EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMEG00000015151 (Gene tree)
Gene ID: 100471573
Gene Symbol: SBNO1
Alias: FLJ10701|FLJ10833|MOP3|Sno
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Ailuropoda_melanoleuca
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 40889 bases
Position: chrGL192354.1:2962463-3003351
Accession: 22973
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMEP00000016039	ResIII	PF04851.15	6e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMET00000016709	SBNO1-201	4191	-	ENSAMEP00000016039	1396 (aa)	-	G1M9L8

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	97.851	ENSG00000139697	SBNO1	100	97.851	Homo_sapiens
ENSAMEG00000015151	SBNO1	82	80.532	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	80.789	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	74.438	ENSACIG00000008088	sbno1	99	74.175	Amphilophus_citrinellus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.070	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.263	Amphiprion_ocellaris
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.070	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	75.263	Amphiprion_percula
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.751	ENSATEG00000006667	sbno1	99	76.031	Anabas_testudineus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	91.762	ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	91.768	Anas_platyrhynchos
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	87.243	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	87.101	Anolis_carolinensis
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	97.636	ENSANAG00000029958	-	99	98.915	Aotus_nancymaae
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	73.500	ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.235	Astatotilapia_calliptera
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	79.773	ENSAMXG00000019473	sbno1	99	79.915	Astyanax_mexicanus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	98.280	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	98.280	Bos_taurus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	97.779	ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	97.779	Callithrix_jacchus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	98.856	ENSCAFG00000007503	SBNO1	100	98.856	Canis_familiaris
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	98.138	ENSCAFG00020015363	SBNO1	100	98.138	Canis_lupus_dingo
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	98.065	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	98.065	Capra_hircus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	98.352	ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	98.352	Carlito_syrichta
ENSAMEG00000015151	SBNO1	96	97.976	ENSCAPG00000000384	SBNO1	100	97.976	Cavia_aperea
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	97.206	ENSCPOG00000008109	SBNO1	100	98.221	Cavia_porcellus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	93.414	ENSCCAG00000035316	SBNO1	100	93.414	Cebus_capucinus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	97	98.078	ENSCATG00000008239	SBNO1	98	99.458	Cercocebus_atys
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	97.350	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	99.277	Chinchilla_lanigera
ENSAMEG00000015151	SBNO1	83	98.708	ENSCSAG00000002064	SBNO1	100	98.708	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	96	94.343	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	94.343	Choloepus_hoffmanni
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	92.054	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	91.840	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	92.561	ENSCANG00000042688	-	100	92.489	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	97.421	ENSCGRG00001017470	Sbno1	100	97.421	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	97.421	ENSCGRG00000004756	Sbno1	100	97.421	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	74.300	ENSCSEG00000011919	sbno1	99	75.280	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.666	ENSCVAG00000007038	sbno1	99	76.064	Cyprinodon_variegatus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	79.131	ENSDARG00000099080	sbno1	99	79.558	Danio_rerio
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	96.868	ENSDNOG00000017147	SBNO1	98	97.848	Dasypus_novemcinctus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	83.405	ENSDORG00000015261	Sbno1	100	83.405	Dipodomys_ordii
ENSAMEG00000015151	SBNO1	93	90.596	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.596	Echinops_telfairi
ENSAMEG00000015151	SBNO1	75	62.407	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	62.268	Eptatretus_burgeri
ENSAMEG00000015151	SBNO1	51	93.820	ENSEASG00005012595	-	92	93.820	Equus_asinus_asinus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	98.496	ENSECAG00000006127	SBNO1	100	98.496	Equus_caballus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	83	99.451	ENSEEUG00000003793	SBNO1	83	99.451	Erinaceus_europaeus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	77.754	ENSELUG00000002886	sbno1	99	77.825	Esox_lucius
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	99.140	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	99.140	Felis_catus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	91.762	ENSFALG00000009273	SBNO1	100	91.840	Ficedula_albicollis
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	95.699	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.699	Fukomys_damarensis
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.651	ENSFHEG00000007360	sbno1	99	75.840	Fundulus_heteroclitus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	94	78.056	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.636	Gadus_morhua
ENSAMEG00000015151	SBNO1	88	92.227	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	91.984	Gallus_gallus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.738	ENSGAFG00000003960	sbno1	99	75.821	Gambusia_affinis
ENSAMEG00000015151	SBNO1	94	78.995	ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.767	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	91.195	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	95.118	Gopherus_agassizii
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	97.708	ENSGGOG00000015000	SBNO1	100	97.708	Gorilla_gorilla
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	67.781	ENSHBUG00000011910	sbno1	99	68.604	Haplochromis_burtoni
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	97.421	ENSHGLG00000014165	-	99	99.277	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMEG00000015151	SBNO1	91	84.676	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	84.980	Hippocampus_comes
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	78.668	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	78.738	Ictalurus_punctatus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	98.138	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	99.458	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	97.851	ENSJJAG00000001741	Sbno1	100	97.851	Jaculus_jaculus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.493	ENSKMAG00000009696	sbno1	99	75.823	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.662	ENSLBEG00000007623	sbno1	99	76.011	Labrus_bergylta
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	81.183	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.279	Latimeria_chalumnae
