EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMEG00000016776 (Gene tree)
Gene ID: 100465320
Gene Symbol: RPP30
Alias: TSG15
Full Name: ribonuclease P/MRP subunit p30
Gene Type: protein_coding
Species: Ailuropoda_melanoleuca
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 26272 bases
Position: chrGL192527.1:340227-366498
Accession: 100465320
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMEP00000017723	RNase_P_p30	PF01876.16	2.7e-64	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMET00000018445	RPP30-201	807	-	ENSAMEP00000017723	268 (aa)	XP_002917336	G1MEE5

Gene Model

Click here to download ENSAMEG00000016776's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
aml03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
aml03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAMEG00000016776's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	93.657	ENSG00000148688	RPP30	100	93.657	Homo_sapiens
ENSAMEG00000016776	RPP30	96	53.696	ENSAPOG00000023156	rpp30	97	53.696	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMEG00000016776	RPP30	87	60.944	ENSACIG00000022810	rpp30	83	60.944	Amphilophus_citrinellus
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	58.427	ENSAOCG00000016438	rpp30	89	58.427	Amphiprion_ocellaris
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	58.427	ENSAPEG00000008697	rpp30	89	58.427	Amphiprion_percula
ENSAMEG00000016776	RPP30	92	62.348	ENSATEG00000015263	rpp30	89	62.348	Anabas_testudineus
ENSAMEG00000016776	RPP30	90	75.104	ENSAPLG00000009959	RPP30	100	75.104	Anas_platyrhynchos
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	70.566	ENSACAG00000007996	RPP30	99	70.566	Anolis_carolinensis
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	80.755	ENSANAG00000009439	RPP30	83	80.755	Aotus_nancymaae
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	57.463	ENSACLG00000015389	-	99	57.463	Astatotilapia_calliptera
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	59.328	ENSAMXG00000040653	rpp30	98	59.328	Astyanax_mexicanus
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	97.753	ENSBTAG00000002973	RPP30	99	97.753	Bos_taurus
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	92.537	ENSCJAG00000011045	RPP30	100	92.537	Callithrix_jacchus
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	98.134	ENSCAFG00000031801	RPP30	100	98.134	Canis_familiaris
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	98.134	ENSCAFG00020000258	RPP30	100	98.134	Canis_lupus_dingo
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	94.007	ENSCHIG00000012901	RPP30	99	94.007	Capra_hircus
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	94.403	ENSTSYG00000013903	RPP30	100	94.403	Carlito_syrichta
ENSAMEG00000016776	RPP30	90	72.917	ENSCAPG00000001326	RPP30	100	72.917	Cavia_aperea
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	92.164	ENSCPOG00000033174	RPP30	100	92.164	Cavia_porcellus
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	93.284	ENSCCAG00000029514	RPP30	100	93.284	Cebus_capucinus
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	92.830	ENSCATG00000042072	RPP30	99	92.830	Cercocebus_atys
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	93.284	ENSCLAG00000008595	RPP30	100	93.284	Chinchilla_lanigera
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	93.258	ENSCSAG00000006694	RPP30	99	93.258	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMEG00000016776	RPP30	87	54.297	ENSCHOG00000007023	-	100	54.297	Choloepus_hoffmanni
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	77.444	ENSCPBG00000026518	RPP30	99	77.444	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMEG00000016776	RPP30	80	43.243	ENSCING00000019714	-	82	42.793	Ciona_intestinalis
ENSAMEG00000016776	RPP30	87	39.516	ENSCSAVG00000011282	-	80	39.516	Ciona_savignyi
