EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMEG00000002651 (Gene tree)
Gene ID: 100471660
Gene Symbol: PTRHD1
Alias: C2orf79|LOC391356
Full Name: peptidyl-tRNA hydrolase domain containing 1
Gene Type: protein_coding
Species: Ailuropoda_melanoleuca
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1695 bases
Position: chrGL192369.1:2643421-2645115
Accession: 100471660
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMEP00000002774	PTH2	PF01981.16	6.6e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMET00000002893	PTRHD1-201	420	-	ENSAMEP00000002774	140 (aa)	XP_002913839	D2GXQ1

Gene Model

Click here to download ENSAMEG00000002651's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAMEG00000002651's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	87.857	ENSG00000184924	PTRHD1	100	87.857	Homo_sapiens
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	54.331	ENSAPOG00000024433	ptrhd1	100	54.331	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	54.331	ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	54.331	Amphilophus_citrinellus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	54.331	ENSAOCG00000007632	ptrhd1	100	54.331	Amphiprion_ocellaris
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	54.331	ENSAPEG00000011491	ptrhd1	100	54.331	Amphiprion_percula
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	55.906	ENSATEG00000019199	ptrhd1	100	55.906	Anabas_testudineus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	85.714	ENSANAG00000019089	PTRHD1	100	85.714	Aotus_nancymaae
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	55.118	ENSACLG00000000814	ptrhd1	100	55.118	Astatotilapia_calliptera
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	89	57.258	ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	53.957	Astyanax_mexicanus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	82.857	ENSBTAG00000015012	PTRHD1	100	82.857	Bos_taurus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	81	44.737	WBGene00050885	Y94H6A.12	100	43.548	Caenorhabditis_elegans
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	85.714	ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	85.714	Callithrix_jacchus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	91.429	ENSCAFG00000024865	PTRHD1	100	91.429	Canis_familiaris
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	82.857	ENSCHIG00000014757	PTRHD1	100	82.857	Capra_hircus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	85.714	ENSTSYG00000009995	PTRHD1	100	85.714	Carlito_syrichta
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	82.857	ENSCPOG00000005561	PTRHD1	100	82.857	Cavia_porcellus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	85.714	ENSCCAG00000033856	PTRHD1	100	85.714	Cebus_capucinus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	87.143	ENSCATG00000033690	PTRHD1	100	87.143	Cercocebus_atys
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	85.000	ENSCLAG00000006505	PTRHD1	97	85.000	Chinchilla_lanigera
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	87.857	ENSCSAG00000008490	PTRHD1	100	87.857	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	91	75.000	ENSCHOG00000001920	PTRHD1	93	75.000	Choloepus_hoffmanni
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	91	64.062	ENSCPBG00000022276	PTRHD1	91	64.062	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	83	54.310	ENSCING00000019647	-	97	54.310	Ciona_intestinalis
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	86.429	ENSCANG00000034444	PTRHD1	100	86.429	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	83.571	ENSCGRG00001003289	Ptrhd1	66	83.571	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	83.571	ENSCGRG00000011834	Ptrhd1	100	83.571	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	55.469	ENSCSEG00000006943	ptrhd1	100	55.469	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	54.331	ENSCVAG00000016345	ptrhd1	100	54.331	Cyprinodon_variegatus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	83	58.621	ENSDARG00000016122	ptrhd1	91	58.621	Danio_rerio
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	84.286	ENSDNOG00000043646	PTRHD1	93	84.286	Dasypus_novemcinctus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	99	85.507	ENSDORG00000026776	Ptrhd1	99	84.892	Dipodomys_ordii
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	83	53.448	FBgn0038446	CG14903	97	53.448	Drosophila_melanogaster
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	91	63.780	ENSETEG00000009379	-	94	63.780	Echinops_telfairi
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	60	77.381	ENSETEG00000001615	-	100	77.381	Echinops_telfairi
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	83	61.207	ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	61.207	Eptatretus_burgeri
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	99	56.115	ENSEASG00005001302	-	99	56.115	Equus_asinus_asinus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	91	61.417	ENSECAG00000005314	-	87	61.417	Equus_caballus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	86.429	ENSECAG00000017730	PTRHD1	100	86.429	Equus_caballus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	80.000	ENSEEUG00000004263	PTRHD1	100	80.000	Erinaceus_europaeus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	54.331	ENSELUG00000003837	ptrhd1	100	54.331	Esox_lucius
