EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000021595 (Gene tree)
Gene ID: 113009213
Gene Symbol: prpf38a
Alias: fa04h11|fc83e08|wu:fa04h11|wu:fc83e08|zgc:92059
Full Name: pre-mRNA processing factor 38A
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10119 bases
Position: chr17:4225372-4235490
Accession: 113009213
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000031848	PRP38	PF03371.15	3.7e-62	1	1
ENSACLP00000031839	PRP38	PF03371.15	4e-62	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000032583	-	3050	-	ENSACLP00000031839	309 (aa)	XP_026003188	UPI0003296E3D
ENSACLT00000032592	-	1749	-	ENSACLP00000031848	300 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSG00000134748	PRPF38A	71	86.425	Homo_sapiens
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	97.087	ENSAPOG00000011652	prpf38a	100	97.087	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSAMEG00000009319	PRPF38A	71	86.425	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	93.528	ENSACIG00000012292	prpf38a	72	93.665	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	97.087	ENSAOCG00000018004	prpf38a	100	97.087	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	97.087	ENSAPEG00000021414	prpf38a	100	97.087	Amphiprion_percula
ENSACLG00000021595	prpf38a	74	93.665	ENSATEG00000004608	prpf38a	72	93.665	Anabas_testudineus
ENSACLG00000021595	prpf38a	79	77.016	ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	83.974	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.831	ENSACAG00000008249	PRPF38A	71	87.330	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	56.311	ENSANAG00000029204	-	70	55.111	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSANAG00000027839	PRPF38A	71	86.425	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	84.345	ENSAMXG00000029274	prpf38a	71	93.665	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSBTAG00000002720	PRPF38A	75	86.425	Bos_taurus
ENSACLG00000021595	prpf38a	65	63.077	WBGene00008380	prp-38	59	64.894	Caenorhabditis_elegans
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSCJAG00000021594	PRPF38A	74	86.425	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSCAFG00000003740	PRPF38A	71	86.425	Canis_familiaris
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSCAFG00020010939	PRPF38A	71	86.425	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSCHIG00000024730	PRPF38A	71	86.425	Capra_hircus
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSTSYG00000009868	-	71	86.425	Carlito_syrichta
ENSACLG00000021595	prpf38a	86	76.296	ENSTSYG00000031994	-	63	82.584	Carlito_syrichta
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	81.672	ENSCPOG00000005079	PRPF38A	71	86.425	Cavia_porcellus
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	77.885	ENSCCAG00000026502	PRPF38A	71	86.425	Cebus_capucinus
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSCATG00000032296	PRPF38A	71	86.425	Cercocebus_atys
ENSACLG00000021595	prpf38a	93	53.287	ENSCATG00000044190	-	57	55.319	Cercocebus_atys
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSCLAG00000005816	PRPF38A	71	86.425	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.511	ENSCPBG00000014791	PRPF38A	71	86.878	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000021595	prpf38a	77	69.658	ENSCSAVG00000009580	-	71	71.889	Ciona_savignyi
ENSACLG00000021595	prpf38a	77	85.714	ENSCANG00000032608	PRPF38A	74	86.425	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	64.333	ENSCGRG00001002557	-	74	72.851	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSCGRG00001018502	-	71	86.425	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSCGRG00000014868	Prpf38a	71	86.425	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000021595	prpf38a	74	93.694	ENSCSEG00000001269	prpf38a	76	93.694	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000021595	prpf38a	74	94.118	ENSCVAG00000012305	prpf38a	72	94.118	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	83.706	ENSDARG00000039213	prpf38a	71	91.855	Danio_rerio
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSDNOG00000042326	PRPF38A	72	86.425	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000021595	prpf38a	85	95.833	ENSDORG00000023857	-	64	95.833	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000021595	prpf38a	84	72.624	ENSDORG00000025371	-	75	78.899	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000021595	prpf38a	84	72.624	ENSDORG00000023691	-	75	78.899	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000021595	prpf38a	94	55.137	FBgn0050342	Prp38	57	72.872	Drosophila_melanogaster
ENSACLG00000021595	prpf38a	79	79.498	ENSEBUG00000012588	prpf38a	71	79.372	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSEASG00005014427	PRPF38A	71	86.425	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSECAG00000022628	PRPF38A	71	86.425	Equus_caballus
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	94.822	ENSELUG00000021094	prpf38a	100	94.822	Esox_lucius
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSFCAG00000002518	PRPF38A	71	86.425	Felis_catus
ENSACLG00000021595	prpf38a	99	75.484	ENSFALG00000003612	-	73	83.028	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000021595	prpf38a	87	78.676	ENSFALG00000005598	-	66	85.556	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	81.350	ENSFDAG00000011287	PRPF38A	72	86.425	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000021595	prpf38a	90	82.437	ENSFHEG00000014317	prpf38a	75	93.665	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000021595	prpf38a	55	96.988	ENSGMOG00000011384	prpf38a	54	96.988	Gadus_morhua
