EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000024865 (Gene tree)
Gene ID: 113036397
Gene Symbol: urb1
Alias: mp:zf637-1-000544|zf637-1-000544
Full Name: URB1 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 19371 bases
Position: chr14:8337218-8356588
Accession: 113036397
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000036715	Npa1	PF11707.8	2.3e-77	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000037588	-	9808	-	ENSACLP00000036715	2255 (aa)	XP_026048513	UPI000E40131C

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000024865	urb1	99	45.011	ENSG00000142207	URB1	99	45.033	Homo_sapiens
ENSACLG00000024865	urb1	100	74.580	ENSAPOG00000020308	urb1	99	76.659	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000024865	urb1	99	44.551	ENSAMEG00000011998	URB1	99	45.035	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000024865	urb1	98	80.027	ENSACIG00000003248	urb1	99	80.027	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000024865	urb1	97	77.186	ENSAOCG00000010364	urb1	99	77.186	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000024865	urb1	97	77.719	ENSAPEG00000010758	urb1	99	77.719	Amphiprion_percula
ENSACLG00000024865	urb1	100	74.663	ENSATEG00000011790	urb1	100	74.663	Anabas_testudineus
ENSACLG00000024865	urb1	97	46.604	ENSAPLG00000012791	URB1	99	46.649	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000024865	urb1	99	45.009	ENSACAG00000002817	URB1	97	45.583	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000024865	urb1	99	44.958	ENSANAG00000024617	URB1	99	44.832	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000024865	urb1	99	48.924	ENSAMXG00000012306	urb1	99	48.924	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000024865	urb1	99	43.935	ENSBTAG00000012412	URB1	99	44.444	Bos_taurus
ENSACLG00000024865	urb1	99	44.820	ENSCJAG00000009118	URB1	99	44.696	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000024865	urb1	99	43.891	ENSCAFG00000008892	URB1	99	43.997	Canis_familiaris
ENSACLG00000024865	urb1	99	43.647	ENSCAFG00020025987	-	99	43.874	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000024865	urb1	99	43.193	ENSCAFG00020025994	-	99	43.193	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000024865	urb1	99	43.965	ENSCHIG00000015645	URB1	99	44.195	Capra_hircus
ENSACLG00000024865	urb1	100	44.759	ENSTSYG00000013286	URB1	99	44.667	Carlito_syrichta
ENSACLG00000024865	urb1	98	43.042	ENSCAPG00000015589	URB1	99	43.036	Cavia_aperea
ENSACLG00000024865	urb1	100	43.666	ENSCPOG00000006748	URB1	99	43.660	Cavia_porcellus
ENSACLG00000024865	urb1	99	44.938	ENSCCAG00000021299	URB1	99	45.134	Cebus_capucinus
ENSACLG00000024865	urb1	100	45.059	ENSCATG00000042630	URB1	99	45.189	Cercocebus_atys
ENSACLG00000024865	urb1	100	44.963	ENSCLAG00000005262	URB1	99	45.302	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000024865	urb1	100	44.333	ENSCSAG00000009584	URB1	99	44.464	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000024865	urb1	99	47.458	ENSCPBG00000006454	URB1	99	47.757	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000024865	urb1	100	45.020	ENSCANG00000031088	URB1	99	45.181	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000024865	urb1	99	44.894	ENSCGRG00001010616	Urb1	99	44.749	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000024865	urb1	98	44.933	ENSCGRG00000015840	Urb1	99	44.929	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000024865	urb1	100	66.271	ENSCSEG00000012616	urb1	99	66.271	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000024865	urb1	94	70.947	ENSCVAG00000009076	urb1	98	72.871	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000024865	urb1	99	53.616	ENSDARG00000060308	urb1	99	53.616	Danio_rerio
ENSACLG00000024865	urb1	85	47.790	ENSDNOG00000015586	URB1	99	47.790	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000024865	urb1	99	44.759	ENSDORG00000006735	Urb1	99	45.035	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000024865	urb1	85	52.727	ENSETEG00000009080	URB1	85	52.727	Echinops_telfairi
ENSACLG00000024865	urb1	99	43.750	ENSEASG00005007711	URB1	99	44.012	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000024865	urb1	95	55.846	ENSECAG00000013206	URB1	99	55.846	Equus_caballus
