EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000022475 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1932 bases
Position: chr9:33302766-33304697
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000033149	zf-C2H2	PF00096.26	7.7e-56	1	11
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ENSACLP00000033149	zf-met	PF12874.7	4.7e-23	4	4

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000033934	-	1230	-	ENSACLP00000033149	409 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000022475	-	91	38.380	ENSACLG00000000102	-	55	38.380
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ENSACLG00000022475	-	89	43.902	ENSTNIG00000003479	-	100	43.902	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000022475	-	94	41.444	ENSUMAG00000004051	-	98	41.608	Ursus_maritimus
ENSACLG00000022475	-	96	41.754	ENSVVUG00000002015	-	99	42.492	Vulpes_vulpes
ENSACLG00000022475	-	96	41.470	ENSXETG00000030307	-	100	41.470	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000022475	-	91	34.704	ENSXETG00000010512	-	99	34.704	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000022475	-	97	39.739	ENSXETG00000034213	-	98	39.739	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000022475	-	93	38.710	ENSXMAG00000000617	-	71	38.710	Xiphophorus_maculatus