EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000027223 (Gene tree)
Gene ID: 113025484
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 21287 bases
Position: chr7:14272044-14293330
Accession: ZDB-GENE-080819-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000040437	IBN_N	PF03810.19	1.9e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000041389	-	2640	-	ENSACLP00000040437	879 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACLG00000027223's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACLG00000027223's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000027223	tnpo1	99	84.234	ENSACLG00000001853	tnpo2	99	84.234
ENSACLG00000027223	tnpo1	99	80.502	ENSACLG00000020672	-	99	80.502

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	ENSG00000083312	TNPO1	100	93.782	Homo_sapiens
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	96.854	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	96.854	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	89.978	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	90.757	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACLG00000027223	tnpo1	87	97.413	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	97.413	Amphilophus_citrinellus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	96.854	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	96.854	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	96.854	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	96.854	Amphiprion_percula
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	96.404	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	96.404	Anabas_testudineus
ENSACLG00000027223	tnpo1	99	87.711	ENSAPLG00000009619	-	97	88.417	Anas_platyrhynchos
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.685	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	91.685	Anolis_carolinensis
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	81.910	ENSANAG00000025351	-	99	81.910	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	59.354	ENSANAG00000027118	-	99	59.313	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.124	ENSANAG00000022453	-	99	91.124	Aotus_nancymaae
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	92.265	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.040	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.685	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	91.685	Bos_taurus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.236	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	91.236	Callithrix_jacchus
ENSACLG00000027223	tnpo1	96	91.482	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	91.482	Canis_familiaris
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	89.213	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	89.213	Canis_lupus_dingo
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	91.573	Capra_hircus
ENSACLG00000027223	tnpo1	99	88.023	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	90.292	Carlito_syrichta
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.124	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	91.124	Cebus_capucinus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	91.573	Cercocebus_atys
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.124	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	91.124	Chinchilla_lanigera
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	91.573	Chlorocebus_sabaeus
ENSACLG00000027223	tnpo1	94	80.238	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	80.357	Choloepus_hoffmanni
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.910	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	91.910	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000027223	tnpo1	99	75.084	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.084	Ciona_savignyi
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	91.573	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.685	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	91.685	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACLG00000027223	tnpo1	96	91.813	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	91.813	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	94.494	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	94.494	Cynoglossus_semilaevis
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	95.281	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	95.281	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	92.593	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.480	Danio_rerio
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	86.404	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	86.404	Dasypus_novemcinctus
ENSACLG00000027223	tnpo1	93	91.687	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	91.677	Dipodomys_ordii
ENSACLG00000027223	tnpo1	99	57.175	FBgn0035693	CG8219	99	56.723	Drosophila_melanogaster
ENSACLG00000027223	tnpo1	87	94.007	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.007	Echinops_telfairi
ENSACLG00000027223	tnpo1	94	83.214	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	82.976	Eptatretus_burgeri
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	91.573	Equus_asinus_asinus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	91.573	Equus_caballus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	87.037	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.928	Esox_lucius
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	91.573	Felis_catus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	92.022	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	92.022	Ficedula_albicollis
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.236	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	91.236	Fukomys_damarensis
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	95.286	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	95.286	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.265	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	91.265	Gadus_morhua
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.236	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	91.236	Gallus_gallus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	94.731	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	94.731	Gambusia_affinis
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	94.719	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	94.719	Gasterosteus_aculeatus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.798	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	91.798	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	76.457	ENSGGOG00000022535	-	98	76.457	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	91.573	Gorilla_gorilla
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	98.202	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	98.202	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.124	ENSHGLG00000000970	-	99	91.124	Heterocephalus_glaber_female
ENSACLG00000027223	tnpo1	97	73.122	ENSHGLG00100000963	-	99	72.535	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000027223	tnpo1	96	91.121	ENSHGLG00100017090	-	99	91.121	Heterocephalus_glaber_male
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.685	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	91.685	Jaculus_jaculus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	94.944	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	94.944	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000027223	tnpo1	91	92.109	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	91.615	Labrus_bergylta
ENSACLG00000027223	tnpo1	96	85.349	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	85.349	Latimeria_chalumnae
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	92.697	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	92.697	Lepisosteus_oculatus
ENSACLG00000027223	tnpo1	97	90.878	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	90.878	Loxodonta_africana
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	91.573	Macaca_fascicularis
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.461	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	91.535	Macaca_mulatta
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	91.573	Macaca_nemestrina
