EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000023788 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1625 bases
Position: chr1:14474012-14475636
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000035131	RVT_1	PF00078.27	7.9e-46	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000035958	-	1625	-	ENSACLP00000035131	513 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000023788	-	72	33.592	ENSACLG00000012447	-	81	33.592
ENSACLG00000023788	-	90	30.720	ENSACLG00000000230	-	99	30.720
ENSACLG00000023788	-	68	31.129	ENSACLG00000005746	-	82	31.129
ENSACLG00000023788	-	99	57.422	ENSACLG00000007954	-	77	57.422
ENSACLG00000023788	-	54	69.818	ENSACLG00000000505	-	78	69.818
ENSACLG00000023788	-	64	30.330	ENSACLG00000009484	-	81	30.330
ENSACLG00000023788	-	97	64.919	ENSACLG00000023590	-	99	64.919
ENSACLG00000023788	-	54	32.155	ENSACLG00000024587	-	74	32.155
ENSACLG00000023788	-	65	30.000	ENSACLG00000014503	-	83	30.000
ENSACLG00000023788	-	99	59.608	ENSACLG00000017241	-	85	59.608
ENSACLG00000023788	-	74	34.908	ENSACLG00000021422	-	96	34.908
ENSACLG00000023788	-	62	31.677	ENSACLG00000005259	-	99	31.677
ENSACLG00000023788	-	72	59.401	ENSACLG00000026307	-	100	59.401
ENSACLG00000023788	-	90	30.932	ENSACLG00000014911	-	73	30.932
ENSACLG00000023788	-	97	31.164	ENSACLG00000016231	-	87	31.164
ENSACLG00000023788	-	99	56.360	ENSACLG00000003707	-	62	56.360
ENSACLG00000023788	-	71	30.933	ENSACLG00000013955	-	91	30.933
ENSACLG00000023788	-	65	30.000	ENSACLG00000017836	-	83	30.000
ENSACLG00000023788	-	76	62.755	ENSACLG00000009848	-	89	62.755
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ENSACLG00000023788	-	61	98.071	ENSACLG00000016290	-	100	98.071
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ENSACLG00000023788	-	94	56.133	ENSACLG00000027577	-	78	56.133
ENSACLG00000023788	-	60	31.013	ENSACLG00000027578	-	81	31.013
ENSACLG00000023788	-	77	30.923	ENSACLG00000025576	-	54	30.923
ENSACLG00000023788	-	76	30.075	ENSACLG00000022277	-	97	30.075
ENSACLG00000023788	-	71	30.295	ENSACLG00000008836	-	70	30.295
ENSACLG00000023788	-	66	31.609	ENSACLG00000009903	-	61	31.609
ENSACLG00000023788	-	100	98.830	ENSACLG00000016956	-	92	98.830
ENSACLG00000023788	-	55	31.119	ENSACLG00000020587	-	76	30.000
ENSACLG00000023788	-	66	30.460	ENSACLG00000015507	-	63	30.460
ENSACLG00000023788	-	99	57.812	ENSACLG00000013374	-	59	57.812
ENSACLG00000023788	-	88	65.708	ENSACLG00000010366	-	99	65.708
ENSACLG00000023788	-	71	56.593	ENSACLG00000027508	-	80	56.593
ENSACLG00000023788	-	74	56.579	ENSACLG00000010907	-	97	56.579
ENSACLG00000023788	-	56	32.313	ENSACLG00000021947	-	95	32.313
ENSACLG00000023788	-	75	63.117	ENSACLG00000021942	-	56	63.117
ENSACLG00000023788	-	63	31.361	ENSACLG00000013213	-	93	31.361
ENSACLG00000023788	-	50	30.916	ENSACLG00000017280	-	73	30.916
ENSACLG00000023788	-	99	57.422	ENSACLG00000005489	-	77	57.422
ENSACLG00000023788	-	69	30.726	ENSACLG00000022352	-	73	30.726
ENSACLG00000023788	-	99	58.071	ENSACLG00000008551	-	92	58.071
ENSACLG00000023788	-	83	67.294	ENSACLG00000008558	-	90	67.294
ENSACLG00000023788	-	65	30.294	ENSACLG00000019298	-	80	30.294
ENSACLG00000023788	-	72	30.871	ENSACLG00000015704	-	62	30.871
ENSACLG00000023788	-	66	30.347	ENSACLG00000016058	-	77	30.347
ENSACLG00000023788	-	69	32.967	ENSACLG00000012352	-	74	32.967
ENSACLG00000023788	-	99	59.412	ENSACLG00000017200	-	50	59.412
ENSACLG00000023788	-	69	30.919	ENSACLG00000010775	-	82	30.919
ENSACLG00000023788	-	58	33.333	ENSACLG00000015324	-	78	33.333
ENSACLG00000023788	-	90	30.149	ENSACLG00000014642	-	78	30.149
ENSACLG00000023788	-	69	31.148	ENSACLG00000026286	-	96	31.148
ENSACLG00000023788	-	66	30.636	ENSACLG00000013281	-	84	30.636
ENSACLG00000023788	-	90	30.361	ENSACLG00000025009	-	99	30.361
ENSACLG00000023788	-	65	30.678	ENSACLG00000002058	-	83	30.678
ENSACLG00000023788	-	71	30.914	ENSACLG00000025310	-	84	30.914
ENSACLG00000023788	-	53	31.047	ENSACLG00000010553	-	57	31.183
ENSACLG00000023788	-	55	31.469	ENSACLG00000024392	-	71	31.469
ENSACLG00000023788	-	69	30.726	ENSACLG00000026062	-	51	30.726
ENSACLG00000023788	-	60	32.492	ENSACLG00000025611	-	78	32.492
ENSACLG00000023788	-	91	30.957	ENSACLG00000009807	-	67	30.957
ENSACLG00000023788	-	89	30.472	ENSACLG00000006688	-	99	30.472
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ENSACLG00000023788	-	62	36.842	ENSACLG00000007200	-	58	32.754
