EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000025119 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2715 bases
Position: chr19:11841334-11844048
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000037081	RVT_1	PF00078.27	2.1e-45	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000037962	-	2715	-	ENSACLP00000037081	904 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000025119	-	52	53.782	ENSACLG00000012219	-	99	53.782
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ENSACLG00000025119	-	89	46.097	ENSACLG00000008383	-	97	46.097
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ENSACLG00000025119	-	71	50.615	ENSACLG00000022841	-	82	50.615
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ENSACLG00000025119	-	100	99.004	ENSACLG00000012014	-	100	99.004
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ENSACLG00000025119	-	62	100.000	ENSACLG00000021814	-	100	100.000
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ENSACLG00000025119	-	75	49.057	ENSACLG00000000736	-	97	49.057
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ENSACLG00000025119	-	51	79.221	ENSACLG00000005844	-	84	79.221
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ENSACLG00000025119	-	64	45.704	ENSACLG00000015704	-	94	45.704
ENSACLG00000025119	-	54	95.400	ENSACLG00000019420	-	99	95.400
ENSACLG00000025119	-	92	41.044	ENSACLG00000021051	-	99	41.044
ENSACLG00000025119	-	89	39.975	ENSACLG00000019519	-	98	39.975
ENSACLG00000025119	-	67	44.389	ENSACLG00000014642	-	99	44.389
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ENSACLG00000025119	-	59	49.074	ENSACLG00000017297	-	99	49.074
ENSACLG00000025119	-	83	42.252	ENSACLG00000012019	-	99	42.252
ENSACLG00000025119	-	56	39.766	ENSACLG00000008832	-	99	40.156
ENSACLG00000025119	-	56	30.435	ENSACLG00000017241	-	83	30.040
ENSACLG00000025119	-	91	41.507	ENSACLG00000009939	-	83	41.507
ENSACLG00000025119	-	75	41.545	ENSACLG00000009807	-	94	41.691
ENSACLG00000025119	-	76	43.927	ENSACLG00000002614	-	99	43.927
ENSACLG00000025119	-	82	40.511	ENSACLG00000015331	-	93	40.027
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ENSACLG00000025119	-	73	31.241	ENSACLG00000006988	-	98	30.657
ENSACLG00000025119	-	100	95.686	ENSACLG00000005662	-	100	95.686
ENSACLG00000025119	-	59	96.834	ENSACLG00000009903	-	95	96.834
ENSACLG00000025119	-	82	98.919	ENSACLG00000013844	-	96	98.919
ENSACLG00000025119	-	92	45.305	ENSACLG00000008391	-	98	45.305
ENSACLG00000025119	-	52	42.979	ENSACLG00000008218	-	100	42.979
ENSACLG00000025119	-	58	47.238	ENSACLG00000013932	-	96	47.238
ENSACLG00000025119	-	58	99.231	ENSACLG00000024400	-	100	99.231

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000025119	-	67	37.971	ENSATEG00000023197	-	94	37.914	Anabas_testudineus
ENSACLG00000025119	-	94	45.233	ENSATEG00000010674	-	99	45.233	Anabas_testudineus
ENSACLG00000025119	-	90	35.366	ENSATEG00000005707	-	99	35.610	Anabas_testudineus
ENSACLG00000025119	-	94	45.233	ENSATEG00000019512	-	99	45.233	Anabas_testudineus
ENSACLG00000025119	-	68	48.864	ENSATEG00000002739	-	99	48.864	Anabas_testudineus
ENSACLG00000025119	-	62	41.652	ENSATEG00000004798	-	97	41.652	Anabas_testudineus
ENSACLG00000025119	-	51	52.030	ENSATEG00000004857	-	99	52.030	Anabas_testudineus
ENSACLG00000025119	-	55	50.797	ENSATEG00000015931	-	99	50.797	Anabas_testudineus
ENSACLG00000025119	-	99	36.203	ENSATEG00000012907	-	92	36.424	Anabas_testudineus
ENSACLG00000025119	-	68	48.701	ENSATEG00000015490	-	99	48.701	Anabas_testudineus
ENSACLG00000025119	-	56	50.392	ENSATEG00000014607	-	98	50.392	Anabas_testudineus
ENSACLG00000025119	-	99	35.126	ENSAMXG00000040053	-	92	35.449	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000025119	-	63	35.355	ENSAMXG00000041363	-	97	35.355	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000025119	-	89	57.442	ENSAMXG00000039914	-	99	57.442	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000025119	-	53	35.135	ENSAMXG00000037974	-	91	35.135	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000025119	-	88	32.801	ENSAMXG00000036646	-	89	34.158	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000025119	-	83	48.079	ENSAMXG00000043096	-	99	48.079	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000025119	-	52	63.057	ENSAMXG00000043740	-	95	63.057	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000025119	-	60	51.554	ENSAMXG00000040860	-	98	51.554	