EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000027511 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3402 bases
Position: chr23:33345982-33349383
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000040849	RVT_1	PF00078.27	1.1e-43	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000041807	-	3402	-	ENSACLP00000040849	1133 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000027511	-	72	42.556	ENSACLG00000004826	-	97	42.438
ENSACLG00000027511	-	64	39.213	ENSACLG00000013844	-	96	39.213
ENSACLG00000027511	-	78	40.691	ENSACLG00000015667	-	99	40.691
ENSACLG00000027511	-	53	37.789	ENSACLG00000012279	-	98	37.789
ENSACLG00000027511	-	81	43.576	ENSACLG00000007643	-	87	43.576
ENSACLG00000027511	-	72	42.556	ENSACLG00000023885	-	97	42.438
ENSACLG00000027511	-	72	44.125	ENSACLG00000021051	-	98	44.125
ENSACLG00000027511	-	78	40.468	ENSACLG00000025376	-	99	40.468
ENSACLG00000027511	-	65	43.968	ENSACLG00000020248	-	98	43.968
ENSACLG00000027511	-	55	47.096	ENSACLG00000014746	-	98	46.939
ENSACLG00000027511	-	58	43.419	ENSACLG00000020183	-	98	43.419
ENSACLG00000027511	-	80	41.342	ENSACLG00000017412	-	99	41.342
ENSACLG00000027511	-	55	46.782	ENSACLG00000005547	-	98	46.782
ENSACLG00000027511	-	67	42.911	ENSACLG00000027996	-	98	42.911
ENSACLG00000027511	-	59	57.164	ENSACLG00000014413	-	98	57.164
ENSACLG00000027511	-	61	43.062	ENSACLG00000009807	-	97	43.062
ENSACLG00000027511	-	52	57.432	ENSACLG00000015659	-	99	57.432
ENSACLG00000027511	-	78	40.468	ENSACLG00000015650	-	99	40.468
ENSACLG00000027511	-	61	44.160	ENSACLG00000017692	-	97	44.160
ENSACLG00000027511	-	65	44.370	ENSACLG00000012019	-	98	44.370
ENSACLG00000027511	-	78	40.914	ENSACLG00000012014	-	99	40.914
ENSACLG00000027511	-	78	40.468	ENSACLG00000022844	-	99	40.468
ENSACLG00000027511	-	55	45.268	ENSACLG00000022841	-	81	44.984
ENSACLG00000027511	-	72	42.321	ENSACLG00000002468	-	97	42.204
ENSACLG00000027511	-	55	47.096	ENSACLG00000003670	-	98	47.096
ENSACLG00000027511	-	61	51.256	ENSACLG00000013805	-	83	51.256
ENSACLG00000027511	-	55	43.968	ENSACLG00000023557	-	98	43.968
ENSACLG00000027511	-	59	57.164	ENSACLG00000005017	-	98	57.164
ENSACLG00000027511	-	51	57.439	ENSACLG00000022169	-	97	57.439
ENSACLG00000027511	-	58	31.341	ENSACLG00000006988	-	98	31.195
ENSACLG00000027511	-	58	42.965	ENSACLG00000001758	-	98	42.965
ENSACLG00000027511	-	56	37.649	ENSACLG00000004144	-	96	36.302
ENSACLG00000027511	-	56	49.137	ENSACLG00000005570	-	99	49.137
ENSACLG00000027511	-	58	43.722	ENSACLG00000001405	-	98	43.722
ENSACLG00000027511	-	61	44.160	ENSACLG00000013061	-	97	44.160
ENSACLG00000027511	-	72	79.285	ENSACLG00000019519	-	99	79.285
ENSACLG00000027511	-	56	46.166	ENSACLG00000008859	-	95	46.166
ENSACLG00000027511	-	58	43.854	ENSACLG00000005212	-	99	43.854
ENSACLG00000027511	-	57	43.760	ENSACLG00000014915	-	99	43.760
ENSACLG00000027511	-	55	45.024	ENSACLG00000014911	-	97	45.024
ENSACLG00000027511	-	73	42.635	ENSACLG00000009590	-	99	42.635
ENSACLG00000027511	-	52	98.822	ENSACLG00000014642	-	98	98.822
ENSACLG00000027511	-	75	45.592	ENSACLG00000000734	-	98	45.592
ENSACLG00000027511	-	59	45.906	ENSACLG00000000736	-	96	45.906
ENSACLG00000027511	-	78	40.468	ENSACLG00000025119	-	99	40.468
ENSACLG00000027511	-	52	31.230	ENSACLG00000007200	-	86	31.877
ENSACLG00000027511	-	78	40.737	ENSACLG00000005662	-	99	40.737
ENSACLG00000027511	-	71	40.909	ENSACLG00000017448	-	98	40.909
ENSACLG00000027511	-	60	42.356	ENSACLG00000002614	-	99	42.356
ENSACLG00000027511	-	67	39.040	ENSACLG00000018252	-	98	39.040
