EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMEG00000018832 (Gene tree)
Gene ID: 100477752
Gene Symbol: RPP38
Alias: -
Full Name: ribonuclease P/MRP subunit p38
Gene Type: protein_coding
Species: Ailuropoda_melanoleuca
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 846 bases
Position: chrGL193464.1:609032-609877
Accession: 100477752
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMEP00000019882	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	4.3e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMET00000020651	RPP38-201	846	-	ENSAMEP00000019882	281 (aa)	XP_002926670	D2HVG7

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
aml03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
aml03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	79.505	ENSG00000152464	RPP38	100	79.762	Homo_sapiens
ENSAMEG00000018832	RPP38	94	43.011	ENSAPOG00000001240	rpp38	96	43.369	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMEG00000018832	RPP38	88	43.750	ENSACIG00000011592	rpp38	98	42.652	Amphilophus_citrinellus
ENSAMEG00000018832	RPP38	94	41.259	ENSAOCG00000017293	rpp38	97	41.581	Amphiprion_ocellaris
ENSAMEG00000018832	RPP38	94	42.804	ENSAPEG00000002315	rpp38	96	43.116	Amphiprion_percula
ENSAMEG00000018832	RPP38	96	43.885	ENSATEG00000000731	rpp38	98	43.885	Anabas_testudineus
ENSAMEG00000018832	RPP38	91	52.290	ENSAPLG00000002054	RPP38	96	53.285	Anas_platyrhynchos
ENSAMEG00000018832	RPP38	94	41.971	ENSACLG00000016962	rpp38	97	43.273	Astatotilapia_calliptera
ENSAMEG00000018832	RPP38	94	42.336	ENSACLG00000016958	rpp38	97	43.636	Astatotilapia_calliptera
ENSAMEG00000018832	RPP38	89	41.600	ENSAMXG00000025023	rpp38	98	41.818	Astyanax_mexicanus
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	76.241	ENSBTAG00000007702	RPP38	100	77.305	Bos_taurus
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	89.324	ENSCAFG00000024373	RPP38	100	89.324	Canis_familiaris
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	89.324	ENSCAFG00020008008	RPP38	100	89.324	Canis_lupus_dingo
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	76.596	ENSCHIG00000012484	RPP38	100	77.660	Capra_hircus
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	75.704	ENSCPOG00000003981	RPP38	100	75.704	Cavia_porcellus
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	77.113	ENSCLAG00000010194	RPP38	100	77.113	Chinchilla_lanigera
ENSAMEG00000018832	RPP38	94	80.000	ENSCSAG00000019055	RPP38	100	79.859	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	82.746	ENSCHOG00000004335	RPP38	100	82.042	Choloepus_hoffmanni
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	71.831	ENSCGRG00001001395	Rpp38	100	71.831	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	71.831	ENSCGRG00000017441	Rpp38	100	71.831	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMEG00000018832	RPP38	94	41.577	ENSCSEG00000001721	rpp38	99	41.812	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMEG00000018832	RPP38	95	41.935	ENSCVAG00000001676	rpp38	97	42.215	Cyprinodon_variegatus
ENSAMEG00000018832	RPP38	94	44.649	ENSDARG00000040350	rpp38	96	44.727	Danio_rerio
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	79.859	ENSDNOG00000040314	RPP38	100	79.152	Dasypus_novemcinctus
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	69.965	ENSDORG00000009783	Rpp38	100	69.965	Dipodomys_ordii
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	75.704	ENSETEG00000002839	RPP38	100	75.704	Echinops_telfairi
ENSAMEG00000018832	RPP38	99	80.576	ENSEASG00005019783	RPP38	98	80.576	Equus_asinus_asinus
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	75.887	ENSEEUG00000014677	RPP38	100	76.950	Erinaceus_europaeus
ENSAMEG00000018832	RPP38	88	44.322	ENSELUG00000010160	rpp38	94	44.128	Esox_lucius
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	83.986	ENSFCAG00000022449	RPP38	100	83.986	Felis_catus
