EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMEG00000014506 (Gene tree)
Gene ID: 100482632
Gene Symbol: SRRT
Alias: ARS2|Asr2|serrate
Full Name: serrate%2C RNA effector molecule
Gene Type: protein_coding
Species: Ailuropoda_melanoleuca
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11866 bases
Position: chrGL193583.1:72182-84047
Accession: 24101
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMEP00000015309	ARS2	PF04959.13	4.5e-92	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMET00000015947	SRRT-201	2682	-	ENSAMEP00000015309	893 (aa)	-	G1M7I9

Gene Model

Click here to download ENSAMEG00000014506's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAMEG00000014506's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.778	ENSG00000087087	SRRT	99	100.000	Homo_sapiens
ENSAMEG00000014506	SRRT	51	77.143	ENSAPOG00000002304	srrt	96	65.859	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMEG00000014506	SRRT	76	76.923	ENSACIG00000015795	srrt	85	76.923	Amphilophus_citrinellus
ENSAMEG00000014506	SRRT	92	54.211	ENSAOCG00000009189	-	94	56.221	Amphiprion_ocellaris
ENSAMEG00000014506	SRRT	81	77.363	ENSAOCG00000009693	srrt	96	65.975	Amphiprion_ocellaris
ENSAMEG00000014506	SRRT	81	76.923	ENSAPEG00000003646	srrt	85	76.923	Amphiprion_percula
ENSAMEG00000014506	SRRT	92	54.211	ENSAPEG00000020016	-	94	56.221	Amphiprion_percula
ENSAMEG00000014506	SRRT	81	74.725	ENSATEG00000014425	srrt	96	64.781	Anabas_testudineus
ENSAMEG00000014506	SRRT	53	62.295	ENSATEG00000003652	-	85	65.032	Anabas_testudineus
ENSAMEG00000014506	SRRT	95	75.704	ENSACAG00000001014	SRRT	96	75.949	Anolis_carolinensis
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	93.805	ENSANAG00000031718	SRRT	100	93.805	Aotus_nancymaae
ENSAMEG00000014506	SRRT	53	61.777	ENSACLG00000009423	-	94	54.717	Astatotilapia_calliptera
ENSAMEG00000014506	SRRT	51	75.604	ENSACLG00000013156	srrt	92	64.781	Astatotilapia_calliptera
ENSAMEG00000014506	SRRT	50	77.111	ENSAMXG00000016671	srrt	93	64.937	Astyanax_mexicanus
ENSAMEG00000014506	SRRT	98	93.213	ENSBTAG00000001134	SRRT	98	92.421	Bos_taurus
ENSAMEG00000014506	SRRT	54	47.656	WBGene00017085	E01A2.2	80	47.500	Caenorhabditis_elegans
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	93.584	ENSCJAG00000014917	SRRT	100	93.584	Callithrix_jacchus
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.801	ENSCAFG00000023538	SRRT	100	94.801	Canis_familiaris
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	95.333	ENSCAFG00020013358	SRRT	100	95.333	Canis_lupus_dingo
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	93.363	ENSCHIG00000010495	SRRT	100	93.363	Capra_hircus
ENSAMEG00000014506	SRRT	95	90.909	ENSTSYG00000036426	SRRT	99	89.510	Carlito_syrichta
ENSAMEG00000014506	SRRT	95	94.805	ENSCAPG00000013586	SRRT	100	94.805	Cavia_aperea
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	93.702	ENSCPOG00000001739	SRRT	100	93.702	Cavia_porcellus
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.027	ENSCCAG00000015877	SRRT	100	94.027	Cebus_capucinus
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.444	ENSCATG00000036306	SRRT	100	94.444	Cercocebus_atys
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	93.916	ENSCLAG00000007568	SRRT	100	93.916	Chinchilla_lanigera
