EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000024565 (Gene tree)
Gene ID: 113022530
Gene Symbol: eefsec
Alias: zgc:123265
Full Name: eukaryotic elongation factor%2C selenocysteine-tRNA specific
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 15463 bases
Position: chr5:21340697-21356159
Accession: 113022530
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000036291	GTP_EFTU	PF00009.27	8.9e-30	1	1
ENSACLP00000036270	GTP_EFTU	PF00009.27	2.7e-29	1	1
ENSACLP00000036291	MMR_HSR1	PF01926.23	1e-06	1	1
ENSACLP00000036270	MMR_HSR1	PF01926.23	2.3e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000037129	-	5907	-	ENSACLP00000036270	585 (aa)	XP_026023799	UPI000329FD45
ENSACLT00000037151	-	1113	-	ENSACLP00000036291	370 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACLG00000024565's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACLG00000024565's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000024565	eefsec	98	65.480	ENSG00000132394	EEFSEC	99	61.921	Homo_sapiens
ENSACLG00000024565	eefsec	100	95.000	ENSAPOG00000015931	eefsec	100	94.188	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000024565	eefsec	75	63.717	ENSAMEG00000015165	EEFSEC	88	62.611	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000024565	eefsec	98	95.041	ENSACIG00000022407	eefsec	99	97.628	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000024565	eefsec	100	94.615	ENSAOCG00000008603	eefsec	100	94.188	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000024565	eefsec	100	95.000	ENSAPEG00000017090	eefsec	100	94.359	Amphiprion_percula
ENSACLG00000024565	eefsec	99	95.294	ENSATEG00000002753	eefsec	100	90.769	Anabas_testudineus
ENSACLG00000024565	eefsec	73	67.506	ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	67.506	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000024565	eefsec	98	64.769	ENSANAG00000032691	EEFSEC	99	62.252	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000024565	eefsec	98	83.267	ENSAMXG00000002260	eefsec	98	74.828	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000024565	eefsec	98	70.588	ENSBTAG00000030962	EEFSEC	99	70.866	Bos_taurus
ENSACLG00000024565	eefsec	79	43.137	WBGene00008133	efsc-1	94	31.978	Caenorhabditis_elegans
ENSACLG00000024565	eefsec	98	64.413	ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	61.488	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000024565	eefsec	98	64.211	ENSCAFG00000004135	EEFSEC	80	61.741	Canis_familiaris
ENSACLG00000024565	eefsec	98	64.211	ENSCAFG00020004811	EEFSEC	99	61.741	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000024565	eefsec	98	69.020	ENSCHIG00000021838	EEFSEC	99	62.689	Capra_hircus
ENSACLG00000024565	eefsec	98	65.125	ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.500	Carlito_syrichta
ENSACLG00000024565	eefsec	83	56.151	ENSCAPG00000000084	EEFSEC	98	54.980	Cavia_aperea
ENSACLG00000024565	eefsec	98	66.544	ENSCPOG00000024352	EEFSEC	99	71.269	Cavia_porcellus
ENSACLG00000024565	eefsec	98	64.664	ENSCCAG00000031336	EEFSEC	99	61.881	Cebus_capucinus
ENSACLG00000024565	eefsec	98	65.125	ENSCATG00000019414	EEFSEC	99	61.818	Cercocebus_atys
ENSACLG00000024565	eefsec	98	65.809	ENSCLAG00000006973	EEFSEC	99	70.522	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000024565	eefsec	98	64.769	ENSCSAG00000008599	EEFSEC	99	61.589	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000024565	eefsec	98	69.337	ENSCPBG00000014356	EEFSEC	86	68.939	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000024565	eefsec	97	65.414	ENSCSAVG00000002208	-	100	59.060	Ciona_savignyi
