EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000024670 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 18411 bases
Position: chr18:4311303-4329713
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000036431	zf-C2H2	PF00096.26	8.4e-28	1	5
ENSACLP00000036431	zf-C2H2	PF00096.26	8.4e-28	2	5
ENSACLP00000036431	zf-C2H2	PF00096.26	8.4e-28	3	5
ENSACLP00000036431	zf-C2H2	PF00096.26	8.4e-28	4	5
ENSACLP00000036431	zf-C2H2	PF00096.26	8.4e-28	5	5
ENSACLP00000036431	zf-met	PF12874.7	4e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000037295	-	930	-	ENSACLP00000036431	309 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACLG00000024670's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACLG00000024670's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000024670	-	71	40.741	ENSACLG00000003679	-	74	40.741
ENSACLG00000024670	-	80	44.118	ENSACLG00000019499	-	92	44.118
ENSACLG00000024670	-	78	44.503	ENSACLG00000000411	-	91	44.503
ENSACLG00000024670	-	71	54.444	ENSACLG00000019424	-	96	44.751
ENSACLG00000024670	-	96	54.545	ENSACLG00000025163	-	99	57.346
ENSACLG00000024670	-	72	40.462	ENSACLG00000019674	-	95	38.579
ENSACLG00000024670	-	83	59.596	ENSACLG00000023979	-	97	59.596
ENSACLG00000024670	-	77	39.409	ENSACLG00000017996	prdm5	74	39.409
ENSACLG00000024670	-	71	35.443	ENSACLG00000022191	znf407	68	35.443
ENSACLG00000024670	-	71	44.505	ENSACLG00000020231	-	93	44.505
ENSACLG00000024670	-	72	45.304	ENSACLG00000019270	-	75	45.304
ENSACLG00000024670	-	77	43.069	ENSACLG00000014176	-	84	44.444
ENSACLG00000024670	-	72	44.371	ENSACLG00000017336	-	92	44.371
ENSACLG00000024670	-	68	35.220	ENSACLG00000007162	scrt1b	55	35.220
ENSACLG00000024670	-	79	44.886	ENSACLG00000001045	-	97	43.269
ENSACLG00000024670	-	98	46.980	ENSACLG00000006718	-	90	46.980
ENSACLG00000024670	-	78	41.000	ENSACLG00000022499	-	84	41.000
ENSACLG00000024670	-	98	48.163	ENSACLG00000021184	-	76	48.163
ENSACLG00000024670	-	94	59.116	ENSACLG00000025251	-	99	58.654
ENSACLG00000024670	-	87	38.922	ENSACLG00000017449	-	57	38.922
ENSACLG00000024670	-	98	53.049	ENSACLG00000019318	-	99	53.503
ENSACLG00000024670	-	78	45.055	ENSACLG00000007749	-	76	45.055
ENSACLG00000024670	-	71	47.619	ENSACLG00000021022	-	71	47.619
ENSACLG00000024670	-	69	41.294	ENSACLG00000014336	-	92	41.294
ENSACLG00000024670	-	99	52.273	ENSACLG00000024459	-	90	59.242
ENSACLG00000024670	-	74	46.575	ENSACLG00000017487	-	78	46.575
ENSACLG00000024670	-	70	41.981	ENSACLG00000014167	-	63	41.981
ENSACLG00000024670	-	76	46.528	ENSACLG00000000473	-	82	46.528
ENSACLG00000024670	-	69	46.980	ENSACLG00000005708	-	62	46.980
ENSACLG00000024670	-	72	40.488	ENSACLG00000022475	-	90	40.488
ENSACLG00000024670	-	84	47.857	ENSACLG00000008821	-	90	51.220
ENSACLG00000024670	-	83	45.588	ENSACLG00000023963	-	99	45.588
ENSACLG00000024670	-	78	45.604	ENSACLG00000007888	-	74	45.604
ENSACLG00000024670	-	96	50.769	ENSACLG00000006870	-	88	50.769
ENSACLG00000024670	-	76	36.321	ENSACLG00000020579	znf319b	84	36.321
ENSACLG00000024670	-	72	43.478	ENSACLG00000018716	-	82	43.478
