EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000022280 (Gene tree)
Gene ID: 113015098
Gene Symbol: twistnb
Alias: -
Full Name: TWIST neighbor
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5845 bases
Position: chr22:18903209-18909053
Accession: ZDB-GENE-041007-3
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000032854	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	4.5e-09	1	1
ENSACLP00000032867	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	4.8e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000033628	-	3267	-	ENSACLP00000032854	412 (aa)	-	-
ENSACLT00000033641	-	3732	-	ENSACLP00000032867	401 (aa)	-	UPI00032A1D71

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000022280	twistnb	78	46.178	ENSG00000105849	TWISTNB	58	54.315	Homo_sapiens
ENSACLG00000022280	twistnb	94	69.974	ENSAPOG00000011796	twistnb	100	70.757	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000022280	twistnb	52	53.589	ENSAMEG00000008558	TWISTNB	51	54.950	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000022280	twistnb	91	78.049	ENSACIG00000020400	twistnb	96	76.667	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000022280	twistnb	93	69.816	ENSAOCG00000024200	twistnb	99	70.604	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000022280	twistnb	93	69.554	ENSAPEG00000016750	twistnb	99	71.129	Amphiprion_percula
ENSACLG00000022280	twistnb	89	67.598	ENSATEG00000017956	twistnb	95	68.056	Anabas_testudineus
ENSACLG00000022280	twistnb	78	45.687	ENSANAG00000026418	TWISTNB	92	42.857	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000022280	twistnb	51	55.814	ENSAMXG00000035868	twistnb	65	55.814	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000022280	twistnb	77	46.688	ENSBTAG00000006721	TWISTNB	91	45.399	Bos_taurus
ENSACLG00000022280	twistnb	78	47.284	ENSCJAG00000001148	TWISTNB	58	55.330	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000022280	twistnb	77	47.604	ENSCHIG00000024078	TWISTNB	91	43.636	Capra_hircus
ENSACLG00000022280	twistnb	77	46.417	ENSTSYG00000001471	TWISTNB	92	42.183	Carlito_syrichta
ENSACLG00000022280	twistnb	82	46.407	ENSCPOG00000031651	TWISTNB	87	47.403	Cavia_porcellus
ENSACLG00000022280	twistnb	78	44.586	ENSCATG00000035621	TWISTNB	91	41.538	Cercocebus_atys
ENSACLG00000022280	twistnb	78	44.586	ENSCSAG00000013544	TWISTNB	91	41.538	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000022280	twistnb	75	45.695	ENSCANG00000038759	TWISTNB	87	42.173	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000022280	twistnb	87	60.326	ENSCVAG00000014324	twistnb	95	55.956	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000022280	twistnb	57	55.022	ENSDARG00000024416	twistnb	58	55.022	Danio_rerio
ENSACLG00000022280	twistnb	89	45.000	ENSEASG00005021702	TWISTNB	65	51.528	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000022280	twistnb	51	54.106	ENSECAG00000014563	TWISTNB	65	51.528	Equus_caballus
ENSACLG00000022280	twistnb	92	54.111	ENSELUG00000000098	TWISTNB	97	51.781	Esox_lucius
ENSACLG00000022280	twistnb	76	40.190	ENSFALG00000009761	TWISTNB	51	54.487	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000022280	twistnb	90	59.239	ENSFHEG00000013318	twistnb	95	57.910	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000022280	twistnb	88	60.763	ENSGAFG00000018309	twistnb	95	57.584	Gambusia_affinis
ENSACLG00000022280	twistnb	63	68.254	ENSGACG00000006425	twistnb	93	68.254	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000022280	twistnb	78	44.409	ENSGGOG00000026888	TWISTNB	58	54.315	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000022280	twistnb	100	99.501	ENSHBUG00000020155	twistnb	100	99.501	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000022280	twistnb	83	47.198	ENSHGLG00000010976	TWISTNB	55	57.297	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000022280	twistnb	89	56.140	ENSHCOG00000010590	twistnb	96	56.030	Hippocampus_comes