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.137	ENSCSAG00000017996	SRRT	100	94.137	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMEG00000014506	SRRT	55	95.294	ENSCHOG00000007815	SRRT	67	95.294	Choloepus_hoffmanni
ENSAMEG00000014506	SRRT	72	82.443	ENSCPBG00000011553	SRRT	83	80.882	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	40.943	ENSCING00000003506	-	54	51.674	Ciona_intestinalis
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	39.850	ENSCSAVG00000008394	-	79	55.172	Ciona_savignyi
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.556	ENSCANG00000034556	SRRT	100	94.556	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMEG00000014506	SRRT	51	96.368	ENSCGRG00001001594	Srrt	98	90.068	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMEG00000014506	SRRT	90	95.957	ENSCGRG00000007292	Srrt	90	91.915	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMEG00000014506	SRRT	74	61.474	ENSCSEG00000005233	-	54	63.793	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMEG00000014506	SRRT	96	58.409	ENSCSEG00000017878	srrt	96	60.550	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMEG00000014506	SRRT	95	63.967	ENSCVAG00000019848	srrt	96	64.538	Cyprinodon_variegatus
ENSAMEG00000014506	SRRT	51	77.851	ENSDARG00000017762	srrt	96	66.967	Danio_rerio
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	93.916	ENSDNOG00000003851	SRRT	100	93.916	Dasypus_novemcinctus
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	93.556	ENSDORG00000005584	Srrt	100	93.556	Dipodomys_ordii
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	40.202	FBgn0033062	Ars2	67	53.632	Drosophila_melanogaster
ENSAMEG00000014506	SRRT	87	88.870	ENSETEG00000016175	SRRT	82	91.558	Echinops_telfairi
ENSAMEG00000014506	SRRT	60	63.043	ENSEBUG00000008517	-	76	65.278	Eptatretus_burgeri
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.690	ENSEASG00005016956	SRRT	100	94.690	Equus_asinus_asinus
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.801	ENSECAG00000012292	SRRT	100	94.801	Equus_caballus
ENSAMEG00000014506	SRRT	85	94.161	ENSEEUG00000009117	SRRT	85	94.161	Erinaceus_europaeus
ENSAMEG00000014506	SRRT	51	64.407	ENSELUG00000021216	-	53	65.254	Esox_lucius
ENSAMEG00000014506	SRRT	95	66.363	ENSELUG00000006651	srrt	96	65.385	Esox_lucius
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	95.022	ENSFCAG00000006855	SRRT	100	95.022	Felis_catus
ENSAMEG00000014506	SRRT	52	92.391	ENSFDAG00000021347	SRRT	98	90.607	Fukomys_damarensis
ENSAMEG00000014506	SRRT	71	76.225	ENSFHEG00000002756	srrt	86	76.225	Fundulus_heteroclitus
ENSAMEG00000014506	SRRT	53	56.108	ENSFHEG00000004105	-	93	57.112	Fundulus_heteroclitus
ENSAMEG00000014506	SRRT	95	61.156	ENSGMOG00000018619	srrt	51	71.616	Gadus_morhua
ENSAMEG00000014506	SRRT	58	56.814	ENSGMOG00000018694	-	98	53.652	Gadus_morhua
ENSAMEG00000014506	SRRT	51	61.255	ENSGAFG00000020383	-	54	61.688	Gambusia_affinis
ENSAMEG00000014506	SRRT	51	76.044	ENSGAFG00000005423	srrt	96	64.327	Gambusia_affinis
ENSAMEG00000014506	SRRT	92	52.195	ENSGACG00000001100	-	53	62.232	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMEG00000014506	SRRT	95	63.940	ENSGACG00000020387	srrt	51	75.764	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.248	ENSGGOG00000001508	SRRT	99	94.248	Gorilla_gorilla
