EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMEG00000002078 (Gene tree)
Gene ID: 100475276
Gene Symbol: SKIV2L
Alias: 170A|DDX13|HLP|SKI2W|SKIV2|SKIV2L1
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Ailuropoda_melanoleuca
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11337 bases
Position: chrGL194271.1:46653-57989
Accession: 100475276
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMEP00000002252	rRNA_proc-arch	PF13234.6	9.1e-41	1	1
ENSAMEP00000002252	DEAD	PF00270.29	1.6e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMET00000002345	SKIV2L-201	3738	XM_002929631	ENSAMEP00000002252	1245 (aa)	XP_002929677	G1L5U1

Gene Model

Click here to download ENSAMEG00000002078's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
aml03018	RNA degradation	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAMEG00000002078's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	76	36.674	ENSAMEG00000013856	MTREX	88	36.674

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	94.783	ENSG00000204351	SKIV2L	100	94.783	Homo_sapiens
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	61.508	ENSAPOG00000008257	skiv2l	99	61.767	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	60.128	ENSACIG00000016719	skiv2l	99	59.952	Amphilophus_citrinellus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	61.190	ENSAOCG00000017352	skiv2l	99	61.384	Amphiprion_ocellaris
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	61.032	ENSAPEG00000001055	skiv2l	99	61.223	Amphiprion_percula
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	61.085	ENSATEG00000007601	skiv2l	99	60.929	Anabas_testudineus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	65.098	ENSACAG00000011746	SKIV2L	98	65.764	Anolis_carolinensis
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	95.345	ENSANAG00000037992	SKIV2L	100	95.345	Aotus_nancymaae
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	61.587	ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.464	Astatotilapia_calliptera
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	98	59.488	ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.327	Astyanax_mexicanus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	95.506	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	100	95.506	Bos_taurus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	96	39.844	WBGene00008502	skih-2	99	39.671	Caenorhabditis_elegans
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	94.783	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	94.783	Callithrix_jacchus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	97.271	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	100	97.271	Canis_familiaris
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	97.191	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	100	97.191	Canis_lupus_dingo
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	95.425	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	100	95.425	Capra_hircus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	94.543	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	100	94.543	Carlito_syrichta
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	92.536	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	100	92.536	Cavia_porcellus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	95.345	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	100	95.345	Cebus_capucinus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	94.543	ENSCATG00000036901	SKIV2L	100	94.543	Cercocebus_atys
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	93.178	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.178	Chinchilla_lanigera
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	94.623	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	100	94.623	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	87	63.919	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	96	65.232	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	94	51.100	ENSCING00000005576	-	99	50.590	Ciona_intestinalis
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	94.940	ENSCANG00000039709	SKIV2L	98	94.939	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	93.745	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	100	93.745	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	60.956	ENSCSEG00000011326	skiv2l	98	60.870	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	61.293	ENSCVAG00000003072	skiv2l	99	61.075	Cyprinodon_variegatus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	60.394	ENSDARG00000062206	skiv2l	99	60.335	Danio_rerio
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	88.649	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	100	88.942	Dasypus_novemcinctus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	93	43.697	FBgn0039117	tst	97	43.708	Drosophila_melanogaster
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	72	93.445	ENSETEG00000009522	SKIV2L	68	93.445	Echinops_telfairi
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	89	56.397	ENSEBUG00000013680	-	95	57.197	Eptatretus_burgeri
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	93	96.213	ENSEASG00005015534	SKIV2L	100	96.213	Equus_asinus_asinus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	96	95.210	ENSECAG00000021823	SKIV2L	96	95.847	Equus_caballus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	54	98.814	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	57	98.814	Erinaceus_europaeus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	60.127	ENSELUG00000000181	skiv2l	94	66.391	Esox_lucius
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	97.833	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	100	97.833	Felis_catus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	90.209	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.449	Fukomys_damarensis
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	60.032	ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.058	Fundulus_heteroclitus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	59.247	ENSGMOG00000005926	skiv2l	98	59.268	Gadus_morhua
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	77	61.331	ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.237	Gallus_gallus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	61.344	ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.298	Gambusia_affinis
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	60.238	ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.355	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	94.703	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	100	94.703	Gorilla_gorilla
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	61.429	ENSHBUG00000000726	skiv2l	99	61.303	Haplochromis_burtoni
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	90.946	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	100	91.266	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	88.462	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	100	88.782	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	98	59.642	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	59.561	Hippocampus_comes
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	59.479	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	59.583	Ictalurus_punctatus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	95.185	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	95.185	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	71	60.192	ENSLACG00000002986	-	73	59.194	Latimeria_chalumnae
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	93.900	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	93.900	Loxodonta_africana
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	94.783	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	100	94.783	Macaca_fascicularis
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	94.703	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	100	94.703	Macaca_mulatta
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	94.703	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	94.703	Macaca_nemestrina
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	94.543	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	100	94.543	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	60.873	ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.981	Mastacembelus_armatus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	61.429	ENSMZEG00005026415	skiv2l	99	61.303	Maylandia_zebra
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	70	51.153	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	97	51.153	Meleagris_gallopavo