ENSACLG00000024565	eefsec	98	64.413	ENSCANG00000031492	EEFSEC	99	61.248	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000024565	eefsec	98	66.058	ENSCGRG00001018089	Eefsec	99	62.040	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000024565	eefsec	97	65.683	ENSCGRG00000010063	Eefsec	98	70.787	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000024565	eefsec	100	92.748	ENSCSEG00000003008	eefsec	99	93.701	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000024565	eefsec	100	93.462	ENSCVAG00000005381	eefsec	100	90.085	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000024565	eefsec	98	85.259	ENSDARG00000004696	eefsec	99	76.430	Danio_rerio
ENSACLG00000024565	eefsec	98	66.065	ENSDNOG00000008925	EEFSEC	99	62.810	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000024565	eefsec	83	52.000	ENSDORG00000000264	Eefsec	84	73.770	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000024565	eefsec	83	58.300	FBgn0034627	eEFSec	95	48.851	Drosophila_melanogaster
ENSACLG00000024565	eefsec	98	55.814	ENSETEG00000007406	EEFSEC	99	55.316	Echinops_telfairi
ENSACLG00000024565	eefsec	71	74.490	ENSEBUG00000015029	eefsec	93	51.504	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000024565	eefsec	98	64.643	ENSEASG00005006786	EEFSEC	99	62.521	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000024565	eefsec	98	64.643	ENSECAG00000016565	EEFSEC	99	62.687	Equus_caballus
ENSACLG00000024565	eefsec	98	80.763	ENSELUG00000016632	eefsec	98	81.456	Esox_lucius
ENSACLG00000024565	eefsec	98	64.664	ENSFCAG00000006153	EEFSEC	99	62.376	Felis_catus
ENSACLG00000024565	eefsec	83	65.859	ENSFALG00000007901	EEFSEC	99	65.859	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000024565	eefsec	83	60.878	ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	60.080	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000024565	eefsec	100	94.615	ENSFHEG00000007155	eefsec	100	90.256	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000024565	eefsec	99	79.825	ENSGMOG00000007705	eefsec	99	78.559	Gadus_morhua
ENSACLG00000024565	eefsec	98	68.635	ENSGALG00000038684	EEFSEC	99	67.742	Gallus_gallus
ENSACLG00000024565	eefsec	100	93.846	ENSGAFG00000021692	eefsec	100	86.838	Gambusia_affinis
ENSACLG00000024565	eefsec	99	92.337	ENSGACG00000000793	eefsec	99	89.913	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000024565	eefsec	98	67.528	ENSGAGG00000002059	EEFSEC	97	66.667	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000024565	eefsec	86	62.644	ENSGGOG00000001445	EEFSEC	98	61.877	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000024565	eefsec	100	100.000	ENSHBUG00000008917	eefsec	100	99.316	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000024565	eefsec	98	66.544	ENSHGLG00000000094	EEFSEC	99	68.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000024565	eefsec	97	66.544	ENSHGLG00100011393	EEFSEC	94	61.720	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000024565	eefsec	99	85.185	ENSHCOG00000004193	eefsec	99	83.562	Hippocampus_comes
ENSACLG00000024565	eefsec	99	78.731	ENSIPUG00000017291	eefsec	98	75.530	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000024565	eefsec	83	61.992	ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	61.122	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000024565	eefsec	72	70.741	ENSJJAG00000020703	-	99	70.741	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000024565	eefsec	100	95.385	ENSKMAG00000019907	eefsec	100	90.769	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000024565	eefsec	100	93.846	ENSLBEG00000017908	eefsec	100	90.769	Labrus_bergylta
ENSACLG00000024565	eefsec	77	79.429	ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	70.254	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000024565	eefsec	99	78.201	ENSLOCG00000014535	eefsec	98	78.028	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000024565	eefsec	98	63.370	ENSLAFG00000001997	EEFSEC	99	60.403	Loxodonta_africana