ENSACLG00000022280	twistnb	92	48.670	ENSIPUG00000004117	twistnb	95	49.859	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000022280	twistnb	94	60.212	ENSKMAG00000001591	twistnb	100	60.743	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000022280	twistnb	94	65.885	ENSLBEG00000024225	twistnb	100	66.230	Labrus_bergylta
ENSACLG00000022280	twistnb	92	45.553	ENSLACG00000010508	TWISTNB	61	55.204	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000022280	twistnb	78	44.268	ENSMFAG00000045328	TWISTNB	91	41.538	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000022280	twistnb	87	42.980	ENSMMUG00000009609	TWISTNB	90	41.538	Macaca_mulatta
ENSACLG00000022280	twistnb	78	43.949	ENSMNEG00000041159	TWISTNB	91	41.231	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000022280	twistnb	78	44.586	ENSMLEG00000042783	TWISTNB	91	41.538	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000022280	twistnb	100	100.000	ENSMZEG00005007561	twistnb	100	100.000	Maylandia_zebra
ENSACLG00000022280	twistnb	73	47.635	ENSMOCG00000003458	Twistnb	59	58.115	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000022280	twistnb	94	60.152	ENSMMOG00000020085	twistnb	100	59.645	Mola_mola
ENSACLG00000022280	twistnb	89	58.886	ENSMALG00000016407	twistnb	95	58.355	Monopterus_albus
ENSACLG00000022280	twistnb	94	97.340	ENSNBRG00000008652	twistnb	100	97.340	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000022280	twistnb	75	46.053	ENSNLEG00000035755	TWISTNB	87	41.667	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000022280	twistnb	73	44.702	ENSOPRG00000016109	TWISTNB	87	42.453	Ochotona_princeps
ENSACLG00000022280	twistnb	85	47.701	ENSODEG00000007222	TWISTNB	93	44.713	Octodon_degus
ENSACLG00000022280	twistnb	95	65.526	ENSORLG00000004005	twistnb	89	65.957	Oryzias_latipes
ENSACLG00000022280	twistnb	94	64.721	ENSORLG00020002579	twistnb	100	64.721	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000022280	twistnb	100	64.677	ENSORLG00015013403	twistnb	92	64.122	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000022280	twistnb	77	46.226	ENSOARG00000009803	TWISTNB	90	44.073	Ovis_aries
ENSACLG00000022280	twistnb	86	43.228	ENSPPAG00000034623	TWISTNB	58	54.315	Pan_paniscus
ENSACLG00000022280	twistnb	78	43.344	ENSPPRG00000005877	TWISTNB	59	55.102	Panthera_pardus
ENSACLG00000022280	twistnb	78	44.728	ENSPTRG00000018962	TWISTNB	58	54.315	Pan_troglodytes
ENSACLG00000022280	twistnb	80	48.318	ENSPKIG00000025635	twistnb	68	51.587	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000022280	twistnb	89	63.612	ENSPMGG00000019023	twistnb	94	62.060	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000022280	twistnb	76	42.857	ENSPCIG00000017456	TWISTNB	91	40.741	Phascolarctos_cinereus
ENSACLG00000022280	twistnb	77	46.774	ENSPPYG00000017752	TWISTNB	55	57.297	Pongo_abelii
ENSACLG00000022280	twistnb	94	99.734	ENSPNYG00000002674	twistnb	100	99.734	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000022280	twistnb	89	42.659	ENSPNAG00000011956	twistnb	97	43.889	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000022280	twistnb	75	45.695	ENSRBIG00000043007	TWISTNB	54	56.216	Rhinopithecus_bieti
ENSACLG00000022280	twistnb	75	45.695	ENSRROG00000040155	TWISTNB	87	45.659	Rhinopithecus_roxellana
ENSACLG00000022280	twistnb	94	64.286	ENSSMAG00000012792	twistnb	100	65.344	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000022280	twistnb	94	68.407	ENSSDUG00000007038	twistnb	100	68.668	Seriola_dumerili
ENSACLG00000022280	twistnb	81	38.066	ENSSPUG00000007595	TWISTNB	61	49.744	Sphenodon_punctatus
ENSACLG00000022280	twistnb	94	68.407	ENSSPAG00000005871	twistnb	100	68.930	Stegastes_partitus
ENSACLG00000022280	twistnb	80	43.155	ENSSSCG00000025298	TWISTNB	65	52.273	Sus_scrofa
ENSACLG00000022280	twistnb	84	58.631	ENSTNIG00000017778	twistnb	96	58.055	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000022280	twistnb	77	43.789	ENSTBEG00000003554	TWISTNB	62	52.336	Tupaia_belangeri
ENSACLG00000022280	twistnb	62	71.654	ENSXCOG00000020199	twistnb	98	59.249	Xiphophorus_couchianus