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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000024913 (Gene tree)
Gene ID: 113025396
Gene Symbol: sbno1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1 (Drosophila)
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 12442 bases
Position: chr7:11685732-11698173
Accession: ZDB-GENE-080522-2
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000036826	ResIII	PF04851.15	4.2e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000037699	-	3957	-	ENSACLP00000036826	1318 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000024913	sbno1	73	63.532	ENSACLG00000005090	si:ch73-63e15.2	61	63.532

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.375	ENSG00000139697	SBNO1	99	74.284	Homo_sapiens
ENSACLG00000024913	sbno1	86	93.520	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	93.783	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.235	ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	73.500	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000024913	sbno1	100	89.868	ENSACIG00000008088	sbno1	99	89.941	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000024913	sbno1	100	87.986	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	88.273	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000024913	sbno1	100	87.914	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	88.201	Amphiprion_percula
ENSACLG00000024913	sbno1	100	87.907	ENSATEG00000006667	sbno1	100	87.835	Anabas_testudineus
ENSACLG00000024913	sbno1	98	75.091	ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	74.964	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000024913	sbno1	98	75.982	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	75.437	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000024913	sbno1	99	76.135	ENSANAG00000029958	-	99	75.974	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000024913	sbno1	100	77.754	ENSAMXG00000019473	sbno1	100	78.183	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000024913	sbno1	100	76.003	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	76.208	Bos_taurus
ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.180	ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	74.087	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.288	ENSCAFG00000007503	SBNO1	99	78.928	Canis_familiaris
ENSACLG00000024913	sbno1	99	75.109	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	75.238	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000024913	sbno1	100	74.377	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	74.429	Capra_hircus
ENSACLG00000024913	sbno1	99	76.061	ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	76.194	Carlito_syrichta
ENSACLG00000024913	sbno1	97	77.432	ENSCAPG00000000384	SBNO1	98	77.217	Cavia_aperea
ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.767	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	74.425	Cavia_porcellus
ENSACLG00000024913	sbno1	99	71.742	ENSCCAG00000035316	SBNO1	99	71.512	Cebus_capucinus
ENSACLG00000024913	sbno1	97	77.063	ENSCATG00000008239	SBNO1	97	77.005	Cercocebus_atys
ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.570	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	73.960	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000024913	sbno1	86	81.288	ENSCSAG00000002064	SBNO1	99	81.207	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000024913	sbno1	95	72.624	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	72.684	Choloepus_hoffmanni
ENSACLG00000024913	sbno1	98	76.493	ENSCPBG00000025968	SBNO1	98	75.570	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000024913	sbno1	99	70.899	ENSCANG00000042688	-	99	70.437	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000024913	sbno1	100	73.860	ENSCGRG00001017470	Sbno1	99	73.767	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000024913	sbno1	100	73.860	ENSCGRG00000004756	Sbno1	99	73.767	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000024913	sbno1	100	84.531	ENSCSEG00000011919	sbno1	100	85.620	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000024913	sbno1	100	85.015	ENSCVAG00000007038	sbno1	100	84.555	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000024913	sbno1	100	78.951	ENSDARG00000099080	sbno1	100	79.023	Danio_rerio
ENSACLG00000024913	sbno1	99	77.333	ENSDNOG00000017147	SBNO1	96	77.333	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000024913	sbno1	99	70.965	ENSDORG00000015261	Sbno1	99	70.210	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000024913	sbno1	92	71.429	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	71.429	Echinops_telfairi
ENSACLG00000024913	sbno1	73	64.230	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	63.382	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000024913	sbno1	97	76.987	ENSECAG00000006127	SBNO1	99	74.374	Equus_caballus
ENSACLG00000024913	sbno1	81	77.278	ENSEEUG00000003793	SBNO1	76	77.049	Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000024913	sbno1	100	77.580	ENSELUG00000002886	sbno1	99	78.663	Esox_lucius
ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.465	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	74.302	Felis_catus
ENSACLG00000024913	sbno1	98	74.873	ENSFALG00000009273	SBNO1	99	75.036	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000024913	sbno1	100	73.481	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	73.338	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000024913	sbno1	100	84.868	ENSFHEG00000007360	sbno1	100	84.632	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000024913	sbno1	97	83.372	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	83.744	Gadus_morhua
ENSACLG00000024913	sbno1	88	74.597	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	75.061	Gallus_gallus
ENSACLG00000024913	sbno1	100	87.731	ENSGAFG00000003960	sbno1	99	87.509	Gambusia_affinis
ENSACLG00000024913	sbno1	97	86.927	ENSGACG00000015633	sbno1	99	87.020	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000024913	sbno1	98	76.105	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	75.258	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000024913	sbno1	99	76.208	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	76.047	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000024913	sbno1	100	92.668	ENSHBUG00000011910	sbno1	100	92.668	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.552	ENSHGLG00000014165	-	99	73.869	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000024913	sbno1	97	82.440	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	83.811	Hippocampus_comes
