EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000027577 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1854 bases
Position: chr15:17200698-17202551
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000040943	RVT_1	PF00078.27	1.1e-44	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000041906	-	1854	-	ENSACLP00000040943	617 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000027577	-	50	58.199	ENSACLG00000016290	-	100	58.199
ENSACLG00000027577	-	53	31.118	ENSACLG00000021775	-	83	31.118
ENSACLG00000027577	-	60	31.117	ENSACLG00000026769	-	89	31.061
ENSACLG00000027577	-	100	50.891	ENSACLG00000013374	-	71	50.891
ENSACLG00000027577	-	52	32.927	ENSACLG00000020388	-	95	32.378
ENSACLG00000027577	-	100	99.352	ENSACLG00000016551	-	61	99.352
ENSACLG00000027577	-	53	33.929	ENSACLG00000015324	-	86	33.929
ENSACLG00000027577	-	64	30.542	ENSACLG00000025525	-	99	30.542
ENSACLG00000027577	-	51	33.742	ENSACLG00000004754	-	75	33.742
ENSACLG00000027577	-	63	31.061	ENSACLG00000017363	-	89	31.061
ENSACLG00000027577	-	62	30.730	ENSACLG00000011058	-	80	30.730
ENSACLG00000027577	-	60	31.649	ENSACLG00000020601	-	89	31.566
ENSACLG00000027577	-	72	30.152	ENSACLG00000012094	-	93	30.152
ENSACLG00000027577	-	72	30.263	ENSACLG00000024400	-	91	30.252
ENSACLG00000027577	-	65	51.733	ENSACLG00000005509	-	89	51.733
ENSACLG00000027577	-	60	30.851	ENSACLG00000004232	-	89	30.808
ENSACLG00000027577	-	57	50.847	ENSACLG00000027508	-	78	50.847
ENSACLG00000027577	-	54	31.176	ENSACLG00000002725	-	92	31.176
ENSACLG00000027577	-	76	61.146	ENSACLG00000008558	-	100	61.146
ENSACLG00000027577	-	77	51.883	ENSACLG00000008551	-	87	51.883
ENSACLG00000027577	-	72	30.044	ENSACLG00000006327	-	91	30.042
ENSACLG00000027577	-	60	31.383	ENSACLG00000017093	-	89	31.313
ENSACLG00000027577	-	100	52.913	ENSACLG00000000579	-	94	52.913
ENSACLG00000027577	-	52	30.581	ENSACLG00000008024	-	87	30.581
ENSACLG00000027577	-	72	30.110	ENSACLG00000010664	-	85	30.105
ENSACLG00000027577	-	84	61.185	ENSACLG00000021942	-	77	61.027
ENSACLG00000027577	-	54	31.471	ENSACLG00000012279	-	53	31.471
ENSACLG00000027577	-	57	60.684	ENSACLG00000000505	-	99	60.684
ENSACLG00000027577	-	78	56.133	ENSACLG00000023788	-	94	56.133
ENSACLG00000027577	-	57	60.114	ENSACLG00000010907	-	90	60.114
ENSACLG00000027577	-	91	59.147	ENSACLG00000017241	-	93	59.147
ENSACLG00000027577	-	51	33.129	ENSACLG00000019110	-	79	33.129
ENSACLG00000027577	-	62	32.637	ENSACLG00000021422	-	96	32.637
ENSACLG00000027577	-	51	32.508	ENSACLG00000005259	-	99	32.508
ENSACLG00000027577	-	63	30.730	ENSACLG00000001035	-	97	30.576
ENSACLG00000027577	-	60	31.383	ENSACLG00000027855	-	89	31.313
ENSACLG00000027577	-	85	54.198	ENSACLG00000016956	-	94	54.198
ENSACLG00000027577	-	65	31.311	ENSACLG00000019420	-	86	31.250
ENSACLG00000027577	-	60	31.117	ENSACLG00000008572	-	89	31.061
ENSACLG00000027577	-	60	30.851	ENSACLG00000013944	-	89	30.808
ENSACLG00000027577	-	83	30.192	ENSACLG00000016231	-	88	30.192
ENSACLG00000027577	-	86	59.623	ENSACLG00000001773	-	70	59.623
ENSACLG00000027577	-	60	31.117	ENSACLG00000025562	-	89	31.061
ENSACLG00000027577	-	59	31.383	ENSACLG00000025851	-	94	31.383
ENSACLG00000027577	-	55	32.277	ENSACLG00000021583	-	83	32.277