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	93.258	ENSCANG00000041084	RPP30	99	93.258	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	79.478	ENSCGRG00001000834	-	100	79.478	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMEG00000016776	RPP30	87	93.103	ENSCGRG00001017068	-	97	93.103	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	79.851	ENSCGRG00000006196	-	100	79.851	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	93.284	ENSCGRG00000002508	-	100	93.284	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	54.212	ENSCSEG00000001779	rpp30	93	54.212	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	60.370	ENSCVAG00000003139	rpp30	99	60.370	Cyprinodon_variegatus
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	61.798	ENSDARG00000027428	rpp30	99	61.798	Danio_rerio
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	96.642	ENSDNOG00000010186	RPP30	92	96.642	Dasypus_novemcinctus
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	91.791	ENSDORG00000015333	Rpp30	100	91.791	Dipodomys_ordii
ENSAMEG00000016776	RPP30	87	31.760	FBgn0283652	Rpp30	78	31.760	Drosophila_melanogaster
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	91.045	ENSETEG00000018823	RPP30	100	91.045	Echinops_telfairi
ENSAMEG00000016776	RPP30	56	38.562	ENSEBUG00000003989	-	83	38.562	Eptatretus_burgeri
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	96.629	ENSEASG00005011050	RPP30	99	96.629	Equus_asinus_asinus
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	96.629	ENSECAG00000021917	RPP30	99	96.629	Equus_caballus
ENSAMEG00000016776	RPP30	97	67.433	ENSEEUG00000009986	-	99	67.433	Erinaceus_europaeus
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	66.912	ENSELUG00000003731	rpp30	95	66.912	Esox_lucius
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	98.507	ENSFCAG00000029073	RPP30	93	98.507	Felis_catus
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	74.532	ENSFALG00000007711	RPP30	99	74.532	Ficedula_albicollis
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	92.509	ENSFDAG00000019241	RPP30	99	92.509	Fukomys_damarensis
ENSAMEG00000016776	RPP30	92	59.756	ENSFHEG00000014739	rpp30	97	58.025	Fundulus_heteroclitus
ENSAMEG00000016776	RPP30	91	55.556	ENSGMOG00000005379	rpp30	100	55.556	Gadus_morhua
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	72.761	ENSGALG00000006486	RPP30	99	73.387	Gallus_gallus
ENSAMEG00000016776	RPP30	95	58.824	ENSGAFG00000001445	rpp30	94	58.824	Gambusia_affinis
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	57.194	ENSGACG00000010285	rpp30	99	57.194	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	75.188	ENSGAGG00000000980	RPP30	69	75.188	Gopherus_agassizii
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	93.657	ENSGGOG00000026917	RPP30	100	93.657	Gorilla_gorilla
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	57.836	ENSHBUG00000019332	rpp30	99	57.836	Haplochromis_burtoni
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	93.657	ENSHGLG00000013072	RPP30	100	93.657	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	93.657	ENSHGLG00100017798	RPP30	100	93.657	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMEG00000016776	RPP30	94	52.326	ENSHCOG00000004763	-	90	52.326	Hippocampus_comes
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	60.517	ENSIPUG00000003863	rpp30	99	60.517	Ictalurus_punctatus
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	93.258	ENSSTOG00000027002	RPP30	99	93.258	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	93.657	ENSJJAG00000020041	Rpp30	100	93.657	Jaculus_jaculus
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	58.209	ENSKMAG00000015355	rpp30	99	58.209	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	56.458	ENSLBEG00000019989	rpp30	99	56.458	Labrus_bergylta
ENSAMEG00000016776	RPP30	72	60.731	ENSLACG00000002534	RPP30	96	60.731	Latimeria_chalumnae
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	66.791	ENSLOCG00000000031	rpp30	99	66.791	Lepisosteus_oculatus
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	94.403	ENSLAFG00000015931	RPP30	100	94.403	Loxodonta_africana
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	93.258	ENSMFAG00000031109	RPP30	99	93.258	Macaca_fascicularis
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	93.258	ENSMMUG00000006628	RPP30	99	93.258	Macaca_mulatta
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	92.884	ENSMNEG00000033838	RPP30	99	92.884	Macaca_nemestrina