ENSACLG00000024670	-	81	57.261	ENSACLG00000024294	-	79	60.748
ENSACLG00000024670	-	94	52.315	ENSACLG00000020615	-	98	53.913
ENSACLG00000024670	-	75	42.703	ENSACLG00000017941	-	62	42.857
ENSACLG00000024670	-	81	44.848	ENSACLG00000027692	-	84	44.848
ENSACLG00000024670	-	83	48.611	ENSACLG00000020393	-	90	50.952
ENSACLG00000024670	-	83	42.718	ENSACLG00000015816	-	93	45.588
ENSACLG00000024670	-	93	42.529	ENSACLG00000016841	-	72	42.529
ENSACLG00000024670	-	100	55.629	ENSACLG00000023513	-	97	50.794
ENSACLG00000024670	-	78	45.588	ENSACLG00000018701	-	76	45.588
ENSACLG00000024670	-	93	51.445	ENSACLG00000020975	-	99	51.445
ENSACLG00000024670	-	77	47.196	ENSACLG00000020339	-	53	47.196
ENSACLG00000024670	-	92	46.405	ENSACLG00000005795	-	62	46.405
ENSACLG00000024670	-	94	58.824	ENSACLG00000024957	-	98	60.190
ENSACLG00000024670	-	93	49.216	ENSACLG00000005615	-	79	58.000
ENSACLG00000024670	-	74	42.975	ENSACLG00000027053	gfi1b	59	42.975
ENSACLG00000024670	-	83	41.414	ENSACLG00000015843	-	98	43.318
ENSACLG00000024670	-	80	42.857	ENSACLG00000022302	-	97	46.354
ENSACLG00000024670	-	68	41.429	ENSACLG00000022305	-	90	41.429
ENSACLG00000024670	-	66	40.288	ENSACLG00000000521	-	91	40.288
ENSACLG00000024670	-	71	54.167	ENSACLG00000011658	-	78	54.167
ENSACLG00000024670	-	72	57.609	ENSACLG00000018707	-	95	57.609
ENSACLG00000024670	-	88	50.847	ENSACLG00000011710	-	99	48.571
ENSACLG00000024670	-	77	39.521	ENSACLG00000019094	-	78	44.030
ENSACLG00000024670	-	91	36.364	ENSACLG00000018551	snai2	54	37.615
ENSACLG00000024670	-	71	42.647	ENSACLG00000003546	-	58	42.647
ENSACLG00000024670	-	67	46.154	ENSACLG00000002844	-	82	46.154
ENSACLG00000024670	-	72	43.407	ENSACLG00000022497	-	90	43.407
ENSACLG00000024670	-	69	37.931	ENSACLG00000026461	-	56	37.931
ENSACLG00000024670	-	78	47.059	ENSACLG00000000487	-	87	47.059
ENSACLG00000024670	-	80	43.455	ENSACLG00000000537	-	98	43.750
ENSACLG00000024670	-	71	42.353	ENSACLG00000013454	-	70	42.197
ENSACLG00000024670	-	69	38.462	ENSACLG00000005594	ZNF319	88	37.624
ENSACLG00000024670	-	89	57.714	ENSACLG00000011642	-	99	57.714
ENSACLG00000024670	-	78	41.781	ENSACLG00000001368	-	89	41.781
ENSACLG00000024670	-	98	58.333	ENSACLG00000026703	-	86	59.906
ENSACLG00000024670	-	93	54.032	ENSACLG00000020474	-	94	54.032
ENSACLG00000024670	-	78	44.444	ENSACLG00000006528	-	96	46.000
ENSACLG00000024670	-	70	45.455	ENSACLG00000019167	-	86	38.863
ENSACLG00000024670	-	94	44.643	ENSACLG00000015462	-	60	44.643
ENSACLG00000024670	-	94	52.229	ENSACLG00000018746	-	98	50.239
ENSACLG00000024670	-	79	46.154	ENSACLG00000001018	-	88	46.154
ENSACLG00000024670	-	83	44.444	ENSACLG00000005617	-	61	48.315
ENSACLG00000024670	-	74	33.188	ENSACLG00000022287	-	65	34.222
ENSACLG00000024670	-	96	51.515	ENSACLG00000020610	-	84	51.515
ENSACLG00000024670	-	72	44.186	ENSACLG00000006702	-	76	44.186
ENSACLG00000024670	-	78	40.284	ENSACLG00000022360	-	96	41.143
ENSACLG00000024670	-	79	46.405	ENSACLG00000021045	-	75	46.939
ENSACLG00000024670	-	89	46.847	ENSACLG00000017576	-	88	50.000
ENSACLG00000024670	-	78	44.231	ENSACLG00000017329	-	85	46.429
