EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000022302 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 42066 bases
Position: chr9:33100035-33142100
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSACLP00000032942	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-144	3	25
ENSACLP00000032942	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-144	4	25
ENSACLP00000032942	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-144	5	25
ENSACLP00000032942	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-144	6	25
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ENSACLP00000032942	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-144	9	25
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ENSACLP00000032942	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-144	14	25
ENSACLP00000032942	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-144	15	25
ENSACLP00000032942	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-144	16	25
ENSACLP00000032942	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-144	17	25
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ENSACLP00000032942	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-144	25	25
ENSACLP00000032900	zf-C2H2	PF00096.26	2.4e-105	1	20
ENSACLP00000032900	zf-C2H2	PF00096.26	2.4e-105	2	20
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ENSACLP00000032900	zf-C2H2	PF00096.26	2.4e-105	10	20
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ENSACLP00000032900	zf-C2H2	PF00096.26	2.4e-105	12	20
ENSACLP00000032900	zf-C2H2	PF00096.26	2.4e-105	13	20
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ENSACLP00000032900	zf-C2H2	PF00096.26	2.4e-105	17	20
ENSACLP00000032900	zf-C2H2	PF00096.26	2.4e-105	18	20
ENSACLP00000032900	zf-C2H2	PF00096.26	2.4e-105	19	20
ENSACLP00000032900	zf-C2H2	PF00096.26	2.4e-105	20	20
ENSACLP00000032942	zf-met	PF12874.7	4.5e-49	1	3
ENSACLP00000032942	zf-met	PF12874.7	4.5e-49	2	3
ENSACLP00000032942	zf-met	PF12874.7	4.5e-49	3	3
ENSACLP00000032900	zf-met	PF12874.7	1.6e-21	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000033677	-	2463	-	ENSACLP00000032900	820 (aa)	-	-
ENSACLT00000033720	-	2592	-	ENSACLP00000032942	863 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000022302	-	98	37.313	ENSACLG00000018551	snai2	76	37.313
ENSACLG00000022302	-	96	46.429	ENSACLG00000019167	-	96	37.097
ENSACLG00000022302	-	98	45.399	ENSACLG00000005795	-	86	45.399
ENSACLG00000022302	-	95	52.891	ENSACLG00000023941	-	96	47.336
ENSACLG00000022302	-	98	71.429	ENSACLG00000014600	-	90	50.888
ENSACLG00000022302	-	96	54.699	ENSACLG00000007888	-	80	54.699
ENSACLG00000022302	-	92	45.122	ENSACLG00000011658	-	95	45.122
ENSACLG00000022302	-	98	40.476	ENSACLG00000022439	-	80	40.476
ENSACLG00000022302	-	99	66.071	ENSACLG00000000487	-	94	66.071
ENSACLG00000022302	-	96	63.889	ENSACLG00000017336	-	95	74.603
ENSACLG00000022302	-	98	41.803	ENSACLG00000015989	-	91	41.803
ENSACLG00000022302	-	98	45.455	ENSACLG00000008374	-	64	45.455
ENSACLG00000022302	-	96	45.238	ENSACLG00000021045	-	86	43.094
ENSACLG00000022302	-	98	49.010	ENSACLG00000024294	-	91	50.292
ENSACLG00000022302	-	94	53.448	ENSACLG00000004663	-	86	53.704
ENSACLG00000022302	-	99	39.161	ENSACLG00000013604	znf710b	52	39.161
ENSACLG00000022302	-	98	41.860	ENSACLG00000020615	-	72	40.840
ENSACLG00000022302	-	98	44.083	ENSACLG00000020610	-	66	45.429
ENSACLG00000022302	-	98	54.712	ENSACLG00000017411	-	98	50.342
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ENSACLG00000022302	-	98	50.081	ENSACLG00000003229	-	96	49.304
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ENSACLG00000022302	-	97	64.828	ENSACLG00000028002	-	99	59.740
ENSACLG00000022302	-	98	43.750	ENSACLG00000013935	-	99	45.815
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ENSACLG00000022302	-	98	48.598	ENSACLG00000006465	bcl6b	51	48.598
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ENSACLG00000022302	-	99	42.765	ENSACLG00000011237	-	99	44.681
ENSACLG00000022302	-	98	47.368	ENSACLG00000021056	-	67	46.875
ENSACLG00000022302	-	94	49.254	ENSACLG00000019424	-	98	39.080
ENSACLG00000022302	-	99	39.080	ENSACLG00000026103	znf526	95	39.080
ENSACLG00000022302	-	97	62.687	ENSACLG00000014365	-	99	49.708
ENSACLG00000022302	-	98	41.026	ENSACLG00000026538	-	93	41.026
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ENSACLG00000022302	-	99	45.278	ENSACLG00000024308	-	99	45.278
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ENSACLG00000022302	-	98	40.690	ENSACLG00000027692	-	79	41.206
ENSACLG00000022302	-	99	65.424	ENSACLG00000000537	-	95	69.355
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ENSACLG00000022302	-	98	65.101	ENSACLG00000019349	-	74	65.101
ENSACLG00000022302	-	98	34.146	ENSACLG00000020231	-	96	39.394
ENSACLG00000022302	-	99	65.967	ENSACLG00000022497	-	99	65.967
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ENSACLG00000022302	-	98	39.873	ENSACLG00000011642	-	80	41.897
ENSACLG00000022302	-	93	43.269	ENSACLG00000001258	-	95	44.578
ENSACLG00000022302	-	98	46.061	ENSACLG00000017925	-	69	47.500
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ENSACLG00000022302	-	97	34.328	ENSACLG00000012046	-	58	34.328
ENSACLG00000022302	-	93	51.923	ENSACLG00000017849	-	85	50.617
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ENSACLG00000022302	-	99	49.029	ENSACLG00000008821	-	98	49.029
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ENSACLG00000022302	-	94	74.468	ENSACLG00000013531	-	95	74.468
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ENSACLG00000022302	-	98	44.318	ENSACLG00000008606	-	99	44.318
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ENSACLG00000022302	-	99	38.071	ENSACLG00000020430	znf384l	50	37.811
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ENSACLG00000022302	-	98	45.823	ENSACLG00000019291	-	98	40.397
ENSACLG00000022302	-	98	44.560	ENSACLG00000019318	-	99	44.059
ENSACLG00000022302	-	99	46.341	ENSACLG00000008624	-	90	46.341
ENSACLG00000022302	-	98	45.226	ENSACLG00000017487	-	71	45.226
ENSACLG00000022302	-	97	74.519	ENSACLG00000001507	-	83	74.519
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ENSACLG00000022302	-	99	65.068	ENSACLG00000000473	-	93	64.316
ENSACLG00000022302	-	96	56.422	ENSACLG00000022360	-	98	57.419
ENSACLG00000022302	-	99	38.947	ENSACLG00000016841	-	74	38.889
ENSACLG00000022302	-	98	47.308	ENSACLG00000017939	-	97	47.297
ENSACLG00000022302	-	98	66.667	ENSACLG00000017449	-	67	69.231
ENSACLG00000022302	-	99	57.966	ENSACLG00000015816	-	98	57.966
ENSACLG00000022302	-	98	61.154	ENSACLG00000022383	-	95	62.500
ENSACLG00000022302	-	98	51.064	ENSACLG00000014336	-	94	51.988
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