EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000022383 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 52639 bases
Position: chr9:33233135-33285773
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000033048	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-141	1	27
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ENSACLP00000033048	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-141	3	27
ENSACLP00000033048	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-141	4	27
ENSACLP00000033048	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-141	5	27
ENSACLP00000033048	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-141	6	27
ENSACLP00000033048	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-141	7	27
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ENSACLP00000033048	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-141	9	27
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ENSACLP00000033048	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-141	27	27
ENSACLP00000033068	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-46	1	8
ENSACLP00000033068	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-46	2	8
ENSACLP00000033068	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-46	3	8
ENSACLP00000033068	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-46	4	8
ENSACLP00000033068	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-46	5	8
ENSACLP00000033068	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-46	6	8
ENSACLP00000033068	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-46	7	8
ENSACLP00000033068	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-46	8	8
ENSACLP00000033048	zf-met	PF12874.7	1.6e-50	1	8
ENSACLP00000033048	zf-met	PF12874.7	1.6e-50	2	8
ENSACLP00000033048	zf-met	PF12874.7	1.6e-50	3	8
ENSACLP00000033048	zf-met	PF12874.7	1.6e-50	4	8
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ENSACLP00000033048	zf-met	PF12874.7	1.6e-50	6	8
ENSACLP00000033048	zf-met	PF12874.7	1.6e-50	7	8
ENSACLP00000033048	zf-met	PF12874.7	1.6e-50	8	8
ENSACLP00000033068	zf-met	PF12874.7	1.6e-22	1	4
ENSACLP00000033068	zf-met	PF12874.7	1.6e-22	2	4
ENSACLP00000033068	zf-met	PF12874.7	1.6e-22	3	4
ENSACLP00000033068	zf-met	PF12874.7	1.6e-22	4	4

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000033849	-	834	-	ENSACLP00000033068	277 (aa)	-	-
ENSACLT00000033828	-	3660	-	ENSACLP00000033048	1219 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000022383	-	99	45.370	ENSACLG00000020975	-	99	44.550
ENSACLG00000022383	-	95	41.667	ENSACLG00000006870	-	60	42.009
ENSACLG00000022383	-	97	58.983	ENSACLG00000014365	-	98	55.224
ENSACLG00000022383	-	95	39.500	ENSACLG00000020430	znf384l	54	40.217
ENSACLG00000022383	-	87	39.286	ENSACLG00000017148	sall1a	60	39.286
ENSACLG00000022383	-	93	35.000	ENSACLG00000007162	scrt1b	89	36.585
ENSACLG00000022383	-	96	41.935	ENSACLG00000015989	-	91	41.935
ENSACLG00000022383	-	95	60.392	ENSACLG00000019349	-	79	64.935
ENSACLG00000022383	-	95	56.322	ENSACLG00000015843	-	90	54.420
ENSACLG00000022383	-	97	72.000	ENSACLG00000013033	-	83	72.000
ENSACLG00000022383	-	95	43.500	ENSACLG00000021045	-	80	42.784
ENSACLG00000022383	-	94	40.183	ENSACLG00000022439	-	80	40.909
ENSACLG00000022383	-	98	45.578	ENSACLG00000005708	-	90	44.375
ENSACLG00000022383	-	93	67.119	ENSACLG00000003546	-	58	67.119
ENSACLG00000022383	-	94	58.159	ENSACLG00000017449	-	64	58.159
ENSACLG00000022383	-	99	43.931	ENSACLG00000016841	-	83	36.929
ENSACLG00000022383	-	94	47.534	ENSACLG00000012251	-	50	45.817
ENSACLG00000022383	-	97	57.407	ENSACLG00000023979	-	96	57.407
ENSACLG00000022383	-	91	43.089	ENSACLG00000001418	znf652	51	43.089
ENSACLG00000022383	-	94	41.860	ENSACLG00000020268	-	87	40.769
ENSACLG00000022383	-	90	39.200	ENSACLG00000017621	-	76	39.200
ENSACLG00000022383	-	99	46.567	ENSACLG00000017939	-	98	46.923
ENSACLG00000022383	-	97	45.810	ENSACLG00000017801	-	67	43.367
ENSACLG00000022383	-	94	45.775	ENSACLG00000020333	-	63	45.652
ENSACLG00000022383	-	96	34.298	ENSACLG00000022191	znf407	73	35.185
ENSACLG00000022383	-	91	43.590	ENSACLG00000011658	-	99	45.570
ENSACLG00000022383	-	93	33.158	ENSACLG00000022287	-	71	33.178
ENSACLG00000022383	-	91	33.846	ENSACLG00000016648	-	84	33.750
