EuRBPDB

  • Home
  • Cancer
  • Family
  • Species
  • RBPredictor
  • Search
  • Download
  • Submit
  • Help
  • Contact

  • Description
  • RBDs
  • Transcripts
  • Gene Model
  • PPI
  • Paralogs
  • Orthologs
Description
Ensembl ID
ENSACLG00000026703 (Gene tree)
Gene ID
-
Gene Symbol
-
Alias
-
Full Name
-
Gene Type
protein_coding
Species
Astatotilapia_calliptera
Status
putative
Strand
Minus strand
Length
36712 bases
Position
chrLS419806.1:451414-488125
Accession
-
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
ENSACLP00000039608zf-C2H2PF00096.263.7e-70111
ENSACLP00000039608zf-C2H2PF00096.263.7e-70211
ENSACLP00000039608zf-C2H2PF00096.263.7e-70311
ENSACLP00000039608zf-C2H2PF00096.263.7e-70411
ENSACLP00000039608zf-C2H2PF00096.263.7e-70511
ENSACLP00000039608zf-C2H2PF00096.263.7e-70611
ENSACLP00000039608zf-C2H2PF00096.263.7e-70711
ENSACLP00000039608zf-C2H2PF00096.263.7e-70811
ENSACLP00000039608zf-C2H2PF00096.263.7e-70911
ENSACLP00000039608zf-C2H2PF00096.263.7e-701011
ENSACLP00000039608zf-C2H2PF00096.263.7e-701111
ENSACLP00000039608zf-metPF12874.75.8e-2915
ENSACLP00000039608zf-metPF12874.75.8e-2925
ENSACLP00000039608zf-metPF12874.75.8e-2935
ENSACLP00000039608zf-metPF12874.75.8e-2945
ENSACLP00000039608zf-metPF12874.75.8e-2955
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
ENSACLT00000040547-1860-ENSACLP00000039608619 (aa)--
Gene Model
Click here to download ENSACLG00000026703's gene model file
Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACLG00000026703's network
Paralogs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy ParalogGene SymbolCoverageIdentiy
ENSACLG00000026703-7839.474ENSACLG00000022475-9739.474
ENSACLG00000026703-7643.609ENSACLG00000019094-8943.609
ENSACLG00000026703-9452.036ENSACLG00000006870-9652.036
ENSACLG00000026703-8554.468ENSACLG00000020474-9754.468
ENSACLG00000026703-7036.364ENSACLG00000022287-6736.364
ENSACLG00000026703-8046.154ENSACLG00000015843-9846.154
ENSACLG00000026703-8660.417ENSACLG00000025163-9960.417
ENSACLG00000026703-7347.059ENSACLG00000019270-8647.059
ENSACLG00000026703-7055.696ENSACLG00000019424-9644.262
ENSACLG00000026703-7939.600ENSACLG00000017925-8049.265
ENSACLG00000026703-7246.923ENSACLG00000003546-6546.923
ENSACLG00000026703-7945.802ENSACLG00000006528-9645.802
ENSACLG00000026703-7349.603ENSACLG00000017329-8549.603
ENSACLG00000026703-9365.179ENSACLG00000011237-10061.959
ENSACLG00000026703-9260.484ENSACLG00000023513-9858.921
ENSACLG00000026703-8452.439ENSACLG00000008374-7752.439
ENSACLG00000026703-7650.000ENSACLG00000021022-8050.000
ENSACLG00000026703-8076.168ENSACLG00000023979-9674.886
ENSACLG00000026703-8853.306ENSACLG00000021184-8153.306
ENSACLG00000026703-9035.238ENSACLG00000012712znf6469935.238
ENSACLG00000026703-7348.230ENSACLG00000000473-8448.230
ENSACLG00000026703-7051.244ENSACLG00000001507-7651.244
ENSACLG00000026703-7741.876ENSACLG00000007888-8541.876
ENSACLG00000026703-7562.844ENSACLG00000024294-9062.844
ENSACLG00000026703-7538.776ENSACLG00000022305-8938.776
ENSACLG00000026703-8150.794ENSACLG00000019499-9950.794
ENSACLG00000026703-7649.495ENSACLG00000011239-6949.495
ENSACLG00000026703-7348.148ENSACLG00000000411-9148.148
ENSACLG00000026703-7442.813ENSACLG00000017941-6842.813
ENSACLG00000026703-7346.667ENSACLG00000019482-8046.667
ENSACLG00000026703-7046.875ENSACLG00000027053gfi1b5446.875
ENSACLG00000026703-7654.787ENSACLG00000008821-9454.787
ENSACLG00000026703-7039.645ENSACLG00000008606-8839.645
