EuRBPDB

  • Home
  • Cancer
  • Family
  • Species
  • RBPredictor
  • Search
  • Download
  • Submit
  • Help
  • Contact

  • Description
  • RBDs
  • Transcripts
  • Gene Model
  • PPI
  • Paralogs
  • Orthologs
Description
Ensembl ID
ENSACLG00000027053 (Gene tree)
Gene ID
113027363
Gene Symbol
gfi1b
Alias
si:ch211-231o6.2
Full Name
growth factor independent 1B transcriptional repressor
Gene Type
protein_coding
Species
Astatotilapia_calliptera
Status
putative
Strand
Plus strand
Length
4895 bases
Position
chr7:31976684-31981578
Accession
113027363
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
ENSACLP00000040144zf-C2H2PF00096.264e-2515
ENSACLP00000040144zf-C2H2PF00096.264e-2525
ENSACLP00000040144zf-C2H2PF00096.264e-2535
ENSACLP00000040144zf-C2H2PF00096.264e-2545
ENSACLP00000040144zf-C2H2PF00096.264e-2555
ENSACLP00000040144zf-metPF12874.71.7e-0712
ENSACLP00000040144zf-metPF12874.71.7e-0722
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
ENSACLT00000041087-1632XM_026176978ENSACLP00000040144323 (aa)XP_026032763UPI0003AFE2D2
Gene Model
Click here to download ENSACLG00000027053's gene model file
Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACLG00000027053's network
Paralogs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy ParalogGene SymbolCoverageIdentiy
ENSACLG00000027053gfi1b7138.971ENSACLG00000019167-8838.732
ENSACLG00000027053gfi1b9441.250ENSACLG00000027424-8441.250
ENSACLG00000027053gfi1b8442.169ENSACLG00000021343-9544.099
ENSACLG00000027053gfi1b5146.970ENSACLG00000017849-6642.857
ENSACLG00000027053gfi1b5143.609ENSACLG00000020333-5243.609
ENSACLG00000027053gfi1b5439.645ENSACLG00000019482-7639.645
ENSACLG00000027053gfi1b5143.373ENSACLG00000019270-7743.373
ENSACLG00000027053gfi1b5441.463ENSACLG00000017996prdm57341.463
ENSACLG00000027053gfi1b6143.860ENSACLG00000014365-9039.080
ENSACLG00000027053gfi1b5233.511ENSACLG00000022287-6033.511
ENSACLG00000027053gfi1b5241.844ENSACLG00000018716-7541.844
ENSACLG00000027053gfi1b5142.857ENSACLG00000005795-5742.857
ENSACLG00000027053gfi1b5437.500ENSACLG00000019094-7337.500
ENSACLG00000027053gfi1b5439.157ENSACLG00000016841-6839.157
ENSACLG00000027053gfi1b7247.692ENSACLG00000025251-9444.848
ENSACLG00000027053gfi1b6942.208ENSACLG00000020231-9142.208
ENSACLG00000027053gfi1b5841.875ENSACLG00000015843-8841.875
ENSACLG00000027053gfi1b7041.250ENSACLG00000022302-9841.060
ENSACLG00000027053gfi1b7133.333ENSACLG00000022305-9133.333
ENSACLG00000027053gfi1b6340.244ENSACLG00000007749-8040.244
ENSACLG00000027053gfi1b7146.250ENSACLG00000018701-7646.250
ENSACLG00000027053gfi1b5244.248ENSACLG00000018700-9544.248
ENSACLG00000027053gfi1b5147.423ENSACLG00000018707-9147.423
ENSACLG00000027053gfi1b7041.290ENSACLG00000007888-7741.290
ENSACLG00000027053gfi1b6142.537ENSACLG00000006697-7242.537
ENSACLG00000027053gfi1b5246.903ENSACLG00000002844-6046.903
ENSACLG00000027053gfi1b6244.937ENSACLG00000024957-9544.304
ENSACLG00000027053gfi1b8243.791ENSACLG00000020474-9643.791
ENSACLG00000027053gfi1b8644.248ENSACLG00000017321-7546.584
ENSACLG00000027053gfi1b7041.304ENSACLG00000017329-8441.304
ENSACLG00000027053gfi1b5331.609ENSACLG00000022191znf4076731.609
