EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMEG00000007098 (Gene tree)
Gene ID: 100473834
Gene Symbol: APOBEC1
Alias: APOBEC-1|BEDP|CDAR1|HEPR
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1
Gene Type: protein_coding
Species: Ailuropoda_melanoleuca
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3040 bases
Position: chrGL194076.1:293023-296062
Accession: 100473834
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMEP00000007480	APOBEC_N	PF08210.11	1e-27	1	1
ENSAMEP00000007480	APOBEC_C	PF05240.14	1.7e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMET00000007795	APOBEC1-201	708	XM_011237199	ENSAMEP00000007480	235 (aa)	XP_011235501	G1LKL4

Gene Model

Click here to download ENSAMEG00000007098's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAMEG00000007098's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	98	80.952	ENSG00000111701	APOBEC1	98	80.952	Homo_sapiens
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	76	40.331	ENSACAG00000028578	-	98	40.331	Anolis_carolinensis
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	98	77.922	ENSANAG00000027743	APOBEC1	93	77.922	Aotus_nancymaae
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	98	74.892	ENSBTAG00000014683	APOBEC1	98	74.892	Bos_taurus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	94	77.828	ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	77.828	Callithrix_jacchus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	99	87.124	ENSCAFG00000013901	APOBEC1	99	87.124	Canis_familiaris
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	96	87.168	ENSCAFG00020003511	APOBEC1	95	87.168	Canis_lupus_dingo
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	100	74.576	ENSCHIG00000011898	APOBEC1	98	74.576	Capra_hircus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	59	84.058	ENSTSYG00000029141	APOBEC1	98	84.058	Carlito_syrichta
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	91	69.302	ENSCAPG00000015882	-	100	69.302	Cavia_aperea
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	98	67.241	ENSCPOG00000033068	APOBEC1	98	67.241	Cavia_porcellus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	98	77.489	ENSCCAG00000022258	APOBEC1	98	77.489	Cebus_capucinus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	98	80.952	ENSCATG00000021613	APOBEC1	93	80.952	Cercocebus_atys
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	95	70.089	ENSCLAG00000014645	APOBEC1	97	70.089	Chinchilla_lanigera
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	80	82.632	ENSCSAG00000009817	APOBEC1	99	82.632	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	77	45.161	ENSCPBG00000017398	-	82	45.161	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	89	38.967	ENSCPBG00000014327	-	82	39.252	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	86	45.498	ENSCPBG00000014328	-	92	45.498	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	82	48.454	ENSCPBG00000014329	-	53	48.454	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	97	39.744	ENSCPBG00000014331	-	94	39.744	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	78	48.663	ENSCPBG00000014335	-	76	48.663	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	97	80.000	ENSCANG00000038359	APOBEC1	100	80.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	97	67.686	ENSCGRG00001011130	Apobec1	100	67.686	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	97	67.686	ENSCGRG00000008644	Apobec1	100	67.686	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	99	76.395	ENSDNOG00000010926	APOBEC1	99	76.395	Dasypus_novemcinctus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	90	66.355	ENSDORG00000023717	Apobec1	100	66.355	Dipodomys_ordii
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	97	74.783	ENSETEG00000004867	APOBEC1	97	74.783	Echinops_telfairi
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	100	83.475	ENSEASG00005015951	APOBEC1	99	83.475	Equus_asinus_asinus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	80	84.211	ENSECAG00000017163	APOBEC1	99	84.211	Equus_caballus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	91	66.820	ENSEEUG00000009112	-	96	66.820	Erinaceus_europaeus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	86	53.922	ENSEEUG00000007530	-	97	53.922	Erinaceus_europaeus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	99	85.408	ENSFCAG00000009350	APOBEC1	99	85.408	Felis_catus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	65	49.296	ENSFALG00000007257	-	73	49.296	Ficedula_albicollis
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	88	57.971	ENSFDAG00000018470	APOBEC1	99	57.971	Fukomys_damarensis
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	68	49.689	ENSGAGG00000004947	-	75	55.556	Gopherus_agassizii
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	74	47.429	ENSGAGG00000006624	-	63	47.429	Gopherus_agassizii
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	91	48.611	ENSGAGG00000011837	-	88	52.500	Gopherus_agassizii
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	89	41.509	ENSGAGG00000021744	-	83	41.509	Gopherus_agassizii
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	72	42.529	ENSGAGG00000021745	-	64	42.529	Gopherus_agassizii
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	97	63.478	ENSHGLG00000001495	APOBEC1	97	63.478	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	97	62.174	ENSHGLG00100002187	APOBEC1	97	62.174	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	91	67.757	ENSSTOG00000021971	APOBEC1	100	85.714	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	96	73.894	ENSJJAG00000022108	Apobec1	99	73.894	Jaculus_jaculus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	94	77.928	ENSLAFG00000030837	APOBEC1	99	77.928	Loxodonta_africana
