EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000021051 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2517 bases
Position: chr13:6862264-6864780
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000031058	RVT_1	PF00078.27	4.4e-42	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000031786	-	2517	-	ENSACLP00000031058	838 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000021051	-	66	39.410	ENSACLG00000005642	-	98	39.410
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ENSACLG00000021051	-	65	45.917	ENSACLG00000010664	-	99	45.917
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ENSACLG00000021051	-	60	47.211	ENSACLG00000008832	-	100	47.410
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ENSACLG00000021051	-	87	39.195	ENSACLG00000008383	-	89	39.195
ENSACLG00000021051	-	56	49.471	ENSACLG00000000230	-	99	49.471
ENSACLG00000021051	-	75	44.201	ENSACLG00000023557	-	98	43.790
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ENSACLG00000021051	-	63	44.015	ENSACLG00000017297	-	99	44.112
ENSACLG00000021051	-	99	42.222	ENSACLG00000023885	-	98	42.222
ENSACLG00000021051	-	99	41.044	ENSACLG00000025119	-	92	41.044
ENSACLG00000021051	-	78	30.781	ENSACLG00000006988	-	98	30.781
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ENSACLG00000021051	-	70	46.520	ENSACLG00000015659	-	99	46.520
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ENSACLG00000021051	-	100	52.324	ENSACLG00000017412	-	90	52.324
ENSACLG00000021051	-	99	41.400	ENSACLG00000009850	-	95	41.400
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ENSACLG00000021051	-	56	49.260	ENSACLG00000025009	-	99	49.260
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ENSACLG00000021051	-	80	46.142	ENSACLG00000014413	-	99	46.142
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ENSACLG00000021051	-	99	41.163	ENSACLG00000000393	-	92	41.163
ENSACLG00000021051	-	53	47.955	ENSACLG00000025562	-	99	47.955
ENSACLG00000021051	-	56	49.053	ENSACLG00000021937	-	99	49.053
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ENSACLG00000021051	-	77	42.923	ENSACLG00000014915	-	99	42.923
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ENSACLG00000021051	-	56	52.731	ENSACLG00000012219	-	99	52.731
ENSACLG00000021051	-	63	46.869	ENSACLG00000022853	-	98	46.869
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ENSACLG00000021051	-	79	43.049	ENSACLG00000008571	-	99	43.049
ENSACLG00000021051	-	99	41.281	ENSACLG00000010900	-	92	41.281

Orthologs

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ENSACLG00000021051	-	60	50.992	ENSATEG00000015931	-	99	50.992	Anabas_testudineus
ENSACLG00000021051	-	99	44.852	ENSATEG00000019512	-	97	44.852	Anabas_testudineus
ENSACLG00000021051	-	61	50.194	ENSATEG00000014607	-	99	50.194	Anabas_testudineus
ENSACLG00000021051	-	73	47.240	ENSATEG00000002739	-	99	47.240	Anabas_testudineus
ENSACLG00000021051	-	70	34.205	ENSATEG00000014055	-	78	34.205	Anabas_testudineus
ENSACLG00000021051	-	73	47.403	ENSATEG00000015490	-	99	47.403	Anabas_testudineus
ENSACLG00000021051	-	99	44.852	ENSATEG00000010674	-	97	44.852	Anabas_testudineus
ENSACLG00000021051	-	95	35.381	ENSATEG00000005707	-	97	35.635	Anabas_testudineus
ENSACLG00000021051	-	74	36.535	ENSATEG00000023197	-	98	36.867	Anabas_testudineus
ENSACLG00000021051	-	99	35.756	ENSATEG00000012907	-	86	36.000	Anabas_testudineus
ENSACLG00000021051	-	51	37.528	ENSAMXG00000035505	-	91	37.528	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000021051	-	78	42.319	ENSAMXG00000032588	-	99	42.018	Astyanax_mexicanus
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