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	81.290	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	81.560	Lepisosteus_oculatus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	96.920	ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	96.920	Loxodonta_africana
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	97.851	ENSMFAG00000031429	SBNO1	100	97.851	Macaca_fascicularis
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	97.851	ENSMMUG00000011496	SBNO1	100	97.851	Macaca_mulatta
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	96.132	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	99.458	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.668	ENSMAMG00000005473	sbno1	99	75.809	Mastacembelus_armatus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	91.762	ENSMGAG00000003274	SBNO1	100	91.840	Meleagris_gallopavo
ENSAMEG00000015151	SBNO1	50	92.735	ENSMAUG00000004834	-	100	92.735	Mesocricetus_auratus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	96.991	ENSMICG00000006573	-	100	96.991	Microcebus_murinus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	93.777	ENSMOCG00000009390	Sbno1	100	97.331	Microtus_ochrogaster
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	71.408	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	71.770	Mola_mola
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	94.767	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	94.767	Monodelphis_domestica
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.157	ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.384	Monopterus_albus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	97.133	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	99	97.133	Mus_caroli
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	97.491	ENSMUSG00000038095	Sbno1	100	96.835	Mus_musculus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	97.491	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	100	96.962	Mus_pahari
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	97.276	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	100	96.456	Mus_spretus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	98.997	ENSMPUG00000001658	SBNO1	100	98.997	Mustela_putorius_furo
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	97.994	ENSMLUG00000017159	SBNO1	100	97.994	Myotis_lucifugus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	98.209	ENSNGAG00000012620	Sbno1	100	98.209	Nannospalax_galili
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	73.519	ENSNBRG00000019189	sbno1	99	74.253	Neolamprologus_brichardi
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	94.054	ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	94.054	Nomascus_leucogenys
ENSAMEG00000015151	SBNO1	62	84.177	ENSMEUG00000008768	-	93	88.608	Notamacropus_eugenii
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	94.349	ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.278	Ochotona_princeps
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	97.350	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	99.277	Octodon_degus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.421	ENSONIG00000015348	sbno1	99	75.647	Oreochromis_niloticus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	98	96.215	ENSOCUG00000002441	SBNO1	95	96.215	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	74.947	ENSORLG00000001593	sbno1	99	75.344	Oryzias_latipes
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.070	ENSORLG00020015216	sbno1	99	75.351	Oryzias_latipes_hni
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.070	ENSORLG00015002726	sbno1	99	75.351	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.035	ENSOMEG00000019313	sbno1	99	75.316	Oryzias_melastigma
ENSAMEG00000015151	SBNO1	50	90.028	ENSOGAG00000010781	-	100	90.028	Otolemur_garnettii
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	98.136	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	98.136	Ovis_aries
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	97.851	ENSPPAG00000024635	SBNO1	100	97.851	Pan_paniscus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	99.140	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	99.140	Panthera_pardus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	98.854	ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	98.854	Panthera_tigris_altaica
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	97.923	ENSPTRG00000005597	SBNO1	100	97.923	Pan_troglodytes
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	97.851	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	99.458	Papio_anubis
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	80.314	ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.542	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	91.239	ENSPSIG00000009572	-	100	91.155	Pelodiscus_sinensis
ENSAMEG00000015151	SBNO1	92	87.597	ENSPSIG00000009256	-	100	87.597	Pelodiscus_sinensis
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	97.206	ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	97.206	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	94.054	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	94.198	Phascolarctos_cinereus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.966	ENSPFOG00000005069	sbno1	99	76.047	Poecilia_formosa
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.826	ENSPLAG00000015015	sbno1	99	76.154	Poecilia_latipinna
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.913	ENSPMEG00000021212	sbno1	99	75.994	Poecilia_mexicana
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.562	ENSPREG00000017746	sbno1	99	75.524	Poecilia_reticulata
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	97.421	ENSPPYG00000005084	SBNO1	100	97.421	Pongo_abelii
ENSAMEG00000015151	SBNO1	89	92.087	ENSPCAG00000008634	SBNO1	89	92.087	Procavia_capensis
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	98.209	ENSPCOG00000024277	SBNO1	100	98.209	Propithecus_coquereli
ENSAMEG00000015151	SBNO1	87	99.405	ENSPVAG00000015304	SBNO1	87	99.405	Pteropus_vampyrus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.738	ENSPNYG00000004291	sbno1	99	75.753	Pundamilia_nyererei
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	79.178	ENSPNAG00000015622	sbno1	99	79.037	Pygocentrus_nattereri
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	97.276	ENSRNOG00000001064	Sbno1	99	98.039	Rattus_norvegicus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	97.994	ENSRROG00000034230	SBNO1	99	99.458	Rhinopithecus_roxellana
ENSAMEG00000015151	SBNO1	96	92.725	ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	92.725	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	76.020	ENSSMAG00000013640	sbno1	99	76.231	Scophthalmus_maximus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.594	ENSSDUG00000023480	sbno1	99	75.734	Seriola_dumerili
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ENSAMEG00000015151	SBNO1	89	98.867	ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.867	Sorex_araneus
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ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	98.281	ENSSSCG00000009776	SBNO1	100	98.281	Sus_scrofa
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ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	82.303	ENSXETG00000031930	SBNO1	99	82.018	Xenopus_tropicalis
ENSAMEG00000015151	SBNO1	89	74.324	ENSXCOG00000011607	sbno1	95	75.080	Xiphophorus_couchianus
ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.843	ENSXMAG00000002140	sbno1	99	75.874	Xiphophorus_maculatus