ENSACLG00000027053gfi1b5842.958ENSACLG00000022497-9242.958
ENSACLG00000027053gfi1b5141.818ENSACLG00000021045-7441.818
ENSACLG00000027053gfi1b5143.609ENSACLG00000006718-5243.609
ENSACLG00000027053gfi1b6043.651ENSACLG00000019291-8943.651
ENSACLG00000027053gfi1b8143.182ENSACLG00000023979-9647.222
ENSACLG00000027053gfi1b9950.633ENSACLG00000026458gfi1ab9250.633
ENSACLG00000027053gfi1b8346.087ENSACLG00000023513-9746.087
ENSACLG00000027053gfi1b5745.185ENSACLG00000020615-6045.185
ENSACLG00000027053gfi1b5945.513ENSACLG00000020610-6945.513
ENSACLG00000027053gfi1b8238.743ENSACLG00000025196-9238.743
ENSACLG00000027053gfi1b7038.750ENSACLG00000000102-6138.750
ENSACLG00000027053gfi1b7041.916ENSACLG00000019499-9141.916
ENSACLG00000027053gfi1b7042.236ENSACLG00000017336-9242.236
ENSACLG00000027053gfi1b9243.571ENSACLG00000018746-9743.571
ENSACLG00000027053gfi1b6144.444ENSACLG00000024308-9746.386
ENSACLG00000027053gfi1b5935.263ENSACLG00000021184-5835.263
ENSACLG00000027053gfi1b5540.441ENSACLG00000027692-7040.441
ENSACLG00000027053gfi1b5246.154ENSACLG00000024294-7346.154
ENSACLG00000027053gfi1b5843.704ENSACLG00000024647-7643.704
ENSACLG00000027053gfi1b5644.526ENSACLG00000021056-6244.526
ENSACLG00000027053gfi1b5144.526ENSACLG00000024459-8345.000
ENSACLG00000027053gfi1b6942.105ENSACLG00000017941-6242.105
ENSACLG00000027053gfi1b6943.671ENSACLG00000020975-8542.857
ENSACLG00000027053gfi1b6544.737ENSACLG00000001018-9044.737
ENSACLG00000027053gfi1b8643.976ENSACLG00000019318-9847.590
ENSACLG00000027053gfi1b5237.956ENSACLG00000018551snai25737.956
ENSACLG00000027053gfi1b5245.652ENSACLG00000011642-7945.652
ENSACLG00000027053gfi1b5740.120ENSACLG00000019349-7040.120
ENSACLG00000027053gfi1b5436.697ENSACLG00000003679-8036.697
ENSACLG00000027053gfi1b5942.975ENSACLG00000024670-7442.975
ENSACLG00000027053gfi1b5144.444ENSACLG00000021022-6644.444
ENSACLG00000027053gfi1b6145.946ENSACLG00000020339-5446.154
ENSACLG00000027053gfi1b5945.985ENSACLG00000003332-9945.985
ENSACLG00000027053gfi1b5442.857ENSACLG00000005594ZNF3198942.857
ENSACLG00000027053gfi1b6943.038ENSACLG00000020393-8843.038
ENSACLG00000027053gfi1b5340.331ENSACLG00000001003-8940.331
ENSACLG00000027053gfi1b5237.500ENSACLG00000014336-9137.975
ENSACLG00000027053gfi1b5045.098ENSACLG00000004663-7145.098
ENSACLG00000027053gfi1b6245.588ENSACLG00000023305-8945.588
ENSACLG00000027053gfi1b8943.885ENSACLG00000025163-9943.885
ENSACLG00000027053gfi1b6040.964ENSACLG00000008821-9440.964
ENSACLG00000027053gfi1b7039.394ENSACLG00000017925-6640.994
ENSACLG00000027053gfi1b6248.148ENSACLG00000019424-9739.394
ENSACLG00000027053gfi1b5643.750ENSACLG00000023941-8443.750
ENSACLG00000027053gfi1b5244.910ENSACLG00000005615-5044.910
ENSACLG00000027053gfi1b5141.284ENSACLG00000013033-8141.284
ENSACLG00000027053gfi1b6340.141ENSACLG00000014600-9140.141
ENSACLG00000027053gfi1b6238.710ENSACLG00000016648-6938.710
ENSACLG00000027053gfi1b7144.521ENSACLG00000001507-8244.521
ENSACLG00000027053gfi1b5244.604ENSACLG00000008374-5144.604
ENSACLG00000027053gfi1b6035.938ENSACLG00000019674-9436.184
ENSACLG00000027053gfi1b8940.708ENSACLG00000012712znf6465340.708