ENSACLG00000024670	-	78	45.455	ENSACLG00000021846	-	86	45.455
ENSACLG00000024670	-	94	54.082	ENSACLG00000025196	-	99	54.082
ENSACLG00000024670	-	90	76.987	ENSACLG00000024647	-	96	76.987
ENSACLG00000024670	-	71	38.519	ENSACLG00000012712	znf646	69	38.519
ENSACLG00000024670	-	81	37.190	ENSACLG00000005694	-	50	45.455
ENSACLG00000024670	-	73	42.771	ENSACLG00000008624	-	77	42.604
ENSACLG00000024670	-	81	47.340	ENSACLG00000003332	-	99	47.340
ENSACLG00000024670	-	68	46.667	ENSACLG00000001258	-	88	46.667
ENSACLG00000024670	-	69	42.604	ENSACLG00000019482	-	74	42.604
ENSACLG00000024670	-	93	48.413	ENSACLG00000022505	-	96	48.413
ENSACLG00000024670	-	78	43.094	ENSACLG00000022383	-	96	43.094
ENSACLG00000024670	-	81	42.157	ENSACLG00000006697	-	69	44.444
ENSACLG00000024670	-	98	45.820	ENSACLG00000017801	-	80	45.820
ENSACLG00000024670	-	68	44.512	ENSACLG00000003229	-	92	44.512
ENSACLG00000024670	-	77	47.619	ENSACLG00000028002	-	87	47.619
ENSACLG00000024670	-	98	51.445	ENSACLG00000021343	-	98	55.172
ENSACLG00000024670	-	76	35.938	ENSACLG00000016648	-	64	35.938
ENSACLG00000024670	-	72	42.254	ENSACLG00000019349	-	71	42.254
ENSACLG00000024670	-	71	48.958	ENSACLG00000017849	-	77	48.958
ENSACLG00000024670	-	76	45.894	ENSACLG00000015989	-	89	45.894
ENSACLG00000024670	-	94	55.556	ENSACLG00000026538	-	99	55.556
ENSACLG00000024670	-	77	50.292	ENSACLG00000021056	-	54	50.292
ENSACLG00000024670	-	96	56.522	ENSACLG00000024308	-	98	60.092
ENSACLG00000024670	-	96	64.789	ENSACLG00000013935	-	99	64.789
ENSACLG00000024670	-	71	44.059	ENSACLG00000022482	-	79	44.059
ENSACLG00000024670	-	98	46.980	ENSACLG00000020333	-	90	46.980
ENSACLG00000024670	-	72	45.312	ENSACLG00000019291	-	90	45.312
ENSACLG00000024670	-	93	47.701	ENSACLG00000027424	-	61	47.701
ENSACLG00000024670	-	95	45.695	ENSACLG00000001507	-	96	45.695
ENSACLG00000024670	-	98	58.974	ENSACLG00000024491	-	95	54.587
ENSACLG00000024670	-	79	44.118	ENSACLG00000023941	-	88	44.118
ENSACLG00000024670	-	72	39.037	ENSACLG00000008606	-	88	39.037
ENSACLG00000024670	-	73	49.080	ENSACLG00000018700	-	99	49.080
ENSACLG00000024670	-	99	50.000	ENSACLG00000020268	-	90	51.351
ENSACLG00000024670	-	74	48.826	ENSACLG00000020260	-	100	48.826
ENSACLG00000024670	-	98	61.321	ENSACLG00000011237	-	97	59.211
ENSACLG00000024670	-	71	43.979	ENSACLG00000011239	-	74	43.979
ENSACLG00000024670	-	68	38.158	ENSACLG00000013033	-	81	38.158
ENSACLG00000024670	-	69	36.364	ENSACLG00000004663	-	71	36.364
ENSACLG00000024670	-	77	42.138	ENSACLG00000017925	-	68	42.138
ENSACLG00000024670	-	96	51.020	ENSACLG00000017939	-	95	54.348
ENSACLG00000024670	-	99	50.658	ENSACLG00000017321	-	85	50.658
ENSACLG00000024670	-	69	45.763	ENSACLG00000000102	-	54	45.763
ENSACLG00000024670	-	83	45.771	ENSACLG00000022439	-	75	45.771
ENSACLG00000024670	-	72	41.237	ENSACLG00000014600	-	91	41.237
ENSACLG00000024670	-	78	39.759	ENSACLG00000017411	-	87	43.500
ENSACLG00000024670	-	78	44.712	ENSACLG00000001003	-	88	44.712
ENSACLG00000024670	-	73	42.512	ENSACLG00000014365	-	94	42.609