ENSACLG00000027511	-	67	42.532	ENSACLG00000020864	-	98	42.405
ENSACLG00000027511	-	73	40.882	ENSACLG00000009850	-	95	40.882
ENSACLG00000027511	-	72	42.556	ENSACLG00000008391	-	97	42.438
ENSACLG00000027511	-	58	43.116	ENSACLG00000008571	-	98	43.116
ENSACLG00000027511	-	75	42.081	ENSACLG00000009939	-	86	42.081
ENSACLG00000027511	-	78	40.468	ENSACLG00000010900	-	99	40.468
ENSACLG00000027511	-	81	43.511	ENSACLG00000003857	-	97	39.983
ENSACLG00000027511	-	65	44.636	ENSACLG00000019194	-	98	44.636
ENSACLG00000027511	-	72	41.816	ENSACLG00000008383	-	99	41.816
ENSACLG00000027511	-	67	52.105	ENSACLG00000015331	-	97	52.105
ENSACLG00000027511	-	78	40.134	ENSACLG00000000393	-	99	40.134
ENSACLG00000027511	-	76	40.618	ENSACLG00000000395	-	99	40.618
ENSACLG00000027511	-	58	43.439	ENSACLG00000000536	-	98	43.439
ENSACLG00000027511	-	72	42.673	ENSACLG00000021287	-	97	42.556

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000027511	-	53	53.808	ENSATEG00000015490	-	98	53.808	Anabas_testudineus
ENSACLG00000027511	-	54	41.167	ENSATEG00000023197	-	95	41.167	Anabas_testudineus
ENSACLG00000027511	-	72	36.957	ENSATEG00000005707	-	99	36.957	Anabas_testudineus
ENSACLG00000027511	-	83	36.402	ENSATEG00000012907	-	97	36.516	Anabas_testudineus
ENSACLG00000027511	-	72	50.732	ENSATEG00000019512	-	96	50.732	Anabas_testudineus
ENSACLG00000027511	-	72	50.732	ENSATEG00000010674	-	96	50.732	Anabas_testudineus
ENSACLG00000027511	-	53	53.311	ENSATEG00000002739	-	98	53.311	Anabas_testudineus
ENSACLG00000027511	-	69	40.602	ENSAMXG00000039914	-	98	40.602	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027511	-	69	40.731	ENSAMXG00000043574	-	96	40.731	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027511	-	64	43.604	ENSAMXG00000043096	-	97	43.604	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027511	-	65	36.156	ENSAMXG00000036646	-	92	35.210	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027511	-	72	40.268	ENSAMXG00000033551	-	98	40.268	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027511	-	56	41.719	ENSAMXG00000041791	-	95	41.719	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027511	-	82	34.595	ENSAMXG00000040053	-	96	35.535	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027511	-	60	33.381	ENSAMXG00000033415	-	92	34.448	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027511	-	61	37.324	ENSAMXG00000030246	-	98	37.324	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027511	-	56	42.065	ENSAMXG00000032588	-	97	42.065	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027511	-	50	41.897	ENSHBUG00000016298	-	98	41.897	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000027511	-	66	38.045	ENSIPUG00000013060	-	89	37.913	Ictalurus_punctatus
ENSACLG00000027511	-	58	42.342	ENSLBEG00000004554	-	96	42.342	Labrus_bergylta
ENSACLG00000027511	-	60	39.112	ENSMAMG00000000974	-	93	39.112	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000027511	-	56	44.359	ENSMAMG00000005648	-	92	44.359	Mastacembelus_armatus
ENSACLG00000027511	-	58	43.419	ENSMZEG00005007942	-	98	43.419	Maylandia_zebra
ENSACLG00000027511	-	58	43.116	ENSMZEG00005006441	-	98	43.116	Maylandia_zebra
ENSACLG00000027511	-	76	42.677	ENSMALG00000019721	-	99	42.726	Monopterus_albus