ENSACLG00000027577	-	51	30.284	ENSACLG00000015445	-	83	30.284
ENSACLG00000027577	-	64	30.769	ENSACLG00000001556	-	85	30.769
ENSACLG00000027577	-	66	30.310	ENSACLG00000012219	-	88	30.310
ENSACLG00000027577	-	63	30.198	ENSACLG00000022277	-	97	30.198
ENSACLG00000027577	-	100	61.003	ENSACLG00000004427	-	76	61.003
ENSACLG00000027577	-	100	53.560	ENSACLG00000019498	-	87	53.560
ENSACLG00000027577	-	68	61.667	ENSACLG00000010366	-	92	61.667
ENSACLG00000027577	-	70	32.574	ENSACLG00000006688	-	93	32.574
ENSACLG00000027577	-	60	31.117	ENSACLG00000010080	-	89	31.061
ENSACLG00000027577	-	100	98.541	ENSACLG00000003707	-	74	98.541
ENSACLG00000027577	-	93	97.548	ENSACLG00000027127	-	77	97.548
ENSACLG00000027577	-	100	51.053	ENSACLG00000002312	-	61	51.053
ENSACLG00000027577	-	58	30.811	ENSACLG00000026286	-	97	30.811
ENSACLG00000027577	-	59	31.016	ENSACLG00000016639	-	86	30.964
ENSACLG00000027577	-	70	56.713	ENSACLG00000026433	-	97	56.713
ENSACLG00000027577	-	97	54.515	ENSACLG00000018778	-	59	54.515
ENSACLG00000027577	-	64	32.576	ENSACLG00000004613	-	95	32.576
ENSACLG00000027577	-	73	53.201	ENSACLG00000020009	-	77	53.201
ENSACLG00000027577	-	70	62.156	ENSACLG00000009848	-	99	62.156
ENSACLG00000027577	-	100	60.258	ENSACLG00000017200	-	60	60.258
ENSACLG00000027577	-	66	50.617	ENSACLG00000001102	-	53	50.617
ENSACLG00000027577	-	68	51.190	ENSACLG00000019219	-	93	51.190
ENSACLG00000027577	-	62	31.061	ENSACLG00000005642	-	66	31.061
ENSACLG00000027577	-	60	30.585	ENSACLG00000024184	-	89	30.556
ENSACLG00000027577	-	100	54.045	ENSACLG00000007650	-	60	54.045
ENSACLG00000027577	-	100	51.216	ENSACLG00000001858	-	86	51.216
ENSACLG00000027577	-	75	62.419	ENSACLG00000023590	-	93	62.419
ENSACLG00000027577	-	100	50.243	ENSACLG00000007954	-	92	50.243
ENSACLG00000027577	-	100	50.891	ENSACLG00000005489	-	92	50.891
ENSACLG00000027577	-	100	54.045	ENSACLG00000018002	-	72	54.045
ENSACLG00000027577	-	60	31.053	ENSACLG00000021354	-	100	31.053
ENSACLG00000027577	-	59	58.424	ENSACLG00000026307	-	100	58.424
ENSACLG00000027577	-	76	30.720	ENSACLG00000005158	-	52	30.720
ENSACLG00000027577	-	62	31.298	ENSACLG00000005746	-	88	31.298
ENSACLG00000027577	-	100	99.028	ENSACLG00000020849	-	94	99.028
ENSACLG00000027577	-	66	30.476	ENSACLG00000009011	-	88	30.476
ENSACLG00000027577	-	100	99.190	ENSACLG00000008988	-	67	99.190

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000027577	-	73	53.007	ENSAPEG00000014494	-	99	53.007	Amphiprion_percula
ENSACLG00000027577	-	70	39.130	ENSAMXG00000035582	-	85	39.130	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027577	-	58	30.978	ENSCPBG00000005177	-	92	30.978	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000027577	-	51	32.808	ENSCPBG00000011561	-	81	32.808	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000027577	-	70	30.046	ENSCPBG00000022715	-	93	30.046	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000027577	-	56	30.925	ENSCPBG00000006651	-	90	30.925	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000027577	-	60	32.075	ENSCPBG00000004252	-	89	32.075	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000027577	-	70	31.279	ENSCPBG00000024353	-	84	31.279	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000027577	-	52	33.131	ENSCPBG00000003209	-	98	33.131	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000027577	-	71	30.159	ENSCPBG00000001489	-	77	30.159	Chrysemys_picta_bellii
