EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000022094 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3093 bases
Position: chr8:3868339-3871431
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000032574	RVT_1	PF00078.27	4.4e-29	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000033340	-	3093	-	ENSACLP00000032574	1030 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000022094	-	74	39.753	ENSACLG00000017161	-	51	39.753
ENSACLG00000022094	-	61	32.308	ENSACLG00000001563	-	63	31.985
ENSACLG00000022094	-	70	35.011	ENSACLG00000013669	-	50	35.011
ENSACLG00000022094	-	66	33.913	ENSACLG00000019989	-	76	33.527
ENSACLG00000022094	-	75	34.043	ENSACLG00000027730	-	68	34.043
ENSACLG00000022094	-	64	34.890	ENSACLG00000000373	-	59	34.890
ENSACLG00000022094	-	75	57.997	ENSACLG00000025657	-	87	57.997
ENSACLG00000022094	-	74	40.291	ENSACLG00000024091	-	51	40.291
ENSACLG00000022094	-	74	35.452	ENSACLG00000026879	-	51	35.452
ENSACLG00000022094	-	72	33.790	ENSACLG00000020048	-	52	33.790
ENSACLG00000022094	-	70	37.383	ENSACLG00000025904	-	51	36.986
ENSACLG00000022094	-	58	34.979	ENSACLG00000000367	-	67	34.979
ENSACLG00000022094	-	74	40.534	ENSACLG00000025719	-	51	40.534
ENSACLG00000022094	-	63	35.459	ENSACLG00000008862	-	88	35.459
ENSACLG00000022094	-	65	32.800	ENSACLG00000001267	-	61	32.800
ENSACLG00000022094	-	72	36.259	ENSACLG00000021770	-	52	36.259
ENSACLG00000022094	-	53	30.603	ENSACLG00000014439	-	92	30.603
ENSACLG00000022094	-	71	35.225	ENSACLG00000008010	-	67	35.225
ENSACLG00000022094	-	70	38.372	ENSACLG00000001282	-	51	38.372
ENSACLG00000022094	-	75	35.934	ENSACLG00000014619	-	53	35.934
ENSACLG00000022094	-	64	34.890	ENSACLG00000012657	-	59	34.890
ENSACLG00000022094	-	62	32.515	ENSACLG00000021355	-	80	32.515
ENSACLG00000022094	-	73	33.857	ENSACLG00000001555	-	50	33.857
ENSACLG00000022094	-	79	30.068	ENSACLG00000027627	-	64	38.588
ENSACLG00000022094	-	73	39.310	ENSACLG00000014688	-	65	39.310
ENSACLG00000022094	-	80	31.900	ENSACLG00000016581	-	79	33.516
ENSACLG00000022094	-	70	38.732	ENSACLG00000013455	-	51	38.732
ENSACLG00000022094	-	67	31.800	ENSACLG00000027633	-	63	31.200
ENSACLG00000022094	-	71	33.708	ENSACLG00000013171	-	51	33.933
ENSACLG00000022094	-	63	32.194	ENSACLG00000013905	-	78	32.479
ENSACLG00000022094	-	76	35.934	ENSACLG00000018181	-	82	35.934
ENSACLG00000022094	-	71	39.091	ENSACLG00000005531	-	55	39.091
ENSACLG00000022094	-	75	35.934	ENSACLG00000019876	-	53	35.934
ENSACLG00000022094	-	76	36.817	ENSACLG00000002180	-	51	36.817
ENSACLG00000022094	-	74	34.483	ENSACLG00000002182	-	56	34.483
ENSACLG00000022094	-	74	34.483	ENSACLG00000019658	-	56	34.483
ENSACLG00000022094	-	68	39.655	ENSACLG00000007343	-	86	39.655
ENSACLG00000022094	-	99	55.263	ENSACLG00000017671	-	90	54.845
ENSACLG00000022094	-	74	40.049	ENSACLG00000009628	-	51	40.049
ENSACLG00000022094	-	71	34.222	ENSACLG00000018454	-	66	34.222
ENSACLG00000022094	-	59	36.032	ENSACLG00000004062	-	81	36.032
ENSACLG00000022094	-	58	36.028	ENSACLG00000018344	-	51	36.028
ENSACLG00000022094	-	60	34.943	ENSACLG00000024387	-	53	34.943
ENSACLG00000022094	-	74	35.174	ENSACLG00000016624	-	57	35.246
ENSACLG00000022094	-	67	31.800	ENSACLG00000002872	-	54	31.200
ENSACLG00000022094	-	72	36.543	ENSACLG00000004344	-	51	36.543
ENSACLG00000022094	-	64	36.018	ENSACLG00000010542	-	53	35.421