ENSACLG00000024670	-	87	41.516	ENSACLG00000023305	-	98	52.632

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000024670	-	82	44.000	ENSACIG00000007882	-	77	45.361	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000024670	-	97	61.850	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	99	61.850	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000024670	-	76	41.447	ENSACIG00000008886	znf1164	84	41.447	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000024670	-	98	47.321	ENSATEG00000008667	-	65	47.321	Anabas_testudineus
ENSACLG00000024670	-	94	48.780	ENSATEG00000008683	si:ch211-241b2.1	89	48.780	Anabas_testudineus
ENSACLG00000024670	-	70	50.000	ENSAMXG00000029660	-	53	50.000	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000024670	-	72	52.356	ENSAMXG00000041650	-	86	52.356	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000024670	-	71	51.190	ENSAMXG00000043291	-	72	51.190	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000024670	-	72	39.869	ENSCSEG00000015585	-	88	39.869	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000024670	-	94	52.695	ENSDARG00000092605	znf1003	90	47.651	Danio_rerio
ENSACLG00000024670	-	71	52.315	ENSDARG00000099731	CABZ01066719.1	94	52.315	Danio_rerio
ENSACLG00000024670	-	92	45.763	ENSDARG00000102678	znf1181	90	45.578	Danio_rerio
ENSACLG00000024670	-	88	42.804	ENSDARG00000098613	si:dkey-15h8.16	90	42.804	Danio_rerio
ENSACLG00000024670	-	78	51.707	ENSDARG00000099890	CU207221.2	98	51.707	Danio_rerio
ENSACLG00000024670	-	77	51.923	ENSDARG00000103777	znf1001	98	54.082	Danio_rerio
ENSACLG00000024670	-	94	50.888	ENSDARG00000053165	zgc:113377	80	50.888	Danio_rerio
ENSACLG00000024670	-	83	50.575	ENSDARG00000113011	zgc:113102	84	52.941	Danio_rerio
ENSACLG00000024670	-	72	42.439	ENSEBUG00000015073	-	80	42.995	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000024670	-	98	41.772	ENSELUG00000024006	-	59	41.772	Esox_lucius
ENSACLG00000024670	-	98	39.241	ENSFHEG00000018209	-	67	47.143	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000024670	-	96	47.651	ENSFHEG00000013152	-	87	47.651	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000024670	-	86	51.282	ENSFHEG00000018009	-	53	51.282	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000024670	-	95	50.595	ENSFHEG00000014023	-	78	50.595	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000024670	-	96	38.162	ENSHBUG00000009953	-	82	39.645	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000024670	-	98	55.455	ENSHBUG00000018916	-	91	58.286	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000024670	-	78	46.465	ENSKMAG00000009563	-	75	44.898	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000024670	-	94	44.086	ENSKMAG00000014629	-	91	44.086	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000024670	-	95	47.826	ENSLBEG00000020461	-	92	48.889	Labrus_bergylta
ENSACLG00000024670	-	94	44.076	ENSLBEG00000028628	znf1174	73	44.076	Labrus_bergylta
ENSACLG00000024670	-	99	47.841	ENSMAMG00000014743	-	75	47.841	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000024670	-	68	45.810	ENSMZEG00005021426	-	76	45.810	Maylandia_zebra