ENSAMEG00000018832	RPP38	91	50.763	ENSFALG00000014804	RPP38	94	50.903	Ficedula_albicollis
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	79.930	ENSFDAG00000018669	RPP38	100	79.577	Fukomys_damarensis
ENSAMEG00000018832	RPP38	95	42.199	ENSFHEG00000013741	rpp38	100	44.108	Fundulus_heteroclitus
ENSAMEG00000018832	RPP38	92	51.894	ENSGALG00000008794	RPP38	92	52.555	Gallus_gallus
ENSAMEG00000018832	RPP38	58	46.429	ENSGACG00000009258	rpp38	98	46.341	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMEG00000018832	RPP38	94	41.971	ENSHBUG00000010937	rpp38	97	43.636	Haplochromis_burtoni
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	76.408	ENSHGLG00000012144	RPP38	100	76.056	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMEG00000018832	RPP38	88	41.296	ENSIPUG00000022879	rpp38	95	40.602	Ictalurus_punctatus
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	77.739	ENSSTOG00000025699	RPP38	98	77.739	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	75.352	ENSJJAG00000007523	Rpp38	100	75.352	Jaculus_jaculus
ENSAMEG00000018832	RPP38	88	40.856	ENSKMAG00000003986	rpp38	93	41.935	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMEG00000018832	RPP38	92	44.444	ENSLBEG00000006853	rpp38	94	44.815	Labrus_bergylta
ENSAMEG00000018832	RPP38	95	50.175	ENSLACG00000006502	RPP38	100	49.833	Latimeria_chalumnae
ENSAMEG00000018832	RPP38	94	48.239	ENSLOCG00000018347	rpp38	96	49.474	Lepisosteus_oculatus
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	81.625	ENSLAFG00000000509	RPP38	100	81.625	Loxodonta_africana
ENSAMEG00000018832	RPP38	94	79.623	ENSMMUG00000007679	RPP38	100	79.505	Macaca_mulatta
ENSAMEG00000018832	RPP38	96	43.617	ENSMAMG00000012774	rpp38	96	43.972	Mastacembelus_armatus
ENSAMEG00000018832	RPP38	94	42.336	ENSMZEG00005003189	rpp38	97	44.000	Maylandia_zebra
ENSAMEG00000018832	RPP38	94	42.336	ENSMZEG00005003200	rpp38	97	43.636	Maylandia_zebra
ENSAMEG00000018832	RPP38	92	52.471	ENSMGAG00000008217	RPP38	92	53.114	Meleagris_gallopavo
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	72.887	ENSMAUG00000003644	Rpp38	100	72.887	Mesocricetus_auratus
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	73.944	ENSMOCG00000007020	Rpp38	100	73.592	Microtus_ochrogaster
ENSAMEG00000018832	RPP38	93	42.336	ENSMMOG00000003446	rpp38	94	41.758	Mola_mola
ENSAMEG00000018832	RPP38	95	67.037	ENSMODG00000024091	RPP38	100	67.254	Monodelphis_domestica
ENSAMEG00000018832	RPP38	91	42.366	ENSMALG00000002356	rpp38	93	42.366	Monopterus_albus
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	73.333	MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	100	72.887	Mus_caroli
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	72.632	ENSMUSG00000049950	Rpp38	100	72.183	Mus_musculus
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	73.333	MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	72.887	Mus_pahari
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	71.930	MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	71.479	Mus_spretus
ENSAMEG00000018832	RPP38	99	93.190	ENSMPUG00000018523	RPP38	99	93.190	Mustela_putorius_furo
ENSAMEG00000018832	RPP38	94	82.890	ENSMLUG00000002153	RPP38	100	82.918	Myotis_lucifugus
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	75.088	ENSNGAG00000011066	Rpp38	100	74.737	Nannospalax_galili
ENSAMEG00000018832	RPP38	94	42.751	ENSNBRG00000006994	rpp38	98	44.000	Neolamprologus_brichardi
ENSAMEG00000018832	RPP38	94	44.526	ENSONIG00000020467	rpp38	96	44.727	Oreochromis_niloticus
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	73.145	ENSOCUG00000022768	-	100	73.145	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	73.145	ENSOCUG00000024367	-	100	73.145	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMEG00000018832	RPP38	90	42.966	ENSORLG00000009219	rpp38	96	43.841	Oryzias_latipes
ENSAMEG00000018832	RPP38	89	43.233	ENSORLG00020011503	rpp38	90	43.333	Oryzias_latipes_hni
