EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000022853 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1611 bases
Position: chr18:30377502-30379112
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000033713	RVT_1	PF00078.27	2.4e-43	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000034515	-	1611	-	ENSACLP00000033713	536 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000022853	-	79	48.605	ENSACLG00000004579	-	100	48.605
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ENSACLG00000022853	-	82	58.219	ENSACLG00000004232	-	99	58.219
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ENSACLG00000022853	-	51	31.022	ENSACLG00000024352	-	56	31.387
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Orthologs

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