ENSACLG00000024670	-	75	54.000	ENSMZEG00005025729	-	94	52.874	Maylandia_zebra
ENSACLG00000024670	-	89	60.000	ENSMZEG00005007426	-	87	59.649	Maylandia_zebra
ENSACLG00000024670	-	87	61.404	ENSMZEG00005027943	-	99	61.404	Maylandia_zebra
ENSACLG00000024670	-	98	61.702	ENSMZEG00005026470	-	87	57.037	Maylandia_zebra
ENSACLG00000024670	-	63	44.860	ENSMZEG00005005162	-	67	44.860	Maylandia_zebra
ENSACLG00000024670	-	75	36.735	ENSMZEG00005025568	-	79	38.235	Maylandia_zebra
ENSACLG00000024670	-	93	60.000	ENSMZEG00005027793	-	98	60.697	Maylandia_zebra
ENSACLG00000024670	-	72	36.190	ENSMZEG00005022161	-	95	42.857	Maylandia_zebra
ENSACLG00000024670	-	79	41.667	ENSMALG00000008638	-	57	41.667	Monopterus_albus
ENSACLG00000024670	-	97	45.070	ENSMALG00000018074	-	91	45.070	Monopterus_albus
ENSACLG00000024670	-	98	73.179	ENSNBRG00000000577	-	97	72.937	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000024670	-	69	39.568	ENSONIG00000006585	-	96	39.568	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000024670	-	71	44.324	ENSONIG00000013908	-	100	44.324	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000024670	-	69	41.622	ENSONIG00000003363	-	99	41.622	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000024670	-	70	46.847	ENSORLG00020019341	-	86	61.364	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000024670	-	95	44.444	ENSPKIG00000018633	-	63	44.444	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000024670	-	80	41.237	ENSPMGG00000001558	znf1174	53	42.222	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000024670	-	72	39.779	ENSPFOG00000011766	-	100	40.183	Poecilia_formosa
ENSACLG00000024670	-	71	48.120	ENSPFOG00000001144	-	93	46.835	Poecilia_formosa
ENSACLG00000024670	-	98	42.157	ENSPLAG00000016561	zgc:113348	91	48.718	Poecilia_latipinna
ENSACLG00000024670	-	96	46.237	ENSPMEG00000007573	zgc:113343	63	46.237	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000024670	-	72	45.263	ENSPREG00000001514	zgc:113343	63	45.263	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000024670	-	81	40.828	ENSPREG00000005538	-	71	34.597	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000024670	-	75	43.258	ENSPREG00000014105	-	85	43.258	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000024670	-	69	41.317	ENSPNYG00000024183	zgc:173577	98	41.317	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000024670	-	94	58.750	ENSSDUG00000008682	-	98	58.750	Seriola_dumerili
ENSACLG00000024670	-	70	45.205	ENSSPAG00000013109	si:ch211-241b2.1	69	45.205	Stegastes_partitus
ENSACLG00000024670	-	57	32.632	ENSSPAG00000009426	-	64	32.632	Stegastes_partitus
ENSACLG00000024670	-	76	43.429	ENSSPAG00000006539	-	97	43.429	Stegastes_partitus
ENSACLG00000024670	-	71	44.633	ENSTNIG00000000277	-	93	44.633	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000024670	-	72	44.048	ENSXCOG00000017871	zgc:113343	66	44.048	Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000024670	-	83	44.048	ENSXMAG00000019923	zgc:113343	64	44.048	Xiphophorus_maculatus