ENSAMEG00000014506	SRRT	51	75.824	ENSHBUG00000002942	srrt	92	64.896	Haplochromis_burtoni
ENSAMEG00000014506	SRRT	98	93.228	ENSHGLG00000008344	Srrt	98	92.212	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.000	ENSHGLG00100018857	Srrt	100	94.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMEG00000014506	SRRT	92	50.845	ENSHCOG00000008904	-	82	61.472	Hippocampus_comes
ENSAMEG00000014506	SRRT	98	63.636	ENSHCOG00000005403	srrt	96	62.950	Hippocampus_comes
ENSAMEG00000014506	SRRT	51	77.899	ENSIPUG00000021150	srrt	96	66.974	Ictalurus_punctatus
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.556	ENSSTOG00000013776	SRRT	100	94.556	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.177	ENSJJAG00000010446	Srrt	100	94.177	Jaculus_jaculus
ENSAMEG00000014506	SRRT	95	63.263	ENSKMAG00000013599	srrt	96	63.940	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMEG00000014506	SRRT	53	61.647	ENSKMAG00000008468	-	94	52.982	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMEG00000014506	SRRT	82	74.837	ENSLBEG00000016308	srrt	81	76.573	Labrus_bergylta
ENSAMEG00000014506	SRRT	95	63.158	ENSLACG00000001089	SRRT	96	62.301	Latimeria_chalumnae
ENSAMEG00000014506	SRRT	64	83.912	ENSLOCG00000013658	srrt	76	85.489	Lepisosteus_oculatus
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	93.916	ENSLAFG00000007725	SRRT	100	93.916	Loxodonta_africana
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.667	ENSMFAG00000033745	SRRT	100	94.667	Macaca_fascicularis
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.137	ENSMMUG00000021255	SRRT	100	94.137	Macaca_mulatta
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.137	ENSMNEG00000041864	SRRT	100	94.137	Macaca_nemestrina
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.667	ENSMLEG00000029479	SRRT	100	94.667	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMEG00000014506	SRRT	92	53.828	ENSMAMG00000010681	-	94	56.440	Mastacembelus_armatus
ENSAMEG00000014506	SRRT	51	74.670	ENSMAMG00000014311	srrt	96	65.935	Mastacembelus_armatus
ENSAMEG00000014506	SRRT	51	75.604	ENSMZEG00005016135	srrt	92	64.781	Maylandia_zebra
ENSAMEG00000014506	SRRT	53	61.777	ENSMZEG00005028002	-	96	55.156	Maylandia_zebra
ENSAMEG00000014506	SRRT	51	96.368	ENSMAUG00000011386	Srrt	98	90.611	Mesocricetus_auratus
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.137	ENSMICG00000009471	SRRT	100	94.137	Microcebus_murinus
ENSAMEG00000014506	SRRT	98	92.195	ENSMOCG00000001971	Srrt	98	90.045	Microtus_ochrogaster
ENSAMEG00000014506	SRRT	95	64.261	ENSMMOG00000016399	srrt	54	76.044	Mola_mola
ENSAMEG00000014506	SRRT	87	52.261	ENSMMOG00000011137	-	55	65.727	Mola_mola
ENSAMEG00000014506	SRRT	51	88.795	ENSMODG00000004862	SRRT	90	90.506	Monodelphis_domestica
ENSAMEG00000014506	SRRT	54	52.282	ENSMALG00000005567	-	84	53.524	Monopterus_albus
ENSAMEG00000014506	SRRT	90	61.899	ENSMALG00000018604	srrt	80	72.247	Monopterus_albus
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.065	MGP_CAROLIEiJ_G0027870	Srrt	100	97.015	Mus_caroli
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.065	ENSMUSG00000037364	Srrt	99	97.015	Mus_musculus
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	93.841	MGP_PahariEiJ_G0024456	Srrt	100	96.642	Mus_pahari
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.065	MGP_SPRETEiJ_G0028875	Srrt	100	97.015	Mus_spretus