ENSACLG00000024565	eefsec	98	65.125	ENSMFAG00000042128	EEFSEC	99	61.755	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000024565	eefsec	82	60.404	ENSMMUG00000018663	EEFSEC	99	59.596	Macaca_mulatta
ENSACLG00000024565	eefsec	98	65.125	ENSMNEG00000028574	EEFSEC	99	61.589	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000024565	eefsec	83	60.947	ENSMLEG00000041771	EEFSEC	93	60.158	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000024565	eefsec	100	90.256	ENSMAMG00000023964	eefsec	99	94.466	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000024565	eefsec	100	100.000	ENSMZEG00005009380	eefsec	100	100.000	Maylandia_zebra
ENSACLG00000024565	eefsec	66	65.075	ENSMGAG00000007243	EEFSEC	100	65.075	Meleagris_gallopavo
ENSACLG00000024565	eefsec	82	75.000	ENSMAUG00000011197	Eefsec	99	70.741	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000024565	eefsec	98	66.058	ENSMOCG00000017748	Eefsec	99	71.111	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000024565	eefsec	98	92.541	ENSMMOG00000021820	eefsec	99	95.257	Mola_mola
ENSACLG00000024565	eefsec	82	75.439	ENSMODG00000008034	EEFSEC	81	65.863	Monodelphis_domestica
ENSACLG00000024565	eefsec	97	94.231	ENSMALG00000016211	eefsec	98	91.845	Monopterus_albus
ENSACLG00000024565	eefsec	98	66.423	MGP_CAROLIEiJ_G0028627	Eefsec	99	71.481	Mus_caroli
ENSACLG00000024565	eefsec	98	66.423	ENSMUSG00000033216	Eefsec	99	71.481	Mus_musculus
ENSACLG00000024565	eefsec	98	66.423	MGP_PahariEiJ_G0022366	Eefsec	99	71.481	Mus_pahari
ENSACLG00000024565	eefsec	98	66.423	MGP_SPRETEiJ_G0029640	Eefsec	99	71.481	Mus_spretus
ENSACLG00000024565	eefsec	97	64.413	ENSMPUG00000017340	EEFSEC	95	61.755	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000024565	eefsec	83	61.067	ENSMLUG00000004261	EEFSEC	99	59.406	Myotis_lucifugus
ENSACLG00000024565	eefsec	72	71.111	ENSNGAG00000023278	-	99	71.111	Nannospalax_galili
ENSACLG00000024565	eefsec	100	99.231	ENSNBRG00000002387	eefsec	100	99.231	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000024565	eefsec	98	64.769	ENSNLEG00000014303	EEFSEC	99	61.424	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000024565	eefsec	83	64.575	ENSMEUG00000005747	EEFSEC	99	63.360	Notamacropus_eugenii
ENSACLG00000024565	eefsec	97	65.818	ENSOPRG00000011276	EEFSEC	99	62.876	Ochotona_princeps
ENSACLG00000024565	eefsec	98	65.683	ENSODEG00000002928	EEFSEC	99	70.412	Octodon_degus
ENSACLG00000024565	eefsec	82	97.904	ENSONIG00000019038	eefsec	100	97.904	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000024565	eefsec	82	64.826	ENSOANG00000009108	EEFSEC	99	64.417	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACLG00000024565	eefsec	97	66.545	ENSOCUG00000016517	EEFSEC	99	63.043	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000024565	eefsec	100	91.538	ENSORLG00000001377	eefsec	99	91.440	Oryzias_latipes
ENSACLG00000024565	eefsec	100	91.538	ENSORLG00020000729	eefsec	99	91.440	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000024565	eefsec	100	91.538	ENSORLG00015001986	eefsec	100	86.838	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000024565	eefsec	83	83.640	ENSOMEG00000010071	eefsec	89	83.231	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000024565	eefsec	73	64.045	ENSOGAG00000014084	EEFSEC	97	63.146	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000024565	eefsec	64	61.658	ENSOARG00000004600	EEFSEC	100	60.622	Ovis_aries
ENSACLG00000024565	eefsec	98	65.125	ENSPPAG00000030936	EEFSEC	99	61.589	Pan_paniscus
ENSACLG00000024565	eefsec	98	65.480	ENSPPRG00000002846	EEFSEC	99	62.975	Panthera_pardus
ENSACLG00000024565	eefsec	85	61.612	ENSPTIG00000013855	EEFSEC	92	60.769	Panthera_tigris_altaica
ENSACLG00000024565	eefsec	98	65.125	ENSPTRG00000015353	EEFSEC	99	61.589	Pan_troglodytes
ENSACLG00000024565	eefsec	98	65.125	ENSPANG00000017041	EEFSEC	99	61.755	Papio_anubis
