EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000027135 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1044 bases
Position: chr18:19445865-19446908
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000040267	RVT_1	PF00078.27	1.4e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000041214	-	1044	-	ENSACLP00000040267	347 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000027135	-	99	48.725	ENSACLG00000004581	-	91	48.725
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ENSACLG00000027135	-	94	56.135	ENSACLG00000014915	-	50	56.135
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ENSACLG00000027135	-	99	50.578	ENSACLG00000014413	-	51	50.578
ENSACLG00000027135	-	99	45.665	ENSACLG00000009983	-	91	45.665
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ENSACLG00000027135	-	78	45.588	ENSACLG00000013213	-	77	45.588
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ENSACLG00000027135	-	99	48.159	ENSACLG00000004579	-	82	48.159
ENSACLG00000027135	-	99	49.280	ENSACLG00000005921	-	66	49.280
ENSACLG00000027135	-	51	30.645	ENSACLG00000022899	-	54	30.645
ENSACLG00000027135	-	94	99.387	ENSACLG00000002171	-	100	99.387
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ENSACLG00000027135	-	93	98.457	ENSACLG00000027738	-	100	98.457
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ENSACLG00000027135	-	99	51.576	ENSACLG00000020302	-	91	51.576
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ENSACLG00000027135	-	93	49.691	ENSACLG00000010284	-	91	49.691
ENSACLG00000027135	-	99	56.812	ENSACLG00000004232	-	78	56.812
ENSACLG00000027135	-	98	53.198	ENSACLG00000011570	-	91	53.198
ENSACLG00000027135	-	99	53.582	ENSACLG00000005547	-	54	53.582
ENSACLG00000027135	-	61	49.296	ENSACLG00000020388	-	61	49.545
ENSACLG00000027135	-	99	47.110	ENSACLG00000015732	-	94	47.110
ENSACLG00000027135	-	73	54.510	ENSACLG00000026286	-	68	54.510
ENSACLG00000027135	-	99	45.821	ENSACLG00000000597	-	98	45.821
ENSACLG00000027135	-	99	52.436	ENSACLG00000013583	-	91	52.436
ENSACLG00000027135	-	84	45.918	ENSACLG00000005126	-	90	45.918
ENSACLG00000027135	-	75	44.656	ENSACLG00000013521	-	66	44.656
ENSACLG00000027135	-	99	50.578	ENSACLG00000005017	-	51	50.578
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ENSACLG00000027135	-	89	48.397	ENSACLG00000002685	-	84	48.397
ENSACLG00000027135	-	92	48.916	ENSACLG00000023425	-	91	48.424
ENSACLG00000027135	-	96	50.000	ENSACLG00000015659	-	56	50.000
ENSACLG00000027135	-	73	46.429	ENSACLG00000015652	-	96	46.429
ENSACLG00000027135	-	99	56.522	ENSACLG00000013183	-	92	56.522
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ENSACLG00000027135	-	51	50.276	ENSACLG00000021947	-	58	50.276
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ENSACLG00000027135	-	100	98.847	ENSACLG00000025009	-	73	98.847
ENSACLG00000027135	-	99	53.868	ENSACLG00000022051	-	91	53.868
ENSACLG00000027135	-	100	98.847	ENSACLG00000014911	-	53	98.847
ENSACLG00000027135	-	99	55.942	ENSACLG00000020184	-	75	55.942
ENSACLG00000027135	-	99	55.942	ENSACLG00000020183	-	51	55.942
ENSACLG00000027135	-	99	55.942	ENSACLG00000027855	-	78	55.942
ENSACLG00000027135	-	93	48.632	ENSACLG00000018346	-	72	48.328
ENSACLG00000027135	-	99	50.289	ENSACLG00000014537	-	73	50.289
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ENSACLG00000027135	-	81	49.645	ENSACLG00000022277	-	69	49.645
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ENSACLG00000027135	-	99	55.814	ENSACLG00000000437	-	92	55.652
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ENSACLG00000027135	-	99	56.232	ENSACLG00000011151	-	92	56.232
ENSACLG00000027135	-	99	53.868	ENSACLG00000022656	-	80	53.868
ENSACLG00000027135	-	91	46.057	ENSACLG00000027774	-	100	46.057
ENSACLG00000027135	-	99	55.652	ENSACLG00000019420	-	69	55.652
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ENSACLG00000027135	-	92	49.847	ENSACLG00000021937	-	69	49.107
ENSACLG00000027135	-	51	30.645	ENSACLG00000024180	-	54	30.645
ENSACLG00000027135	-	99	45.087	ENSACLG00000022741	-	96	45.087
ENSACLG00000027135	-	99	56.522	ENSACLG00000013944	-	78	56.522