ENSACLG00000026703-7053.435ENSACLG00000018716-9548.701
ENSACLG00000026703-7134.240ENSACLG00000017996prdm58432.773
ENSACLG00000026703-8448.538ENSACLG00000005795-8748.538
ENSACLG00000026703-7638.559ENSACLG00000019167-9238.559
ENSACLG00000026703-7747.451ENSACLG00000000537-9845.361
ENSACLG00000026703-8157.480ENSACLG00000005617-6457.480
ENSACLG00000026703-7436.111ENSACLG00000018551snai26936.111
ENSACLG00000026703-7541.250ENSACLG00000001003-8941.250
ENSACLG00000026703-8252.381ENSACLG00000017576-9952.381
ENSACLG00000026703-7747.160ENSACLG00000001018-8847.160
ENSACLG00000026703-7359.200ENSACLG00000018700-9959.200
ENSACLG00000026703-8947.126ENSACLG00000018701-8747.126
ENSACLG00000026703-7059.091ENSACLG00000018707-8859.091
ENSACLG00000026703-7944.028ENSACLG00000022302-9846.693
ENSACLG00000026703-7742.640ENSACLG00000003229-9642.640
ENSACLG00000026703-7047.853ENSACLG00000005708-9547.853
ENSACLG00000026703-7036.691ENSACLG00000013531-9636.691
ENSACLG00000026703-8549.655ENSACLG00000020615-9849.655
ENSACLG00000026703-6940.541ENSACLG00000013033-9439.355
ENSACLG00000026703-9149.074ENSACLG00000020610-9849.074
ENSACLG00000026703-6948.113ENSACLG00000001258-8748.113
ENSACLG00000026703-7143.182ENSACLG00000000521-9343.182
ENSACLG00000026703-6938.150ENSACLG00000014336-9338.150
ENSACLG00000026703-6537.008ENSACLG00000016648-7638.739
ENSACLG00000026703-6842.775ENSACLG00000002844-8441.823
ENSACLG00000026703-8459.174ENSACLG00000020975-9759.174
ENSACLG00000026703-7241.848ENSACLG00000006697-7041.398
ENSACLG00000026703-7147.794ENSACLG00000025353ZNF3845247.794
ENSACLG00000026703-7342.534ENSACLG00000017336-9943.237
ENSACLG00000026703-7446.226ENSACLG00000026130-5141.096
ENSACLG00000026703-7842.640ENSACLG00000020231-9341.832
ENSACLG00000026703-7741.975ENSACLG00000006702-8341.975
ENSACLG00000026703-7056.044ENSACLG00000011658-8656.044
ENSACLG00000026703-7147.222ENSACLG00000014365-9643.023
ENSACLG00000026703-7342.564ENSACLG00000014167-6743.243
ENSACLG00000026703-8552.979ENSACLG00000026538-9953.191
ENSACLG00000026703-8638.571ENSACLG00000026187-7438.571
ENSACLG00000026703-9151.327ENSACLG00000024491-9954.032
ENSACLG00000026703-7338.053ENSACLG00000007162scrt1b5838.053
ENSACLG00000026703-7245.055ENSACLG00000027692-6945.055
ENSACLG00000026703-7343.382ENSACLG00000001418znf6525643.382
ENSACLG00000026703-8037.619ENSACLG00000014600-8845.833
ENSACLG00000026703-8959.172ENSACLG00000024459-9559.172
ENSACLG00000026703-7046.875ENSACLG00000000487-8646.875
ENSACLG00000026703-7852.101ENSACLG00000020339-9450.222
ENSACLG00000026703-7437.931ENSACLG00000003679-8637.931
ENSACLG00000026703-7940.426ENSACLG00000022499-9540.426
ENSACLG00000026703-7342.857ENSACLG00000022497-9342.857
ENSACLG00000026703-9053.755ENSACLG00000018746-9853.755
ENSACLG00000026703-7640.183ENSACLG00000019674-8840.183
ENSACLG00000026703-7554.023ENSACLG00000017849-8354.023
ENSACLG00000026703-7039.416ENSACLG00000000102-5740.149
ENSACLG00000026703-8462.827ENSACLG00000019318-9962.827
ENSACLG00000026703-7342.609ENSACLG00000013454-6442.609
ENSACLG00000026703-8659.906ENSACLG00000024670-9858.333
ENSACLG00000026703-8550.385ENSACLG00000021056-9450.385
ENSACLG00000026703-8450.129ENSACLG00000022505-9951.117
ENSACLG00000026703-7044.099ENSACLG00000005694-5240.367
ENSACLG00000026703-7041.071ENSACLG00000026103znf5267131.844
ENSACLG00000026703-7842.751ENSACLG00000019291-9044.076
ENSACLG00000026703-8046.768ENSACLG00000021846-8746.768
ENSACLG00000026703-7040.000ENSACLG00000017449-5940.000
