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Description

Ensembl ID: ENSAMEG00000012325 (Gene tree)
Gene ID: 100471512
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: BAF190|BRM|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Ailuropoda_melanoleuca
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 153998 bases
Position: chrGL192649.1:1495877-1649874
Accession: 11098
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMEP00000013109	ResIII	PF04851.15	1.2e-08	1	1
ENSAMEP00000013145	ResIII	PF04851.15	1.4e-08	1	1
ENSAMEP00000013109	BRK	PF07533.16	1.4e-17	1	1
ENSAMEP00000013145	BRK	PF07533.16	1.7e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMET00000013658	SMARCA2-201	3834	-	ENSAMEP00000013109	1278 (aa)	-	G1M198
ENSAMET00000013695	SMARCA2-202	4404	-	ENSAMEP00000013145	1468 (aa)	-	G1M1D4

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
aml04714	Thermogenesis	KEGG
aml05225	Hepatocellular carcinoma	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	98	77.894	ENSAMEG00000010868	SMARCA4	89	72.288

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	99.218	ENSG00000080503	SMARCA2	99	100.000	Homo_sapiens
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	85.379	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	76.939	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	84.305	ENSACIG00000015607	SMARCA2	88	76.292	Amphilophus_citrinellus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	85.379	ENSAOCG00000009647	-	88	77.364	Amphiprion_ocellaris
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	85.379	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	96	76.788	Amphiprion_percula
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	98	86.545	ENSATEG00000006916	SMARCA2	88	77.510	Anabas_testudineus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	85.947	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	85.977	Anas_platyrhynchos
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	93.432	ENSACAG00000002423	SMARCA2	90	85.424	Anolis_carolinensis
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	99.374	ENSANAG00000026498	SMARCA2	99	88.303	Aotus_nancymaae
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	85.994	ENSACLG00000004248	SMARCA2	81	85.524	Astatotilapia_calliptera
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	87.038	ENSAMXG00000012404	smarca2	89	78.754	Astyanax_mexicanus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	97.966	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	90	89.864	Bos_taurus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	99.296	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	89.613	Callithrix_jacchus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	99.687	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	81	99.687	Canis_familiaris
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	96	93.360	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	98	93.360	Canis_lupus_dingo
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	99.296	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	81	99.296	Capra_hircus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	99.452	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	91	89.046	Carlito_syrichta
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	95.422	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	91	84.973	Cavia_aperea
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	99.134	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	80	99.134	Cavia_porcellus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	99.296	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	98	88.950	Cebus_capucinus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	99.452	ENSCATG00000031470	SMARCA2	99	89.117	Cercocebus_atys
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	99.135	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	90	88.247	Chinchilla_lanigera
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	92	97.959	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	96	89.136	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	84	98.889	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	68	98.889	Choloepus_hoffmanni
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	95.465	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	86	95.465	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	99.374	ENSCANG00000039597	SMARCA2	98	90.418	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	97	94.306	ENSCGRG00001002323	Smarca2	80	94.306	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	98	81.529	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	88	72.690	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	79	86.346	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	95	75.350	Cyprinodon_variegatus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	86.980	ENSDARG00000008904	smarca2	80	86.854	Danio_rerio
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	97.731	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	90	90.102	Dasypus_novemcinctus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	99.296	ENSDORG00000014832	Smarca2	80	99.296	Dipodomys_ordii
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	96	59.123	FBgn0000212	brm	70	62.855	Drosophila_melanogaster
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	94	76.344	ENSEBUG00000011442	-	90	68.680	Eptatretus_burgeri
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	95	66.156	ENSEBUG00000002449	-	83	67.766	Eptatretus_burgeri
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	98.200	ENSEASG00005010312	SMARCA2	90	90.211	Equus_asinus_asinus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	81	85.000	ENSEEUG00000015540	-	62	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	94	86.462	ENSELUG00000010318	smarca2	95	76.763	Esox_lucius
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	99.609	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	81	99.609	Felis_catus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	95.856	ENSFALG00000010416	SMARCA2	86	95.856	Ficedula_albicollis
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	98.980	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	80	98.980	Fukomys_damarensis
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	86.083	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	89	77.572	Fundulus_heteroclitus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	98	83.466	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	80	83.307	Gadus_morhua
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	95.622	ENSGALG00000010164	SMARCA2	81	95.622	Gallus_gallus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	86	96.667	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	71	96.667	Gambusia_affinis
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	98	84.261	ENSGACG00000014488	SMARCA2	89	74.966	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	95.465	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	90	86.748	Gopherus_agassizii
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	97.414	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	90	91.443	Gorilla_gorilla
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	85.994	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	88	77.076	Haplochromis_burtoni
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	99.290	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	80	99.290	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	99.296	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	82	99.296	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	91	83.877	ENSHCOG00000015348	-	88	83.301	Hippocampus_comes
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	98	86.741	ENSIPUG00000011060	smarca2	94	77.518	Ictalurus_punctatus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	99.296	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	80	99.296	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	99.132	ENSJJAG00000010867	Smarca2	90	88.283	Jaculus_jaculus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	85.301	ENSKMAG00000015844	-	88	76.671	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	53	72.354	ENSLACG00000000270	SMARCA2	99	73.877	Latimeria_chalumnae
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	89.445	ENSLOCG00000011499	smarca2	80	89.054	Lepisosteus_oculatus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	97.263	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	90	88.829	Loxodonta_africana
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	99.452	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	99	89.196	Macaca_fascicularis
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	99.452	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	94	90.000	Macaca_mulatta