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	90.714	ENSFCAG00000003648	PTRHD1	100	90.714	Felis_catus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	83.571	ENSFDAG00000004017	PTRHD1	100	83.571	Fukomys_damarensis
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	54.331	ENSFHEG00000009135	ptrhd1	100	54.331	Fundulus_heteroclitus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	83	59.483	ENSGALG00000016610	PTRHD1	82	59.483	Gallus_gallus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	55.118	ENSGAFG00000005717	ptrhd1	100	55.118	Gambusia_affinis
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	86	54.167	ENSGACG00000006743	ptrhd1	94	54.167	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	89	64.800	ENSGAGG00000023951	PTRHD1	98	64.800	Gopherus_agassizii
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	88.095	ENSGGOG00000043870	PTRHD1	100	88.095	Gorilla_gorilla
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	55.118	ENSHBUG00000014289	ptrhd1	100	55.118	Haplochromis_burtoni
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	79.286	ENSHGLG00000008203	PTRHD1	100	79.286	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	79.286	ENSHGLG00100012553	PTRHD1	100	79.286	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	91	81.102	ENSHGLG00100004341	-	93	81.102	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	53.906	ENSHCOG00000013504	ptrhd1	100	53.906	Hippocampus_comes
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	83	56.034	ENSIPUG00000004885	ptrhd1	97	56.034	Ictalurus_punctatus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	89.286	ENSSTOG00000006030	PTRHD1	100	89.286	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	92	86.047	ENSJJAG00000024180	Ptrhd1	93	86.719	Jaculus_jaculus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	81	53.982	ENSKMAG00000016961	ptrhd1	99	53.982	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	54.331	ENSLBEG00000024406	ptrhd1	100	54.331	Labrus_bergylta
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	75	59.048	ENSLACG00000018052	PTRHD1	91	56.897	Latimeria_chalumnae
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	92	54.264	ENSLOCG00000015890	ptrhd1	99	54.264	Lepisosteus_oculatus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	85.714	ENSLAFG00000014453	PTRHD1	100	85.714	Loxodonta_africana
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	86.429	ENSMFAG00000040267	PTRHD1	100	86.429	Macaca_fascicularis
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	86.429	ENSMMUG00000009598	PTRHD1	100	86.429	Macaca_mulatta
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	86.429	ENSMNEG00000035044	PTRHD1	100	86.429	Macaca_nemestrina
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	85.000	ENSMLEG00000030314	PTRHD1	100	85.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	52.756	ENSMAMG00000021201	ptrhd1	100	52.756	Mastacembelus_armatus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	55.118	ENSMZEG00005021808	ptrhd1	100	55.118	Maylandia_zebra
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	82.857	ENSMAUG00000019251	Ptrhd1	100	82.857	Mesocricetus_auratus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	86.429	ENSMICG00000001578	PTRHD1	100	86.429	Microcebus_murinus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	84.286	ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	84.286	Microtus_ochrogaster
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	83	55.172	ENSMMOG00000015284	ptrhd1	91	55.172	Mola_mola
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	89	68.939	ENSMODG00000015895	PTRHD1	97	68.939	Monodelphis_domestica
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	51.969	ENSMALG00000003471	ptrhd1	100	51.969	Monopterus_albus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	85.714	MGP_CAROLIEiJ_G0017582	Ptrhd1	100	85.714	Mus_caroli
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	85.714	ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	85.714	Mus_musculus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	85.714	MGP_SPRETEiJ_G0018426	Ptrhd1	100	85.714	Mus_spretus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	92.857	ENSMPUG00000014016	PTRHD1	100	92.857	Mustela_putorius_furo
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	82.857	ENSMLUG00000014127	PTRHD1	100	82.857	Myotis_lucifugus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	83.571	ENSNGAG00000016335	Ptrhd1	100	83.571	Nannospalax_galili
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	55.118	ENSNBRG00000009690	ptrhd1	100	55.118	Neolamprologus_brichardi
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	86.429	ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	86.429	Nomascus_leucogenys
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	55	70.130	ENSMEUG00000010482	-	93	70.130	Notamacropus_eugenii
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	79.286	ENSOPRG00000008600	PTRHD1	100	79.286	Ochotona_princeps
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	83.571	ENSODEG00000007805	PTRHD1	97	83.571	Octodon_degus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	94	54.887	ENSONIG00000015722	ptrhd1	97	54.887	Oreochromis_niloticus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	81.429	ENSOCUG00000015432	PTRHD1	100	81.429	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	83	55.556	ENSORLG00000028768	ptrhd1	98	55.556	Oryzias_latipes