ENSACLG00000027053gfi1b5340.625ENSACLG00000017411-8840.625
ENSACLG00000027053gfi1b5241.667ENSACLG00000006702-7641.667
ENSACLG00000027053gfi1b5639.521ENSACLG00000015989-7739.521
ENSACLG00000027053gfi1b5043.125ENSACLG00000017487-6943.125
ENSACLG00000027053gfi1b5642.105ENSACLG00000014176-8541.593
ENSACLG00000027053gfi1b5342.424ENSACLG00000000487-8342.424
ENSACLG00000027053gfi1b5341.916ENSACLG00000006528-9941.916
ENSACLG00000027053gfi1b6042.683ENSACLG00000015816-9442.683
ENSACLG00000027053gfi1b5446.875ENSACLG00000026703-7046.875
ENSACLG00000027053gfi1b7146.341ENSACLG00000001045-9744.848
ENSACLG00000027053gfi1b5244.375ENSACLG00000020268-6244.375
ENSACLG00000027053gfi1b6941.916ENSACLG00000020260-9941.916
ENSACLG00000027053gfi1b7040.580ENSACLG00000022499-8440.580
ENSACLG00000027053gfi1b5139.241ENSACLG00000008606-8839.241
ENSACLG00000027053gfi1b6436.364ENSACLG00000022439-8237.156
ENSACLG00000027053gfi1b5342.593ENSACLG00000023963-8742.593
ENSACLG00000027053gfi1b6940.719ENSACLG00000000473-8240.719
ENSACLG00000027053gfi1b6938.255ENSACLG00000014167-6538.255
ENSACLG00000027053gfi1b6946.923ENSACLG00000017939-9944.828
ENSACLG00000027053gfi1b6944.144ENSACLG00000017576-8446.250
ENSACLG00000027053gfi1b7443.662ENSACLG00000022505-8643.662
ENSACLG00000027053gfi1b5239.456ENSACLG00000008624-7339.456
ENSACLG00000027053gfi1b5241.844ENSACLG00000022482-8041.844
ENSACLG00000027053gfi1b5441.212ENSACLG00000022360-9841.212
ENSACLG00000027053gfi1b7144.375ENSACLG00000028002-9044.375
ENSACLG00000027053gfi1b5840.854ENSACLG00000022475-9340.854
ENSACLG00000027053gfi1b7144.375ENSACLG00000000411-9044.375
ENSACLG00000027053gfi1b5343.478ENSACLG00000015462-6543.478
ENSACLG00000027053gfi1b7043.902ENSACLG00000022383-9543.373
ENSACLG00000027053gfi1b5138.824ENSACLG00000011658-8138.824
ENSACLG00000027053gfi1b7442.857ENSACLG00000000537-9840.625
ENSACLG00000027053gfi1b5645.113ENSACLG00000006870-5445.113
ENSACLG00000027053gfi1b5842.857ENSACLG00000011239-7242.857
ENSACLG00000027053gfi1b8443.452ENSACLG00000011237-9945.255
ENSACLG00000027053gfi1b5740.909ENSACLG00000005708-8340.909
ENSACLG00000027053gfi1b7141.447ENSACLG00000021846-8541.447
ENSACLG00000027053gfi1b5437.931ENSACLG00000013454-6537.931
ENSACLG00000027053gfi1b7843.609ENSACLG00000020579znf319b8443.609
ENSACLG00000027053gfi1b7142.857ENSACLG00000003546-5842.857
ENSACLG00000027053gfi1b5239.806ENSACLG00000001368-8739.806
ENSACLG00000027053gfi1b6745.522ENSACLG00000024491-9145.522
ENSACLG00000027053gfi1b6038.028ENSACLG00000000521-9338.028
ENSACLG00000027053gfi1b8044.099ENSACLG00000003229-9444.099
ENSACLG00000027053gfi1b5243.478ENSACLG00000026538-9943.478
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
ENSACLG00000027053gfi1b9978.419ENSAPOG00000001296gfi1b9978.419Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000027053gfi1b10076.292ENSACIG00000002190gfi1b10076.292Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000027053gfi1b9978.116ENSAOCG00000021187gfi1b9978.116Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000027053gfi1b9978.723ENSAPEG00000016196gfi1b9978.723Amphiprion_percula
ENSACLG00000027053gfi1b10078.419ENSATEG00000002534gfi1b10078.419Anabas_testudineus
