EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000022833 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tyw3
Alias: zgc:92277
Full Name: tRNA-yW synthesizing protein 3 homolog (S. cerevisiae)
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8521 bases
Position: chr18:30361918-30370438
Accession: ZDB-GENE-040718-355
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000033706	TYW3	PF02676.14	1.9e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000034508	-	717	-	ENSACLP00000033706	238 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000022833	tyw3	89	55.111	ENSG00000162623	TYW3	100	71.429	Homo_sapiens
ENSACLG00000022833	tyw3	99	63.060	ENSAPOG00000009462	tyw3	99	63.060	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000022833	tyw3	95	52.988	ENSAMEG00000003461	TYW3	95	52.988	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000022833	tyw3	98	80.426	ENSACIG00000002242	tyw3	97	80.426	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000022833	tyw3	99	62.687	ENSAOCG00000002161	tyw3	99	62.687	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000022833	tyw3	87	50.633	ENSAPEG00000009395	tyw3	93	61.290	Amphiprion_percula
ENSACLG00000022833	tyw3	97	71.489	ENSATEG00000004518	tyw3	98	71.489	Anabas_testudineus
ENSACLG00000022833	tyw3	97	71.489	ENSATEG00000004411	-	98	71.489	Anabas_testudineus
ENSACLG00000022833	tyw3	95	50.794	ENSACAG00000011380	TYW3	91	50.794	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000022833	tyw3	90	54.626	ENSANAG00000034485	TYW3	86	54.626	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000022833	tyw3	77	67.935	ENSAMXG00000039965	tyw3	90	59.322	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000022833	tyw3	98	51.969	ENSBTAG00000005196	TYW3	97	51.969	Bos_taurus
ENSACLG00000022833	tyw3	88	54.464	ENSCJAG00000006550	TYW3	86	54.464	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000022833	tyw3	79	50.000	ENSCAFG00000032209	TYW3	96	50.000	Canis_familiaris
ENSACLG00000022833	tyw3	87	56.306	ENSCAFG00020017095	TYW3	78	56.306	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000022833	tyw3	92	56.769	ENSCHIG00000009333	TYW3	88	56.769	Capra_hircus
ENSACLG00000022833	tyw3	72	62.428	ENSTSYG00000006369	TYW3	69	62.428	Carlito_syrichta
ENSACLG00000022833	tyw3	90	55.066	ENSCCAG00000034210	TYW3	86	55.066	Cebus_capucinus
ENSACLG00000022833	tyw3	87	56.459	ENSCATG00000044397	TYW3	80	56.459	Cercocebus_atys
ENSACLG00000022833	tyw3	87	58.852	ENSCLAG00000004370	TYW3	76	58.852	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000022833	tyw3	87	56.459	ENSCSAG00000001387	TYW3	80	56.459	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000022833	tyw3	90	52.609	ENSCPBG00000017047	TYW3	89	52.609	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000022833	tyw3	87	55.981	ENSCANG00000036108	TYW3	80	55.981	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000022833	tyw3	87	54.545	ENSCGRG00001022820	Tyw3	94	57.554	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000022833	tyw3	64	53.289	ENSCGRG00000003132	Tyw3	92	57.317	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000022833	tyw3	89	61.411	ENSCSEG00000021219	tyw3	95	59.774	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000022833	tyw3	79	65.426	ENSCVAG00000003270	tyw3	100	55.294	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000022833	tyw3	89	63.393	ENSDARG00000038222	tyw3	88	63.393	Danio_rerio
ENSACLG00000022833	tyw3	88	54.018	ENSDNOG00000033863	TYW3	86	54.018	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000022833	tyw3	63	58.667	ENSETEG00000012572	TYW3	74	58.667	Echinops_telfairi
ENSACLG00000022833	tyw3	55	54.962	ENSEBUG00000014020	tyw3	51	54.962	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000022833	tyw3	87	58.852	ENSEASG00005007776	TYW3	79	58.852	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000022833	tyw3	87	58.373	ENSECAG00000007888	TYW3	79	58.373	Equus_caballus
ENSACLG00000022833	tyw3	95	46.559	ENSEEUG00000009289	TYW3	95	46.559	Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000022833	tyw3	100	60.079	ENSELUG00000023000	tyw3	100	60.079	Esox_lucius
ENSACLG00000022833	tyw3	92	54.091	ENSFCAG00000035340	TYW3	84	54.091	Felis_catus