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	92.943	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	93.189	Mesocricetus_auratus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	94.623	ENSMICG00000046331	SKIV2L	98	94.776	Microcebus_murinus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	91.820	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	98	92.170	Microtus_ochrogaster
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	60.255	ENSMMOG00000014547	skiv2l	98	59.530	Mola_mola
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	87.910	ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.910	Monodelphis_domestica
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	59.259	ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.235	Monopterus_albus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	92.943	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	100	92.943	Mus_caroli
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	93.023	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	100	93.023	Mus_musculus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	92.702	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	100	92.702	Mus_pahari
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	92.622	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	100	92.622	Mus_spretus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	97.512	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	100	97.512	Mustela_putorius_furo
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	94.703	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	100	94.703	Myotis_lucifugus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	60.734	ENSNBRG00000018650	skiv2l	98	60.806	Neolamprologus_brichardi
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	98	91.443	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	91.592	Nomascus_leucogenys
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	78	92.035	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	92.035	Notamacropus_eugenii
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	93.660	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	93.660	Ochotona_princeps
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	91.814	ENSODEG00000017516	SKIV2L	100	91.814	Octodon_degus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	62.141	ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.247	Oreochromis_niloticus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	94.944	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	100	94.944	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	61.313	ENSORLG00000002021	skiv2l	99	61.285	Oryzias_latipes
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	61.155	ENSORLG00020009462	skiv2l	99	61.138	Oryzias_latipes_hni
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	61.124	ENSORLG00015016750	skiv2l	99	61.044	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	62.113	ENSOMEG00000008531	skiv2l	99	61.847	Oryzias_melastigma
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	94.864	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	100	94.864	Otolemur_garnettii
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	89.820	ENSOARG00000002411	-	100	89.820	Ovis_aries
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	98	93.760	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	99	93.831	Pan_paniscus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	97.994	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	100	97.994	Panthera_pardus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	97.512	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	97.512	Panthera_tigris_altaica
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	94.703	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	100	94.703	Pan_troglodytes
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	98	93.350	ENSPANG00000011501	SKIV2L	99	93.420	Papio_anubis
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	60.568	ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.637	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	60.611	ENSPMGG00000019707	skiv2l	98	60.764	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	93.504	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	100	93.504	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	87.920	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	100	87.920	Phascolarctos_cinereus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	61.283	ENSPFOG00000002424	skiv2l	99	61.236	Poecilia_formosa
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	61.410	ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.365	Poecilia_latipinna
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	61.313	ENSPMEG00000006997	skiv2l	99	61.267	Poecilia_mexicana
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	59.646	ENSPREG00000002277	skiv2l	98	59.448	Poecilia_reticulata
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	94.061	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	94.061	Pongo_abelii
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	77	94.216	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	77	94.216	Procavia_capensis
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	95.746	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	100	95.746	Propithecus_coquereli
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	93.900	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	100	93.900	Pteropus_vampyrus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	59.839	ENSPNYG00000017853	skiv2l	98	60.227	Pundamilia_nyererei
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	98	60.706	ENSPNAG00000011823	skiv2l	99	60.866	Pygocentrus_nattereri
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	93.585	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	100	93.585	Rattus_norvegicus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	98	92.065	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	92.133	Rhinopithecus_bieti
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	94.543	ENSRROG00000036429	SKIV2L	100	94.543	Rhinopithecus_roxellana
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	93	37.510	YLR398C	-	93	37.302	Saccharomyces_cerevisiae
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	95.024	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	95.024	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	87.430	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.389	Sarcophilus_harrisii
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	60.945	ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.293	Scleropages_formosus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	60.654	ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.594	Scophthalmus_maximus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	61.203	ENSSDUG00000019977	skiv2l	99	61.156	Seriola_dumerili
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	60.016	ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.000	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	62.026	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	98	62.234	Sphenodon_punctatus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	94	61.590	ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.441	Stegastes_partitus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	95.586	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	95.586	Sus_scrofa
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	74	61.886	ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	54.478	Takifugu_rubripes
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	59.442	ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.435	Tetraodon_nigroviridis
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	94	93.006	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.006	Tupaia_belangeri
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	90.610	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	90.610	Tursiops_truncatus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	99.037	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	99.037	Ursus_americanus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	93	99.053	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	100	99.053	Ursus_maritimus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	97.419	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	99	97.419	Vulpes_vulpes
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	58.446	ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.637	Xenopus_tropicalis
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	61.133	ENSXCOG00000019517	skiv2l	96	61.129	Xiphophorus_couchianus
ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	60.966	ENSXMAG00000014079	skiv2l	99	60.835	Xiphophorus_maculatus