EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000022741 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1529 bases
Position: chr10:27082171-27083699
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000033555	RVT_1	PF00078.27	7.2e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000034354	-	1529	-	ENSACLP00000033555	362 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000022741	-	99	49.722	ENSACLG00000024568	-	85	49.722
ENSACLG00000022741	-	99	90.859	ENSACLG00000005593	-	95	90.859
ENSACLG00000022741	-	99	44.693	ENSACLG00000021814	-	64	44.693
ENSACLG00000022741	-	94	44.543	ENSACLG00000014915	-	52	44.543
ENSACLG00000022741	-	99	86.427	ENSACLG00000026963	-	95	86.427
ENSACLG00000022741	-	99	44.847	ENSACLG00000004232	-	81	44.972
ENSACLG00000022741	-	98	51.541	ENSACLG00000011570	-	94	51.541
ENSACLG00000022741	-	61	42.081	ENSACLG00000020388	-	64	41.202
ENSACLG00000022741	-	99	52.089	ENSACLG00000015732	-	97	51.944
ENSACLG00000022741	-	98	47.458	ENSACLG00000000597	-	99	47.458
ENSACLG00000022741	-	99	51.381	ENSACLG00000013583	-	94	51.381
ENSACLG00000022741	-	85	69.805	ENSACLG00000005126	-	94	69.805
ENSACLG00000022741	-	99	46.944	ENSACLG00000005017	-	53	46.944
ENSACLG00000022741	-	76	64.130	ENSACLG00000002725	-	75	64.130
ENSACLG00000022741	-	99	50.139	ENSACLG00000002680	-	88	50.139
ENSACLG00000022741	-	89	50.000	ENSACLG00000002685	-	88	50.000
ENSACLG00000022741	-	95	50.435	ENSACLG00000023425	-	94	50.975
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ENSACLG00000022741	-	96	45.821	ENSACLG00000015659	-	59	45.821
ENSACLG00000022741	-	99	51.934	ENSACLG00000000736	-	51	51.934
ENSACLG00000022741	-	99	44.568	ENSACLG00000020184	-	78	44.693
ENSACLG00000022741	-	95	51.437	ENSACLG00000006014	-	75	51.437
ENSACLG00000022741	-	93	53.550	ENSACLG00000013483	-	99	53.550
ENSACLG00000022741	-	81	50.680	ENSACLG00000022277	-	72	50.680
ENSACLG00000022741	-	99	45.682	ENSACLG00000025009	-	76	45.682
ENSACLG00000022741	-	99	52.486	ENSACLG00000022051	-	94	52.486
ENSACLG00000022741	-	99	44.847	ENSACLG00000013183	-	96	44.972
ENSACLG00000022741	-	99	52.210	ENSACLG00000005547	-	56	52.210
ENSACLG00000022741	-	99	44.693	ENSACLG00000020183	-	53	44.693
ENSACLG00000022741	-	68	46.748	ENSACLG00000012352	-	50	46.748
ENSACLG00000022741	-	99	44.568	ENSACLG00000027855	-	81	44.693
ENSACLG00000022741	-	99	63.889	ENSACLG00000014537	-	76	63.889
ENSACLG00000022741	-	73	53.008	ENSACLG00000012447	-	57	53.558
ENSACLG00000022741	-	99	44.693	ENSACLG00000000182	-	64	44.693
ENSACLG00000022741	-	99	44.134	ENSACLG00000001758	-	53	44.134
ENSACLG00000022741	-	99	87.535	ENSACLG00000025957	-	68	87.535
ENSACLG00000022741	-	90	46.789	ENSACLG00000024268	-	86	46.377
ENSACLG00000022741	-	99	63.889	ENSACLG00000013061	-	50	63.889
ENSACLG00000022741	-	99	51.381	ENSACLG00000020302	-	94	51.381
ENSACLG00000022741	-	73	50.000	ENSACLG00000026286	-	71	50.000
ENSACLG00000022741	-	99	44.568	ENSACLG00000011151	-	96	44.693
ENSACLG00000022741	-	88	65.931	ENSACLG00000027774	-	96	67.434
ENSACLG00000022741	-	83	45.485	ENSACLG00000003344	-	96	45.485
ENSACLG00000022741	-	95	52.326	ENSACLG00000017680	-	99	52.326
ENSACLG00000022741	-	90	63.272	ENSACLG00000005711	-	96	64.630
ENSACLG00000022741	-	78	54.196	ENSACLG00000022104	-	82	50.000
ENSACLG00000022741	-	99	49.444	ENSACLG00000014642	-	60	49.444
ENSACLG00000022741	-	68	43.673	ENSACLG00000001556	-	52	43.673
ENSACLG00000022741	-	83	48.505	ENSACLG00000001865	-	83	48.505
ENSACLG00000022741	-	51	39.674	ENSACLG00000022966	-	51	39.674
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ENSACLG00000022741	-	92	44.643	ENSACLG00000018346	-	74	44.643
ENSACLG00000022741	-	99	44.413	ENSACLG00000008571	-	53	44.413
ENSACLG00000022741	-	99	44.568	ENSACLG00000013944	-	81	44.693
ENSACLG00000022741	-	98	66.289	ENSACLG00000003937	-	89	66.289
ENSACLG00000022741	-	60	48.858	ENSACLG00000021583	-	53	48.858
ENSACLG00000022741	-	99	44.568	ENSACLG00000000437	-	96	44.693
ENSACLG00000022741	-	96	45.087	ENSACLG00000027135	-	99	45.087
ENSACLG00000022741	-	99	63.889	ENSACLG00000017692	-	50	63.889
ENSACLG00000022741	-	90	48.624	ENSACLG00000021937	-	72	48.116
ENSACLG00000022741	-	99	44.972	ENSACLG00000008024	-	96	44.972
