EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000025875 (Gene tree)
Gene ID: 113013412
Gene Symbol: prpf6
Alias: c20orf14|fc12b02|wu:fa05f07|wu:fc12b02|zgc:65913
Full Name: pre-mRNA processing factor 6
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 22644 bases
Position: chr20:9656022-9678665
Accession: 113013412
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000038352	PRP1_N	PF06424.12	2.1e-57	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000039250	-	8205	-	ENSACLP00000038352	969 (aa)	XP_026010073	UPI00032A0E47

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000025875	prpf6	96	92.349	ENSG00000101161	PRPF6	100	91.923	Homo_sapiens
ENSACLG00000025875	prpf6	100	98.142	ENSAPOG00000010395	prpf6	100	98.142	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000025875	prpf6	96	91.720	ENSAMEG00000001916	PRPF6	99	91.295	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000025875	prpf6	100	98.968	ENSACIG00000019862	prpf6	100	98.968	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000025875	prpf6	100	98.246	ENSAOCG00000012988	prpf6	100	98.246	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000025875	prpf6	96	91.720	ENSAPEG00000008301	prpf6	100	91.935	Amphiprion_percula
ENSACLG00000025875	prpf6	100	97.730	ENSATEG00000005581	prpf6	100	97.730	Anabas_testudineus
ENSACLG00000025875	prpf6	96	92.880	ENSACAG00000006464	PRPF6	95	92.455	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000025875	prpf6	96	92.349	ENSANAG00000012661	PRPF6	100	92.815	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000025875	prpf6	97	94.597	ENSAMXG00000001929	prpf6	100	92.828	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000025875	prpf6	96	92.667	ENSBTAG00000011656	PRPF6	100	92.242	Bos_taurus
ENSACLG00000025875	prpf6	96	92.349	ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	91.923	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000025875	prpf6	96	92.774	ENSCAFG00000013165	PRPF6	100	92.349	Canis_familiaris
ENSACLG00000025875	prpf6	96	92.774	ENSCAFG00020002050	PRPF6	100	92.349	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000025875	prpf6	96	92.667	ENSCHIG00000018187	PRPF6	100	92.242	Capra_hircus
ENSACLG00000025875	prpf6	96	92.774	ENSTSYG00000007814	PRPF6	100	92.349	Carlito_syrichta
ENSACLG00000025875	prpf6	93	91.930	ENSCAPG00000015077	PRPF6	100	91.058	Cavia_aperea
ENSACLG00000025875	prpf6	96	93.199	ENSCPOG00000007518	PRPF6	100	92.774	Cavia_porcellus
ENSACLG00000025875	prpf6	96	89.267	ENSCCAG00000024564	PRPF6	100	88.842	Cebus_capucinus
ENSACLG00000025875	prpf6	96	92.455	ENSCATG00000037473	PRPF6	100	92.030	Cercocebus_atys
ENSACLG00000025875	prpf6	96	89.692	ENSCLAG00000003854	PRPF6	100	89.267	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000025875	prpf6	96	87.751	ENSCSAG00000016742	PRPF6	100	87.328	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000025875	prpf6	81	77.886	ENSCHOG00000003315	-	98	77.686	Choloepus_hoffmanni
ENSACLG00000025875	prpf6	98	91.675	ENSCPBG00000013964	PRPF6	96	92.766	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000025875	prpf6	96	72.622	ENSCING00000008817	-	99	72.199	Ciona_intestinalis
ENSACLG00000025875	prpf6	96	92.242	ENSCANG00000038230	PRPF6	100	91.817	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000025875	prpf6	96	93.199	ENSCGRG00001022666	Prpf6	100	92.774	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000025875	prpf6	96	92.366	ENSCSEG00000018561	prpf6	100	92.366	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000025875	prpf6	100	96.698	ENSCVAG00000010550	prpf6	100	96.698	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000025875	prpf6	100	92.930	ENSDARG00000091367	prpf6	100	94.386	Danio_rerio
ENSACLG00000025875	prpf6	96	92.349	ENSDNOG00000040544	PRPF6	100	92.030	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000025875	prpf6	87	92.407	ENSDORG00000005406	Prpf6	100	92.407	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000025875	prpf6	96	71.720	FBgn0036828	CG6841	99	71.828	Drosophila_melanogaster