ENSACLG00000027053gfi1b10058.772ENSAPLG00000003373GFI1B10058.772Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000027053gfi1b10067.656ENSAMXG00000037544GFI1B10067.656Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027053gfi1b10055.952ENSCAPG00000010404GFI1B10055.952Cavia_aperea
ENSACLG00000027053gfi1b10055.682ENSCPBG00000021186GFI1B10055.682Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000027053gfi1b10073.636ENSCSEG00000001315gfi1b10073.636Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000027053gfi1b10070.091ENSCVAG00000017168gfi1b10070.091Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000027053gfi1b10067.257ENSDARG00000079947gfi1b9982.278Danio_rerio
ENSACLG00000027053gfi1b6351.471ENSEEUG00000012609-9051.471Erinaceus_europaeus
ENSACLG00000027053gfi1b9968.750ENSELUG00000016933gfi1b9968.750Esox_lucius
ENSACLG00000027053gfi1b10053.659ENSFALG00000001479GFI1B10053.659Ficedula_albicollis
ENSACLG00000027053gfi1b10075.000ENSFHEG00000015138gfi1b10075.000Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000027053gfi1b7380.658ENSGMOG00000019123gfi1b9180.658Gadus_morhua
ENSACLG00000027053gfi1b10056.851ENSGALG00000003478GFI1B10056.851Gallus_gallus
ENSACLG00000027053gfi1b7586.777ENSGAFG00000003059gfi1b10086.777Gambusia_affinis
ENSACLG00000027053gfi1b10070.255ENSGACG00000018134gfi1b10070.255Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000027053gfi1b10057.478ENSGAGG00000021327GFI1B10057.478Gopherus_agassizii
ENSACLG00000027053gfi1b100100.000ENSHBUG00000005451gfi1b100100.000Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000027053gfi1b9971.560ENSHCOG00000013713gfi1b9971.560Hippocampus_comes
ENSACLG00000027053gfi1b10069.162ENSIPUG00000012769gfi1b10069.162Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000027053gfi1b9949.867ENSJJAG00000016355Gfi1b10049.867Jaculus_jaculus
ENSACLG00000027053gfi1b10073.333ENSKMAG00000016047gfi1b10073.333Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000027053gfi1b9975.380ENSLBEG00000020297gfi1b9975.684Labrus_bergylta
ENSACLG00000027053gfi1b10059.819ENSLACG00000012207GFI1B10059.819Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000027053gfi1b9964.583ENSLOCG00000005750gfi1b9964.583Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000027053gfi1b10055.882ENSLAFG00000022367GFI1B10055.882Loxodonta_africana
ENSACLG00000027053gfi1b10078.963ENSMAMG00000003040gfi1b10078.963Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000027053gfi1b10099.381ENSMZEG00005015594gfi1b10099.381Maylandia_zebra
ENSACLG00000027053gfi1b10057.143ENSMGAG00000006129GFI1B10057.143Meleagris_gallopavo
ENSACLG00000027053gfi1b9977.134ENSMMOG00000011764gfi1b9977.134Mola_mola
ENSACLG00000027053gfi1b9949.606ENSMODG00000012600GFI1B9949.606Monodelphis_domestica
ENSACLG00000027053gfi1b9977.064ENSMALG00000004034gfi1b9977.064Monopterus_albus
ENSACLG00000027053gfi1b9956.637ENSNGAG00000003333Gfi1b10056.637Nannospalax_galili