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.912	ENSMPUG00000015839	SRRT	100	94.912	Mustela_putorius_furo
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	93.916	ENSMLUG00000009975	SRRT	100	93.916	Myotis_lucifugus
ENSAMEG00000014506	SRRT	52	96.391	ENSNGAG00000023715	Srrt	100	90.413	Nannospalax_galili
ENSAMEG00000014506	SRRT	51	74.670	ENSNBRG00000019100	srrt	96	63.837	Neolamprologus_brichardi
ENSAMEG00000014506	SRRT	94	84.588	ENSNLEG00000011987	SRRT	99	84.542	Nomascus_leucogenys
ENSAMEG00000014506	SRRT	98	72.573	ENSMEUG00000011941	SRRT	98	71.995	Notamacropus_eugenii
ENSAMEG00000014506	SRRT	60	100.000	ENSOPRG00000002502	-	67	100.000	Ochotona_princeps
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.961	ENSODEG00000016856	SRRT	100	94.961	Octodon_degus
ENSAMEG00000014506	SRRT	51	76.044	ENSONIG00000004242	srrt	96	65.482	Oreochromis_niloticus
ENSAMEG00000014506	SRRT	53	62.834	ENSONIG00000016080	-	52	64.301	Oreochromis_niloticus
ENSAMEG00000014506	SRRT	96	64.335	ENSORLG00000008120	srrt	52	75.385	Oryzias_latipes
ENSAMEG00000014506	SRRT	96	65.132	ENSORLG00020003058	srrt	96	63.200	Oryzias_latipes_hni
ENSAMEG00000014506	SRRT	96	65.178	ENSORLG00015008062	srrt	96	63.543	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMEG00000014506	SRRT	96	65.517	ENSOMEG00000003155	srrt	85	75.604	Oryzias_melastigma
ENSAMEG00000014506	SRRT	92	55.276	ENSOMEG00000006963	-	95	55.413	Oryzias_melastigma
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.358	ENSOGAG00000017242	SRRT	100	94.358	Otolemur_garnettii
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	93.889	ENSOARG00000015645	SRRT	100	93.889	Ovis_aries
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.667	ENSPPAG00000041090	SRRT	100	94.667	Pan_paniscus
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	95.000	ENSPPRG00000009557	SRRT	100	95.000	Panthera_pardus
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.912	ENSPTIG00000014355	SRRT	100	94.912	Panthera_tigris_altaica
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.667	ENSPTRG00000019511	SRRT	100	94.667	Pan_troglodytes
ENSAMEG00000014506	SRRT	95	93.533	ENSPANG00000020763	SRRT	97	92.379	Papio_anubis
ENSAMEG00000014506	SRRT	51	77.143	ENSPKIG00000022212	-	96	65.557	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMEG00000014506	SRRT	96	66.820	ENSPKIG00000005434	srrt	96	68.621	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMEG00000014506	SRRT	95	78.706	ENSPSIG00000016311	SRRT	96	78.306	Pelodiscus_sinensis
ENSAMEG00000014506	SRRT	51	74.620	ENSPMGG00000002841	srrt	56	74.620	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	93.617	ENSPEMG00000010834	Srrt	100	93.617	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMEG00000014506	SRRT	96	54.462	ENSPMAG00000009614	-	55	64.905	Petromyzon_marinus
ENSAMEG00000014506	SRRT	98	87.910	ENSPCIG00000000816	SRRT	98	87.910	Phascolarctos_cinereus
ENSAMEG00000014506	SRRT	51	76.096	ENSPFOG00000005704	srrt	96	65.212	Poecilia_formosa
ENSAMEG00000014506	SRRT	79	61.388	ENSPFOG00000016554	-	90	61.905	Poecilia_formosa
ENSAMEG00000014506	SRRT	79	61.039	ENSPLAG00000004526	-	85	61.555	Poecilia_latipinna
ENSAMEG00000014506	SRRT	95	63.109	ENSPLAG00000021992	srrt	96	63.073	Poecilia_latipinna
ENSAMEG00000014506	SRRT	76	75.274	ENSPMEG00000001182	srrt	96	65.438	Poecilia_mexicana
