EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000022051 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1155 bases
Position: chr6:10709784-10710938
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000032516	RVT_1	PF00078.27	2.5e-31	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000033281	-	1155	-	ENSACLP00000032516	384 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000022051	-	100	52.332	ENSACLG00000024568	-	90	52.332
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ENSACLG00000022051	-	100	54.427	ENSACLG00000025562	-	86	54.427
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ENSACLG00000022051	-	100	51.562	ENSPKIG00000003826	-	64	51.562	Paramormyrops_kingsleyae
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ENSACLG00000022051	-	100	51.302	ENSPREG00000020670	-	84	51.302	Poecilia_reticulata
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ENSACLG00000022051	-	100	97.656	ENSPNYG00000023943	-	100	97.656	Pundamilia_nyererei
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ENSACLG00000022051	-	72	75.451	ENSSMAG00000016680	-	59	75.451	Scophthalmus_maximus
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ENSACLG00000022051	-	100	52.344	ENSSDUG00000012909	-	62	52.344	Seriola_dumerili
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ENSACLG00000022051	-	99	41.732	ENSSPUG00000004689	-	70	41.732	Sphenodon_punctatus
ENSACLG00000022051	-	80	48.220	ENSSPAG00000005749	-	99	48.220	Stegastes_partitus
ENSACLG00000022051	-	91	79.083	ENSSPAG00000005778	-	99	79.083	Stegastes_partitus
ENSACLG00000022051	-	70	73.408	ENSTRUG00000024564	-	60	73.408	Takifugu_rubripes
ENSACLG00000022051	-	58	67.857	ENSTRUG00000020404	-	89	67.857	Takifugu_rubripes
ENSACLG00000022051	-	100	52.083	ENSXMAG00000028039	-	55	52.083	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000022051	-	86	50.303	ENSXMAG00000021176	-	99	50.303	Xiphophorus_maculatus