ENSACLG00000027053gfi1b5267.407ENSNBRG00000012376-10067.407Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000027053gfi1b10097.568ENSNBRG00000012391gfi1b10097.568Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000027053gfi1b10096.353ENSONIG00000013011gfi1b10096.353Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000027053gfi1b10058.631ENSOANG00000014723GFI1B10058.631Ornithorhynchus_anatinus
ENSACLG00000027053gfi1b10056.098ENSORLG00000014390GFI1B9665.217Oryzias_latipes
ENSACLG00000027053gfi1b10071.037ENSORLG00020003719GFI1B10071.037Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000027053gfi1b10070.427ENSORLG00015017142gfi1b10070.427Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000027053gfi1b10071.341ENSOMEG00000015149GFI1B10071.341Oryzias_melastigma
ENSACLG00000027053gfi1b10057.396ENSOGAG00000008879GFI1B10057.692Otolemur_garnettii
ENSACLG00000027053gfi1b10066.964ENSPKIG00000007643gfi1b10066.964Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000027053gfi1b10055.807ENSPSIG00000012112GFI1B10055.807Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000027053gfi1b9964.634ENSPMGG00000006021gfi1b9962.798Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000027053gfi1b9949.326ENSPCIG00000019724GFI1B9949.326Phascolarctos_cinereus
ENSACLG00000027053gfi1b10075.522ENSPFOG00000003460gfi1b10075.522Poecilia_formosa
ENSACLG00000027053gfi1b10076.900ENSPLAG00000021960GFI1B10076.900Poecilia_latipinna
ENSACLG00000027053gfi1b9974.556ENSPLAG00000017181GFI1B9974.556Poecilia_latipinna
ENSACLG00000027053gfi1b10076.292ENSPMEG00000019220gfi1b10076.292Poecilia_mexicana
ENSACLG00000027053gfi1b10076.292ENSPMEG00000001556GFI1B10076.292Poecilia_mexicana
ENSACLG00000027053gfi1b10075.988ENSPREG00000021718gfi1b10075.988Poecilia_reticulata
ENSACLG00000027053gfi1b10094.737ENSPNYG00000018422gfi1b10094.737Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000027053gfi1b10068.452ENSPNAG00000021118gfi1b10068.452Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000027053gfi1b9946.381ENSSHAG00000006462GFI1B9946.381Sarcophilus_harrisii
ENSACLG00000027053gfi1b8361.429ENSSFOG00015011566gfi1b9061.429Scleropages_formosus
ENSACLG00000027053gfi1b9974.006ENSSMAG00000015181gfi1b9973.700Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000027053gfi1b10079.205ENSSDUG00000011604gfi1b10079.205Seriola_dumerili
ENSACLG00000027053gfi1b10078.593ENSSLDG00000013823gfi1b10078.593Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000027053gfi1b9948.424ENSSPUG00000016039GFI1B9948.424Sphenodon_punctatus
ENSACLG00000027053gfi1b10076.829ENSSPAG00000022914gfi1b10076.829Stegastes_partitus
ENSACLG00000027053gfi1b5190.351ENSTGUG00000005282-9990.351Taeniopygia_guttata
ENSACLG00000027053gfi1b9974.312ENSTRUG00000004525gfi1b9974.312Takifugu_rubripes
ENSACLG00000027053gfi1b9972.866ENSTNIG00000003834gfi1b9972.866Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000027053gfi1b10041.954ENSTBEG00000014459GFI1B10041.954Tupaia_belangeri
ENSACLG00000027053gfi1b9957.185ENSXETG00000006263gfi1b9959.581Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000027053gfi1b10076.596ENSXMAG00000027589gfi1b10076.596Xiphophorus_maculatus

Copyright © , Bioinformatics Center, Sun Yat-sen Memorial Hospital, Sun Yat-sen University, China. All Rights Reserved.

Any comment and suggestion, please contact us