EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000027774 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1207 bases
Position: chr13:27181960-27183166
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000041256	RVT_1	PF00078.27	7.6e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000042226	-	1207	-	ENSACLP00000041256	317 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000027774	-	78	53.252	ENSACLG00000022104	-	66	53.252
ENSACLG00000027774	-	100	47.003	ENSACLG00000017093	-	72	47.003
ENSACLG00000027774	-	100	46.372	ENSACLG00000011151	-	85	46.372
ENSACLG00000027774	-	100	47.003	ENSACLG00000004232	-	72	47.003
ENSACLG00000027774	-	70	48.673	ENSACLG00000021354	-	59	48.673
ENSACLG00000027774	-	100	46.688	ENSACLG00000021814	-	56	46.688
ENSACLG00000027774	-	99	52.038	ENSACLG00000013932	-	58	52.038
ENSACLG00000027774	-	82	53.462	ENSACLG00000015652	-	99	53.462
ENSACLG00000027774	-	99	51.420	ENSACLG00000022656	-	72	51.420
ENSACLG00000027774	-	76	53.942	ENSACLG00000010474	-	53	53.942
ENSACLG00000027774	-	100	32.177	ENSACLG00000024587	-	67	32.177
ENSACLG00000027774	-	100	49.057	ENSACLG00000004998	-	71	49.057
ENSACLG00000027774	-	97	50.323	ENSACLG00000023425	-	83	50.784
ENSACLG00000027774	-	88	46.403	ENSACLG00000000802	-	84	46.403
ENSACLG00000027774	-	100	66.562	ENSACLG00000025957	-	60	66.562
ENSACLG00000027774	-	100	48.742	ENSACLG00000015732	-	86	48.742
ENSACLG00000027774	-	99	68.987	ENSACLG00000003937	-	79	68.987
ENSACLG00000027774	-	99	52.351	ENSACLG00000020926	-	83	52.351
ENSACLG00000027774	-	100	47.003	ENSACLG00000027855	-	72	47.003
ENSACLG00000027774	-	99	56.329	ENSACLG00000013483	-	92	56.329
ENSACLG00000027774	-	81	52.713	ENSACLG00000013213	-	73	52.713
ENSACLG00000027774	-	99	52.050	ENSACLG00000022051	-	82	52.050
ENSACLG00000027774	-	99	51.104	ENSACLG00000007318	-	82	51.104
ENSACLG00000027774	-	96	68.092	ENSACLG00000009983	-	83	66.562
ENSACLG00000027774	-	90	49.481	ENSACLG00000002685	-	77	49.481
ENSACLG00000027774	-	100	46.688	ENSACLG00000017363	-	72	46.688
ENSACLG00000027774	-	100	52.366	ENSACLG00000024414	-	83	52.366
ENSACLG00000027774	-	99	50.158	ENSACLG00000013583	-	82	50.158
ENSACLG00000027774	-	100	46.688	ENSACLG00000019420	-	63	46.688
ENSACLG00000027774	-	100	46.372	ENSACLG00000025009	-	67	46.372
ENSACLG00000027774	-	100	45.597	ENSACLG00000000597	-	89	45.597
ENSACLG00000027774	-	87	45.290	ENSACLG00000003344	-	89	45.290
ENSACLG00000027774	-	100	45.741	ENSACLG00000000230	-	67	45.741
ENSACLG00000027774	-	100	46.688	ENSACLG00000024400	-	61	46.688
ENSACLG00000027774	-	99	47.003	ENSACLG00000004581	-	82	47.003
ENSACLG00000027774	-	85	66.421	ENSACLG00000005126	-	83	66.421
ENSACLG00000027774	-	100	67.508	ENSACLG00000012076	-	85	67.508
ENSACLG00000027774	-	100	46.688	ENSACLG00000016639	-	69	46.688
ENSACLG00000027774	-	100	47.003	ENSACLG00000000182	-	56	47.003
ENSACLG00000027774	-	77	64.754	ENSACLG00000002591	-	80	64.754
ENSACLG00000027774	-	100	46.688	ENSACLG00000013944	-	72	46.688
ENSACLG00000027774	-	100	48.113	ENSACLG00000002680	-	78	48.113
ENSACLG00000027774	-	100	53.628	ENSACLG00000017680	-	92	53.628
ENSACLG00000027774	-	100	42.500	ENSACLG00000004579	-	75	42.500
ENSACLG00000027774	-	96	49.191	ENSACLG00000006014	-	67	49.191
ENSACLG00000027774	-	100	46.855	ENSACLG00000006202	-	85	46.855