ENSACLG00000027135	-	98	45.723	ENSACLG00000003937	-	85	45.723
ENSACLG00000027135	-	59	52.913	ENSACLG00000021583	-	50	52.913
ENSACLG00000027135	-	99	56.232	ENSACLG00000008024	-	92	56.232
ENSACLG00000027135	-	99	46.821	ENSACLG00000017402	-	74	46.821
ENSACLG00000027135	-	93	49.379	ENSACLG00000005711	-	99	49.379
ENSACLG00000027135	-	99	46.667	ENSACLG00000012076	-	92	46.667
ENSACLG00000027135	-	99	56.105	ENSACLG00000026769	-	78	56.105
ENSACLG00000027135	-	99	49.857	ENSACLG00000013932	-	64	49.857
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ENSACLG00000027135	-	78	46.125	ENSACLG00000002591	-	89	46.125
ENSACLG00000027135	-	56	50.754	ENSACLG00000003644	-	61	50.754
ENSACLG00000027135	-	99	53.009	ENSACLG00000012219	-	73	53.009
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ENSACLG00000027135	-	99	48.442	ENSACLG00000014661	-	74	48.442
ENSACLG00000027135	-	97	47.478	ENSACLG00000017680	-	97	47.478
ENSACLG00000027135	-	99	56.522	ENSACLG00000001405	-	51	56.522
ENSACLG00000027135	-	99	53.295	ENSACLG00000008859	-	51	53.295
ENSACLG00000027135	-	100	97.695	ENSACLG00000022853	-	65	97.695
ENSACLG00000027135	-	87	55.116	ENSACLG00000000802	-	92	54.934
ENSACLG00000027135	-	99	55.652	ENSACLG00000008571	-	51	55.652
ENSACLG00000027135	-	99	56.522	ENSACLG00000008572	-	78	56.522
ENSACLG00000027135	-	78	45.725	ENSACLG00000022104	-	73	45.725
ENSACLG00000027135	-	99	56.232	ENSACLG00000017093	-	78	56.232
ENSACLG00000027135	-	99	49.284	ENSACLG00000014642	-	57	49.284
ENSACLG00000027135	-	99	44.638	ENSACLG00000024414	-	90	44.638
ENSACLG00000027135	-	88	55.921	ENSACLG00000006327	-	58	55.921
ENSACLG00000027135	-	99	47.110	ENSACLG00000004998	-	77	47.110
ENSACLG00000027135	-	99	55.942	ENSACLG00000020601	-	78	55.942
ENSACLG00000027135	-	99	53.582	ENSACLG00000003670	-	54	53.582
ENSACLG00000027135	-	99	45.507	ENSACLG00000018107	-	62	45.507
ENSACLG00000027135	-	99	55.652	ENSACLG00000010664	-	62	55.652
ENSACLG00000027135	-	99	54.023	ENSACLG00000007318	-	91	54.023
ENSACLG00000027135	-	99	56.812	ENSACLG00000023557	-	54	56.812
ENSACLG00000027135	-	99	55.652	ENSACLG00000010080	-	78	55.652
ENSACLG00000027135	-	99	50.000	ENSACLG00000010082	-	62	50.000
ENSACLG00000027135	-	86	56.146	ENSACLG00000022219	-	80	56.146
ENSACLG00000027135	-	99	55.523	ENSACLG00000006202	-	92	55.362
ENSACLG00000027135	-	99	44.348	ENSACLG00000024587	-	75	44.348
ENSACLG00000027135	-	100	98.559	ENSACLG00000000230	-	73	98.559
ENSACLG00000027135	-	99	47.110	ENSACLG00000026963	-	91	47.110
ENSACLG00000027135	-	80	45.936	ENSACLG00000000907	-	75	45.936
ENSACLG00000027135	-	100	48.571	ENSACLG00000019417	-	98	48.571

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000027135	-	52	38.830	ENSAOCG00000022972	-	95	38.830	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000027135	-	99	48.696	ENSAOCG00000004576	-	93	48.696	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000027135	-	99	48.406	ENSAPEG00000024502	-	93	48.406	Amphiprion_percula
ENSACLG00000027135	-	99	53.913	ENSATEG00000015490	-	56	53.913	Anabas_testudineus
ENSACLG00000027135	-	99	54.203	ENSATEG00000002739	-	56	54.203	Anabas_testudineus
ENSACLG00000027135	-	99	42.733	ENSATEG00000004798	-	60	42.733	Anabas_testudineus
ENSACLG00000027135	-	98	53.687	ENSATEG00000004857	-	73	53.687	Anabas_testudineus
ENSACLG00000027135	-	99	53.623	ENSATEG00000015931	-	68	53.623	Anabas_testudineus
ENSACLG00000027135	-	99	54.203	ENSATEG00000014607	-	67	54.203	Anabas_testudineus
ENSACLG00000027135	-	88	42.345	ENSATEG00000014055	-	53	42.345	Anabas_testudineus
ENSACLG00000027135	-	99	43.023	ENSATEG00000019241	-	97	43.023	Anabas_testudineus
ENSACLG00000027135	-	76	41.288	ENSAMXG00000041932	-	64	41.288	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027135	-	99	44.186	ENSAMXG00000032827	-	99	44.186	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027135	-	99	57.514	ENSAMXG00000032588	-	52	57.514	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027135	-	99	55.202	ENSAMXG00000043461	-	69	55.202	Astyanax_mexicanus
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