ENSACLG00000026703-7941.176ENSACLG00000022360-9741.176
ENSACLG00000026703-9250.000ENSACLG00000021343-9754.124
ENSACLG00000026703-8562.500ENSACLG00000013935-9960.538
ENSACLG00000026703-9441.395ENSACLG00000027424-9941.395
ENSACLG00000026703-8362.722ENSACLG00000024647-9659.880
ENSACLG00000026703-7034.545ENSACLG00000020579znf319b8534.545
ENSACLG00000026703-9246.386ENSACLG00000016405zbtb176747.297
ENSACLG00000026703-8941.547ENSACLG00000015989-8742.146
ENSACLG00000026703-8242.378ENSACLG00000019349-7442.378
ENSACLG00000026703-8155.072ENSACLG00000011642-9847.809
ENSACLG00000026703-7147.619ENSACLG00000015462-6147.619
ENSACLG00000026703-7862.857ENSACLG00000024957-9860.351
ENSACLG00000026703-7350.000ENSACLG00000021045-9650.000
ENSACLG00000026703-9146.032ENSACLG00000020393-9947.135
ENSACLG00000026703-7344.841ENSACLG00000007749-7744.841
ENSACLG00000026703-8658.883ENSACLG00000025196-9758.883
ENSACLG00000026703-9351.698ENSACLG00000017321-9251.698
ENSACLG00000026703-8047.179ENSACLG00000023963-9847.179
ENSACLG00000026703-8653.285ENSACLG00000020333-9053.285
ENSACLG00000026703-9556.500ENSACLG00000005615-9356.500
ENSACLG00000026703-8345.854ENSACLG00000022439-7945.854
ENSACLG00000026703-9055.725ENSACLG00000025251-9560.517
ENSACLG00000026703-7345.045ENSACLG00000022482-7945.045
ENSACLG00000026703-8165.385ENSACLG00000024308-9961.004
ENSACLG00000026703-7838.514ENSACLG00000015816-9343.103
ENSACLG00000026703-7244.512ENSACLG00000008624-8044.512
ENSACLG00000026703-8747.407ENSACLG00000010811-7847.407
ENSACLG00000026703-8044.292ENSACLG00000014176-9444.292
ENSACLG00000026703-8743.011ENSACLG00000020268-8741.071
ENSACLG00000026703-8454.400ENSACLG00000011710-9951.724
ENSACLG00000026703-7544.231ENSACLG00000023941-9336.590
ENSACLG00000026703-9036.070ENSACLG00000016841-8931.988
ENSACLG00000026703-7437.885ENSACLG00000004663-7437.900
ENSACLG00000026703-7150.000ENSACLG00000003332-9745.122
ENSACLG00000026703-7345.745ENSACLG00000017411-9245.745
ENSACLG00000026703-8653.285ENSACLG00000006718-9053.285
ENSACLG00000026703-8843.167ENSACLG00000028002-9743.891
ENSACLG00000026703-7050.980ENSACLG00000001045-9750.980
ENSACLG00000026703-7234.670ENSACLG00000005594ZNF3198733.983
ENSACLG00000026703-7541.818ENSACLG00000014349znf3415441.818
ENSACLG00000026703-8159.036ENSACLG00000023305-9859.036
ENSACLG00000026703-8953.299ENSACLG00000017801-8253.299
ENSACLG00000026703-8043.257ENSACLG00000022383-9845.276
ENSACLG00000026703-8853.125ENSACLG00000017939-9955.328
ENSACLG00000026703-7148.299ENSACLG00000020260-10048.299
ENSACLG00000026703-7944.286ENSACLG00000001368-8944.286
ENSACLG00000026703-8748.069ENSACLG00000017487-8848.069
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
ENSACLG00000026703-8859.155ENSAPOG00000006303-9359.155Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000026703-7540.849ENSAPOG00000019960-9839.249Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000026703-9251.762ENSAPOG00000008802-9959.884Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000026703-8853.242ENSACIG00000004745-9456.213Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000026703-8753.757ENSACIG00000022658-9752.256Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000026703-8456.944ENSAOCG00000014165-9756.944Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000026703-8654.861ENSAOCG00000013130-9454.861Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000026703-7950.787ENSAOCG00000013710-9849.278Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000026703-8954.422ENSAPEG00000006650-9856.410Amphiprion_percula
