EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACLG00000027996 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astatotilapia_calliptera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2403 bases
Position: chr3:44043602-44046004
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACLP00000041590	RVT_1	PF00078.27	2.6e-47	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACLT00000042573	-	2403	-	ENSACLP00000041590	800 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACLG00000027996	-	66	50.664	ENSACLG00000006327	-	100	50.664
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ENSACLG00000027996	-	58	48.283	ENSACLG00000012447	-	99	48.283
ENSACLG00000027996	-	59	54.737	ENSACLG00000019420	-	94	54.737
ENSACLG00000027996	-	99	46.299	ENSACLG00000009850	-	88	45.970
ENSACLG00000027996	-	55	55.982	ENSACLG00000017363	-	99	55.982
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ENSACLG00000027996	-	81	30.758	ENSACLG00000006988	-	95	30.758
ENSACLG00000027996	-	62	40.845	ENSACLG00000012279	-	78	40.845
ENSACLG00000027996	-	66	49.333	ENSACLG00000018107	-	94	49.427
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ENSACLG00000027996	-	99	42.643	ENSACLG00000021051	-	92	42.643
ENSACLG00000027996	-	52	48.210	ENSACLG00000008836	-	79	48.210
ENSACLG00000027996	-	55	52.370	ENSACLG00000018346	-	98	52.370
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ENSACLG00000027996	-	56	51.893	ENSACLG00000022877	-	99	51.893
ENSACLG00000027996	-	55	55.530	ENSACLG00000013944	-	99	55.530
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ENSACLG00000027996	-	71	51.408	ENSACLG00000021814	-	99	50.973
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ENSACLG00000027996	-	87	46.121	ENSACLG00000008383	-	81	46.121
ENSACLG00000027996	-	84	49.258	ENSACLG00000005212	-	99	49.258
ENSACLG00000027996	-	60	99.371	ENSACLG00000009011	-	100	99.371
ENSACLG00000027996	-	55	54.977	ENSACLG00000020184	-	96	54.977
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ENSACLG00000027996	-	55	55.530	ENSACLG00000017093	-	99	55.530
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ENSACLG00000027996	-	65	52.772	ENSACLG00000024400	-	99	52.772
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Orthologs

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ENSACLG00000027996	-	65	57.774	ENSAPEG00000010166	-	95	57.634	Amphiprion_percula
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