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	83	56.410	ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	56.410	Oryzias_latipes_hni
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	83	55.556	ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	55.556	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	54.688	ENSOMEG00000017594	ptrhd1	100	54.688	Oryzias_melastigma
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	80.714	ENSOGAG00000000756	PTRHD1	100	80.714	Otolemur_garnettii
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	83.571	ENSOARG00000018052	PTRHD1	100	83.571	Ovis_aries
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	87.857	ENSPPAG00000035395	PTRHD1	100	87.857	Pan_paniscus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	90.714	ENSPPRG00000022961	PTRHD1	100	90.714	Panthera_pardus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	90.714	ENSPTIG00000012136	PTRHD1	100	90.714	Panthera_tigris_altaica
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	87.857	ENSPTRG00000011716	PTRHD1	100	87.857	Pan_troglodytes
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	87.143	ENSPANG00000006781	PTRHD1	100	87.143	Papio_anubis
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	83	56.897	ENSPKIG00000015207	ptrhd1	78	56.897	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	83	56.897	ENSPMGG00000020297	ptrhd1	100	55.118	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	76	59.434	ENSPMAG00000007352	ptrhd1	91	58.621	Petromyzon_marinus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	83	75.000	ENSPCIG00000025242	PTRHD1	92	75.000	Phascolarctos_cinereus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	91	55.469	ENSPFOG00000004468	ptrhd1	90	55.469	Poecilia_formosa
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	55.118	ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	55.118	Poecilia_latipinna
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	55.118	ENSPMEG00000001321	ptrhd1	100	55.118	Poecilia_mexicana
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	55.118	ENSPREG00000017624	ptrhd1	100	55.118	Poecilia_reticulata
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	85.000	ENSPPYG00000012597	PTRHD1	100	85.000	Pongo_abelii
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	82.143	ENSPCAG00000007535	PTRHD1	100	82.143	Procavia_capensis
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	83.571	ENSPCOG00000003110	PTRHD1	100	83.571	Propithecus_coquereli
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	85.000	ENSPVAG00000017514	PTRHD1	100	85.000	Pteropus_vampyrus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	55.118	ENSPNYG00000016755	ptrhd1	100	55.118	Pundamilia_nyererei
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	83	59.483	ENSPNAG00000028214	ptrhd1	91	59.483	Pygocentrus_nattereri
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	84.286	ENSRNOG00000004059	Ptrhd1	100	84.286	Rattus_norvegicus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	87.143	ENSRBIG00000032190	PTRHD1	100	87.143	Rhinopithecus_bieti
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	87.143	ENSRROG00000029627	PTRHD1	100	87.143	Rhinopithecus_roxellana
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	87.143	ENSSBOG00000031751	PTRHD1	100	87.143	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	66.197	ENSSHAG00000005774	PTRHD1	91	66.197	Sarcophilus_harrisii
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	83	56.034	ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.034	Scleropages_formosus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	83	55.172	ENSSMAG00000004450	ptrhd1	100	53.125	Scophthalmus_maximus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	91	55.469	ENSSDUG00000004610	ptrhd1	85	55.469	Seriola_dumerili
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	55.906	ENSSLDG00000006231	ptrhd1	100	55.906	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	84	67.521	ENSSPUG00000002905	PTRHD1	88	67.521	Sphenodon_punctatus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	54.331	ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	54.331	Stegastes_partitus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	89	60.000	ENSSSCG00000040441	-	94	60.000	Sus_scrofa
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	84	56.410	ENSTGUG00000015169	-	85	56.410	Taeniopygia_guttata
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	51.969	ENSTRUG00000007201	ptrhd1	100	51.969	Takifugu_rubripes
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	83	56.034	ENSTNIG00000019143	ptrhd1	91	56.034	Tetraodon_nigroviridis
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	77.143	ENSTTRG00000015128	PTRHD1	100	77.143	Tursiops_truncatus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	96.429	ENSUAMG00000007305	PTRHD1	100	96.429	Ursus_americanus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	85.000	ENSVPAG00000005556	PTRHD1	100	85.000	Vicugna_pacos
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	87	63.115	ENSXETG00000021176	ptrhd1	94	62.879	Xenopus_tropicalis
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	55.118	ENSXCOG00000019083	ptrhd1	100	55.118	Xiphophorus_couchianus
ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	55.118	ENSXMAG00000024458	ptrhd1	100	55.118	Xiphophorus_maculatus