ENSACLG00000026703-8557.265ENSAPEG00000009383-9357.265Amphiprion_percula
ENSACLG00000026703-7748.991ENSATEG00000015695-9949.132Anabas_testudineus
ENSACLG00000026703-7748.991ENSATEG00000017618-9949.132Anabas_testudineus
ENSACLG00000026703-7153.247ENSAMXG00000042275-9450.485Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000026703-7050.179ENSAMXG00000039408-9550.179Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000026703-7451.111ENSAMXG00000043302-8850.870Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000026703-7261.468ENSAMXG00000035920-9461.468Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000026703-7553.398ENSAMXG00000041975-8452.318Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000026703-7347.368ENSBTAG00000016191ZNF327947.368Bos_taurus
ENSACLG00000026703-7347.368ENSCHIG00000021099ZNF327947.368Capra_hircus
ENSACLG00000026703-7247.638ENSCSAVG00000001808-10046.707Ciona_savignyi
ENSACLG00000026703-8748.707ENSCVAG00000021225-9260.377Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000026703-8049.451ENSDARG00000099986si:ch211-207i20.27749.451Danio_rerio
ENSACLG00000026703-7548.421ENSDNOG00000035046ZNF328548.421Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000026703-7347.368ENSEASG00005006910ZNF327947.368Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000026703-7047.368ENSECAG00000023676ZNF327147.368Equus_caballus
ENSACLG00000026703-7442.896ENSELUG00000021229-8341.878Esox_lucius
ENSACLG00000026703-7545.592ENSFHEG00000018063-9047.368Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000026703-7048.333ENSFHEG00000000678-9548.052Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000026703-8446.216ENSGAFG00000020499-9946.512Gambusia_affinis
ENSACLG00000026703-7248.352ENSGACG00000010352si:ch211-207i20.26148.352Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000026703-7640.210ENSHBUG00000013296-9640.210Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000026703-7160.714ENSHBUG00000021003-9960.714Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000026703-8250.893ENSHBUG00000015166-9750.893Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000026703-7353.414ENSIPUG00000005733-6953.414Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000026703-7753.670ENSIPUG00000002655-9853.211Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000026703-7254.839ENSIPUG00000021998-9054.839Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000026703-7153.540ENSIPUG00000022741-8053.540Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000026703-7052.000ENSIPUG00000023761-6052.000Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000026703-7351.240ENSLBEG00000020128-9651.240Labrus_bergylta
ENSACLG00000026703-9043.841ENSMAMG00000014734-8952.326Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000026703-8556.364ENSMZEG00005021052-9256.364Maylandia_zebra
ENSACLG00000026703-8660.000ENSMZEG00005019918-9456.931Maylandia_zebra
ENSACLG00000026703-7858.095ENSMZEG00005026082-7957.426Maylandia_zebra
ENSACLG00000026703-9053.755ENSMZEG00005003336-9853.755Maylandia_zebra
ENSACLG00000026703-7038.108ENSMZEG00005020156-8038.108Maylandia_zebra
ENSACLG00000026703-8858.712ENSMZEG00005007262-9958.462Maylandia_zebra
ENSACLG00000026703-7740.057ENSMZEG00005014592-9540.057Maylandia_zebra
ENSACLG00000026703-8460.069ENSMZEG00005025343-9960.069Maylandia_zebra
ENSACLG00000026703-7340.830ENSMZEG00005020162-7740.830Maylandia_zebra