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ENSACLG00000022383	-	97	56.716	ENSACLG00000017411	-	88	56.716
ENSACLG00000022383	-	95	47.490	ENSACLG00000025163	-	93	46.203
ENSACLG00000022383	-	96	37.226	ENSACLG00000026187	-	69	41.525
ENSACLG00000022383	-	95	49.057	ENSACLG00000008821	-	100	46.637
ENSACLG00000022383	-	95	47.826	ENSACLG00000019424	-	98	38.650
ENSACLG00000022383	-	99	40.323	ENSACLG00000017925	-	70	38.579
ENSACLG00000022383	-	98	47.475	ENSACLG00000020260	-	100	47.475
ENSACLG00000022383	-	95	64.615	ENSACLG00000000473	-	92	60.160
ENSACLG00000022383	-	97	41.104	ENSACLG00000005694	-	51	41.104
ENSACLG00000022383	-	98	43.256	ENSACLG00000008606	-	99	43.256
ENSACLG00000022383	-	93	47.748	ENSACLG00000018746	-	95	44.697
ENSACLG00000022383	-	95	46.369	ENSACLG00000023305	-	90	47.368
ENSACLG00000022383	-	97	69.663	ENSACLG00000000537	-	98	69.672
ENSACLG00000022383	-	96	49.231	ENSACLG00000011710	-	64	49.231
ENSACLG00000022383	-	95	66.284	ENSACLG00000001018	-	86	66.284
ENSACLG00000022383	-	98	45.276	ENSACLG00000026703	-	80	43.257
ENSACLG00000022383	-	95	67.552	ENSACLG00000017329	-	92	64.305
ENSACLG00000022383	-	99	45.614	ENSACLG00000017321	-	88	42.745
ENSACLG00000022383	-	99	42.913	ENSACLG00000019318	-	97	44.788
ENSACLG00000022383	-	95	66.154	ENSACLG00000000487	-	83	66.154
ENSACLG00000022383	-	94	70.742	ENSACLG00000011239	-	85	70.742
ENSACLG00000022383	-	95	60.481	ENSACLG00000022475	-	92	60.481
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ENSACLG00000022383	-	94	45.775	ENSACLG00000006718	-	63	45.652
ENSACLG00000022383	-	95	47.482	ENSACLG00000006697	-	75	39.726
ENSACLG00000022383	-	96	63.063	ENSACLG00000021846	-	86	63.063
ENSACLG00000022383	-	95	57.634	ENSACLG00000003229	-	98	52.891
ENSACLG00000022383	-	96	37.838	ENSACLG00000012712	znf646	99	34.028
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ENSACLG00000022383	-	95	63.258	ENSACLG00000022497	-	99	60.938
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ENSACLG00000022383	-	96	61.508	ENSACLG00000003332	-	97	61.508
ENSACLG00000022383	-	99	63.830	ENSACLG00000002844	-	97	49.102
ENSACLG00000022383	-	95	40.201	ENSACLG00000025353	ZNF384	51	38.710
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ENSACLG00000022383	-	94	41.339	ENSACLG00000020615	-	79	42.056
ENSACLG00000022383	-	95	50.000	ENSACLG00000024294	-	84	50.000
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ENSACLG00000022383	-	95	60.137	ENSACLG00000019499	-	97	54.202
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ENSACLG00000022383	-	94	40.520	ENSACLG00000017941	-	66	37.847
ENSACLG00000022383	-	99	45.532	ENSACLG00000021343	-	99	44.214
ENSACLG00000022383	-	96	44.444	ENSACLG00000016405	zbtb17	59	45.638
ENSACLG00000022383	-	95	44.910	ENSACLG00000008624	-	78	42.073
ENSACLG00000022383	-	94	66.935	ENSACLG00000018716	-	92	66.265
ENSACLG00000022383	-	99	40.887	ENSACLG00000019167	-	84	45.000
ENSACLG00000022383	-	97	50.193	ENSACLG00000024308	-	99	50.193
ENSACLG00000022383	-	95	38.583	ENSACLG00000018551	snai2	97	36.000
ENSACLG00000022383	-	92	41.358	ENSACLG00000019094	-	84	41.358
ENSACLG00000022383	-	95	67.308	ENSACLG00000018701	-	75	67.308
ENSACLG00000022383	-	95	62.500	ENSACLG00000022302	-	98	61.154
ENSACLG00000022383	-	98	44.565	ENSACLG00000015462	-	76	44.565
ENSACLG00000022383	-	92	56.364	ENSACLG00000013531	-	96	56.364
ENSACLG00000022383	-	96	46.610	ENSACLG00000020474	-	99	46.610
ENSACLG00000022383	-	99	43.043	ENSACLG00000003679	-	89	40.299
ENSACLG00000022383	-	93	50.000	ENSACLG00000023513	-	94	50.000
ENSACLG00000022383	-	95	57.718	ENSACLG00000022482	-	94	57.718
ENSACLG00000022383	-	99	46.696	ENSACLG00000011237	-	99	44.970
ENSACLG00000022383	-	96	58.462	ENSACLG00000007749	-	76	58.462
ENSACLG00000022383	-	96	39.669	ENSACLG00000013604	znf710b	52	38.462
ENSACLG00000022383	-	96	42.188	ENSACLG00000004663	-	95	42.188
ENSACLG00000022383	-	96	55.598	ENSACLG00000023963	-	91	55.598
ENSACLG00000022383	-	95	46.721	ENSACLG00000021184	-	56	46.721
ENSACLG00000022383	-	95	42.391	ENSACLG00000021022	-	81	43.820
ENSACLG00000022383	-	97	35.065	ENSACLG00000020231	-	95	38.235
ENSACLG00000022383	-	95	59.004	ENSACLG00000007888	-	91	51.034
ENSACLG00000022383	-	96	36.882	ENSACLG00000005594	ZNF319	93	35.223
ENSACLG00000022383	-	96	60.633	ENSACLG00000006528	-	96	60.633
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