ENSACLG00000027577	-	61	30.729	ENSCPBG00000001408	-	87	30.729	Chrysemys_picta_bellii
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ENSACLG00000027577	-	70	30.485	ENSGAGG00000017706	-	90	30.485	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000027577	-	53	30.091	ENSGAGG00000025522	-	94	30.091	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000027577	-	52	31.464	ENSGAGG00000007999	-	96	31.464	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000027577	-	53	31.611	ENSGAGG00000015930	-	94	31.611	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000027577	-	58	33.240	ENSGAGG00000021454	-	83	33.240	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000027577	-	63	31.525	ENSGAGG00000014895	-	78	31.525	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000027577	-	53	31.307	ENSGAGG00000003617	-	93	31.307	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000027577	-	70	30.394	ENSGAGG00000017850	-	98	30.394	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000027577	-	64	31.218	ENSGAGG00000006259	-	83	31.218	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000027577	-	53	31.307	ENSGAGG00000000719	-	92	31.307	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000027577	-	64	30.025	ENSGAGG00000022076	-	99	30.025	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000027577	-	70	30.162	ENSGAGG00000018246	-	77	30.162	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000027577	-	64	31.218	ENSGAGG00000002004	-	85	31.218	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000027577	-	64	31.061	ENSGAGG00000010190	-	91	31.061	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000027577	-	66	30.562	ENSGAGG00000022089	-	97	30.562	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000027577	-	58	31.742	ENSGAGG00000006922	-	99	31.742	Gopherus_agassizii
ENSACLG00000027577	-	62	54.856	ENSHBUG00000000067	-	99	54.856	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000027577	-	66	30.048	ENSKMAG00000020993	-	99	30.048	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000027577	-	100	48.298	ENSKMAG00000004644	-	91	48.298	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000027577	-	73	48.344	ENSKMAG00000011565	-	93	48.344	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000027577	-	56	30.791	ENSKMAG00000018693	-	95	30.791	Kryptolebias_marmoratus
ENSACLG00000027577	-	64	31.095	ENSLBEG00000007826	-	99	31.095	Labrus_bergylta
ENSACLG00000027577	-	100	61.588	ENSLBEG00000018374	-	93	61.588	Labrus_bergylta
ENSACLG00000027577	-	73	63.415	ENSLBEG00000003172	-	93	63.415	Labrus_bergylta
ENSACLG00000027577	-	82	61.386	ENSLBEG00000015802	-	70	61.386	Labrus_bergylta
ENSACLG00000027577	-	67	61.687	ENSLBEG00000009271	-	81	61.687	Labrus_bergylta
ENSACLG00000027577	-	85	62.311	ENSLBEG00000008627	-	94	62.311	Labrus_bergylta
ENSACLG00000027577	-	62	63.185	ENSLBEG00000007558	-	99	63.185	Labrus_bergylta
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ENSACLG00000027577	-	57	32.865	ENSLACG00000015198	-	61	32.865	Latimeria_chalumnae
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