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Description

Ensembl ID: ENSAMEG00000007147 (Gene tree)
Gene ID: 100483263
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Ailuropoda_melanoleuca
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 46754 bases
Position: chrGL192823.1:380425-427178
Accession: 6401
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMEP00000007548	IBN_N	PF03810.19	4.2e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMET00000007866	TNPO1-201	2721	-	ENSAMEP00000007548	906 (aa)	-	G1LKS9

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	82.210	ENSAMEG00000012123	TNPO2	99	82.099

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	99.109	ENSG00000083312	TNPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.984	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	92.873	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	86	91.944	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	91.049	Amphilophus_citrinellus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	93.096	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	92.984	Amphiprion_ocellaris
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	93.096	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	92.984	Amphiprion_percula
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.650	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	92.539	Anabas_testudineus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	98	91.844	ENSAPLG00000009619	-	97	92.711	Anas_platyrhynchos
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	95.880	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	95.880	Anolis_carolinensis
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.559	ENSANAG00000022453	-	99	98.559	Aotus_nancymaae
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	63.806	ENSANAG00000027118	-	99	62.979	Aotus_nancymaae
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	87.902	ENSANAG00000025351	-	99	87.791	Aotus_nancymaae
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	90.757	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	89.978	Astatotilapia_calliptera
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	91.889	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	91.444	Astyanax_mexicanus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	100	98.344	ENSBTAG00000007979	TNPO1	100	98.344	Bos_taurus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.670	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	98.670	Callithrix_jacchus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	95	99.305	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.305	Canis_familiaris
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	95.991	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	95.991	Canis_lupus_dingo
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.670	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	98.670	Capra_hircus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	94.849	ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.118	Carlito_syrichta
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.664	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	98.664	Cebus_capucinus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	99.109	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	99.109	Cercocebus_atys
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.664	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	98.664	Chinchilla_lanigera
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.891	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	98.891	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	94	86.134	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	85.194	Choloepus_hoffmanni
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	96.885	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	96.885	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	74.750	ENSCSAVG00000010981	-	99	74.638	Ciona_savignyi
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	99.002	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	99.002	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.670	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	98.670	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMEG00000007147	TNPO1	95	98.725	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	98.725	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	91.425	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	91.314	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.428	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	92.316	Cyprinodon_variegatus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	91.769	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	91.324	Danio_rerio
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	93.016	ENSDNOG00000006647	TNPO1	100	93.016	Dasypus_novemcinctus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	92	98.807	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	98.805	Dipodomys_ordii
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	57.271	FBgn0035693	CG8219	99	56.711	Drosophila_melanogaster
ENSAMEG00000007147	TNPO1	86	99.625	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	99.625	Echinops_telfairi
ENSAMEG00000007147	TNPO1	94	84.316	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.316	Eptatretus_burgeri
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	99.109	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	99.109	Equus_asinus_asinus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.780	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	98.780	Equus_caballus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	85.745	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	85.205	Esox_lucius
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	99.109	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	99.109	Felis_catus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	96.548	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	96.548	Ficedula_albicollis
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.670	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	98.670	Fukomys_damarensis
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.770	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	92.659	Fundulus_heteroclitus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	89.183	ENSGMOG00000000347	tnpo1	100	89.073	Gadus_morhua
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	95.880	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	95.880	Gallus_gallus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	91.556	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	91.444	Gambusia_affinis
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.018	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	91.907	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	96.659	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	96.659	Gopherus_agassizii
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	82.503	ENSGGOG00000022535	-	99	82.392	Gorilla_gorilla
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	99.109	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	99.109	Gorilla_gorilla
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.316	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	92.205	Haplochromis_burtoni
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.446	ENSHGLG00000000970	-	99	98.446	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMEG00000007147	TNPO1	95	98.264	ENSHGLG00100017090	-	99	98.264	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	74.807	ENSHGLG00100000963	-	99	73.370	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMEG00000007147	TNPO1	100	98.786	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	98	98.786	Jaculus_jaculus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.762	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	92.650	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	90	89.255	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	87.912	Labrus_bergylta
ENSAMEG00000007147	TNPO1	95	88.364	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	88.249	Latimeria_chalumnae
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	94.568	ENSLOCG00000011092	tnpo1	98	94.457	Lepisosteus_oculatus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	96	98.284	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.284	Loxodonta_africana
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	99.002	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	99.002	Macaca_fascicularis
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	99.001	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	99.001	Macaca_mulatta
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	99.002	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	99.002	Macaca_nemestrina
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	99.002	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	99.002	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.650	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	92.539	Mastacembelus_armatus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.094	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	91.314	Maylandia_zebra
ENSAMEG00000007147	TNPO1	100	98.344	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	95.006	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.006	Microcebus_murinus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	100	98.675	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	98.675	Microtus_ochrogaster
ENSAMEG00000007147	TNPO1	86	90.944	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	90.306	Mola_mola
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	97.458	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.458	Monodelphis_domestica
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	91.537	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	91.425	Monopterus_albus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.552	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	100.000	Mus_caroli
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.775	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	100.000	Mus_musculus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.559	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	Mus_pahari
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.448	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	100.000	Mus_spretus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.891	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	98.891	Mustela_putorius_furo
ENSAMEG00000007147	TNPO1	95	99.305	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.305	Myotis_lucifugus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.779	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	98.779	Nannospalax_galili
ENSAMEG00000007147	TNPO1	86	91.816	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	90.921	Neolamprologus_brichardi
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	99.109	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	99.109	Nomascus_leucogenys
ENSAMEG00000007147	TNPO1	90	92.879	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	92.698	Ochotona_princeps
ENSAMEG00000007147	TNPO1	100	98.124	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	98.337	Octodon_degus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	100	90.899	ENSONIG00000011151	tnpo1	100	90.132	Oreochromis_niloticus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	91	96.981	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	96.981	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	95	92.361	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.245	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	86	91.784	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	90.886	Oryzias_latipes
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.179	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	91.397	Oryzias_latipes_hni
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.291	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	92.179	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.179	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.067	Oryzias_melastigma
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.891	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	98.891	Otolemur_garnettii
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.780	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	98.780	Ovis_aries
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	99.002	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	99.002	Pan_paniscus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	99.109	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	99.109	Panthera_pardus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	99.109	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	99.109	Panthera_tigris_altaica
ENSAMEG00000007147	TNPO1	93	86.066	ENSPTRG00000047731	-	100	85.929	Pan_troglodytes
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	99.002	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	99.002	Pan_troglodytes
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	99.002	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	99.002	Papio_anubis
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	89.755	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	89.644	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	96.552	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	96.552	Pelodiscus_sinensis
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	89.655	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	88.988	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	95	98.725	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	98.725	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	97.439	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	97.439	Phascolarctos_cinereus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.342	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	92.231	Poecilia_formosa
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.342	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	92.231	Poecilia_latipinna
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.539	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	92.428	Poecilia_mexicana
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.444	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	92.333	Poecilia_reticulata
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.891	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	98.891	Pongo_abelii
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.891	ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	98.891	Propithecus_coquereli
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.670	ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	98.670	Pteropus_vampyrus
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.102	ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	91.991	Pundamilia_nyererei
ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	91.343	ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	91.667	Pygocentrus_nattereri
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ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.214	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.102	Xiphophorus_maculatus