ENSACLG00000025875	prpf6	83	91.520	ENSETEG00000004447	PRPF6	85	91.520	Echinops_telfairi
ENSACLG00000025875	prpf6	96	86.138	ENSEBUG00000008835	prpf6	100	85.714	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000025875	prpf6	99	90.402	ENSEASG00005023115	PRPF6	100	92.242	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000025875	prpf6	96	88.417	ENSECAG00000013983	PRPF6	100	87.991	Equus_caballus
ENSACLG00000025875	prpf6	86	95.833	ENSEEUG00000000180	PRPF6	81	95.833	Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000025875	prpf6	97	95.016	ENSELUG00000001945	prpf6	94	95.016	Esox_lucius
ENSACLG00000025875	prpf6	96	92.774	ENSFCAG00000001183	PRPF6	100	92.349	Felis_catus
ENSACLG00000025875	prpf6	96	92.804	ENSFALG00000010326	-	98	92.487	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000025875	prpf6	96	86.702	ENSFALG00000006046	-	97	86.980	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000025875	prpf6	96	91.711	ENSFDAG00000006451	PRPF6	100	92.404	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000025875	prpf6	100	97.420	ENSFHEG00000000560	prpf6	100	97.420	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000025875	prpf6	97	94.062	ENSGMOG00000015622	prpf6	99	93.531	Gadus_morhua
ENSACLG00000025875	prpf6	96	93.092	ENSGALG00000006001	PRPF6	100	92.774	Gallus_gallus
ENSACLG00000025875	prpf6	100	93.189	ENSGAFG00000021109	prpf6	100	93.189	Gambusia_affinis
ENSACLG00000025875	prpf6	97	95.551	ENSGACG00000002576	prpf6	100	95.551	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000025875	prpf6	98	91.771	ENSGAGG00000008653	PRPF6	96	92.872	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000025875	prpf6	96	92.349	ENSGGOG00000016876	PRPF6	100	91.923	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000025875	prpf6	100	100.000	ENSHBUG00000004496	prpf6	100	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000025875	prpf6	96	93.092	ENSHGLG00000009222	PRPF6	100	92.667	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000025875	prpf6	93	93.021	ENSHGLG00100016600	PRPF6	100	92.585	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000025875	prpf6	100	95.769	ENSHCOG00000011513	prpf6	100	95.769	Hippocampus_comes
ENSACLG00000025875	prpf6	100	92.813	ENSIPUG00000004912	prpf6	100	92.813	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000025875	prpf6	96	90.658	ENSSTOG00000002922	PRPF6	100	89.809	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACLG00000025875	prpf6	96	93.199	ENSJJAG00000000836	Prpf6	100	92.774	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000025875	prpf6	100	97.730	ENSKMAG00000017800	prpf6	100	97.730	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000025875	prpf6	100	96.594	ENSLBEG00000012582	prpf6	100	96.594	Labrus_bergylta
ENSACLG00000025875	prpf6	98	92.708	ENSLOCG00000004827	prpf6	96	92.340	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000025875	prpf6	96	92.455	ENSLAFG00000005272	PRPF6	100	92.030	Loxodonta_africana
ENSACLG00000025875	prpf6	96	92.242	ENSMFAG00000037542	PRPF6	100	91.817	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000025875	prpf6	96	86.093	ENSMMUG00000015558	PRPF6	98	93.414	Macaca_mulatta
ENSACLG00000025875	prpf6	96	79.767	ENSMNEG00000045555	PRPF6	100	79.343	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000025875	prpf6	100	97.626	ENSMAMG00000010718	prpf6	100	97.626	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000025875	prpf6	97	99.467	ENSMZEG00005015261	-	100	99.467	Maylandia_zebra
ENSACLG00000025875	prpf6	90	99.543	ENSMZEG00005026539	prpf6	100	99.543	Maylandia_zebra
ENSACLG00000025875	prpf6	93	93.239	ENSMGAG00000006634	PRPF6	100	92.912	Meleagris_gallopavo