ENSACLG00000022741	-	99	51.811	ENSACLG00000020926	-	94	51.811
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ENSACLG00000022741	-	51	48.387	ENSACLG00000007824	-	51	48.387
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ENSACLG00000022741	-	99	51.811	ENSACLG00000013932	-	66	51.811
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ENSACLG00000022741	-	90	44.923	ENSACLG00000002171	-	95	45.806
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ENSACLG00000022741	-	99	44.413	ENSACLG00000000536	-	53	44.413
ENSACLG00000022741	-	99	44.568	ENSACLG00000017093	-	81	44.693
ENSACLG00000022741	-	97	30.618	ENSACLG00000021775	-	89	30.618
ENSACLG00000022741	-	72	58.015	ENSACLG00000013521	-	66	58.015
ENSACLG00000022741	-	99	53.444	ENSACLG00000024414	-	94	53.444
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ENSACLG00000022741	-	99	44.290	ENSACLG00000019420	-	71	44.413
ENSACLG00000022741	-	99	52.368	ENSACLG00000004998	-	80	52.222
ENSACLG00000022741	-	99	44.847	ENSACLG00000020601	-	81	44.972
ENSACLG00000022741	-	99	53.039	ENSACLG00000003670	-	56	53.039
ENSACLG00000022741	-	97	30.899	ENSACLG00000016231	-	60	30.899
ENSACLG00000022741	-	99	54.396	ENSACLG00000018107	-	65	54.396
ENSACLG00000022741	-	99	45.251	ENSACLG00000010664	-	64	45.251
ENSACLG00000022741	-	99	51.524	ENSACLG00000007318	-	94	51.524
ENSACLG00000022741	-	99	44.847	ENSACLG00000023557	-	56	44.972
ENSACLG00000022741	-	70	53.488	ENSACLG00000015652	-	93	54.618
ENSACLG00000022741	-	99	44.290	ENSACLG00000010080	-	81	44.413
ENSACLG00000022741	-	99	52.925	ENSACLG00000010082	-	64	52.925
ENSACLG00000022741	-	86	53.035	ENSACLG00000022219	-	83	53.035
ENSACLG00000022741	-	99	45.682	ENSACLG00000000230	-	76	45.682
ENSACLG00000022741	-	99	44.568	ENSACLG00000025562	-	81	44.693
ENSACLG00000022741	-	99	47.514	ENSACLG00000004581	-	94	47.514
ENSACLG00000022741	-	99	49.448	ENSACLG00000005921	-	69	49.448
ENSACLG00000022741	-	99	45.125	ENSACLG00000014911	-	55	45.125
ENSACLG00000022741	-	72	50.189	ENSACLG00000021354	-	70	50.189
ENSACLG00000022741	-	99	45.404	ENSACLG00000022853	-	67	45.404
ENSACLG00000022741	-	94	51.462	ENSACLG00000011440	-	94	51.462
ENSACLG00000022741	-	99	46.944	ENSACLG00000014413	-	53	46.944
ENSACLG00000022741	-	61	42.986	ENSACLG00000005746	-	50	42.986
ENSACLG00000022741	-	100	99.171	ENSACLG00000009983	-	95	99.171
ENSACLG00000022741	-	99	44.693	ENSACLG00000017363	-	81	44.693
ENSACLG00000022741	-	53	46.392	ENSACLG00000021947	-	62	46.392
ENSACLG00000022741	-	79	53.472	ENSACLG00000013213	-	81	53.979
ENSACLG00000022741	-	92	47.006	ENSACLG00000022169	-	56	47.006
ENSACLG00000022741	-	76	53.091	ENSACLG00000010474	-	60	53.091
ENSACLG00000022741	-	98	49.296	ENSACLG00000019417	-	100	49.296
ENSACLG00000022741	-	99	44.475	ENSACLG00000004579	-	85	44.475
ENSACLG00000022741	-	99	32.961	ENSACLG00000024587	-	78	32.961
ENSACLG00000022741	-	91	63.030	ENSACLG00000010284	-	87	64.309
ENSACLG00000022741	-	99	44.011	ENSACLG00000006202	-	96	44.134
ENSACLG00000022741	-	78	52.482	ENSACLG00000000907	-	74	52.482
ENSACLG00000022741	-	62	51.304	ENSACLG00000004754	-	53	51.304
ENSACLG00000022741	-	73	31.227	ENSACLG00000021422	-	67	31.227
ENSACLG00000022741	-	99	44.847	ENSACLG00000005212	-	54	44.972
ENSACLG00000022741	-	97	56.410	ENSACLG00000005570	-	55	56.410
ENSACLG00000022741	-	99	52.368	ENSACLG00000022877	-	80	52.222
ENSACLG00000022741	-	99	52.762	ENSACLG00000014746	-	56	52.762
ENSACLG00000022741	-	99	44.413	ENSACLG00000016639	-	78	44.413
ENSACLG00000022741	-	80	30.690	ENSACLG00000026433	-	64	30.690
ENSACLG00000022741	-	87	44.268	ENSACLG00000000802	-	95	44.268
ENSACLG00000022741	-	88	45.625	ENSACLG00000027738	-	99	45.625
ENSACLG00000022741	-	99	43.454	ENSACLG00000024184	-	81	43.575

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000022741	-	52	37.895	ENSACIG00000019567	-	65	42.553	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000022741	-	99	48.889	ENSAOCG00000004576	-	97	48.889	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000022741	-	99	48.333	ENSAPEG00000024502	-	97	48.333	Amphiprion_percula
ENSACLG00000022741	-	99	51.111	ENSATEG00000002739	-	58	50.970	Anabas_testudineus
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