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	81.150	ENSGALG00000010627	PRPF38A	71	87.783	Gallus_gallus
ENSACLG00000021595	prpf38a	74	94.118	ENSGAFG00000012422	prpf38a	72	94.118	Gambusia_affinis
ENSACLG00000021595	prpf38a	54	92.353	ENSGACG00000000182	-	100	92.353	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000021595	prpf38a	74	93.722	ENSGACG00000005423	prpf38a	100	94.534	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.511	ENSGAGG00000020547	PRPF38A	71	86.878	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSGGOG00000003940	PRPF38A	71	86.425	Gorilla_gorilla
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ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSHGLG00100008935	PRPF38A	71	86.425	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	73.770	ENSHGLG00100003928	-	71	74.208	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000021595	prpf38a	61	93.956	ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	94.149	Hippocampus_comes
ENSACLG00000021595	prpf38a	90	78.445	ENSIPUG00000005757	prpf38a	71	90.090	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSSTOG00000015610	PRPF38A	71	86.425	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	79.872	ENSJJAG00000015811	Prpf38a	71	85.973	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000021595	prpf38a	74	94.118	ENSKMAG00000006588	prpf38a	72	94.118	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	94.498	ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	94.498	Labrus_bergylta
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	81.470	ENSLACG00000011495	PRPF38A	71	87.330	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	90.968	ENSLOCG00000006262	prpf38a	72	88.739	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSLAFG00000025862	PRPF38A	71	86.425	Loxodonta_africana
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSMFAG00000039449	PRPF38A	74	86.425	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000021595	prpf38a	87	77.206	ENSMMUG00000014333	PRPF38A	65	82.873	Macaca_mulatta
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSMNEG00000031221	PRPF38A	71	86.425	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000021595	prpf38a	93	52.595	ENSMNEG00000040242	-	65	57.005	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSMLEG00000041105	PRPF38A	71	86.425	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	97.087	ENSMAMG00000015431	prpf38a	100	97.087	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	100.000	ENSMZEG00005017838	prpf38a	100	100.000	Maylandia_zebra
ENSACLG00000021595	prpf38a	77	87.013	ENSMGAG00000011176	PRPF38A	74	87.783	Meleagris_gallopavo
ENSACLG00000021595	prpf38a	85	81.061	ENSMAUG00000018029	-	84	81.900	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSMICG00000014193	PRPF38A	71	86.425	Microcebus_murinus
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSMOCG00000013080	Prpf38a	71	86.425	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	88.424	ENSMMOG00000016972	prpf38a	78	94.570	Mola_mola
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	78.662	ENSMODG00000000644	PRPF38A	71	84.234	Monodelphis_domestica
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	96.440	ENSMALG00000019363	prpf38a	97	96.440	Monopterus_albus
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	79.872	MGP_CAROLIEiJ_G0026269	Prpf38a	71	85.973	Mus_caroli
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ENSACLG00000021595	prpf38a	100	79.872	MGP_PahariEiJ_G0028602	Prpf38a	71	85.973	Mus_pahari
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	79.553	MGP_SPRETEiJ_G0027238	Prpf38a	93	90.426	Mus_spretus
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSMPUG00000006896	PRPF38A	71	86.425	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	81.994	ENSNGAG00000011884	Prpf38a	72	86.425	Nannospalax_galili
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	97.735	ENSNBRG00000004013	prpf38a	98	97.735	Neolamprologus_brichardi
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ENSACLG00000021595	prpf38a	97	61.513	ENSNLEG00000012592	-	67	57.014	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000021595	prpf38a	93	78.966	ENSNLEG00000017999	PRPF38A	63	85.354	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	77.636	ENSMEUG00000003860	PRPF38A	71	82.805	Notamacropus_eugenii
ENSACLG00000021595	prpf38a	76	85.965	ENSOPRG00000008985	PRPF38A	92	86.425	Ochotona_princeps
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSODEG00000005869	PRPF38A	71	86.425	Octodon_degus
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	99.029	ENSONIG00000007816	prpf38a	100	99.029	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000021595	prpf38a	77	44.206	ENSOANG00000009541	-	71	42.857	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSOCUG00000000963	PRPF38A	71	86.425	Oryctolagus_cuniculus
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ENSACLG00000021595	prpf38a	99	93.506	ENSORLG00015021393	prpf38a	75	92.308	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000021595	prpf38a	100	93.851	ENSOMEG00000016333	prpf38a	72	93.213	Oryzias_melastigma
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ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.192	ENSOARG00000005373	PRPF38A	71	86.425	Ovis_aries
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