EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000022219 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1137 bases
Position: chr17:4946856-4947992
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000032757	RVT_1	PF00078.27	9.8e-30	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000033527	-	1137	-	ENSACLP00000032757	378 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000022219	-	84	50.157	ENSACLG00000003937	-	79	50.157
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ENSACLG00000022219	-	71	74.815	ENSSMAG00000016680	-	58	74.815	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000022219	-	79	53.691	ENSSDUG00000021566	-	89	51.940	Seriola_dumerili
ENSACLG00000022219	-	79	53.691	ENSSDUG00000012909	-	53	51.940	Seriola_dumerili
ENSACLG00000022219	-	90	42.522	ENSSPUG00000004689	-	62	42.522	Sphenodon_punctatus
ENSACLG00000022219	-	77	48.123	ENSSPAG00000005749	-	98	47.097	Stegastes_partitus
ENSACLG00000022219	-	85	75.389	ENSSPAG00000005778	-	91	75.389	Stegastes_partitus
ENSACLG00000022219	-	58	66.063	ENSTRUG00000020404	-	88	66.063	Takifugu_rubripes
ENSACLG00000022219	-	69	71.264	ENSTRUG00000024564	-	58	71.264	Takifugu_rubripes
ENSACLG00000022219	-	69	51.154	ENSXMAG00000021176	-	85	50.709	Xiphophorus_maculatus