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	93.258	ENSMLEG00000037578	RPP30	99	93.258	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	58.672	ENSMAMG00000010934	rpp30	99	58.672	Mastacembelus_armatus
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	57.836	ENSMZEG00005018508	-	99	57.836	Maylandia_zebra
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	67.537	ENSMGAG00000008452	RPP30	100	67.537	Meleagris_gallopavo
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	92.910	ENSMAUG00000008797	Rpp30	100	92.910	Mesocricetus_auratus
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	95.896	ENSMICG00000012019	RPP30	100	95.896	Microcebus_murinus
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	92.164	ENSMOCG00000016872	Rpp30	100	92.164	Microtus_ochrogaster
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	54.478	ENSMMOG00000009266	rpp30	93	54.478	Mola_mola
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	85.393	ENSMODG00000006863	-	99	85.393	Monodelphis_domestica
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	72.659	ENSMODG00000009342	-	99	72.659	Monodelphis_domestica
ENSAMEG00000016776	RPP30	98	58.935	ENSMALG00000011718	rpp30	96	58.935	Monopterus_albus
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	91.760	MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	91.760	Mus_caroli
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	91.791	ENSMUSG00000024800	Rpp30	100	91.791	Mus_musculus
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	91.045	MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	91.045	Mus_pahari
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	91.791	MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	91.791	Mus_spretus
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	99.245	ENSMPUG00000017258	RPP30	93	99.245	Mustela_putorius_furo
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	97.378	ENSMLUG00000017169	RPP30	99	97.378	Myotis_lucifugus
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	76.119	ENSNGAG00000014392	-	100	76.119	Nannospalax_galili
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	94.030	ENSNGAG00000012018	-	100	94.030	Nannospalax_galili
ENSAMEG00000016776	RPP30	92	52.227	ENSNBRG00000024170	-	91	52.227	Neolamprologus_brichardi
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	94.030	ENSNLEG00000012383	RPP30	100	94.030	Nomascus_leucogenys
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	74.539	ENSMEUG00000015587	-	100	74.539	Notamacropus_eugenii
ENSAMEG00000016776	RPP30	53	94.366	ENSOPRG00000007367	-	100	94.366	Ochotona_princeps
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	69.776	ENSODEG00000004560	-	100	69.776	Octodon_degus
ENSAMEG00000016776	RPP30	98	92.395	ENSODEG00000004530	-	100	92.395	Octodon_degus
ENSAMEG00000016776	RPP30	77	59.420	ENSONIG00000019140	rpp30	100	59.420	Oreochromis_niloticus
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	82.397	ENSOANG00000003415	RPP30	99	82.397	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	91.418	ENSOCUG00000006896	RPP30	92	91.418	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMEG00000016776	RPP30	95	59.843	ENSORLG00000020420	rpp30	87	59.843	Oryzias_latipes
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	58.955	ENSORLG00020009037	-	99	58.955	Oryzias_latipes_hni
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	58.955	ENSORLG00015008300	rpp30	93	58.955	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMEG00000016776	RPP30	68	55.978	ENSOMEG00000012640	-	98	55.978	Oryzias_melastigma
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	94.776	ENSOGAG00000013963	RPP30	100	94.776	Otolemur_garnettii
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	87.687	ENSOARG00000015789	RPP30	100	87.687	Ovis_aries
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	93.657	ENSPPAG00000043779	RPP30	100	93.657	Pan_paniscus
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	98.134	ENSPPRG00000000115	RPP30	100	98.134	Panthera_pardus
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	98.134	ENSPTIG00000014949	RPP30	100	98.134	Panthera_tigris_altaica
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	93.233	ENSPTRG00000002742	RPP30	100	90.299	Pan_troglodytes