ENSACLG00000024913	sbno1	100	77.969	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	78.469	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000024913	sbno1	99	76.281	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	76.194	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.161	ENSJJAG00000001741	Sbno1	99	74.140	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000024913	sbno1	100	89.614	ENSKMAG00000009696	sbno1	100	89.466	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000024913	sbno1	100	85.591	ENSLBEG00000007623	sbno1	99	86.383	Labrus_bergylta
ENSACLG00000024913	sbno1	100	70.735	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	72.977	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000024913	sbno1	100	78.255	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	78.152	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.019	ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	74.122	Loxodonta_africana
ENSACLG00000024913	sbno1	99	75.146	ENSMFAG00000031429	SBNO1	99	74.909	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000024913	sbno1	99	75.146	ENSMMUG00000011496	SBNO1	99	74.909	Macaca_mulatta
ENSACLG00000024913	sbno1	99	77.014	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	76.855	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000024913	sbno1	100	86.823	ENSMAMG00000005473	sbno1	100	86.467	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000024913	sbno1	98	75.127	ENSMGAG00000003274	SBNO1	99	75.215	Meleagris_gallopavo
ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.671	ENSMICG00000006573	-	99	74.724	Microcebus_murinus
ENSACLG00000024913	sbno1	100	73.299	ENSMOCG00000009390	Sbno1	99	73.626	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000024913	sbno1	100	84.496	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	85.089	Mola_mola
ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.056	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	73.997	Monodelphis_domestica
ENSACLG00000024913	sbno1	100	87.426	ENSMALG00000001056	sbno1	100	87.426	Monopterus_albus
ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.803	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	90.351	Mus_caroli
ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.839	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	90.351	Mus_musculus
ENSACLG00000024913	sbno1	99	75.000	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	90.351	Mus_pahari
ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.731	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	90.351	Mus_spretus
ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.465	ENSMPUG00000001658	SBNO1	99	74.230	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.355	ENSMLUG00000017159	SBNO1	99	73.997	Myotis_lucifugus
ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.322	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	73.502	Nannospalax_galili
ENSACLG00000024913	sbno1	100	95.526	ENSNBRG00000019189	sbno1	100	95.526	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000024913	sbno1	99	73.280	ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	73.035	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000024913	sbno1	60	69.811	ENSMEUG00000008768	-	91	75.362	Notamacropus_eugenii
ENSACLG00000024913	sbno1	99	73.729	ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	73.854	Ochotona_princeps
ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.982	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	74.642	Octodon_degus
ENSACLG00000024913	sbno1	100	92.445	ENSONIG00000015348	sbno1	100	92.445	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000024913	sbno1	100	72.598	ENSOCUG00000002441	SBNO1	96	72.429	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000024913	sbno1	100	83.476	ENSORLG00000001593	sbno1	100	83.618	Oryzias_latipes
ENSACLG00000024913	sbno1	100	83.464	ENSORLG00020015216	sbno1	100	83.607	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000024913	sbno1	100	83.535	ENSORLG00015002726	sbno1	100	83.678	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000024913	sbno1	99	85.090	ENSOMEG00000019313	sbno1	99	84.648	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000024913	sbno1	100	74.200	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	74.251	Ovis_aries
ENSACLG00000024913	sbno1	99	76.281	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	76.120	Pan_paniscus
ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.465	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	74.302	Panthera_pardus
ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.553	ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	74.462	Panthera_tigris_altaica
ENSACLG00000024913	sbno1	99	76.281	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	76.120	Pan_troglodytes
ENSACLG00000024913	sbno1	99	76.428	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	76.120	Papio_anubis
ENSACLG00000024913	sbno1	100	77.243	ENSPKIG00000001441	sbno1	100	77.116	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000024913	sbno1	98	76.642	ENSPSIG00000009572	-	99	75.570	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000024913	sbno1	92	71.296	ENSPSIG00000009256	-	99	70.675	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000024913	sbno1	100	73.932	ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	73.838	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000024913	sbno1	99	76.173	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	75.806	Phascolarctos_cinereus
ENSACLG00000024913	sbno1	100	85.470	ENSPFOG00000005069	sbno1	100	85.328	Poecilia_formosa
ENSACLG00000024913	sbno1	100	85.470	ENSPLAG00000015015	sbno1	100	85.328	Poecilia_latipinna
ENSACLG00000024913	sbno1	100	85.409	ENSPMEG00000021212	sbno1	100	85.267	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000024913	sbno1	100	85.650	ENSPREG00000017746	sbno1	99	86.323	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.624	ENSPPYG00000005084	SBNO1	99	74.194	Pongo_abelii
ENSACLG00000024913	sbno1	89	67.623	ENSPCAG00000008634	SBNO1	88	66.712	Procavia_capensis
ENSACLG00000024913	sbno1	99	75.897	ENSPCOG00000024277	SBNO1	99	75.809	Propithecus_coquereli
ENSACLG00000024913	sbno1	87	83.800	ENSPVAG00000015304	SBNO1	87	83.800	Pteropus_vampyrus
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ENSACLG00000024913	sbno1	100	78.286	ENSPNAG00000015622	sbno1	100	78.357	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.429	ENSRNOG00000001064	Sbno1	99	74.265	Rattus_norvegicus
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ENSACLG00000024913	sbno1	97	75.382	ENSSBOG00000015422	SBNO1	97	75.309	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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