ENSACLG00000027774	-	100	46.372	ENSACLG00000013183	-	85	46.372
ENSACLG00000027774	-	100	49.057	ENSACLG00000022877	-	71	49.057
ENSACLG00000027774	-	96	67.434	ENSACLG00000022741	-	88	65.931
ENSACLG00000027774	-	98	46.624	ENSACLG00000015659	-	52	46.624
ENSACLG00000027774	-	100	66.562	ENSACLG00000005593	-	83	66.562
ENSACLG00000027774	-	99	53.481	ENSACLG00000018107	-	57	53.481
ENSACLG00000027774	-	100	46.688	ENSACLG00000020184	-	69	46.688
ENSACLG00000027774	-	94	47.987	ENSACLG00000022169	-	50	47.987
ENSACLG00000027774	-	100	70.662	ENSACLG00000010284	-	89	70.662
ENSACLG00000027774	-	100	66.877	ENSACLG00000017402	-	68	66.877
ENSACLG00000027774	-	94	42.667	ENSACLG00000018346	-	67	42.667
ENSACLG00000027774	-	94	50.000	ENSACLG00000011440	-	83	50.000
ENSACLG00000027774	-	92	45.066	ENSACLG00000021937	-	62	45.066
ENSACLG00000027774	-	71	48.246	ENSACLG00000026286	-	60	48.246
ENSACLG00000027774	-	92	43.750	ENSACLG00000024268	-	74	43.750
ENSACLG00000027774	-	100	47.003	ENSACLG00000025562	-	72	47.003
ENSACLG00000027774	-	99	49.527	ENSACLG00000020302	-	82	49.527
ENSACLG00000027774	-	99	51.735	ENSACLG00000009011	-	66	51.735
ENSACLG00000027774	-	88	46.763	ENSACLG00000006327	-	54	46.763
ENSACLG00000027774	-	100	70.662	ENSACLG00000014537	-	67	70.662
ENSACLG00000027774	-	100	66.877	ENSACLG00000026963	-	83	66.877
ENSACLG00000027774	-	71	65.778	ENSACLG00000013521	-	56	65.778
ENSACLG00000027774	-	78	52.033	ENSACLG00000000907	-	65	52.033
ENSACLG00000027774	-	94	46.801	ENSACLG00000027738	-	92	46.801
ENSACLG00000027774	-	100	47.003	ENSACLG00000000437	-	85	47.003
ENSACLG00000027774	-	100	47.003	ENSACLG00000008024	-	85	47.003
ENSACLG00000027774	-	83	44.906	ENSACLG00000001865	-	73	44.906
ENSACLG00000027774	-	76	72.500	ENSACLG00000002725	-	65	72.500
ENSACLG00000027774	-	100	46.372	ENSACLG00000002171	-	97	46.372
ENSACLG00000027774	-	65	44.390	ENSACLG00000005259	-	63	44.390
ENSACLG00000027774	-	99	50.316	ENSACLG00000012219	-	66	50.316
ENSACLG00000027774	-	100	47.634	ENSACLG00000010664	-	57	47.634
ENSACLG00000027774	-	81	53.435	ENSACLG00000022277	-	63	53.435
ENSACLG00000027774	-	100	42.812	ENSACLG00000014661	-	68	42.812
ENSACLG00000027774	-	98	51.118	ENSACLG00000014642	-	52	51.118
ENSACLG00000027774	-	98	51.118	ENSACLG00000024568	-	74	51.118
ENSACLG00000027774	-	99	50.633	ENSACLG00000011570	-	83	50.633
ENSACLG00000027774	-	100	71.924	ENSACLG00000005711	-	98	71.924
ENSACLG00000027774	-	100	46.372	ENSACLG00000020601	-	72	46.372
ENSACLG00000027774	-	53	45.087	ENSACLG00000003644	-	53	45.087
ENSACLG00000027774	-	100	47.799	ENSACLG00000015536	-	83	47.799
ENSACLG00000027774	-	100	46.057	ENSACLG00000024184	-	72	46.057
ENSACLG00000027774	-	100	46.688	ENSACLG00000026769	-	72	46.688
ENSACLG00000027774	-	100	47.003	ENSACLG00000008572	-	72	47.003
ENSACLG00000027774	-	58	42.162	ENSACLG00000020388	-	54	41.624
ENSACLG00000027774	-	100	46.372	ENSACLG00000010080	-	72	46.372
ENSACLG00000027774	-	99	56.688	ENSACLG00000010082	-	56	56.688
ENSACLG00000027774	-	100	46.057	ENSACLG00000027135	-	91	46.057
ENSACLG00000027774	-	100	46.057	ENSACLG00000022853	-	59	46.057
ENSACLG00000027774	-	99	47.022	ENSACLG00000005921	-	61	46.688
ENSACLG00000027774	-	85	52.190	ENSACLG00000022219	-	72	52.190
ENSACLG00000027774	-	98	50.479	ENSACLG00000019417	-	88	50.479