ENSACLG00000026703-7843.919ENSMZEG00005012715-7743.919Maylandia_zebra
ENSACLG00000026703-7050.644ENSMMOG00000006131-9550.644Mola_mola
ENSACLG00000026703-8850.877ENSMMOG00000004460-9750.877Mola_mola
ENSACLG00000026703-8462.245ENSMMOG00000010703-9862.245Mola_mola
ENSACLG00000026703-8753.951ENSMALG00000015655-9954.054Monopterus_albus
ENSACLG00000026703-8853.160ENSMALG00000007051-9956.917Monopterus_albus
ENSACLG00000026703-9154.709ENSMALG00000004216-9954.709Monopterus_albus
ENSACLG00000026703-7350.862MGP_PahariEiJ_G0022533Zfp6378047.368Mus_pahari
ENSACLG00000026703-7350.862MGP_SPRETEiJ_G0029809Zfp6378047.368Mus_spretus
ENSACLG00000026703-7547.895ENSNGAG00000020281Zfp6378547.895Nannospalax_galili
ENSACLG00000026703-7142.652ENSNBRG00000005805-9442.652Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000026703-7137.770ENSNBRG00000016564-8337.770Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000026703-7147.489ENSNBRG00000005849-8447.489Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000026703-9051.832ENSNBRG00000000523-9953.229Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000026703-7754.000ENSNBRG00000003000-8254.000Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000026703-7147.183ENSNBRG00000005796-9647.183Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000026703-7443.083ENSONIG00000015514-9343.083Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000026703-7047.619ENSONIG00000005693-9547.619Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000026703-7241.969ENSONIG00000015552-9139.314Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000026703-7047.368ENSOARG00000002999ZNF327447.368Ovis_aries
ENSACLG00000026703-7451.163ENSPKIG00000014786-5351.163Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000026703-7146.091ENSPLAG00000015973-9946.091Poecilia_latipinna
ENSACLG00000026703-8951.557ENSPMEG00000016458-9354.930Poecilia_mexicana
ENSACLG00000026703-8643.011ENSPMEG00000006726-8849.650Poecilia_mexicana
ENSACLG00000026703-7653.704ENSPREG00000010437-8553.704Poecilia_reticulata
ENSACLG00000026703-7146.154ENSPCAG00000005270-9848.387Procavia_capensis
ENSACLG00000026703-7350.508ENSPVAG00000009430-7947.427Pteropus_vampyrus
ENSACLG00000026703-8553.571ENSPNYG00000007597-9851.667Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000026703-8654.268ENSPNYG00000002684-10054.268Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000026703-7353.275ENSPNAG00000029997-8453.275Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000026703-7444.516ENSSFOG00015015878-9444.516Scleropages_formosus
ENSACLG00000026703-8251.724ENSSDUG00000015159-9551.724Seriola_dumerili
ENSACLG00000026703-8151.320ENSSDUG00000015254-9357.143Seriola_dumerili
ENSACLG00000026703-9053.535ENSSDUG00000015182-8953.535Seriola_dumerili
ENSACLG00000026703-8554.639ENSSDUG00000008943-10054.639Seriola_dumerili
ENSACLG00000026703-8954.661ENSSLDG00000018273-9654.661Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000026703-9056.522ENSSLDG00000020675-9954.830Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000026703-7057.037ENSSLDG00000012036-9857.037Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000026703-7344.058ENSSARG00000000532-8544.058Sorex_araneus
ENSACLG00000026703-9054.331ENSXCOG00000008116-9254.331Xiphophorus_couchianus

Copyright © , Bioinformatics Center, Sun Yat-sen Memorial Hospital, Sun Yat-sen University, China. All Rights Reserved.

Any comment and suggestion, please contact us