EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000021846 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5392 bases
Position: chr3:41293590-41298981
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000032211	zf-C2H2	PF00096.26	3.7e-54	1	10
ENSACLP00000032211	zf-C2H2	PF00096.26	3.7e-54	2	10
ENSACLP00000032211	zf-C2H2	PF00096.26	3.7e-54	3	10
ENSACLP00000032211	zf-C2H2	PF00096.26	3.7e-54	4	10
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ENSACLP00000032211	zf-C2H2	PF00096.26	3.7e-54	9	10
ENSACLP00000032211	zf-C2H2	PF00096.26	3.7e-54	10	10
ENSACLP00000032211	zf-met	PF12874.7	5.8e-06	1	2
ENSACLP00000032211	zf-met	PF12874.7	5.8e-06	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000032973	-	1248	-	ENSACLP00000032211	415 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000021846	-	86	56.250	ENSACLG00000019482	-	77	56.250
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ENSACLG00000021846	-	87	48.684	ENSACLG00000022305	-	89	48.684
ENSACLG00000021846	-	86	49.296	ENSACLG00000021045	-	94	41.000
ENSACLG00000021846	-	86	63.390	ENSACLG00000014365	-	96	60.759
ENSACLG00000021846	-	90	40.127	ENSACLG00000013604	znf710b	54	40.127
ENSACLG00000021846	-	86	58.952	ENSACLG00000022482	-	81	58.952
ENSACLG00000021846	-	86	51.389	ENSACLG00000005795	-	61	51.389
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ENSACLG00000021846	-	85	48.864	ENSACLG00000019424	-	98	37.500
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ENSACLG00000021846	-	86	41.981	ENSACLG00000026538	-	83	41.981
ENSACLG00000021846	-	85	46.789	ENSACLG00000018746	-	97	36.685
ENSACLG00000021846	-	85	44.681	ENSACLG00000020474	-	82	44.681
ENSACLG00000021846	-	85	34.921	ENSACLG00000014349	znf341	58	34.921
ENSACLG00000021846	-	85	49.744	ENSACLG00000024294	-	81	49.744
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ENSACLG00000021846	-	86	50.218	ENSACLG00000008821	-	98	50.218
ENSACLG00000021846	-	89	52.083	ENSACLG00000015989	-	91	52.083
ENSACLG00000021846	-	86	54.648	ENSACLG00000000411	-	89	54.648
ENSACLG00000021846	-	87	41.975	ENSACLG00000001418	znf652	51	41.975
ENSACLG00000021846	-	86	39.935	ENSACLG00000000102	-	63	39.935
ENSACLG00000021846	-	86	40.563	ENSACLG00000022505	-	86	41.417
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ENSACLG00000021846	-	86	38.849	ENSACLG00000026187	-	58	38.849
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ENSACLG00000021846	-	89	45.609	ENSSSCG00000038009	-	94	45.609	Sus_scrofa
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ENSACLG00000021846	-	89	46.250	ENSVVUG00000002015	-	94	44.225	Vulpes_vulpes
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ENSACLG00000021846	-	78	43.590	ENSXETG00000010512	-	99	36.467	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000021846	-	89	42.778	ENSXETG00000030307	-	100	42.778	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000021846	-	86	41.401	ENSXMAG00000000617	-	77	41.401	Xiphophorus_maculatus