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACLG00000027774	-	100	54.062	ENSAOCG00000004576	-	86	54.062	Amphiprion_ocellaris
ENSACLG00000027774	-	100	53.125	ENSAPEG00000024502	-	86	53.125	Amphiprion_percula
ENSACLG00000027774	-	98	40.127	ENSATEG00000004798	-	55	40.127	Anabas_testudineus
ENSACLG00000027774	-	100	52.201	ENSATEG00000015931	-	63	52.201	Anabas_testudineus
ENSACLG00000027774	-	100	51.887	ENSATEG00000014607	-	61	51.887	Anabas_testudineus
ENSACLG00000027774	-	98	40.127	ENSATEG00000019241	-	88	40.127	Anabas_testudineus
ENSACLG00000027774	-	99	52.050	ENSATEG00000004857	-	68	52.050	Anabas_testudineus
ENSACLG00000027774	-	100	52.516	ENSATEG00000002739	-	51	52.516	Anabas_testudineus
ENSACLG00000027774	-	100	52.516	ENSATEG00000015490	-	51	52.516	Anabas_testudineus
ENSACLG00000027774	-	96	40.000	ENSATEG00000014055	-	52	40.000	Anabas_testudineus
ENSACLG00000027774	-	98	37.421	ENSAMXG00000035545	-	90	37.421	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027774	-	98	37.736	ENSAMXG00000037298	-	91	37.888	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027774	-	74	38.559	ENSAMXG00000041932	-	57	38.559	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027774	-	98	38.994	ENSAMXG00000039054	-	90	38.994	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027774	-	72	54.148	ENSAMXG00000038571	-	56	54.148	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027774	-	96	39.016	ENSAMXG00000032827	-	88	39.016	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027774	-	72	37.991	ENSAMXG00000029786	-	59	37.991	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027774	-	81	55.253	ENSAMXG00000038658	-	76	55.253	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027774	-	96	39.344	ENSAMXG00000043932	-	88	39.344	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027774	-	98	38.365	ENSAMXG00000029419	-	90	38.365	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027774	-	83	38.433	ENSAMXG00000032328	-	79	38.433	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027774	-	84	39.194	ENSAMXG00000036759	-	81	39.194	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027774	-	80	39.147	ENSAMXG00000034283	-	73	39.147	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027774	-	100	45.426	ENSAMXG00000043461	-	64	45.426	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027774	-	100	44.795	ENSAMXG00000043740	-	64	44.795	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027774	-	82	39.464	ENSAMXG00000032194	-	68	39.464	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027774	-	96	39.344	ENSAMXG00000025823	-	77	39.344	Astyanax_mexicanus
ENSACLG00000027774	-	84	43.820	ENSCVAG00000013070	-	99	42.909	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000027774	-	96	54.605	ENSCVAG00000014341	-	96	54.605	Cyprinodon_variegatus
ENSACLG00000027774	-	98	53.055	ENSELUG00000018484	-	73	53.376	Esox_lucius
ENSACLG00000027774	-	100	52.997	ENSELUG00000008222	-	99	53.312	Esox_lucius
ENSACLG00000027774	-	97	48.867	ENSFHEG00000001990	-	99	48.867	Fundulus_heteroclitus
ENSACLG00000027774	-	100	45.741	ENSHBUG00000006900	-	91	45.741	Haplochromis_burtoni
ENSACLG00000027774	-	88	66.547	ENSHBUG00000010402	-	82	66.547	Haplochromis_burtoni
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