ENSACLG00000022094	-	67	39.525	ENSACLG00000003852	-	50	39.525
ENSACLG00000022094	-	61	30.476	ENSACLG00000017258	-	63	30.476
ENSACLG00000022094	-	99	98.728	ENSACLG00000008738	-	91	98.728
ENSACLG00000022094	-	72	36.245	ENSACLG00000000384	-	57	32.668
ENSACLG00000022094	-	74	35.174	ENSACLG00000009118	-	57	35.246
ENSACLG00000022094	-	76	35.729	ENSACLG00000013947	-	75	35.729
ENSACLG00000022094	-	72	56.563	ENSACLG00000001434	-	86	56.563
ENSACLG00000022094	-	70	35.469	ENSACLG00000021546	-	50	35.469
ENSACLG00000022094	-	70	38.732	ENSACLG00000003361	-	51	38.732
ENSACLG00000022094	-	67	37.947	ENSACLG00000015880	-	54	37.947
ENSACLG00000022094	-	67	31.800	ENSACLG00000018325	-	54	31.200

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000022094	-	91	56.688	ENSATEG00000007261	-	92	56.688	Anabas_testudineus
ENSACLG00000022094	-	91	56.777	ENSATEG00000021232	-	92	56.777	Anabas_testudineus
ENSACLG00000022094	-	98	56.535	ENSATEG00000018457	-	92	56.535	Anabas_testudineus
ENSACLG00000022094	-	76	41.268	ENSACAG00000028286	-	98	40.992	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000022094	-	77	40.828	ENSACAG00000029095	-	90	40.909	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000022094	-	67	39.751	ENSACAG00000028272	-	100	39.751	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000022094	-	70	38.482	ENSACAG00000029570	-	58	38.351	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000022094	-	77	41.065	ENSACAG00000029679	-	93	40.909	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000022094	-	79	53.752	ENSAMXG00000037157	-	93	53.752	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000022094	-	99	51.320	ENSAMXG00000040104	-	61	51.365	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000022094	-	76	50.442	ENSAMXG00000038310	-	87	50.442	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000022094	-	86	51.451	ENSAMXG00000031305	-	91	51.451	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000022094	-	98	50.397	ENSAMXG00000033138	-	70	49.951	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000022094	-	61	57.661	ENSAMXG00000033786	-	92	57.661	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000022094	-	99	51.613	ENSAMXG00000042521	-	80	51.613	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000022094	-	98	52.020	ENSAMXG00000036523	-	61	51.906	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000022094	-	98	52.709	ENSAMXG00000040149	-	65	52.590	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000022094	-	97	53.884	ENSAMXG00000040695	-	71	53.353	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000022094	-	82	57.412	ENSCVAG00000020653	-	96	57.412	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000022094	-	79	55.394	ENSDARG00000101547	CR354395.1	92	55.394	Danio_rerio
ENSACLG00000022094	-	98	50.831	ENSDARG00000116832	CR749164.1	69	50.438	Danio_rerio
ENSACLG00000022094	-	92	55.556	ENSDARG00000086495	BX546500.1	69	56.077	Danio_rerio
ENSACLG00000022094	-	98	53.360	ENSDARG00000112601	FO704673.1	71	53.223	Danio_rerio
ENSACLG00000022094	-	98	58.243	ENSDARG00000114583	BX890543.1	72	57.895	Danio_rerio
ENSACLG00000022094	-	99	56.012	ENSDARG00000116402	CR925755.2	73	56.012	Danio_rerio
ENSACLG00000022094	-	99	56.305	ENSDARG00000113678	BX511082.1	71	56.305	Danio_rerio
ENSACLG00000022094	-	99	55.914	ENSDARG00000113243	BX511224.1	71	55.914	Danio_rerio
