EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000022360 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 24252 bases
Position: chr9:33174656-33198907
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSACLP00000033006	zf-C2H2	PF00096.26	2.6e-72	4	13
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ENSACLP00000033006	zf-met	PF12874.7	3.3e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000033786	-	1794	-	ENSACLP00000033006	597 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

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ENSACLG00000022360	-	97	39.264	ENSSLDG00000010190	-	98	39.264	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000022360	-	96	42.334	ENSSLDG00000007756	-	94	40.741	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000022360	-	99	40.984	ENSSLDG00000017937	-	99	40.705	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000022360	-	94	46.341	ENSSPAG00000008865	-	91	41.546	Stegastes_partitus
ENSACLG00000022360	-	99	40.323	ENSSSCG00000038009	-	94	40.323	Sus_scrofa
ENSACLG00000022360	-	93	43.836	ENSTNIG00000003479	-	96	43.836	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000022360	-	95	37.434	ENSTNIG00000003979	-	99	37.434	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000022360	-	96	39.623	ENSUMAG00000004051	-	98	39.623	Ursus_maritimus
ENSACLG00000022360	-	99	40.376	ENSVVUG00000002015	-	94	40.395	Vulpes_vulpes
ENSACLG00000022360	-	95	37.008	ENSXETG00000010512	-	99	32.432	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000022360	-	96	40.728	ENSXETG00000034213	-	99	40.728	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000022360	-	96	38.241	ENSXETG00000030307	-	100	38.241	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000022360	-	99	37.421	ENSXMAG00000000617	-	72	37.421	Xiphophorus_maculatus