ENSAMEG00000014506	SRRT	76	60.321	ENSPMEG00000001520	-	89	60.870	Poecilia_mexicana
ENSAMEG00000014506	SRRT	95	64.767	ENSPREG00000022308	srrt	96	64.983	Poecilia_reticulata
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	84.403	ENSPPYG00000017432	SRRT	100	84.403	Pongo_abelii
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.248	ENSPCOG00000025751	SRRT	100	94.248	Propithecus_coquereli
ENSAMEG00000014506	SRRT	77	86.771	ENSPVAG00000000834	SRRT	100	86.771	Pteropus_vampyrus
ENSAMEG00000014506	SRRT	51	75.604	ENSPNYG00000018710	srrt	96	64.781	Pundamilia_nyererei
ENSAMEG00000014506	SRRT	75	77.333	ENSPNAG00000010629	srrt	95	53.802	Pygocentrus_nattereri
ENSAMEG00000014506	SRRT	52	85.776	ENSRNOG00000048277	AABR07035787.1	93	85.776	Rattus_norvegicus
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.137	ENSRBIG00000035718	SRRT	100	94.137	Rhinopithecus_bieti
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.137	ENSRROG00000030622	SRRT	100	94.137	Rhinopithecus_roxellana
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.027	ENSSBOG00000033570	SRRT	100	94.027	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAMEG00000014506	SRRT	72	84.195	ENSSHAG00000007349	-	100	83.639	Sarcophilus_harrisii
ENSAMEG00000014506	SRRT	93	69.168	ENSSFOG00015017293	srrt	96	70.468	Scleropages_formosus
ENSAMEG00000014506	SRRT	51	62.716	ENSSMAG00000018195	-	96	62.661	Scophthalmus_maximus
ENSAMEG00000014506	SRRT	95	64.678	ENSSMAG00000015342	srrt	96	65.318	Scophthalmus_maximus
ENSAMEG00000014506	SRRT	53	54.812	ENSSDUG00000002051	-	93	55.508	Seriola_dumerili
ENSAMEG00000014506	SRRT	51	75.824	ENSSDUG00000012049	srrt	91	65.278	Seriola_dumerili
ENSAMEG00000014506	SRRT	81	75.604	ENSSLDG00000017477	srrt	81	76.703	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAMEG00000014506	SRRT	51	56.427	ENSSPAG00000018943	-	93	57.298	Stegastes_partitus
ENSAMEG00000014506	SRRT	51	75.983	ENSSPAG00000005665	srrt	94	65.287	Stegastes_partitus
ENSAMEG00000014506	SRRT	94	92.235	ENSSSCG00000024789	SRRT	99	91.320	Sus_scrofa
ENSAMEG00000014506	SRRT	51	73.810	ENSTRUG00000016075	srrt	96	64.719	Takifugu_rubripes
ENSAMEG00000014506	SRRT	90	52.761	ENSTRUG00000000023	-	51	60.641	Takifugu_rubripes
ENSAMEG00000014506	SRRT	74	61.267	ENSTNIG00000011779	srrt	100	60.997	Tetraodon_nigroviridis
ENSAMEG00000014506	SRRT	92	49.701	ENSTNIG00000003111	-	53	61.771	Tetraodon_nigroviridis
ENSAMEG00000014506	SRRT	62	96.477	ENSTBEG00000005212	SRRT	62	96.477	Tupaia_belangeri
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	93.695	ENSTTRG00000011104	SRRT	100	93.695	Tursiops_truncatus
ENSAMEG00000014506	SRRT	95	95.476	ENSUAMG00000027997	SRRT	99	95.476	Ursus_americanus
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	95.465	ENSUMAG00000011295	SRRT	100	95.465	Ursus_maritimus
ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.801	ENSVVUG00000023572	SRRT	100	94.801	Vulpes_vulpes
ENSAMEG00000014506	SRRT	69	78.916	ENSXETG00000025124	srrt	96	58.797	Xenopus_tropicalis
ENSAMEG00000014506	SRRT	51	51.641	ENSXCOG00000013105	-	90	51.860	Xiphophorus_couchianus
ENSAMEG00000014506	SRRT	77	61.438	ENSXMAG00000002090	-	89	62.174	Xiphophorus_maculatus
ENSAMEG00000014506	SRRT	77	76.096	ENSXMAG00000007627	srrt	85	76.096	Xiphophorus_maculatus