ENSACLG00000022833	tyw3	77	64.865	ENSFDAG00000003816	TYW3	70	64.865	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000022833	tyw3	79	68.617	ENSFHEG00000001347	tyw3	75	68.617	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000022833	tyw3	98	47.674	ENSGALG00000032549	TYW3	97	47.674	Gallus_gallus
ENSACLG00000022833	tyw3	100	58.364	ENSGAFG00000012457	tyw3	100	58.364	Gambusia_affinis
ENSACLG00000022833	tyw3	79	77.660	ENSGACG00000014630	tyw3	81	77.660	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000022833	tyw3	89	55.111	ENSGGOG00000013676	TYW3	86	55.111	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000022833	tyw3	77	63.784	ENSHGLG00000004440	TYW3	70	63.784	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000022833	tyw3	77	60.541	ENSHGLG00100018315	TYW3	69	60.541	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000022833	tyw3	79	65.241	ENSHCOG00000016590	TYW3	89	65.241	Hippocampus_comes
ENSACLG00000022833	tyw3	77	69.565	ENSIPUG00000012907	tyw3	77	61.277	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000022833	tyw3	82	51.777	ENSSTOG00000028816	TYW3	69	51.777	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000022833	tyw3	58	64.493	ENSJJAG00000005103	-	94	64.493	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000022833	tyw3	100	59.567	ENSKMAG00000020761	tyw3	100	60.650	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000022833	tyw3	100	72.245	ENSLBEG00000021318	tyw3	100	73.061	Labrus_bergylta
ENSACLG00000022833	tyw3	89	60.090	ENSLACG00000012636	TYW3	86	60.090	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000022833	tyw3	78	67.380	ENSLOCG00000003437	tyw3	72	67.380	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000022833	tyw3	88	55.656	ENSLAFG00000011373	TYW3	84	55.656	Loxodonta_africana
ENSACLG00000022833	tyw3	87	55.502	ENSMFAG00000003496	TYW3	80	55.502	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000022833	tyw3	87	46.411	ENSMMUG00000014595	TYW3	71	55.769	Macaca_mulatta
ENSACLG00000022833	tyw3	87	55.502	ENSMNEG00000028346	TYW3	80	55.502	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000022833	tyw3	87	56.938	ENSMLEG00000041647	TYW3	80	56.938	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000022833	tyw3	100	63.534	ENSMAMG00000010987	tyw3	100	63.534	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000022833	tyw3	100	80.597	ENSMZEG00005023808	tyw3	100	82.836	Maylandia_zebra
ENSACLG00000022833	tyw3	90	54.626	ENSMICG00000015883	TYW3	84	54.626	Microcebus_murinus
ENSACLG00000022833	tyw3	100	67.339	ENSMMOG00000021442	tyw3	100	67.339	Mola_mola
ENSACLG00000022833	tyw3	90	58.590	ENSMODG00000019082	TYW3	81	58.590	Monodelphis_domestica
ENSACLG00000022833	tyw3	100	63.433	ENSMALG00000014442	tyw3	100	63.433	Monopterus_albus
ENSACLG00000022833	tyw3	77	63.784	MGP_CAROLIEiJ_G0025755	Tyw3	94	62.590	Mus_caroli
ENSACLG00000022833	tyw3	79	62.105	ENSMUSG00000047583	Tyw3	94	62.590	Mus_musculus
ENSACLG00000022833	tyw3	87	60.287	MGP_PahariEiJ_G0027206	Tyw3	94	64.029	Mus_pahari
ENSACLG00000022833	tyw3	79	62.105	MGP_SPRETEiJ_G0026708	Tyw3	94	61.871	Mus_spretus
ENSACLG00000022833	tyw3	89	55.607	ENSMPUG00000010967	TYW3	81	55.607	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000022833	tyw3	90	53.509	ENSMLUG00000005999	TYW3	87	53.509	Myotis_lucifugus
ENSACLG00000022833	tyw3	60	60.839	ENSNGAG00000000586	-	97	60.839	Nannospalax_galili
ENSACLG00000022833	tyw3	87	56.938	ENSNLEG00000009556	TYW3	80	56.938	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000022833	tyw3	70	47.305	ENSOPRG00000014182	TYW3	64	47.305	Ochotona_princeps
ENSACLG00000022833	tyw3	77	63.784	ENSODEG00000005361	TYW3	97	61.538	Octodon_degus
ENSACLG00000022833	tyw3	79	90.426	ENSONIG00000019965	tyw3	94	90.426	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000022833	tyw3	63	62.893	ENSOANG00000002172	-	79	62.893	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACLG00000022833	tyw3	77	60.541	ENSOCUG00000003043	TYW3	71	60.541	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000022833	tyw3	99	57.422	ENSORLG00000004470	tyw3	98	57.422	Oryzias_latipes
ENSACLG00000022833	tyw3	99	55.344	ENSORLG00020003793	tyw3	98	57.031	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000022833	tyw3	99	56.641	ENSORLG00015006950	tyw3	98	56.641	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000022833	tyw3	99	59.766	ENSOMEG00000016176	tyw3	98	59.766	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000022833	tyw3	77	56.452	ENSOGAG00000025029	-	71	56.452	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000022833	tyw3	97	52.049	ENSOGAG00000011590	-	93	52.049	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000022833	tyw3	92	55.895	ENSOARG00000012508	TYW3	88	55.895	Ovis_aries