ENSACLG00000025875	prpf6	96	93.199	ENSMAUG00000013969	Prpf6	100	92.774	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000025875	prpf6	84	91.849	ENSMICG00000017793	PRPF6	98	91.862	Microcebus_murinus
ENSACLG00000025875	prpf6	96	93.092	ENSMOCG00000001701	Prpf6	100	92.667	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000025875	prpf6	96	97.527	ENSMMOG00000020419	prpf6	100	97.527	Mola_mola
ENSACLG00000025875	prpf6	93	93.835	ENSMODG00000017051	PRPF6	99	93.342	Monodelphis_domestica
ENSACLG00000025875	prpf6	95	98.152	ENSMALG00000000089	prpf6	100	98.152	Monopterus_albus
ENSACLG00000025875	prpf6	96	86.929	MGP_CAROLIEiJ_G0024814	Prpf6	100	96.296	Mus_caroli
ENSACLG00000025875	prpf6	96	93.199	ENSMUSG00000002455	Prpf6	100	96.296	Mus_musculus
ENSACLG00000025875	prpf6	96	93.199	MGP_PahariEiJ_G0026262	Prpf6	100	96.296	Mus_pahari
ENSACLG00000025875	prpf6	96	93.199	MGP_SPRETEiJ_G0025741	Prpf6	100	96.296	Mus_spretus
ENSACLG00000025875	prpf6	86	92.953	ENSMPUG00000008673	PRPF6	98	92.953	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000025875	prpf6	96	93.305	ENSNGAG00000003365	Prpf6	100	92.880	Nannospalax_galili
ENSACLG00000025875	prpf6	100	99.897	ENSNBRG00000015025	prpf6	100	99.897	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000025875	prpf6	96	92.242	ENSNLEG00000010208	PRPF6	100	91.817	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000025875	prpf6	96	83.936	ENSMEUG00000009824	-	90	84.190	Notamacropus_eugenii
ENSACLG00000025875	prpf6	96	87.248	ENSODEG00000004841	PRPF6	100	86.823	Octodon_degus
ENSACLG00000025875	prpf6	100	99.587	ENSONIG00000017406	prpf6	100	99.587	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000025875	prpf6	96	93.092	ENSOANG00000004920	PRPF6	100	92.667	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACLG00000025875	prpf6	95	90.880	ENSOCUG00000014151	PRPF6	100	90.451	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000025875	prpf6	100	96.698	ENSORLG00000009592	prpf6	100	96.698	Oryzias_latipes
ENSACLG00000025875	prpf6	100	96.801	ENSORLG00020001458	prpf6	100	96.801	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000025875	prpf6	100	96.801	ENSORLG00015018762	prpf6	100	96.801	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000025875	prpf6	100	97.214	ENSOMEG00000012174	prpf6	100	97.214	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000025875	prpf6	96	85.987	ENSOGAG00000007573	PRPF6	100	85.563	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000025875	prpf6	96	92.242	ENSOARG00000008776	PRPF6	99	91.817	Ovis_aries
ENSACLG00000025875	prpf6	96	92.349	ENSPPAG00000008686	PRPF6	100	91.923	Pan_paniscus
ENSACLG00000025875	prpf6	96	92.774	ENSPPRG00000008497	PRPF6	100	92.349	Panthera_pardus
ENSACLG00000025875	prpf6	93	92.694	ENSPTIG00000011184	PRPF6	97	92.257	Panthera_tigris_altaica
ENSACLG00000025875	prpf6	96	92.349	ENSPTRG00000013765	PRPF6	100	91.923	Pan_troglodytes
ENSACLG00000025875	prpf6	96	92.030	ENSPANG00000024135	PRPF6	100	91.605	Papio_anubis
ENSACLG00000025875	prpf6	98	93.555	ENSPKIG00000005627	prpf6	99	94.787	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000025875	prpf6	90	92.744	ENSPSIG00000007717	PRPF6	100	92.290	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000025875	prpf6	99	94.628	ENSPMGG00000008925	prpf6	99	93.905	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000025875	prpf6	96	93.199	ENSPEMG00000016036	Prpf6	100	92.774	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000025875	prpf6	98	87.147	ENSPMAG00000006144	prpf6	100	87.777	Petromyzon_marinus
ENSACLG00000025875	prpf6	96	93.199	ENSPCIG00000017909	PRPF6	100	92.774	Phascolarctos_cinereus
ENSACLG00000025875	prpf6	100	96.830	ENSPFOG00000006431	prpf6	99	96.830	Poecilia_formosa
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ENSACLG00000025875	prpf6	96	92.349	ENSPCOG00000016881	PRPF6	100	91.923	Propithecus_coquereli
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