ENSACLG00000024565	eefsec	98	85.259	ENSPKIG00000005220	eefsec	97	81.818	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000024565	eefsec	81	81.481	ENSPSIG00000015135	EEFSEC	98	68.352	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000024565	eefsec	99	87.732	ENSPMGG00000020300	eefsec	99	86.059	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000024565	eefsec	98	66.058	ENSPEMG00000013677	Eefsec	99	71.111	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000024565	eefsec	83	75.000	ENSPMAG00000006779	eefsec	98	67.730	Petromyzon_marinus
ENSACLG00000024565	eefsec	82	63.265	ENSPCIG00000020494	EEFSEC	99	62.525	Phascolarctos_cinereus
ENSACLG00000024565	eefsec	100	94.231	ENSPFOG00000003748	eefsec	100	87.521	Poecilia_formosa
ENSACLG00000024565	eefsec	99	94.531	ENSPLAG00000018012	eefsec	99	87.608	Poecilia_latipinna
ENSACLG00000024565	eefsec	100	94.231	ENSPMEG00000001202	eefsec	100	87.863	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000024565	eefsec	100	94.231	ENSPREG00000012235	eefsec	100	88.889	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000024565	eefsec	98	64.413	ENSPPYG00000013436	EEFSEC	99	61.424	Pongo_abelii
ENSACLG00000024565	eefsec	71	75.926	ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	56.822	Procavia_capensis
ENSACLG00000024565	eefsec	98	68.359	ENSPCOG00000023432	EEFSEC	99	61.167	Propithecus_coquereli
ENSACLG00000024565	eefsec	98	67.181	ENSPVAG00000007070	EEFSEC	64	67.181	Pteropus_vampyrus
ENSACLG00000024565	eefsec	100	99.615	ENSPNYG00000005726	eefsec	100	99.615	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000024565	eefsec	98	79.167	ENSPNAG00000016724	eefsec	99	75.521	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000024565	eefsec	98	66.667	ENSRNOG00000012954	Eefsec	99	70.356	Rattus_norvegicus
ENSACLG00000024565	eefsec	98	64.769	ENSRBIG00000032635	EEFSEC	99	61.755	Rhinopithecus_bieti
ENSACLG00000024565	eefsec	68	70.120	ENSRROG00000030260	-	85	68.605	Rhinopithecus_roxellana
ENSACLG00000024565	eefsec	82	61.010	ENSSBOG00000031478	EEFSEC	99	60.202	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACLG00000024565	eefsec	82	63.061	ENSSHAG00000014760	EEFSEC	99	62.729	Sarcophilus_harrisii
ENSACLG00000024565	eefsec	97	84.524	ENSSFOG00015021109	eefsec	98	76.061	Scleropages_formosus
ENSACLG00000024565	eefsec	98	93.254	ENSSMAG00000001454	eefsec	99	90.468	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000024565	eefsec	100	93.487	ENSSDUG00000007924	eefsec	100	91.126	Seriola_dumerili
ENSACLG00000024565	eefsec	97	93.487	ENSSLDG00000024985	eefsec	99	91.115	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000024565	eefsec	51	71.429	ENSSARG00000003789	-	51	71.429	Sorex_araneus
ENSACLG00000024565	eefsec	82	64.959	ENSSPUG00000004191	EEFSEC	100	65.314	Sphenodon_punctatus
ENSACLG00000024565	eefsec	100	96.538	ENSSPAG00000001320	eefsec	99	95.868	Stegastes_partitus
ENSACLG00000024565	eefsec	98	70.356	ENSSSCG00000011619	EEFSEC	99	70.356	Sus_scrofa
ENSACLG00000024565	eefsec	98	71.825	ENSTGUG00000007895	EEFSEC	99	66.044	Taeniopygia_guttata
ENSACLG00000024565	eefsec	99	93.846	ENSTRUG00000010327	eefsec	99	86.815	Takifugu_rubripes
ENSACLG00000024565	eefsec	99	91.406	ENSTNIG00000003225	eefsec	99	87.241	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000024565	eefsec	98	69.020	ENSTTRG00000000994	EEFSEC	99	62.814	Tursiops_truncatus
ENSACLG00000024565	eefsec	98	65.480	ENSUAMG00000017283	EEFSEC	99	62.583	Ursus_americanus
ENSACLG00000024565	eefsec	72	63.636	ENSVVUG00000018372	EEFSEC	90	62.727	Vulpes_vulpes
ENSACLG00000024565	eefsec	79	68.619	ENSXETG00000002066	eefsec	99	68.399	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000024565	eefsec	99	94.942	ENSXCOG00000019916	eefsec	99	87.801	Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000024565	eefsec	100	95.000	ENSXMAG00000001839	eefsec	100	89.231	Xiphophorus_maculatus