ENSACLG00000024865	urb1	99	56.428	ENSELUG00000020516	urb1	99	56.604	Esox_lucius
ENSACLG00000024865	urb1	99	44.168	ENSFCAG00000002177	URB1	99	44.356	Felis_catus
ENSACLG00000024865	urb1	97	42.883	ENSFALG00000004636	URB1	98	42.927	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000024865	urb1	99	45.086	ENSFDAG00000007288	URB1	95	44.710	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000024865	urb1	100	65.286	ENSFHEG00000000202	urb1	99	68.642	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000024865	urb1	93	57.927	ENSGMOG00000001838	urb1	94	57.890	Gadus_morhua
ENSACLG00000024865	urb1	99	46.808	ENSGALG00000015887	URB1	99	46.984	Gallus_gallus
ENSACLG00000024865	urb1	96	70.864	ENSGAFG00000020694	urb1	99	70.864	Gambusia_affinis
ENSACLG00000024865	urb1	99	73.253	ENSGACG00000011703	urb1	99	73.164	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000024865	urb1	99	47.084	ENSGAGG00000022544	URB1	99	47.336	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000024865	urb1	99	44.934	ENSGGOG00000000285	URB1	99	45.102	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000024865	urb1	100	99.290	ENSHBUG00000001904	urb1	100	99.290	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000024865	urb1	99	43.546	ENSHGLG00000004907	URB1	99	43.540	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000024865	urb1	99	43.810	ENSHGLG00100010749	URB1	99	43.805	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000024865	urb1	74	77.419	ENSHCOG00000018683	urb1	99	71.456	Hippocampus_comes
ENSACLG00000024865	urb1	99	49.079	ENSIPUG00000014721	urb1	99	49.210	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000024865	urb1	99	44.680	ENSSTOG00000004539	URB1	99	44.567	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000024865	urb1	93	72.912	ENSKMAG00000006001	urb1	98	75.699	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000024865	urb1	95	73.426	ENSLBEG00000027208	urb1	99	73.426	Labrus_bergylta
ENSACLG00000024865	urb1	99	44.933	ENSLACG00000017059	URB1	99	45.284	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000024865	urb1	99	53.409	ENSLOCG00000009190	urb1	98	53.897	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000024865	urb1	99	45.022	ENSLAFG00000010407	URB1	98	45.022	Loxodonta_africana
ENSACLG00000024865	urb1	100	44.880	ENSMFAG00000034391	URB1	97	45.035	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000024865	urb1	100	44.846	ENSMMUG00000010295	URB1	99	45.000	Macaca_mulatta
ENSACLG00000024865	urb1	100	44.096	ENSMNEG00000032981	URB1	99	44.251	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000024865	urb1	100	45.054	ENSMLEG00000041435	URB1	99	45.507	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000024865	urb1	99	70.459	ENSMAMG00000011238	urb1	99	70.370	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000024865	urb1	100	92.763	ENSMZEG00005011862	urb1	100	92.763	Maylandia_zebra
ENSACLG00000024865	urb1	98	46.476	ENSMGAG00000014512	URB1	99	46.837	Meleagris_gallopavo
ENSACLG00000024865	urb1	92	53.695	ENSMAUG00000010516	Urb1	99	52.950	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000024865	urb1	99	44.663	ENSMICG00000016424	URB1	99	44.867	Microcebus_murinus
ENSACLG00000024865	urb1	99	43.799	ENSMOCG00000012613	Urb1	98	44.283	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000024865	urb1	99	44.425	ENSMODG00000021076	URB1	99	44.738	Monodelphis_domestica
ENSACLG00000024865	urb1	98	74.895	ENSMALG00000017411	urb1	99	74.895	Monopterus_albus
ENSACLG00000024865	urb1	99	44.122	MGP_CAROLIEiJ_G0020948	Urb1	99	44.122	Mus_caroli
ENSACLG00000024865	urb1	99	44.092	ENSMUSG00000039929	Urb1	99	44.092	Mus_musculus
ENSACLG00000024865	urb1	99	44.067	MGP_PahariEiJ_G0016653	Urb1	99	44.067	Mus_pahari
ENSACLG00000024865	urb1	99	44.000	MGP_SPRETEiJ_G0021854	Urb1	99	44.000	Mus_spretus
ENSACLG00000024865	urb1	99	44.952	ENSMPUG00000001123	URB1	99	45.193	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000024865	urb1	99	43.747	ENSNGAG00000001905	Urb1	98	43.977	Nannospalax_galili
ENSACLG00000024865	urb1	83	91.580	ENSNBRG00000001049	urb1	99	91.580	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000024865	urb1	98	43.867	ENSNLEG00000026872	URB1	99	43.733	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000024865	urb1	93	49.904	ENSMEUG00000010828	URB1	95	41.603	Notamacropus_eugenii