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	99.452	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	99	90.068	Macaca_nemestrina
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	99.451	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	83	99.451	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	86.317	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	77.331	Mastacembelus_armatus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	85.915	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	88	77.388	Maylandia_zebra
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	85	74.395	ENSMGAG00000005160	-	100	73.121	Meleagris_gallopavo
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	99.218	ENSMICG00000005162	SMARCA2	99	89.372	Microcebus_murinus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	98.905	ENSMOCG00000001611	Smarca2	80	98.905	Microtus_ochrogaster
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	98	83.187	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	90	74.829	Mola_mola
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	96.479	ENSMODG00000003578	SMARCA2	90	88.100	Monodelphis_domestica
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	98	84.861	ENSMALG00000009611	SMARCA2	88	76.602	Monopterus_albus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	98.670	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	94	89.182	Mus_caroli
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	98.592	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	99.441	Mus_musculus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	98.513	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	94	88.595	Mus_pahari
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	98.513	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	89	100.000	Mus_spretus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	99.609	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	94	99.609	Mustela_putorius_furo
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	93.176	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	91	85.061	Myotis_lucifugus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	98.121	ENSNGAG00000000108	Smarca2	81	98.121	Nannospalax_galili
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	70.634	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	83.085	Neolamprologus_brichardi
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	98.748	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	98	88.966	Nomascus_leucogenys
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	87.480	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	90	81.965	Notamacropus_eugenii
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	92.645	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	80	92.645	Ochotona_princeps
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	98.976	ENSODEG00000005452	SMARCA2	90	88.361	Octodon_degus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	98	86.953	ENSONIG00000014163	SMARCA2	88	77.512	Oreochromis_niloticus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	61	94.352	ENSOANG00000008299	-	95	98.113	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	98.200	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	90	89.646	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	85.223	ENSORLG00000020820	SMARCA2	99	74.897	Oryzias_latipes
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	85.301	ENSORLG00015006289	SMARCA2	97	86.239	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	98	86.067	ENSOMEG00000009736	-	91	76.548	Oryzias_melastigma
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	97.806	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	91	89.202	Otolemur_garnettii
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	97.576	ENSOARG00000013265	SMARCA2	90	89.295	Ovis_aries
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	99.368	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	99	89.317	Pan_paniscus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	99.609	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	81	99.609	Panthera_pardus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	99.374	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	98	90.473	Pan_troglodytes
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	92.656	ENSPANG00000025121	SMARCA2	90	83.636	Papio_anubis
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	87.480	ENSPKIG00000018469	-	82	87.031	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	95.391	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	90	86.302	Pelodiscus_sinensis
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	98	79.524	ENSPMGG00000013696	-	90	73.255	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	98.279	ENSPEMG00000019821	Smarca2	80	98.279	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	55	81.346	ENSPMAG00000001030	-	100	81.119	Petromyzon_marinus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	93	78.583	ENSPMAG00000005337	-	90	70.652	Petromyzon_marinus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	96.401	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	82	96.401	Phascolarctos_cinereus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	85.066	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	88	77.235	Poecilia_formosa
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	98	85.669	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	86	77.045	Poecilia_latipinna
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	98	85.669	ENSPMEG00000001815	-	88	77.235	Poecilia_mexicana
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	85.301	ENSPREG00000013800	SMARCA2	90	77.113	Poecilia_reticulata
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	97.574	ENSPPYG00000019258	SMARCA2	90	89.211	Pongo_abelii
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	73	85.350	ENSPCAG00000016969	SMARCA2	67	78.792	Procavia_capensis
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	96.560	ENSPCOG00000025709	SMARCA2	99	88.138	Propithecus_coquereli
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	94	99.507	ENSPVAG00000000901	SMARCA2	80	99.507	Pteropus_vampyrus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	82.473	ENSPNYG00000004533	SMARCA2	88	73.868	Pundamilia_nyererei
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	98	88.259	ENSPNAG00000014635	smarca2	88	79.198	Pygocentrus_nattereri
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	98.748	ENSRNOG00000011931	Smarca2	95	88.371	Rattus_norvegicus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	98.513	ENSRBIG00000038618	SMARCA2	94	98.044	Rhinopithecus_bieti
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	98.513	ENSRROG00000019271	SMARCA2	99	90.205	Rhinopithecus_roxellana
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	99.296	ENSSBOG00000034827	SMARCA2	83	98.279	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	96.166	ENSSHAG00000007884	SMARCA2	91	86.916	Sarcophilus_harrisii
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ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	84.514	ENSSMAG00000013707	SMARCA2	80	84.280	Scophthalmus_maximus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	85.614	ENSSDUG00000008852	-	89	75.638	Seriola_dumerili
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	98	84.395	ENSSLDG00000025449	SMARCA2	88	74.625	Seriola_lalandi_dorsalis
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ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	99.452	ENSSSCG00000005232	SMARCA2	81	99.452	Sus_scrofa
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	95.700	ENSTGUG00000005460	SMARCA2	80	95.700	Taeniopygia_guttata
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	98	85.760	ENSTRUG00000015619	SMARCA2	88	76.204	Takifugu_rubripes
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	70	100.000	ENSTBEG00000008767	SMARCA2	70	100.000	Tupaia_belangeri
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	95.227	ENSTTRG00000002033	SMARCA2	90	88.381	Tursiops_truncatus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	91.804	ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	91.730	Ursus_americanus
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ENSAMEG00000012325	SMARCA2	95	94.253	ENSVVUG00000004598	SMARCA2	99	94.253	Vulpes_vulpes
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	87.956	ENSXETG00000015299	smarca2	91	78.378	Xenopus_tropicalis
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	75.907	ENSXCOG00000011073	SMARCA2	97	75.792	Xiphophorus_couchianus
ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	85.223	ENSXMAG00000015611	SMARCA2	90	77.684	Xiphophorus_maculatus