-	85	45.556	ENSCSAVG00000000690	-	99	45.556	Ciona_savignyi
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ENSACLG00000021022	-	90	50.000	ENSOMEG00000019336	-	79	50.000	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000021022	-	88	54.217	ENSOMEG00000011566	-	87	54.217	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000021022	-	85	56.818	ENSOMEG00000019519	-	88	51.042	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000021022	-	72	56.250	ENSOMEG00000020870	-	97	56.250	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000021022	-	72	51.648	ENSOMEG00000006511	-	72	51.648	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000021022	-	88	51.724	ENSOMEG00000009816	-	99	52.778	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000021022	-	72	47.126	ENSPMGG00000001554	-	75	47.126	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000021022	-	69	46.512	ENSPMAG00000000401	-	87	46.512	Petromyzon_marinus
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ENSACLG00000021022	-	82	56.790	ENSPFOG00000006147	-	100	56.790	Poecilia_formosa
ENSACLG00000021022	-	72	52.041	ENSPFOG00000018774	-	87	52.041	Poecilia_formosa
ENSACLG00000021022	-	81	55.435	ENSPFOG00000001053	-	100	55.435	Poecilia_formosa
ENSACLG00000021022	-	82	48.958	ENSPFOG00000007333	-	78	48.958	Poecilia_formosa
ENSACLG00000021022	-	81	48.333	ENSPFOG00000021869	-	79	49.180	Poecilia_formosa
ENSACLG00000021022	-	87	52.083	ENSPLAG00000008529	-	99	51.111	Poecilia_latipinna
ENSACLG00000021022	-	83	50.562	ENSPLAG00000016372	-	96	50.562	Poecilia_latipinna
ENSACLG00000021022	-	70	53.061	ENSPMEG00000022687	-	72	53.061	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000021022	-	69	50.549	ENSPMEG00000001873	-	52	50.549	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000021022	-	81	51.020	ENSPMEG00000020833	-	82	51.020	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000021022	-	93	50.000	ENSPMEG00000022716	-	82	50.000	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000021022	-	78	52.128	ENSPMEG00000022667	-	85	52.128	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000021022	-	70	53.061	ENSPREG00000014366	-	99	53.061	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000021022	-	72	53.125	ENSPREG00000013780	-	97	51.042	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000021022	-	69	49.451	ENSPREG00000000467	-	52	49.451	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000021022	-	61	44.068	ENSPNYG00000010799	-	62	44.068	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000021022	-	72	47.887	ENSPNAG00000027916	-	73	47.887	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000021022	-	72	44.944	ENSSFOG00015021831	-	63	46.154	Scleropages_formosus
ENSACLG00000021022	-	69	51.163	ENSSDUG00000002488	-	56	48.913	Seriola_dumerili
ENSACLG00000021022	-	72	48.913	ENSSLDG00000015116	-	74	45.556	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000021022	-	86	48.454	ENSSPAG00000005690	-	63	48.454	Stegastes_partitus
ENSACLG00000021022	-	81	44.828	ENSTNIG00000019069	-	99	44.828	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000021022	-	70	52.041	ENSXCOG00000006951	-	79	52.041	Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000021022	-	66	51.648	ENSXCOG00000012458	-	60	51.648	Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000021022	-	70	49.383	ENSXCOG00000003493	-	61	50.667	Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000021022	-	70	45.161	ENSXCOG00000009768	-	75	45.161	Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000021022	-	83	47.917	ENSXCOG00000003530	-	77	47.917	Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000021022	-	71	53.846	ENSXMAG00000028978	-	71	53.846	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000021022	-	69	51.648	ENSXMAG00000029703	-	53	51.648	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000021022	-	68	48.529	ENSXMAG00000027362	-	96	48.529	Xiphophorus_maculatus