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ENSACLG00000023788	-	76	30.151	ENSACLG00000013575	-	82	30.151
ENSACLG00000023788	-	66	32.092	ENSACLG00000020388	-	94	31.686
ENSACLG00000023788	-	56	33.555	ENSACLG00000003644	-	90	33.555
ENSACLG00000023788	-	72	30.607	ENSACLG00000021583	-	90	30.607
ENSACLG00000023788	-	56	33.904	ENSACLG00000011058	-	61	33.904
ENSACLG00000023788	-	98	99.404	ENSACLG00000018002	-	59	99.404
ENSACLG00000023788	-	72	31.053	ENSACLG00000021775	-	96	31.053
ENSACLG00000023788	-	97	31.164	ENSACLG00000006988	-	74	31.164
ENSACLG00000023788	-	61	32.381	ENSACLG00000015445	-	83	32.381
ENSACLG00000023788	-	69	30.168	ENSACLG00000025391	-	60	30.168
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ENSACLG00000023788	-	99	57.812	ENSACLG00000002312	-	51	57.812
ENSACLG00000023788	-	65	30.294	ENSACLG00000002314	-	83	30.294
ENSACLG00000023788	-	75	30.456	ENSACLG00000001588	-	60	30.456
ENSACLG00000023788	-	54	36.140	ENSACLG00000019046	-	92	36.140
ENSACLG00000023788	-	100	61.793	ENSACLG00000000579	-	78	61.793
ENSACLG00000023788	-	50	33.080	ENSACLG00000004175	-	67	33.080
ENSACLG00000023788	-	71	30.563	ENSACLG00000008424	-	91	30.563
ENSACLG00000023788	-	91	30.550	ENSACLG00000018107	-	86	30.550
ENSACLG00000023788	-	66	35.756	ENSACLG00000004613	-	83	35.756
ENSACLG00000023788	-	63	31.928	ENSACLG00000025525	-	81	31.928
ENSACLG00000023788	-	65	30.588	ENSACLG00000024504	-	83	30.588
ENSACLG00000023788	-	79	30.144	ENSACLG00000017297	-	77	30.144
ENSACLG00000023788	-	61	30.938	ENSACLG00000022149	-	78	30.938
ENSACLG00000023788	-	71	31.200	ENSACLG00000013992	-	92	31.200
ENSACLG00000023788	-	88	31.169	ENSACLG00000022841	-	59	31.169
ENSACLG00000023788	-	50	33.080	ENSACLG00000008603	-	67	33.080
ENSACLG00000023788	-	65	30.294	ENSACLG00000003179	-	83	30.294
ENSACLG00000023788	-	58	34.539	ENSACLG00000018945	-	51	34.539
ENSACLG00000023788	-	65	30.383	ENSACLG00000005668	-	83	30.383
ENSACLG00000023788	-	59	98.339	ENSACLG00000020009	-	51	98.339
ENSACLG00000023788	-	51	36.059	ENSACLG00000001035	-	68	36.059
ENSACLG00000023788	-	76	30.151	ENSACLG00000021380	-	82	30.151
ENSACLG00000023788	-	60	32.063	ENSACLG00000012982	-	78	32.063
ENSACLG00000023788	-	69	30.168	ENSACLG00000004866	-	59	30.168
ENSACLG00000023788	-	69	30.447	ENSACLG00000013867	-	59	30.447
ENSACLG00000023788	-	54	30.035	ENSACLG00000021692	-	76	30.035
ENSACLG00000023788	-	99	56.360	ENSACLG00000020849	-	78	56.360
ENSACLG00000023788	-	64	31.378	ENSACLG00000012094	-	70	31.378
ENSACLG00000023788	-	64	32.845	ENSACLG00000027256	-	83	32.845
ENSACLG00000023788	-	90	30.233	ENSACLG00000022853	-	88	30.233
ENSACLG00000023788	-	99	56.360	ENSACLG00000008988	-	55	56.360
ENSACLG00000023788	-	85	57.931	ENSACLG00000027127	-	58	57.931
ENSACLG00000023788	-	76	61.735	ENSACLG00000001773	-	52	61.735
ENSACLG00000023788	-	100	98.830	ENSACLG00000019498	-	72	98.830
ENSACLG00000023788	-	85	97.489	ENSACLG00000026433	-	98	97.489
ENSACLG00000023788	-	71	30.270	ENSACLG00000001556	-	78	30.270
ENSACLG00000023788	-	99	58.398	ENSACLG00000001858	-	72	58.398

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000023788	-	88	54.566	ENSAPEG00000014494	-	99	54.566	Amphiprion_percula
ENSACLG00000023788	-	97	37.870	ENSAMXG00000035582	-	98	37.795	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000023788	-	62	32.822	ENSCPBG00000005177	-	83	32.822	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000023788	-	56	38.966	ENSCPBG00000001455	-	78	38.966	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000023788	-	76	30.982	ENSCPBG00000022715	-	86	30.982	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000023788	-	70	30.854	ENSCPBG00000002764	-	65	30.854	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000023788	-	73	30.366	ENSCPBG00000001408	-	87	30.366	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000023788	-	76	31.579	ENSCPBG00000024353	-	77	31.579	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000023788	-	55	39.298	ENSCPBG00000003199	-	83	39.298	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000023788	-	61	33.022	ENSCPBG00000011561	-	81	33.022	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000023788	-	68	34.278	ENSCPBG00000019838	-	97	34.278	Chrysemys_picta_bellii
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