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000025119	-	72	60.305	ENSAMXG00000032588	-	99	60.305	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000025119	-	89	57.248	ENSAMXG00000043574	-	99	57.248	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000025119	-	72	31.657	ENSAMXG00000033415	-	88	33.283	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000025119	-	77	36.415	ENSAMXG00000030246	-	97	36.662	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000025119	-	70	59.688	ENSAMXG00000041791	-	95	59.688	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000025119	-	54	65.432	ENSAMXG00000043461	-	98	65.432	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000025119	-	88	46.424	ENSAMXG00000033551	-	95	46.424	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000025119	-	55	63.928	ENSFHEG00000008959	-	100	63.928	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000025119	-	51	43.750	ENSHBUG00000015916	-	98	43.750	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000025119	-	64	39.661	ENSHBUG00000016298	-	99	39.661	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000025119	-	58	43.238	ENSIPUG00000024068	-	96	43.238	Ictalurus_punctatus
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ENSACLG00000025119	-	56	46.322	ENSOMEG00000011035	-	99	46.521	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000025119	-	69	31.522	ENSOMEG00000023554	-	97	31.522	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000025119	-	57	85.493	ENSOMEG00000006808	-	100	85.493	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000025119	-	77	82.302	ENSOMEG00000019368	-	100	82.302	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000025119	-	75	41.134	ENSOMEG00000010070	-	100	41.270	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000025119	-	100	78.982	ENSOMEG00000001464	-	99	78.982	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000025119	-	99	42.700	ENSOMEG00000011087	-	80	42.700	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000025119	-	58	85.769	ENSOMEG00000014130	-	100	85.769	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000025119	-	85	47.781	ENSOMEG00000022566	-	99	47.781	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000025119	-	56	86.056	ENSOMEG00000014892	-	100	86.056	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000025119	-	52	47.569	ENSPKIG00000025243	-	99	47.569	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000025119	-	51	43.668	ENSPREG00000009370	-	99	43.668	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000025119	-	55	72.065	ENSPREG00000012366	-	96	72.065	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000025119	-	59	70.377	ENSPREG00000006761	-	99	70.377	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000025119	-	53	47.500	ENSPREG00000000138	-	95	47.712	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000025119	-	50	48.661	ENSPREG00000011748	-	85	48.661	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000025119	-	57	48.438	ENSPREG00000002150	-	96	48.438	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000025119	-	50	70.732	ENSPREG00000015023	-	96	70.732	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000025119	-	62	45.811	ENSPNYG00000010678	-	99	45.811	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000025119	-	74	97.765	ENSPNYG00000008434	-	100	97.765	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000025119	-	58	57.875	ENSPNAG00000001796	-	99	57.875	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000025119	-	57	30.524	ENSSFOG00015004172	-	89	30.524	Scleropages_formosus
ENSACLG00000025119	-	64	41.186	ENSSLDG00000007615	-	97	41.117	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000025119	-	100	43.139	ENSXMAG00000021781	-	93	43.139	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000025119	-	79	40.694	ENSXMAG00000020920	-	99	40.694	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000025119	-	100	43.139	ENSXMAG00000021735	-	81	43.139	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000025119	-	61	47.397	ENSXMAG00000020915	-	99	47.397	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000025119	-	67	46.470	ENSXMAG00000027958	-	93	46.470	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000025119	-	59	69.680	ENSXMAG00000024274	-	99	69.680	Xiphophorus_maculatus
ENSACLG00000025119	-	61	47.576	ENSXMAG00000027740	-	99	47.576	Xiphophorus_maculatus