ENSACLG00000024865	urb1	99	43.057	ENSOPRG00000013482	URB1	99	43.382	Ochotona_princeps
ENSACLG00000024865	urb1	99	44.031	ENSODEG00000002587	URB1	98	44.312	Octodon_degus
ENSACLG00000024865	urb1	100	96.188	ENSONIG00000005599	urb1	100	96.188	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000024865	urb1	99	45.166	ENSOCUG00000009381	URB1	99	45.495	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000024865	urb1	99	68.819	ENSORLG00000003429	urb1	99	68.819	Oryzias_latipes
ENSACLG00000024865	urb1	99	68.463	ENSORLG00020013785	urb1	99	68.463	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000024865	urb1	99	65.755	ENSORLG00015019421	urb1	99	67.481	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000024865	urb1	77	69.231	ENSOMEG00000002094	urb1	98	69.231	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000024865	urb1	100	44.972	ENSOGAG00000017140	URB1	99	45.370	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000024865	urb1	95	48.407	ENSOARG00000013679	URB1	99	47.771	Ovis_aries
ENSACLG00000024865	urb1	99	44.934	ENSPPAG00000003423	URB1	99	45.102	Pan_paniscus
ENSACLG00000024865	urb1	99	44.314	ENSPPRG00000023131	URB1	99	44.562	Panthera_pardus
ENSACLG00000024865	urb1	87	45.752	ENSPTIG00000016125	URB1	93	45.752	Panthera_tigris_altaica
ENSACLG00000024865	urb1	99	44.846	ENSPTRG00000013852	URB1	99	45.013	Pan_troglodytes
ENSACLG00000024865	urb1	100	45.035	ENSPANG00000021964	URB1	99	45.166	Papio_anubis
ENSACLG00000024865	urb1	99	54.150	ENSPKIG00000003683	urb1	98	54.747	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000024865	urb1	99	45.002	ENSPEMG00000021205	Urb1	98	45.002	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000024865	urb1	80	32.590	ENSPMAG00000009733	URB1	99	32.761	Petromyzon_marinus
ENSACLG00000024865	urb1	99	43.897	ENSPCIG00000016350	URB1	99	44.275	Phascolarctos_cinereus
ENSACLG00000024865	urb1	97	69.941	ENSPLAG00000004371	urb1	100	69.941	Poecilia_latipinna
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ENSACLG00000024865	urb1	100	70.057	ENSPREG00000013453	urb1	100	70.057	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000024865	urb1	99	44.508	ENSPPYG00000011359	URB1	99	44.802	Pongo_abelii
ENSACLG00000024865	urb1	99	39.745	ENSPCAG00000007430	URB1	99	39.789	Procavia_capensis
ENSACLG00000024865	urb1	99	44.774	ENSPCOG00000022695	URB1	99	45.158	Propithecus_coquereli
ENSACLG00000024865	urb1	99	43.827	ENSPVAG00000000889	URB1	98	44.071	Pteropus_vampyrus
ENSACLG00000024865	urb1	100	92.923	ENSPNYG00000010589	urb1	100	92.923	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000024865	urb1	99	50.198	ENSPNAG00000019324	urb1	99	50.534	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000024865	urb1	99	43.761	ENSRNOG00000002080	Urb1	99	43.761	Rattus_norvegicus
ENSACLG00000024865	urb1	100	45.000	ENSRBIG00000033122	URB1	99	45.000	Rhinopithecus_bieti
ENSACLG00000024865	urb1	100	44.976	ENSRROG00000040237	URB1	99	44.976	Rhinopithecus_roxellana
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ENSACLG00000024865	urb1	99	46.070	ENSSPUG00000012447	URB1	99	46.309	Sphenodon_punctatus
ENSACLG00000024865	urb1	99	77.778	ENSSPAG00000006325	urb1	99	77.910	Stegastes_partitus
ENSACLG00000024865	urb1	99	43.816	ENSSSCG00000032024	URB1	98	44.182	Sus_scrofa
ENSACLG00000024865	urb1	74	48.333	ENSTGUG00000013442	URB1	100	48.243	Taeniopygia_guttata
ENSACLG00000024865	urb1	100	69.027	ENSTRUG00000009372	urb1	100	68.850	Takifugu_rubripes
ENSACLG00000024865	urb1	99	67.351	ENSTNIG00000016277	urb1	99	67.158	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000024865	urb1	77	49.425	ENSTBEG00000010044	URB1	79	49.425	Tupaia_belangeri
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ENSACLG00000024865	urb1	99	44.372	ENSVVUG00000000551	URB1	99	44.606	Vulpes_vulpes
ENSACLG00000024865	urb1	99	44.915	ENSXETG00000009895	urb1	98	44.915	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000024865	urb1	100	65.546	ENSXCOG00000005500	urb1	98	68.366	Xiphophorus_couchianus
ENSACLG00000024865	urb1	100	66.033	ENSXMAG00000007253	urb1	98	68.626	Xiphophorus_maculatus