EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000022497 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: zinc finger protein 43-like
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1416 bases
Position: chr9:33425336-33426751
Accession: 113029629
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSACLP00000033174	zf-C2H2	PF00096.26	2.2e-82	3	15
ENSACLP00000033174	zf-C2H2	PF00096.26	2.2e-82	4	15
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ENSACLP00000033174	zf-C2H2	PF00096.26	2.2e-82	6	15
ENSACLP00000033174	zf-C2H2	PF00096.26	2.2e-82	7	15
ENSACLP00000033174	zf-C2H2	PF00096.26	2.2e-82	8	15
ENSACLP00000033174	zf-C2H2	PF00096.26	2.2e-82	9	15
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ENSACLP00000033174	zf-C2H2	PF00096.26	2.2e-82	15	15
ENSACLP00000033174	zf-met	PF12874.7	1e-37	1	9
ENSACLP00000033174	zf-met	PF12874.7	1e-37	2	9
ENSACLP00000033174	zf-met	PF12874.7	1e-37	3	9
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ENSACLP00000033174	zf-met	PF12874.7	1e-37	9	9

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000033960	-	1416	XM_026180599	ENSACLP00000033174	471 (aa)	XP_026036384	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000022497	-	97	61.561	ENSACLG00000019349	-	76	61.561
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ENSACLG00000022497	-	89	37.226	ENSACLG00000007162	scrt1b	66	37.226
ENSACLG00000022497	-	95	38.849	ENSACLG00000013531	-	95	38.129
ENSACLG00000022497	-	90	34.054	ENSACLG00000020579	znf319b	88	32.614
ENSACLG00000022497	-	95	38.017	ENSACLG00000018551	snai2	65	38.017
ENSACLG00000022497	-	92	38.272	ENSACLG00000019094	-	74	38.272
ENSACLG00000022497	-	98	70.588	ENSACLG00000000411	-	94	70.588
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ENSACLG00000022497	-	98	63.655	ENSACLG00000000487	-	91	65.966
ENSACLG00000022497	-	95	41.117	ENSACLG00000027692	-	69	41.667
ENSACLG00000022497	-	93	51.220	ENSACLG00000014600	-	90	50.265
ENSACLG00000022497	-	93	37.908	ENSACLG00000000102	-	61	37.908
ENSACLG00000022497	-	93	40.201	ENSACLG00000021045	-	80	40.201
ENSACLG00000022497	-	98	46.222	ENSACLG00000023513	-	94	46.222
ENSACLG00000022497	-	89	43.506	ENSACLG00000018700	-	97	43.506
ENSACLG00000022497	-	91	54.229	ENSACLG00000023941	-	88	54.229
ENSACLG00000022497	-	95	42.331	ENSACLG00000016405	zbtb17	56	42.331
ENSACLG00000022497	-	98	42.904	ENSACLG00000015462	-	79	42.904
ENSACLG00000022497	-	99	76.493	ENSACLG00000011239	-	81	76.493
ENSACLG00000022497	-	89	47.343	ENSACLG00000019674	-	90	47.085
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ENSACLG00000022497	-	97	43.750	ENSACLG00000024308	-	98	45.261
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ENSACLG00000022497	-	94	47.137	ENSACLG00000019270	-	81	47.137
ENSACLG00000022497	-	90	39.333	ENSACLG00000005694	-	50	39.333
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ENSACLG00000022497	-	90	35.979	ENSACLG00000017996	prdm5	72	35.979
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ENSACLG00000022497	-	91	41.212	ENSACLG00000005795	-	61	41.212
ENSACLG00000022497	-	90	42.159	ENSACLG00000024491	-	81	41.667
ENSACLG00000022497	-	92	45.022	ENSACLG00000013454	-	66	44.156
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ENSACLG00000022497	-	93	45.882	ENSACLG00000017321	-	73	44.223
ENSACLG00000022497	-	89	64.430	ENSACLG00000003546	-	58	59.816
ENSACLG00000022497	-	87	41.810	ENSACLG00000017487	-	70	41.810
ENSACLG00000022497	-	90	60.938	ENSACLG00000006528	-	97	60.938
ENSACLG00000022497	-	90	43.407	ENSACLG00000024670	-	72	43.407
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ENSACLG00000022497	-	94	45.000	ENSACLG00000021343	-	100	43.379
ENSACLG00000022497	-	93	42.857	ENSACLG00000026703	-	73	42.857
ENSACLG00000022497	-	96	45.078	ENSACLG00000025196	-	83	45.078
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Orthologs

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ENSACLG00000022497	-	99	64.744	ENSNBRG00000009815	-	82	51.293	Neolamprologus_brichardi
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ENSACLG00000022497	-	99	63.529	ENSPNYG00000023637	-	81	56.197	Pundamilia_nyererei
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ENSACLG00000022497	-	97	73.494	ENSPNYG00000023916	-	88	73.494	Pundamilia_nyererei