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	91.573	Mandrillus_leucophaeus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	96.854	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	96.854	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	98.647	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	98.647	Maylandia_zebra
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.685	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	Mesocricetus_auratus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	87.978	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	87.978	Microcebus_murinus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.685	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	91.685	Microtus_ochrogaster
ENSACLG00000027223	tnpo1	87	94.845	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	94.845	Mola_mola
ENSACLG00000027223	tnpo1	99	90.638	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	90.638	Monodelphis_domestica
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	95.506	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	95.506	Monopterus_albus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.685	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	93.820	Mus_caroli
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.685	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	93.820	Mus_musculus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.798	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.820	Mus_pahari
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.461	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	93.820	Mus_spretus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	91.573	Mustela_putorius_furo
ENSACLG00000027223	tnpo1	96	91.153	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	91.153	Myotis_lucifugus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.798	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	91.798	Nannospalax_galili
ENSACLG00000027223	tnpo1	87	97.925	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	97.925	Neolamprologus_brichardi
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	91.573	Nomascus_leucogenys
ENSACLG00000027223	tnpo1	90	86.901	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	86.901	Ochotona_princeps
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	90.899	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	90.899	Octodon_degus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	97.433	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	97.433	Oreochromis_niloticus
ENSACLG00000027223	tnpo1	92	92.073	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	92.073	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACLG00000027223	tnpo1	96	86.449	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.215	Oryctolagus_cuniculus
ENSACLG00000027223	tnpo1	86	95.703	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	95.703	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027223	tnpo1	99	96.041	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	96.041	Oryzias_latipes_hni
ENSACLG00000027223	tnpo1	99	95.716	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	95.716	Oryzias_latipes_hsok
ENSACLG00000027223	tnpo1	99	95.265	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	95.265	Oryzias_melastigma
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	91.573	Otolemur_garnettii
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.685	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	91.685	Ovis_aries
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	91.573	Pan_paniscus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	91.573	Panthera_pardus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	91.573	Panthera_tigris_altaica
ENSACLG00000027223	tnpo1	94	80.110	ENSPTRG00000047731	-	100	80.110	Pan_troglodytes
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	91.573	Pan_troglodytes
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	91.573	Papio_anubis
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	88.989	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	88.989	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.910	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	91.910	Pelodiscus_sinensis
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	92.929	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	92.593	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACLG00000027223	tnpo1	96	91.813	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	91.813	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	92.472	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	92.472	Phascolarctos_cinereus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	95.073	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	95.073	Poecilia_formosa
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	95.073	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	95.073	Poecilia_latipinna
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	95.506	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	95.506	Poecilia_mexicana
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	95.291	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	95.291	Poecilia_reticulata
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.461	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	91.461	Pongo_abelii
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	91.573	Propithecus_coquereli
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.461	ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	91.461	Pteropus_vampyrus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	98.204	ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	98.204	Pundamilia_nyererei
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	92.152	ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.265	Pygocentrus_nattereri
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.685	ENSRNOG00000014999	Tnpo1	100	91.685	Rattus_norvegicus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	91.573	Rhinopithecus_bieti
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	ENSRROG00000035271	TNPO1	99	91.573	Rhinopithecus_roxellana
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.236	ENSSBOG00000029256	TNPO1	100	91.236	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACLG00000027223	tnpo1	96	92.398	ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	92.398	Sarcophilus_harrisii
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	93.603	ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	93.827	Scleropages_formosus
ENSACLG00000027223	tnpo1	96	95.327	ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	95.327	Scophthalmus_maximus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	96.966	ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	96.966	Seriola_dumerili
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	96.854	ENSSLDG00000014578	tnpo1	100	96.854	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.685	ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	91.685	Sphenodon_punctatus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	96.966	ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	96.966	Stegastes_partitus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	91.573	Sus_scrofa
ENSACLG00000027223	tnpo1	99	90.067	ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	90.067	Taeniopygia_guttata
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	95.603	ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	95.603	Takifugu_rubripes
ENSACLG00000027223	tnpo1	69	89.448	ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	89.448	Tetraodon_nigroviridis
ENSACLG00000027223	tnpo1	87	94.667	ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	94.667	Tupaia_belangeri
ENSACLG00000027223	tnpo1	96	88.070	ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	88.070	Tursiops_truncatus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	ENSUMAG00000007635	TNPO1	100	91.573	Ursus_maritimus
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	87.991	ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	87.991	Vicugna_pacos
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	ENSVVUG00000007338	TNPO1	100	91.573	Vulpes_vulpes
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	90.449	ENSXETG00000016812	tnpo1	99	90.000	Xenopus_tropicalis
ENSACLG00000027223	tnpo1	100	95.286	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	95.286	Xiphophorus_maculatus