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	98	80.519	ENSMFAG00000000277	APOBEC1	99	81.053	Macaca_fascicularis
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	98	80.087	ENSMNEG00000029670	APOBEC1	98	80.087	Macaca_nemestrina
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	98	80.952	ENSMLEG00000036301	APOBEC1	98	80.952	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	91	68.837	ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	68.837	Mesocricetus_auratus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	98	79.654	ENSMICG00000043645	APOBEC1	97	80.717	Microcebus_murinus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	98	67.241	ENSMODG00000018004	APOBEC1	98	67.241	Monodelphis_domestica
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	97	67.982	ENSMUSG00000040613	Apobec1	99	67.982	Mus_musculus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	97	66.228	MGP_PahariEiJ_G0022580	-	99	66.228	Mus_pahari
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	97	67.982	MGP_SPRETEiJ_G0029857	Apobec1	99	67.982	Mus_spretus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	99	84.979	ENSMPUG00000017532	APOBEC1	99	84.979	Mustela_putorius_furo
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	95	71.875	ENSNGAG00000022607	Apobec1	98	71.875	Nannospalax_galili
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	98	80.952	ENSNLEG00000005342	APOBEC1	98	80.952	Nomascus_leucogenys
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	98	66.234	ENSMEUG00000013406	APOBEC1	98	66.234	Notamacropus_eugenii
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	77	62.222	ENSOPRG00000009508	-	100	62.222	Ochotona_princeps
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	98	72.727	ENSOCUG00000025736	APOBEC1	87	72.727	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	100	80.508	ENSOGAG00000026415	APOBEC1	100	80.508	Otolemur_garnettii
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	98	74.459	ENSOARG00000002072	APOBEC1	97	74.459	Ovis_aries
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	100	75.424	ENSPPAG00000027657	APOBEC1	100	75.424	Pan_paniscus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	99	85.837	ENSPPRG00000012182	APOBEC1	99	85.837	Panthera_pardus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	99	85.837	ENSPTIG00000020280	APOBEC1	99	85.837	Panthera_tigris_altaica
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	98	81.385	ENSPTRG00000004614	APOBEC1	98	81.385	Pan_troglodytes
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	98	80.952	ENSPANG00000021027	APOBEC1	98	80.952	Papio_anubis
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	57	53.636	ENSPSIG00000012791	-	75	53.636	Pelodiscus_sinensis
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	95	42.920	ENSPSIG00000012568	-	95	42.920	Pelodiscus_sinensis
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	97	68.996	ENSPEMG00000023841	Apobec1	100	68.996	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	98	69.264	ENSPCIG00000023973	APOBEC1	98	69.264	Phascolarctos_cinereus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	98	79.654	ENSPPYG00000004228	APOBEC1	93	79.654	Pongo_abelii
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	79	74.332	ENSPCAG00000008733	APOBEC1	100	74.332	Procavia_capensis
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	95	81.333	ENSPCOG00000013957	APOBEC1	99	81.333	Propithecus_coquereli
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	98	64.348	ENSPVAG00000010709	APOBEC1	98	64.348	Pteropus_vampyrus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	97	66.667	ENSRNOG00000015411	Apobec1	99	66.667	Rattus_norvegicus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	98	80.519	ENSRBIG00000031161	APOBEC1	98	80.519	Rhinopithecus_bieti
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	98	80.519	ENSRROG00000033576	APOBEC1	99	81.053	Rhinopithecus_roxellana
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	74	76.136	ENSSBOG00000030587	APOBEC1	99	76.136	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	96	69.163	ENSSHAG00000008925	APOBEC1	99	69.163	Sarcophilus_harrisii
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	73	67.442	ENSSARG00000000032	-	100	67.442	Sorex_araneus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	56	72.727	ENSSARG00000011972	-	100	72.727	Sorex_araneus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	90	41.743	ENSSPUG00000009044	-	83	41.743	Sphenodon_punctatus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	98	81.385	ENSSSCG00000000668	APOBEC1	98	81.385	Sus_scrofa
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	61	50.694	ENSTGUG00000013118	-	99	50.694	Taeniopygia_guttata
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	94	76.471	ENSTBEG00000010043	APOBEC1	94	76.471	Tupaia_belangeri
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	77	74.176	ENSTTRG00000014015	APOBEC1	97	74.176	Tursiops_truncatus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	100	97.458	ENSUAMG00000011636	APOBEC1	97	97.458	Ursus_americanus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	100	97.458	ENSUMAG00000016552	APOBEC1	97	97.458	Ursus_maritimus
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	98	76.623	ENSVPAG00000001343	APOBEC1	98	76.623	Vicugna_pacos
ENSAMEG00000007098	APOBEC1	99	87.983	ENSVVUG00000010522	APOBEC1	99	87.983	Vulpes_vulpes