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	93.258	ENSPANG00000021710	RPP30	99	93.258	Papio_anubis
ENSAMEG00000016776	RPP30	53	47.222	ENSPKIG00000024858	rpp30	76	47.222	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMEG00000016776	RPP30	90	76.955	ENSPSIG00000013213	RPP30	99	76.955	Pelodiscus_sinensis
ENSAMEG00000016776	RPP30	87	45.259	ENSPMGG00000014872	rpp30	93	45.259	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	76.119	ENSPEMG00000001948	Rpp30	100	76.119	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMEG00000016776	RPP30	53	42.683	ENSPMAG00000001855	-	99	42.683	Petromyzon_marinus
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	85.768	ENSPCIG00000015730	RPP30	99	85.768	Phascolarctos_cinereus
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	57.836	ENSPFOG00000000610	rpp30	99	57.836	Poecilia_formosa
ENSAMEG00000016776	RPP30	94	59.684	ENSPLAG00000003728	rpp30	86	59.684	Poecilia_latipinna
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	56.716	ENSPMEG00000015692	rpp30	99	56.716	Poecilia_mexicana
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	57.778	ENSPREG00000001536	rpp30	99	57.778	Poecilia_reticulata
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	93.657	ENSPPYG00000002473	RPP30	100	93.657	Pongo_abelii
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	60.839	ENSPCAG00000016930	RPP30	100	60.839	Procavia_capensis
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	95.896	ENSPCOG00000017865	RPP30	100	95.896	Propithecus_coquereli
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	89.273	ENSPVAG00000010524	RPP30	94	89.273	Pteropus_vampyrus
ENSAMEG00000016776	RPP30	93	50.598	ENSPNYG00000016930	-	85	50.598	Pundamilia_nyererei
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	63.060	ENSPNAG00000014804	rpp30	99	63.060	Pygocentrus_nattereri
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	91.418	ENSRNOG00000018718	Rpp30	100	91.418	Rattus_norvegicus
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	89.434	ENSRBIG00000036948	RPP30	85	89.434	Rhinopithecus_bieti
ENSAMEG00000016776	RPP30	79	30.841	YHR062C	-	71	30.841	Saccharomyces_cerevisiae
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	74.254	ENSSBOG00000025405	RPP30	89	74.254	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	84.074	ENSSHAG00000007452	RPP30	100	84.074	Sarcophilus_harrisii
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	65.428	ENSSFOG00015012510	rpp30	99	65.428	Scleropages_formosus
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	58.647	ENSSMAG00000013854	rpp30	95	58.647	Scophthalmus_maximus
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	57.609	ENSSDUG00000015086	rpp30	98	57.609	Seriola_dumerili
ENSAMEG00000016776	RPP30	88	54.583	ENSSLDG00000021234	rpp30	94	54.583	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	94.030	ENSSARG00000007110	RPP30	100	94.030	Sorex_araneus
ENSAMEG00000016776	RPP30	85	67.982	ENSSPUG00000000595	RPP30	97	70.833	Sphenodon_punctatus
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	94.757	ENSSSCG00000010460	RPP30	99	94.757	Sus_scrofa
ENSAMEG00000016776	RPP30	90	75.934	ENSTGUG00000008399	RPP30	96	75.934	Taeniopygia_guttata
ENSAMEG00000016776	RPP30	56	42.105	ENSTRUG00000020711	-	57	42.657	Takifugu_rubripes
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	55.839	ENSTNIG00000018540	rpp30	96	55.839	Tetraodon_nigroviridis
ENSAMEG00000016776	RPP30	83	93.694	ENSTBEG00000010734	RPP30	100	93.694	Tupaia_belangeri
ENSAMEG00000016776	RPP30	89	86.555	ENSTTRG00000014708	RPP30	89	86.555	Tursiops_truncatus
ENSAMEG00000016776	RPP30	68	98.361	ENSUAMG00000001045	RPP30	90	98.361	Ursus_americanus
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	99.627	ENSUMAG00000000971	RPP30	100	99.627	Ursus_maritimus
ENSAMEG00000016776	RPP30	99	79.443	ENSVPAG00000002077	RPP30	100	79.443	Vicugna_pacos
ENSAMEG00000016776	RPP30	100	89.179	ENSVVUG00000021784	RPP30	100	89.179	Vulpes_vulpes
ENSAMEG00000016776	RPP30	89	73.950	ENSXETG00000021785	rpp30	88	73.950	Xenopus_tropicalis
ENSAMEG00000016776	RPP30	91	57.959	ENSXCOG00000017864	rpp30	90	57.959	Xiphophorus_couchianus