ENSACLG00000022094	-	98	54.689	ENSDARG00000099359	CR855320.1	70	54.788	Danio_rerio
ENSACLG00000022094	-	84	54.713	ENSFHEG00000015797	-	69	54.713	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000022094	-	91	55.426	ENSGAFG00000020459	-	97	55.426	Gambusia_affinis
ENSACLG00000022094	-	99	54.661	ENSGAFG00000015891	-	72	54.661	Gambusia_affinis
ENSACLG00000022094	-	97	56.902	ENSKMAG00000021870	-	73	56.556	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000022094	-	99	55.034	ENSKMAG00000006793	-	73	55.034	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000022094	-	77	51.259	ENSKMAG00000010098	-	91	51.259	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000022094	-	77	54.282	ENSKMAG00000012888	-	65	54.282	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000022094	-	82	52.906	ENSKMAG00000010001	-	64	52.906	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000022094	-	91	53.518	ENSKMAG00000000229	-	98	53.529	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000022094	-	90	54.662	ENSKMAG00000017146	-	90	54.662	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000022094	-	98	56.016	ENSORLG00000024912	-	91	56.055	Oryzias_latipes
ENSACLG00000022094	-	92	55.333	ENSORLG00000023596	-	89	55.342	Oryzias_latipes
ENSACLG00000022094	-	99	54.086	ENSORLG00000025916	-	70	54.086	Oryzias_latipes
ENSACLG00000022094	-	93	54.697	ENSORLG00000027596	-	86	55.069	Oryzias_latipes
ENSACLG00000022094	-	98	54.429	ENSORLG00000030034	-	70	54.483	Oryzias_latipes
ENSACLG00000022094	-	98	56.035	ENSORLG00000024848	-	90	56.074	Oryzias_latipes
ENSACLG00000022094	-	99	56.323	ENSORLG00000024098	-	72	56.323	Oryzias_latipes
ENSACLG00000022094	-	99	54.785	ENSORLG00000028742	-	91	54.883	Oryzias_latipes
ENSACLG00000022094	-	99	56.226	ENSORLG00000030124	-	72	56.226	Oryzias_latipes
ENSACLG00000022094	-	98	55.775	ENSORLG00000023407	-	89	55.620	Oryzias_latipes
ENSACLG00000022094	-	77	55.155	ENSORLG00000029044	-	62	55.155	Oryzias_latipes
ENSACLG00000022094	-	98	54.158	ENSORLG00000027877	-	90	54.158	Oryzias_latipes
ENSACLG00000022094	-	98	55.413	ENSORLG00000023643	-	69	55.437	Oryzias_latipes
ENSACLG00000022094	-	78	54.613	ENSORLG00000026506	-	65	54.590	Oryzias_latipes
ENSACLG00000022094	-	98	55.906	ENSORLG00000029259	-	88	55.652	Oryzias_latipes
ENSACLG00000022094	-	98	54.483	ENSORLG00000022229	-	71	54.537	Oryzias_latipes
ENSACLG00000022094	-	98	53.998	ENSORLG00000022696	-	70	54.057	Oryzias_latipes
ENSACLG00000022094	-	98	55.380	ENSORLG00000025100	-	91	55.380	Oryzias_latipes
ENSACLG00000022094	-	89	53.050	ENSORLG00000025105	-	89	53.050	Oryzias_latipes
ENSACLG00000022094	-	98	55.523	ENSORLG00000025108	-	70	55.373	Oryzias_latipes
ENSACLG00000022094	-	99	54.350	ENSORLG00000022515	-	71	54.350	Oryzias_latipes
ENSACLG00000022094	-	99	55.577	ENSORLG00000024925	-	99	55.534	Oryzias_latipes
ENSACLG00000022094	-	85	54.100	ENSORLG00000027499	-	68	54.100	Oryzias_latipes
ENSACLG00000022094	-	99	56.226	ENSORLG00000026965	-	72	56.226	Oryzias_latipes
ENSACLG00000022094	-	86	53.483	ENSORLG00000024316	-	88	53.483	Oryzias_latipes
ENSACLG00000022094	-	93	57.203	ENSORLG00000027753	-	99	57.231	Oryzias_latipes
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ENSACLG00000022094	-	98	55.556	ENSORLG00000030436	-	91	55.309	Oryzias_latipes
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