ENSACLG00000027511	-	59	44.131	ENSORLG00000022724	-	97	44.131	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	51	42.906	ENSORLG00000022257	-	100	42.906	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	61	43.634	ENSORLG00000029550	-	98	43.634	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	83	42.222	ENSORLG00000028030	-	98	42.222	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	71	43.558	ENSORLG00000024191	-	99	43.558	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	81	43.723	ENSORLG00000029224	-	83	43.723	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	62	43.521	ENSORLG00000030233	-	95	43.521	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	81	42.196	ENSORLG00000024855	-	98	42.196	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	63	43.994	ENSORLG00000025670	-	96	43.994	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	83	42.222	ENSORLG00000027909	-	98	42.222	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	83	43.542	ENSORLG00000028245	-	84	40.385	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	83	41.481	ENSORLG00000025146	-	98	41.481	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	62	44.239	ENSORLG00000023505	-	96	44.239	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	78	58.539	ENSORLG00000022165	-	99	58.539	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	56	30.370	ENSORLG00000026699	-	84	30.370	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	60	44.217	ENSORLG00000029236	-	99	44.217	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	81	41.765	ENSORLG00000024780	-	98	41.765	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	71	43.558	ENSORLG00000028993	-	99	43.558	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	83	42.328	ENSORLG00000029170	-	98	42.328	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	83	43.542	ENSORLG00000029686	-	99	40.385	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	71	43.975	ENSORLG00000025955	-	98	43.975	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	78	58.539	ENSORLG00000024647	-	99	58.539	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	56	45.156	ENSORLG00000022342	-	97	45.156	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	75	45.434	ENSORLG00000030003	-	98	45.434	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	59	44.279	ENSORLG00000024475	-	97	44.279	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	78	42.123	ENSORLG00000026935	-	99	42.123	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	66	38.705	ENSORLG00000025344	-	98	38.705	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	52	30.435	ENSORLG00000025964	-	92	30.435	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	64	40.274	ENSORLG00000024275	-	99	40.274	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	59	44.428	ENSORLG00000028549	-	97	44.428	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	83	42.540	ENSORLG00000029083	-	98	42.540	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	59	40.560	ENSORLG00000025214	-	93	40.560	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	59	44.428	ENSORLG00000028484	-	97	44.428	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	69	46.474	ENSORLG00000028387	-	98	46.474	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	71	43.313	ENSORLG00000026927	-	99	43.313	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	67	44.037	ENSORLG00000025506	-	99	44.037	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	75	42.160	ENSORLG00000023110	-	96	42.160	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	50	55.950	ENSORLG00000028297	-	98	55.594	Oryzias_latipes
ENSACLG00000027511	-	81	41.883	ENSORLG00000029119	-	99	41.883	Oryzias_latipes
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