EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000023747 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 802 bases
Position: chr9:34423165-34423966
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000035071	MMR_HSR1	PF01926.23	1.9e-09	1	1

Transcripts

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ENSACLT00000035897	-	717	-	ENSACLP00000035071	238 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

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ENSACLG00000023747	-	83	39.899	ENSACLG00000011913	-	59	39.899
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ENSACLG00000023747	-	100	77.311	ENSACLG00000023760	-	100	77.311
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ENSACLG00000023747	-	93	41.333	ENSACLG00000005232	-	85	41.333
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ENSACLG00000023747	-	83	39.423	ENSACLG00000003763	-	61	39.423
ENSACLG00000023747	-	96	66.228	ENSACLG00000023555	-	97	66.228
ENSACLG00000023747	-	80	31.771	ENSACLG00000000859	-	69	31.771
ENSACLG00000023747	-	84	49.751	ENSACLG00000016933	-	68	49.751
ENSACLG00000023747	-	82	38.384	ENSACLG00000014795	-	67	38.384
ENSACLG00000023747	-	84	34.483	ENSACLG00000016222	-	71	34.483
ENSACLG00000023747	-	84	47.761	ENSACLG00000001936	-	73	47.761
ENSACLG00000023747	-	72	37.572	ENSACLG00000023728	-	79	37.572

Orthologs

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ENSACLG00000023747	-	85	48.039	ENSAPOG00000007322	-	70	48.039	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000023747	-	85	47.291	ENSAPOG00000006169	-	57	47.291	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000023747	-	84	48.241	ENSAPOG00000006488	-	77	48.241	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000023747	-	84	48.768	ENSAPOG00000021159	-	66	48.768	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000023747	-	54	44.030	ENSAPOG00000007361	-	75	44.030	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000023747	-	82	44.949	ENSAPOG00000022240	-	57	43.939	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000023747	-	92	38.182	ENSAPOG00000001268	-	52	38.182	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000023747	-	84	43.719	ENSAPOG00000014759	-	66	43.719	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000023747	-	83	45.226	ENSAPOG00000007333	-	58	44.724	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000023747	-	85	55.556	ENSAPOG00000008344	zgc:113625	73	55.556	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000023747	-	82	47.179	ENSAPOG00000011509	-	67	47.179	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000023747	-	83	42.929	ENSAPOG00000020897	-	75	42.929	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000023747	-	85	46.829	ENSAPOG00000012716	-	69	46.829	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000023747	-	77	41.848	ENSAPOG00000001262	-	88	41.848	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000023747	-	81	54.822	ENSAPOG00000014243	-	81	54.822	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000023747	-	89	45.581	ENSAPOG00000008063	-	68	45.581	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000023747	-	87	39.130	ENSAPOG00000001315	-	64	39.130	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000023747	-	84	57.214	ENSACIG00000014690	-	78	57.214	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000023747	-	82	55.330	ENSACIG00000014716	-	79	55.330	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000023747	-	88	43.128	ENSACIG00000008001	-	91	43.128	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000023747	-	96	49.583	ENSACIG00000014662	-	97	49.583	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000023747	-	96	41.921	ENSACIG00000000893	-	93	41.921	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000023747	-	83	43.939	ENSACIG00000020234	-	70	43.939	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000023747	-	84	54.000	ENSACIG00000014634	zgc:113625	81	53.731	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000023747	-	80	43.005	ENSACIG00000001596	-	76	43.005	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000023747	-	84	48.571	ENSACIG00000014745	-	95	48.571	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000023747	-	54	46.094	ENSACIG00000001465	-	78	46.094	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000023747	-	99	65.823	ENSACIG00000019524	-	99	65.823	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000023747	-	84	50.990	ENSACIG00000014680	-	87	50.990	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000023747	-	91	46.575	ENSACIG00000001455	-	80	46.575	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000023747	-	86	54.808	ENSACIG00000014655	-	78	54.808	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000023747	-	84	49.261	ENSACIG00000023381	-	80	49.261	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000023747	-	93	39.640	ENSACIG00000016502	-	94	39.640	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000023747	-	84	46.040	ENSACIG00000016888	-	66	46.040	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000023747	-	87	44.928	ENSACIG00000022370	-	74	44.928	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000023747	-	83	45.226	ENSACIG00000020225	-	68	45.226	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000023747	-	73	47.429	ENSACIG00000008666	-	85	47.429	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000023747	-	86	57.282	ENSACIG00000014646	zgc:113625	81	57.282	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000023747	-	87	42.857	ENSACIG00000007466	-	64	42.857	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000023747	-	84	45.771	ENSACIG00000001070	-	72	45.771	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000023747	-	84	48.000	ENSACIG00000022377	-	73	48.000	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000023747	-	81	43.590	ENSACIG00000020244	-	83	43.590	Amphilophus_citrinellus
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ENSACLG00000023747	-	84	48.500	ENSACIG00000022366	-	72	48.500	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000023747	-	89	44.340	ENSACIG00000004245	-	75	44.340	Amphilophus_citrinellus
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ENSACLG00000023747	-	90	42.791	ENSACIG00000007494	-	70	43.363	Amphilophus_citrinellus
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