ENSACLG00000022833	tyw3	89	54.667	ENSPPAG00000043438	TYW3	86	54.667	Pan_paniscus
ENSACLG00000022833	tyw3	94	53.617	ENSPPRG00000023209	TYW3	91	53.617	Panthera_pardus
ENSACLG00000022833	tyw3	92	54.091	ENSPTIG00000017448	TYW3	84	54.091	Panthera_tigris_altaica
ENSACLG00000022833	tyw3	89	55.556	ENSPTRG00000000867	TYW3	86	55.556	Pan_troglodytes
ENSACLG00000022833	tyw3	87	56.459	ENSPANG00000013397	TYW3	80	56.459	Papio_anubis
ENSACLG00000022833	tyw3	94	53.516	ENSPKIG00000009802	tyw3	93	53.516	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000022833	tyw3	57	55.102	ENSPSIG00000008432	TYW3	86	55.102	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000022833	tyw3	99	61.417	ENSPMGG00000005290	tyw3	98	61.417	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000022833	tyw3	77	62.162	ENSPEMG00000013100	Tyw3	94	61.151	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000022833	tyw3	95	57.384	ENSPCIG00000024204	TYW3	76	57.384	Phascolarctos_cinereus
ENSACLG00000022833	tyw3	100	59.480	ENSPFOG00000000927	tyw3	100	59.480	Poecilia_formosa
ENSACLG00000022833	tyw3	100	59.480	ENSPLAG00000009891	tyw3	100	59.480	Poecilia_latipinna
ENSACLG00000022833	tyw3	100	60.223	ENSPMEG00000002006	tyw3	100	60.223	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000022833	tyw3	100	58.736	ENSPREG00000012341	tyw3	100	58.736	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000022833	tyw3	87	56.459	ENSPPYG00000001234	TYW3	80	56.459	Pongo_abelii
ENSACLG00000022833	tyw3	87	56.164	ENSPCAG00000000524	TYW3	84	56.164	Procavia_capensis
ENSACLG00000022833	tyw3	92	55.652	ENSPCOG00000023207	TYW3	84	55.217	Propithecus_coquereli
ENSACLG00000022833	tyw3	77	61.622	ENSPVAG00000002356	TYW3	73	61.622	Pteropus_vampyrus
ENSACLG00000022833	tyw3	98	100.000	ENSPNYG00000017982	tyw3	77	100.000	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000022833	tyw3	92	60.606	ENSPNAG00000028431	tyw3	89	60.606	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000022833	tyw3	77	64.865	ENSRNOG00000028328	Tyw3	62	64.865	Rattus_norvegicus
ENSACLG00000022833	tyw3	87	56.459	ENSRROG00000034171	TYW3	80	56.459	Rhinopithecus_roxellana
ENSACLG00000022833	tyw3	76	31.481	YGL050W	-	78	31.019	Saccharomyces_cerevisiae
ENSACLG00000022833	tyw3	90	54.626	ENSSBOG00000022917	TYW3	87	54.626	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACLG00000022833	tyw3	98	54.118	ENSSFOG00015021842	tyw3	97	54.118	Scleropages_formosus
ENSACLG00000022833	tyw3	100	62.593	ENSSMAG00000019609	tyw3	97	62.593	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000022833	tyw3	100	68.657	ENSSDUG00000003674	tyw3	100	68.657	Seriola_dumerili
ENSACLG00000022833	tyw3	100	68.284	ENSSLDG00000010425	tyw3	100	68.284	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000022833	tyw3	66	52.663	ENSSARG00000001097	TYW3	83	52.663	Sorex_araneus
ENSACLG00000022833	tyw3	87	54.245	ENSSPUG00000007880	TYW3	90	50.826	Sphenodon_punctatus
ENSACLG00000022833	tyw3	100	64.388	ENSSPAG00000013786	tyw3	100	65.468	Stegastes_partitus
ENSACLG00000022833	tyw3	89	57.944	ENSSSCG00000003779	TYW3	81	57.944	Sus_scrofa
ENSACLG00000022833	tyw3	100	57.934	ENSTRUG00000023563	tyw3	100	57.934	Takifugu_rubripes
ENSACLG00000022833	tyw3	79	67.021	ENSTNIG00000003368	tyw3	94	67.021	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000022833	tyw3	97	52.245	ENSTBEG00000017002	TYW3	93	52.245	Tupaia_belangeri
ENSACLG00000022833	tyw3	91	56.818	ENSTTRG00000010464	TYW3	82	56.818	Tursiops_truncatus
ENSACLG00000022833	tyw3	95	52.191	ENSUAMG00000010803	TYW3	98	52.191	Ursus_americanus
ENSACLG00000022833	tyw3	95	52.590	ENSUMAG00000006460	TYW3	96	52.590	Ursus_maritimus
ENSACLG00000022833	tyw3	76	63.388	ENSVPAG00000006900	TYW3	97	63.388	Vicugna_pacos
ENSACLG00000022833	tyw3	87	56.757	ENSVVUG00000006902	TYW3	78	56.757	Vulpes_vulpes
ENSACLG00000022833	tyw3	77	65.761	ENSXETG00000002996	tyw3	86	60.000	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000022833	tyw3	100	55.344	ENSXCOG00000000715	tyw3	100	55.344	Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000022833	tyw3	100	54.104	ENSXMAG00000006464	tyw3	100	54.104	Xiphophorus_maculatus