ENSAMEG00000018832	RPP38	89	42.692	ENSORLG00015017702	rpp38	93	41.343	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMEG00000018832	RPP38	89	44.615	ENSOMEG00000005414	rpp38	99	43.902	Oryzias_melastigma
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	78.369	ENSOGAG00000008059	RPP38	100	78.369	Otolemur_garnettii
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	76.950	ENSOARG00000004534	RPP38	100	78.014	Ovis_aries
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	79.505	ENSPPAG00000041577	RPP38	91	79.505	Pan_paniscus
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	84.698	ENSPPRG00000015329	RPP38	100	84.698	Panthera_pardus
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	84.342	ENSPTIG00000007188	RPP38	100	84.342	Panthera_tigris_altaica
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	79.505	ENSPTRG00000002318	RPP38	91	79.505	Pan_troglodytes
ENSAMEG00000018832	RPP38	93	44.803	ENSPKIG00000025652	rpp38	93	44.681	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMEG00000018832	RPP38	97	55.396	ENSPSIG00000001527	RPP38	98	55.396	Pelodiscus_sinensis
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	76.408	ENSPEMG00000008375	Rpp38	100	76.056	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	70.070	ENSPCIG00000009096	RPP38	94	70.070	Phascolarctos_cinereus
ENSAMEG00000018832	RPP38	68	45.408	ENSPFOG00000016823	rpp38	91	45.408	Poecilia_formosa
ENSAMEG00000018832	RPP38	89	42.146	ENSPLAG00000007626	rpp38	92	42.642	Poecilia_latipinna
ENSAMEG00000018832	RPP38	87	38.672	ENSPMEG00000020392	rpp38	93	39.552	Poecilia_mexicana
ENSAMEG00000018832	RPP38	96	41.343	ENSPREG00000017744	rpp38	97	42.254	Poecilia_reticulata
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	80.212	ENSPPYG00000002113	RPP38	100	80.212	Pongo_abelii
ENSAMEG00000018832	RPP38	94	83.712	ENSPVAG00000007155	RPP38	100	83.333	Pteropus_vampyrus
ENSAMEG00000018832	RPP38	94	42.336	ENSPNYG00000004293	rpp38	97	44.000	Pundamilia_nyererei
ENSAMEG00000018832	RPP38	88	42.800	ENSPNAG00000010633	rpp38	99	42.599	Pygocentrus_nattereri
ENSAMEG00000018832	RPP38	98	70.504	ENSRNOG00000038025	Rpp38	99	70.504	Rattus_norvegicus
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	70.070	ENSSHAG00000015529	RPP38	100	70.070	Sarcophilus_harrisii
ENSAMEG00000018832	RPP38	94	43.478	ENSSMAG00000018276	rpp38	95	43.478	Scophthalmus_maximus
ENSAMEG00000018832	RPP38	94	42.960	ENSSDUG00000001651	rpp38	98	43.214	Seriola_dumerili
ENSAMEG00000018832	RPP38	94	42.500	ENSSLDG00000014355	rpp38	98	42.857	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	58.363	ENSSARG00000012099	RPP38	100	58.363	Sorex_araneus
ENSAMEG00000018832	RPP38	96	55.636	ENSSPUG00000008560	-	97	55.636	Sphenodon_punctatus
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	58.188	ENSSPUG00000005237	-	100	58.188	Sphenodon_punctatus
ENSAMEG00000018832	RPP38	99	57.544	ENSSPUG00000018363	-	99	57.544	Sphenodon_punctatus
ENSAMEG00000018832	RPP38	94	41.877	ENSSPAG00000020387	rpp38	96	42.199	Stegastes_partitus
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	75.789	ENSSSCG00000027110	RPP38	100	75.789	Sus_scrofa
ENSAMEG00000018832	RPP38	91	50.763	ENSTGUG00000001366	RPP38	97	51.825	Taeniopygia_guttata
ENSAMEG00000018832	RPP38	94	43.956	ENSTNIG00000001334	rpp38	96	43.956	Tetraodon_nigroviridis
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	75.532	ENSTTRG00000004420	RPP38	100	75.532	Tursiops_truncatus
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	96.797	ENSUAMG00000002618	RPP38	100	96.797	Ursus_americanus
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	97.527	ENSUMAG00000012382	RPP38	100	97.527	Ursus_maritimus
ENSAMEG00000018832	RPP38	100	89.680	ENSVVUG00000005272	RPP38	100	89.680	Vulpes_vulpes
ENSAMEG00000018832	RPP38	92	48.120	ENSXETG00000003419	rpp38	97	48.727	Xenopus_tropicalis